Los axones en crecimiento desarrollan una estructura altamente móvil en su punta, denominada cono de crecimiento. El cono de crecimiento entra en contacto con señales ambientales extracelulares para navegar por el crecimiento axonal. La netrina, la hendidura, el semáfora y las efrinas son moléculas guía conocidas que pueden atraer o repeler axones al unirse a receptores y correceptores en el axón. Los receptores activados inician varias moléculas de señalización en el cono de crecimiento que alteran la estructura y el movimiento de la neurona. Aquí, describimos el protocolo detallado para un ensayo de rayas para evaluar la capacidad de una molécula guía para atraer o repeler neuronas. En este método, las neuronas del hipocampo disociadas de ratones E15.5 se cultivan en placas recubiertas de laminina procesadas con franjas alternas de ectodominio de fibronectina y proteína transmembrana 2 rica en leucina (FLRT2) y proteína de la región cristalizable (Fc) del fragmento de inmunoglobulina G (IgG) de control. Tanto los axones como los cuerpos celulares fueron fuertemente repelidos de las regiones de rayas recubiertas de FLRT2 después de 24 h de cultivo. La inmunotinción con tau1 mostró que ~90% de las neuronas se distribuyeron en las franjas recubiertas de Fc en comparación con las franjas recubiertas de FLRT2-Fc (~10%). Este resultado indica que FLRT2 tiene un fuerte efecto repulsivo sobre estas neuronas. Este poderoso método es aplicable no solo para las neuronas primarias cultivadas, sino también para una variedad de otras células, como los neuroblastos.