Aparición de células inmediatamente después de la siembra y después de Agregación
Inmediatamente después de la siembra, se puede observar la presencia de células individuales dentro de cada pocillo de la placa de 96 pocillos con un microscopio invertido estándar de cultivo de tejidos (Figura 1B). Dentro de 8 h de chapado, estas células se han comenzado a descender a la parte inferior de la bien debido a la gravedad y se han empezado a unirse en grupos discretos (Figura 1C). Después de 24 horas, las células de coalescencia habrán completado la agregación primaria, y se han compactado en bien definidos, agregados todavía irregulares donde las células individuales son indistintos entre sí (Figura 1D). Al final del segundo día (48 horas), los agregados deben buscar "limpia", después de haber tomado todas las células dentro del pozo (Figura 1E); la parte inferior del pozo puede tener algunas células que se han desprendido del agregado en esta etapa. Siempre queque los agregados se han agregado en N2B27, en este punto de tiempo, deben ser esférica, aproximadamente de 150-200 micras de diámetro y se mueve libremente dentro del pozo (es decir., no adherido a la parte inferior de los pocillos). Agregación en otros medios (es decir., ESLIF o N2B27 con factores específicos) tiene el potencial de alterar tanto la morfología agregado inicial y la respuesta a los estímulos posteriores (Turner et al., En preparación).
Representante morfológica Cambios
La adición de un pulso de 24 h de medio secundario que contiene Chi entre 48 y 72 hr (Figura 1A, 5A) genera bien definido agregados alargados que muestran expresión polarizada en marcadores específicos de las capas germinales 19,21. Inmediatamente después del pulso de Chi (72 hr), los agregados comenzarán a eliminar las células y empezar a mostrar su respuesta a estas señales hacia el final de este día (Figura 3A). Estas respuestasse manifiestan por los cambios en la expresión génica y la morfología, ambos de los cuales son dependientes sobre el tratamiento que los agregados han recibido después del periodo de agregación de 48 hr inicial en N2B27 (Figura 3B). Si sólo se requiere un análisis de punto final, el momento óptimo para la imagen de los agregados es de aproximadamente 96 a 120 horas. En este punto, los agregados se han desarrollado morfologías cristalinas y patrones de expresión génica (figura 3A), y su tamaño y masa son todavía lo suficientemente bajo como para que la expulsión de medio de P200 pipeta es suficiente para desalojar cualquier que pueden haber adjunto. El incumplimiento de impedir la adhesión del agregado al pozo afectará negativamente a la formación de agregados (Figura 5Biv). El patrón de morfologías y la expresión génica de los agregados puede ser alterado dependiendo del tratamiento. Los resultados representativos para regímenes sostenidos o pulsadas con cualquiera de los tratamientos individuales o combinaciones de factores se muestran para BMP4, Dorsomorphin H1 (BMP inhibidor del receptor), ActivinA, SB43 (activina / inhibidor de Nodal), bFGF o PD03 (inhibidor de MEK) (Figura 3B).
Imaging agregada y Análisis de Imagen Cuantitativa
Los agregados son susceptibles a las imágenes ya sea por microscopía de campo amplio (principalmente para time-lapse 19), o fija y immunostained de imagen confocal 19,21 (Figura 2). La descripción del protocolo y la imagen actual de arriba permite que la información cuantitativa que se pueden obtener a partir de estos agregados. Siguiendo confocal o de gran campo de captura de imagen, la longitud y la expresión del gen correspondiente a lo largo del diámetro o la columna vertebral del agregado (esférica o alargada, respectivamente; Figura 4A, B) se pueden medir. Estos análisis también son directamente aplicables a las imágenes de lapso de tiempo, donde se puede obtener información de la tasa de crecimiento, el tamaño y el alargamiento de los agregados en diferentes condiciones (Figura 4 ).

