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1. Neuronal Cultura
Nota: la reprogramación de fibroblastos en células madre pluripotentes, el compromiso con el linaje telencéfalo dorsal, derivación, amplificación, y la banca de progenitores finales corticales (LCP) se describe en Boissart et al 4. La diferenciación neuronal de las células-LCP como también se realizó de acuerdo a Boissart et al 4 con ligeras modificaciones. Otros procedimientos han sido desarrollados para la reprogramación directa de los fibroblastos en células madre pluripotentes inducidas seguido por su diferenciación en neuronas. Este protocolo fue retenido ya que permite la producción selectiva de las neuronas glutamatérgicas piramidales.
- Tratar 6 pocillos placas de cultivo con cubreobjetos de vidrio con poli-ornitina (diluido a 1/6 en DPBS, la concentración de stock 0,01%) O / N, seguido de tres lavados en DPBS. A continuación, añadir la laminina (concentración de solución madre 1 mg / ml, se diluyó 500 veces en DPBS) durante al menos 10 h bajo la campana de flujo .
- Plate y despachar NSC a baja densidad (50.000 células / cm 2) en 6 pocillos placas de cultivo con cubreobjetos de vidrio en 3 ml de medio de cultivo que consta de DMEM / F12 (500 ml), 2 viales (5 ml cada uno) de suplemento de N2, 2 viales (10 ml cada una) de suplemento B27, 10 ml de Pen-estreptomicina (Penicilina = 10.000 unidades / ml y estreptomicina = 10.000 unidades / ml), 1 ml de 2-mercaptoetanol (Stock solución: 50 mM) y laminina (1 / 500), y sin factores de crecimiento. PASO CRÍTICO: Llevar a cabo este paso cuidadosamente por la adición de células con movimientos giratorios lentos con el fin de reducir la agrupación de células.
- Retire el medio de cultivo. Añadir medio N2B27 fresco que contiene 2 mg / ml de solución de laminina fresco para mantener la neurona adjunto sobre los cubreobjetos de vidrio y evitar la formación de grumos. Cambie el medio cada 3 días. Mantener algunos de el medio restante (200 l) antes de añadir medio fresco con el fin de evitar que la célula de secado. Alternativamente, proceder rápidamente y cambiar el volumen total (3 ml).
e_title "> 2. Lentiviral Transducción
Nota: lentiviral vectores GFP fueron amablemente proporcionados por el Dr. Uwe Maskos Laboratorio en el Instituto Pasteur (París) y preparados de acuerdo con el protocolo publicado 5. Expresión de GFP es impulsado por el promotor de fosfoglicerato quinasa de ratón (PGK). Para este estudio, título viral fue de 400 ng / l (solución madre en PBS 1x).
- Transducir neuronas derivadas de IPSC humanos en cualquier etapa de la maduración de las partículas virales mediante la adición de 1 l de la solución madre que contiene 40 ng de GFP vector lentiviral por cultivo así (placas de 6 pocillos) y se incuba durante 48 horas en medio de cultivo fresco. Nota: Para este protocolo, la duración de la incubación permite un buen etiquetado de las estructuras de la columna vertebral.
3. La inmunofluorescencia
Nota: Con el fin de mejorar el etiquetado de toda la morfología de la columna vertebral, se llevó a cabo el etiquetado de inmunofluorescencia utilizando un anticuerpo anti-GFP en condiciones permeabilizadas.
- Retire medio de cultivo y fijar las células transducidas en cubreobjetos en paraformaldehído al 4% durante 10 min a RT, a continuación, lavar 3 veces en 1X PBS (10 min cada uno).
- Cubreobjetos immergé en PBS suplementado con 0,05% de Triton (100x) y 10% de suero de caballo durante 1 hora a RT, a continuación, lavar 3 veces en 1X PBS.
- Añadir 100 l de 1x PBS suplementado con 4% de suero de caballo y anticuerpo primario (1 / 1.000) generado contra GFP y se diluyeron por un factor de 1000 en cada cubreobjetos. Incubar en una caja oscura O / N a 4 ° C, luego lavar 3 veces con PBS 1x.
- Diluir Alexa Fluor 488-anticuerpo conjugado (1/200) en PBS suplementado con 0,5% de Tween 20 y se incuba durante 1 hora a RT. A continuación, lavar 3 veces en PBS 1x y montar cubreobjetos en portaobjetos de vidrio con medio de montaje para microscopía de fluorescencia.
4. dendríticas Spine Imaging
- Realizar imagen confocal través de un microscopio láser confocal de barrido.
- Seleccionar las neuronas sanas con una morfología piramidalencontrar una arborización dendrítica completo, y cuantificar al menos 10 neuronas por condición de experimentos separados. Cuantificar 60 - 100 micras en las dendritas.
- Adquirir imágenes utilizando un aceite 40X NA = 1,3 objetiva y una línea láser de 488 nm para la excitación GFP, con una potencia pico típico a nivel de muestra de alrededor de 20 mW. Establecer tamaño de píxel alrededor de 80 nm para probar adecuadamente las espinas dendríticas.
