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Artículo de método

Clonación funcional utilizando una

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DOI:

10.3791/53518

30 de enero de 2016

En este artículo

Resumen

Describimos un sistema de ovocitos y capuchones animales de Xenopus para la clonación de expresión de genes capaces de inducir una respuesta en ectodermo competente, y discutimos técnicas para el análisis posterior de dichos genes. Este sistema es útil en la identificación funcional de una amplia gama de productos génicos.

Resumen

La identificación de genes responsables de la inducción embrionaria plantea una serie de desafíos; por nombrar algunos, las moléculas secretadas de interés pueden ser bajas en abundancia, pueden no ser secretadas sino estar atadas a la(s) célula(s) señalizadora(s), o pueden requerir la presencia de socios de unión o moléculas reguladoras aguas arriba. Por lo tanto, en la búsqueda de productos genéticos capaces de provocar una respuesta inductiva temprana del cristalino en un ectodermo competente, utilizamos un sistema de clonación de expresión que permitiría la identificación de factores paracrinos o yuxtacrinos, así como proteínas transcripcionales u otras proteínas reguladoras. Se inyectaron grupos de ARNm en los ovocitos de Xenopus y el tejido que respondió se colocó directamente sobre los ovocitos y se realizó un cocultivo. Después de la clonación funcional de ldb1 a partir de una biblioteca de ADNc en etapa de placa neural basada en su capacidad para provocar la expresión del marcador de placa del lente temprano foxe3 en el ectodermo de la tapa animal competente para el lente, caracterizamos el patrón de expresión del ARNm y analizamos la progresión del desarrollo después de la sobreexpresión o el derribo de ldb1. Este sistema es adecuado en una amplia variedad de contextos en los que se busca la identificación de un inductor o sus moléculas reguladoras aguas arriba utilizando una respuesta funcional en tejido competente.

Introducción

Los enfoques genéticos avanzados para identificar genes de interés a través de su función o pérdida de función1,2 son una parte integral de la comprensión de eventos de patrones complejos en el desarrollo. Junto con las poderosas técnicas de genética inversa disponibles para una gama cada vez más amplia de sistemas e investigadores3-5, ahora es posible identificar genes con un papel funcional clave en una vía y luego dilucidar esa función a nivel celular y en interacción con otros productos génicos. Un enfoque para la identificación funcional de genes de interés que ha producido muchos hallazgos clave en el pasado es la clonación de expresión

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Protocolo

Todos los procedimientos experimentales fueron aprobados por la Universidad de Virginia Institucional Cuidado de Animales y el empleo Comisión.

Nota: La figura 1 muestra una vista general esquemática de los procedimientos experimentales.

1. Preparación de ovocitos

  1. X. Pre-prime laevis hembras con 150 U de Mare embarazada suero de gonadotropina (PMSG) aproximadamente una semana antes de que el aislamiento de los ovocitos. Inyectar 1 ml 150 U / ml PMSG en dorsal linfático salida con 1 cc jeringa estéril con 29 G aguja.
  2. Preparar soluciones pa....

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Resultados

En respuesta a la expresión del ARNm inyectado en oocitos, respondiendo tejido casquillo animal se sometió a ensayo para la expresión de Otx2 mediante hibridación in situ (Figura 2 y Tabla 1); Otx2 se expresa en el ectodermo lente presuntiva (PLE) a partir de cierre del tubo neural a través de placoda del cristalino engrosamiento 19. Sin embargo, desde Otx2 se expresa también en el ectodermo neural anterior, así como la cabe.......

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Discusión

El método descrito aquí para la clonación funcional de genes capaces de inducir una respuesta en ectodermo competente puede ser usado para identificar una amplia gama de productos génicos. Este método se expande al trabajo anterior mediante la combinación de los ensayos de inducción de tejido con técnicas de clonación de expresión. Utilizamos las vías metabólicas de Xenopus el ovocito como una fuente de producción de factores de inducción de, directa o indirectamente, después de la inyección de ARN. Esto, en co.......

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Divulgaciones

Los autores declaran que no tienen intereses financieros contrapuestos.

Agradecimientos

Este trabajo fue apoyado por una Beca de Desarrollo Profesional para C.Z.P. de la Fundación Shepherd University. Los autores desean agradecer a Brett Zirkle y Malia Deshotel por sus útiles discusiones sobre los protocolos, y a la Dra. Carol Hurney por su generosa ayuda.

