Los alimentadores de suspensión bentónicos desempeñan un papel esencial en el funcionamiento de los ecosistemas marinos. Al filtrar grandes volúmenes de agua, eliminar el plancton y los detritus, y excretar partículas y compuestos disueltos, sirven como agentes importantes para el acoplamiento bentónico-pelágico. La medición precisa de los compuestos eliminados y excretados por los alimentadores en suspensión (como esponjas, ascidias, poliquetos, bivalvos) es crucial para el estudio de su fisiología, metabolismo y ecología de la alimentación, y es fundamental para determinar la relevancia ecológica de los flujos de nutrientes mediados por estos organismos. Sin embargo, la evaluación de la velocidad a la que los alimentadores de suspensión procesan las partículas y los compuestos disueltos en la naturaleza está limitada por las limitaciones de las metodologías actualmente disponibles. Nuestro objetivo era desarrollar un método sencillo, fiable y no intrusivo que permitiera tomar muestras de agua limpia y controlada desde un punto específico, como la apertura excurrente de los alimentadores de suspensión bentónica, in situ. Nuestro método permite el muestreo simultáneo del agua inhalada y exhalada del organismo estudiado mediante el uso de tubos diminutos instalados en un dispositivo manipulador hecho a medida y cuidadosamente colocados dentro del orificio exhalante del organismo muestreado. La perforación de un tabique en el recipiente colector con una aguja de jeringa unida al extremo distal de cada tubo permite que la presión externa fuerce lentamente el agua muestreada hacia el recipiente a través del tubo de muestreo. La velocidad de muestreo lenta y controlada permite integrar la irregularidad inherente en el agua, al tiempo que garantiza un muestreo libre de contaminación. Proporcionamos recomendaciones sobre los dispositivos de filtrado, el recipiente de recolección y los procedimientos de almacenamiento más adecuados para los análisis de diferentes partículas y compuestos disueltos. El sistema VacuSIP ofrece un método fiable para la cuantificación del metabolismo de los alimentadores de suspensión inalterados en condiciones naturales, que es barato y fácil de aprender y aplicar para evaluar la fisiología y el papel funcional de los alimentadores por filtración en diferentes ecosistemas.