Nota: La llamada posterior análisis de una imagen en la que el ruido no ponga en peligro la segmentación adecuada de las dendritas y espinas. Con los ajustes de toma de muestras y de potencia espaciales mencionadas anteriormente, se observó que un píxel en tiempo de permanencia de 3,15 mu s es suficiente para recoger suficientes fotones para construir una imagen tal. Para las muestras tenue, la calidad de imagen puede mejorarse mediante un promedio de 2 a 4 scans. La adquisición de varios azulejos XY puede ser necesaria para cubrir la región de interés, que luego debe ser cosida juntos antes de su procesamiento. - Para muestra, el volumen total de las neuronas, adquirir una Z-pila, conun espaciado Z que van desde 150 nm a 300 nm, produciendo 20 a 30 rebanadas z.
Nota: La resolución espacial lateral logrado con estos ajustes es 234 nm y la resolución axial es 591 nm. El muestreo elegido aquí es adecuada, pero como la resolución axial es más grande que el tamaño más pequeño de las espinas en ser fotografiado, el análisis favorece las espinas que se extienden lateralmente desde las dendritas.
5. 3D Cuantificación de espinas dendríticas
Nota: Las siguientes secciones describen específicamente el uso del software Imaris para su análisis. Existen implementaciones alternativas, incluyendo NeuronStudio 15 o Metamorph 8, que puede proporcionar resultados similares.
Utilice los siguientes valores fundamentales:
- Como una etapa de tratamiento previo, utilizar el filtrado gaussiano a través de las instalaciones de procesamiento de imágenes que ofrece el software. Realizar filtrado gaussiano a través del procesamiento de imágenes> SmooLo> Filtro de Gauss. Ajuste el ancho del filtro para que sea igual al tamaño del pixel en XY.
- Realizar un trazado semi-automática de las dendritas, utilizando el módulo de Filamento trazador del software.
- En primer lugar, calcular el diámetro de las dendritas, con la función distancia en la pestaña de la rebanada del software.
- En la pestaña Surpass, haga clic en la herramienta de filamentos. Para una mejor robustez, este protocolo se basa en el seguimiento semiautomático; haga clic en la creación automática Omitir. El interfaz del módulo muestra ahora en la pestaña Dibujo. Aquí, seleccione AutoPath como método, Dendrita como un tipo, y la entrada al diámetro estimado de dendritas.
- Utilice el modo de selección del puntero, convirtiendo el cursor en una caja. Mayús y haga clic derecho en el punto de partida de las dendritas. Nota: el software realiza cálculos iniciales.
- Mueva el puntero a lo largo de la dendrita. Desde el punto de partida (representared como una esfera azul), se muestra una línea amarilla que representa la ruta de dendritas más probable. Mayús y haga clic izquierdo en el punto final de dendritas.
- Realice el espinas segmentación automatizada. Nota: Las espinas en la dendrita trazado se encuentran automáticamente por la interfaz del módulo.
- En la interfaz de módulo, haga clic en la ficha Creación. En la lista desplegable Reconstruir, recoger Reconstruir Dendrita Diámetro y marque la casilla de datos Fortaleza. Luego haga clic en Reconstruir.
- Establecer el umbral de modo que el volumen segmentado corresponde al volumen dendrita real. Como un algoritmo, seleccione la distancia más corta de Distancia mapa. Haga clic en el botón Siguiente.
- Determine el diámetro de la cabeza más pequeña columna vertebral y la longitud máxima, de nuevo con la función distancia en la pestaña de la rebanada del software, y luego volver a la pestaña Surpass e introduzca los parámetros. Fo este protocolo, los valores alrededor de 200 a 300 nm para el diámetro mínimo y 4 m de longitud máxima son buenos puntos de partida. No marque la casilla Permitir Rama de espinas. Haga clic en el botón Siguiente.
- Ajustar el umbral de puntos semilla de modo que los puntos azules que representan espinas localizar a las cabezas de la columna vertebral reales. Haga clic en el botón Siguiente. Nota: El cálculo básico se hace ahora y puede ser largo.
- Clasifique espinas por ir a la pestaña Herramientas de la interfaz del módulo. Haga clic en Clasificar espinas. En la interfaz de usuario se le solicite, asegúrese de que hay cuatro clases, que se define por su morfología de la siguiente manera: Stubby: longitud <1 m; Mushroom: Longitud (columna vertebral)> 3 y el ancho máximo (cabeza)> significan ancho (cuello) x 2; Larga delgada: La media anchura (cabeza) ≥ media anchura (cuello); -Filopodios como: Longitud ≤ 4 micras (sin cabeza).
Nota: El mointerfaz dule genera cuatro nuevos objetos filamentos que contienen los resultados de la clasificación. - Exportar Datos estadísticos: en cualquiera de estos cuatro interfaces de objetos, vaya a la pestaña Estadísticas.
Haga clic en los Exportar Estadísticas de botón File.
Nota: Otros valores estadísticos se pueden exportar para dendritas (. Por ejemplo, longitud, área, diámetro, profundidad rama, ramas ángulo, volumen, etc significa.), Y por espinas (por ejemplo, la rectitud, la zona de unión, longitud y volumen de distinta partes de la columna vertebral, diámetro columna vertebral, densidades, etc.)