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Artículo de método

Silencios de

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DOI:

10.3791/52849

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12 de agosto de 2015

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En este artículo

Resumen

El silenciamiento génico por siRNA representa una estrategia experimental conveniente para analizar las funciones biológicas dependientes de BRCA2 con implicaciones inmediatas para comprender mejor la biología del cáncer. Se presenta un método para silenciar eficientemente BRCA2, junto con el procedimiento experimental para detectar y cuantificar cambios en la expresión de la proteína BRCA2 por inmunotransferencia en líneas celulares humanas.

Resumen

El silenciamiento de la proteína BRCA2 supresor de tumores y su detección por análisis bioquímicos convencionales representan un gran desafío técnico debido al gran tamaño de la proteína BRCA2 humano (aproximadamente 390 kDa). Se presenta modificaciones de transfección y inmunotransferencia protocolos estándar siRNA para silenciar BRCA2 humano y detectar la proteína BRCA2 endógeno, respectivamente, en las líneas de células epiteliales humanas. Los pasos clave incluyen una alta proporción de reactivo de transfección siRNA ay dos rondas posteriores de siRNA transfección dentro del mismo experimento. El uso de estas y otras modificaciones en el protocolo estándar logramos consistentemente más de 70% silenciamiento del gen BRCA2 humano a juzgar por el análisis de inmunotransferencia con anticuerpos anti-BRCA2. Además, la desnaturalización de los lisados ​​de células a 55 ° C en lugar de la convencional 70-100 ° C y otras optimizaciones técnicas del procedimiento de inmunotransferencia permite la detección de la proteína BRCA2 intacta incluso when muy bajas cantidades de material de partida están disponibles o cuando los niveles de expresión de proteínas BRCA2 son muy bajos. Silenciamiento eficiente de BRCA2 en las células humanas ofrece una valiosa estrategia para interrumpir la función de BRCA2 en células con BRCA2 intacto, incluyendo las células tumorales, para examinar nuevas vías moleculares y las funciones celulares que pueden ser afectados por mutaciones BRCA2 patógenos en los tumores. La adaptación de este protocolo para el silenciamiento y el análisis de otros "grandes" como proteínas BRCA2 eficiente debe ser fácilmente alcanzable.

Introducción

El gen BRCA2 (cáncer de mama susceptibilidad gen-2) codifica para una proteína supresora de tumores que juega un papel crucial en la reparación de ADN de doble filamento se rompe mediante la regulación de la función de la enzima recombinasa Rad51 1. BRCA2 también ha sido implicado en la modulación de la transcripción y en el control del ciclo celular 2. Mutaciones de la línea germinal en el gen BRCA2 inducen una susceptibilidad autosómica dominante a cáncer de mama y de ovario en mujeres y el cáncer de próstata en hombres, así como predisposición a otros tipos de cáncer 3,4. Sin embargo, a pesar del aumento en el rie....

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Protocolo

1. Preparar soluciones siRNA

  1. Resuspender 5 nmol de revueltos (Ctrl) y 5 nmol de BRCA2 siRNA gránulos secos en 100 l de RNasa libre de agua (concentración final de siRNA: 50 m). Este es el stock siRNA y debe ser almacenado a -20 ° C en 10 alícuotas.
  2. Tomar una alícuota de 10 l de la población de siRNA y añadir 40 l de RNasa libre de agua para obtener la solución de trabajo de 10 M siRNA. Esta dilución debe ser almacenado a -20 ° C hasta su uso.
    NOTA: La solución de trabajo siRNA no debe someterse a la congelación / descongelación de más de 3 veces.

2. Siembra del epiteliales humanas Líneas Celulares ....

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Resultados

Antes de proceder con un ensayo biológico / bioquímica para examinar el efecto de silenciamiento BRCA2 en las funciones celulares, el primer paso es para confirmar la especificidad de la silenciamiento mediante el uso de un siRNA revueltos (no la orientación siRNA) lado a lado con BRCA2 siRNA (Figura 1A ). Es importante llevar a cabo una segunda ronda de siRNA transfección con una alta relación de siRNA / transfección para conseguir una alta eficiencia del silenciamiento BRCA2. De hech.......