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
12/101Banco de hibridomas12/101Anticuerpo monoclonal para la detección de tejido muscular
20x SSC BufferSigmaS6639para ISH
Anhídrido acéticoSigmaA6404para ISH
Anti-Dig-APRoche11093274910para ISH
Aurum Plasmid Mini KitBio-Rad732-6400Purificación de ADN plasmídico
Reactivo de bloqueoRoche11096176001para ISH
BM PurpleRoche11442074001para ISH
Boekel Horno de hibridaciónFisher Scientific13-245-121para ISH
Bouin's SolutionSigmaHT10132para ISH
BSASigmaA9647para OCM
CHAPSSigmaC3023para ISH
Colagenasa ARoche10103578001Desfoliculación de ovocitos
CisteínaSigmaC121800Embriones de Dejelly
DEPC-H2OFisher ScientificBP5611para ISH
Mezcla de marcaje de ARN Dig Roche11277073910para sondas ISH
Pinzas Dumont #5World Precision Instruments500233para envoltura Vitelline
3-aminobenzoato de etiloSigmaA5040MS222 anestésico
Ficoll PM 400SigmaF4375para medios de inyección
FormamidaSigmaF9037para ISH
Sulfato de gentamicinaSigmaG1914para OCM
Capilares de vidrioWorld Precision Instruments48783,5" de largo, I,D, 0,530 mm
Viales de muestra de vidrioFisher Scientific06-408Bpara ISH
Hair loopPelo adherido en pipeta Pasteur para la manipulación de tejidos
Sal sódica de heparinaSigmaH4784para inyector ISH
Nanoliter 2010World Precision InstrumentsNanoliter 2010Microinyector controlado por microprocesador
Instant OceanCarolina972433Aquarium Sal para la recuperación de ranas
IRBG XGC Xenopus verificado de longitud completa cam cDNASource Bioscience989_IRBGcDNA library 
Placas de agar LB con 100 µ g/ml AmpicilinaTeknovaL5004Placas LB-Amp prevertidas de 150 mm para la selección de hermanos
LB Luria CaldoTeknovaL8650LB para la recolección de colonias en la selección de hermanos a partir de placas y dilución de cultivos Kit de aislamiento magnético
ARNmNew England BioLabsS1550Spara el aislamiento de ácido maleico de ARN enriquecido con poli(A)
SigmaM0375para ISH
Micromanipulador manual MicrofilWorld Precision InstrumentsM3310RMicromanipulador manual
Mezclador nutanteFisher Scientific22-363-152Balancín para ISH
PermoplastNasco SB33495MArcilla para placas de inyección y disección
Salina tamponada con fosfatoSigmaP5368para ISH
PMSGSigmaG4877para estimular el desarrollo de los ovocitos
PolivinilpirrolidonaSigmaPVP40para
ISH Extractor programableWorld Precision InstrumentsPUL-1000Extractor de agujas de micropipeta
Proteinasa KSigmaP6556para ISH
pTnT VectorPromegaL5610Construcción de la biblioteca de ADNc
Sistema de combinación RiboprobePromegaP1450in vitro transcripción
Superíndice Kit de construcción de bibliotecas de ADNc de longitud completaKit18248013Life Technologies para la construcción de bibliotecas de ADNc
Suturas, seda 3-0Fisher Scientific19-037-516Hilo y aguja de sutura para la extracción post-ovocito
Torula RNASigmaR3629para ISH
TrietanolaminaSigmaT1502para ISH
Tween 20SigmaP9416para
el sistema de síntesis de ADNc RiboClone universalISH PromegaC4360kit alternativo para la construcción de bibliotecas de ADNc
Clones de entrada ORF completos de Xenopus - ORProfuente de colaboraciónBioscience5055_XenORFeomeORFeome clones
XL2-Blue Células ultracompetentesAgilent Technologies200150células para la transformación de ADNc biblioteca
Estudios de desarrollo de anticuerpos de de

Referencias

  1. Yergeau, D., Kelley, C., Zhu, H., Kuliyev, E., Mead, P. Forward Genetic Screens in Xenopus. Using Transposon-Mediated Insertional Mutagenesis. Methods in Molecular Biology. 917, 111-127 (2012).
  2. Grainger, R.

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Etiquetas

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