Figura 1. Típico tiempo de curso y los primeros morfologías. (A) El curso de tiempo típico para experimentos de agregación. Las células se agregan durante 48 horas en N2B27 contiene una suspensión de células ES de ratón (10 células / l) en una placa de 96 pocillos (p1, p2). (B) Inmediatamente después de la siembra (t = ~ 5min), las células individuales pueden ser vistos en la suspensión y han comenzado a formar montones por 8h (C). (D) Después de 24 horas las células se han formado un solo agregado en cada pocillo que es de aproximadamente 100 micras de diámetro. (E) Después de la agregación de 48 hr, el agregado diámetro varía de 150 a 200 micras. En este punto, el medio de agregación (N2B27) se retira y se añade un medio secundario o bien para el resto del experimento (p1 en la parte A) o durante 24 horas antes de ser cambiado bACK al N2B27 (p2 en la parte A). La barra de escala representa 100 micras. Por favor haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2. agregados de montaje en portaobjetos de microscopio. Una vez que los agregados se han fijado, inmunotinción y se coloca en medio de montaje, cada agregado se pipetea en un portaobjetos de microscopio como una gotita de 17 l (A, B, B '). Suficiente espacio se deja entre las gotas agregadas para evitar su fusión. Los espaciadores están hechas con cinta de doble cara y se colocan en cada esquina del portaobjetos de microscopio (A, A ', B). Es sobre estos que se coloca un cubreobjetos de vidrio. Por favor haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3. El efecto de diferentes tratamientos sobre la morfología de las células ES agregados. Después de 2 días en N2B27, las células ES se han formado agregados. La adición de factores específicos, ya sea como un pulso de 1 día (A) o de manera continua (B) puede alterar el fenotipo de los agregados con respecto a la polaridad de la expresión génica, el potencial de alargamiento, o su forma general. Los ejemplos de esta figura son agregados formados desde cualquier sujetador :: GFP 30 (A) o Sox1 :: GFP 27 (B) células ES de ratón fotografiados después de 120 horas y tratados como se indica. Chi: CHIR 99021 31; SB43: SB 431542 32; DM: DorsomorphinH1 33,34; PD03:. PD0325901 Haga clic aquí para ver una versión más grande de les figura.

Figura 4. Análisis cuantitativo de Áridos. Un total típica formada de Bra :: mESCs GFP 25,30 después de un pulso de 24 h de Chi y fotografiados a 120 horas. Imagen fusionada del campo luminoso y canal de GFP se muestra con línea segmentada que marca la 'columna vertebral' del agregado del punto A al B (A), a lo largo de la cual la fluorescencia y la longitud del agregado se pueden medir (B). La longitud (C) y 'redondez' (D) a partir de 24 agregados dentro de la misma experimento se muestran. Descriptores de forma tal como la redondez (D), la circularidad, perímetro y el área se pueden medir mediante el Análisis de Imágenes Cookbook plugin desde el software de análisis de imágenes FIJI 35. La media indicada por la línea horizontal en cada punto del tiempo;barras de error indican la desviación estándar; barra de escala en (A) indica 200 micras. Como hay diferencias sutiles entre líneas celulares reportero, se espera que después de un pulso de Chi, la longitud máxima media y la redondez mínima promedio de los agregados variarán. Entre las diferentes líneas celulares, nos encontramos con que la longitud máxima promedio puede estar dentro del rango de ~ 400 a 800 micras y la redondez mínima promedio entre 0,4 y 0,6. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5. Ejemplos de fallos en la formación de agregados. La capacidad de generar agregados reproducibles (A) depende de factores críticos, tales como (Bi) medio secundario fresco y bien mezclado, (Bii, BIII) la exactitud en el conteo de la inicial número de células y (BIV), lo que garantiza los agregados no forman colonias adherentes, es decir., 'accidente' en la superficie del pozo. Se muestran ejemplos típicos de los errores en la formación de agregados para cada una de las condiciones mencionadas (B). Escala-bar como se indica; véase la tabla de solución de problemas para obtener más información (Tabla 1). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Tabla 1. Guía para la solución de problemas. Los errores típicos asociados con el protocolo de agregación se dan con sugerencias en cuanto a su resolución.

Tabla 2. Tabla de líneas celulares ensayadas para la formación de aggRegates. Un número de líneas celulares 19,22,27,30,36-40 se han caracterizado por la formación de agregados y, aunque se espera que las diferencias sutiles entre líneas celulares y han sido observados, todas las líneas anteriores muestran dinámicas similares en términos de la elongación y la morfología. En términos de la expresión génica, el patrón de expresión es específica para el gen expresado, pero dentro de cada línea celular, el patrón de expresión es generalmente constante durante un número de pasajes. Para mantener la coherencia, generamos agregados de células que no han superado los 15 pasajes en cultivo.

Tabla 3. Lista de anticuerpos representativos utilizados en estos estudios. Una selección de los anticuerpos y los factores de dilución utilizados para la inmunotinción agregado.