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Discusión

Debido a que las mutaciones en la línea germinal del gen BRCA2 plomo a un mayor riesgo de varios tipos de cáncer, incluyendo el cáncer femenino y masculino de mama, cáncer de ovario, cáncer de próstata, cáncer de páncreas, y el melanoma 3,4, una serie de estudios se han realizado para entender la función biológica de la proteína BRCA2. La mayoría de estos estudios son principalmente basados ​​en genética debido a dificultades técnicas en el análisis de una proteína gigante como BRCA2. El método descr.......

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Divulgaciones

Los autores no tienen nada que revelar.

Agradecimientos

Este trabajo fue apoyado por las subvenciones FIRB-Merit RBNE08YFN3_005 y RBNE08HWLZ_012, y el Ministerio de Economía y Finanzas italiano al CNR para el proyecto "FaReBio di Qualità".

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
BRCA2 siRNADharmaconL-003462-00SMARTpool: ON-TARGETplus BRCA2 siRNA
Ctrl siRNADharmacon  D-001810-10-05ON-TARGETplus
Reactivo de ARNiMAX de lipofectamina de grupo no objetivo Life Technologies13778075Reactivo de transfección
OPTI-MEM I Reduced Serum MediumLife Technologies31985-070Medio para el procedimiento de transfección
NuPAGE Tris-Acetato 3-8% 1,5 mm Gel prefabricadoLife TechnologiesEA0378Gel para electroforesis de proteínas
NuPAGE LDS Búfer de muestra Life TechnologiesNP0007Reactivo para electroforesis de proteínas
NuPAGE Agente reductor de muestras (10x)Life TechnologiesNP0004Reactivo para electroforesis de proteínas
NuPAGE AntioxidanteLife TechnologiesNP0005Reactivo para electroforesis de proteínas
HiMark Estándar de proteínas preteñidoLife TechnologiesLC5699Marcador preteñido para gel electroforesis
XCell SureLoc Mini-Cell  SystemLife TechnologiesEI0002Equipo para electroforesis/transferencia de proteínas
NuPAGE Tris-Acetato SDS Running BufferLife TechnologiesLA0041Reactivo para Western blot
Membrana de PVDFMilliporeIPVH00010Reactivo para Western blot
NuPAGE TransferBuffer Life TechnologiesNP0006-1Reactivo para Western blot
BRCA2 H-300 anticuerpo policlonal conejoSanta Cruz Biotechnologysc-8326dilución 1:300
Anticuerpo monoclonal beta-tubulinaSigma AldrichT4026-100ULdilución 1:1.000
Leche desnatada en polvoSigma Aldrich70166Reactivo para Western blot
Tween-20Sigma AldrichP1379Reactivo para Western blot
SuperSignal West Pico/Femto Sustrato quimioluminiscentePierce Thermo Scientific34080/34096Sistema de quimioluminiscencia
Células PNT1ASIGMA Aldrich (para ECACC)95012614PNT1A epitelio prostático humano normal inmortalizado con células SV40
NthySIGMA Aldrich (para ECACC)90011609Línea celular Nthy-ori 3-1 Células epiteliales foliculares humanas, tiroideas
Proliferación celular Kit I (MTT)Roche11465007001Kit para ensayos de proliferación celular

Referencias

  1. Thorslund, T., West, S. C. BRCA2: a universal recombinase regulator. Oncogene. 26, 7720-7730 (2007).
  2. Yoshida, K., Miki, Y. Role of BRCA1 and BRCA2 as regulators of DNA repair, transcription, and cell cycle in response to DNA damage. Cancer Sci. 95<....

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Reimpresiones y permisos

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