Cada año, los brotes de gripe estacional afectan profundamente a las sociedades de todo el mundo. A pesar de los esfuerzos mundiales, la gripe sigue siendo una carga sanitaria intratable. La principal estrategia para reducir las infecciones es la vacunación anual. En las personas que han contraído influenza, los medicamentos antivirales pueden mitigar los síntomas. Existe una necesidad clara e insatisfecha de desarrollar estrategias alternativas para combatir la gripe. Se han creado varios modelos animales para modelar las interacciones entre el huésped y la influenza. Aquí se describen los protocolos para generar modelos de pez cebra para la infección sistémica y localizada por el virus de la influenza humana A (IAV). Utilizando un modelo de infección sistémica por IAV, se pueden cribar moléculas pequeñas con potencial actividad antiviral. Como prueba de principio, se describe un protocolo que demuestra la eficacia del fármaco antiviral Zanamivir en el pez cebra infectado por IAV. Muestra cómo se pueden cuantificar los fenotipos de la enfermedad para determinar la eficacia relativa de los posibles antivirales en el pez cebra infectado por IAV. En los últimos años, ha habido un mayor aprecio por el papel fundamental que desempeñan los neutrófilos en la respuesta del huésped humano a la infección por gripe. El pez cebra ha demostrado ser un modelo indispensable para el estudio de la biología de los neutrófilos, con impactos directos en la medicina humana. Se describe un protocolo para generar una infección localizada por IAV en la línea de pez cebra Tg(mpx:mCherry) para estudiar la biología de los neutrófilos en el contexto de una infección viral localizada. El reclutamiento de neutrófilos a sitios de infección localizados proporciona un fenotipo cuantificable adicional para evaluar manipulaciones experimentales que pueden tener aplicaciones terapéuticas. Ambos protocolos de pez cebra descritos recapitulan fielmente aspectos de la infección por IAV humano. El modelo de pez cebra posee numerosas ventajas inherentes, incluida la alta fecundidad, la claridad óptica, la facilidad para el cribado de fármacos y la disponibilidad de líneas transgénicas, incluidas aquellas en las que las células inmunitarias como los neutrófilos están marcadas con proteínas fluorescentes. Los protocolos detallados aquí explotan estas ventajas y tienen el potencial de revelar información crítica sobre las interacciones entre el host y la IAV que, en última instancia, puede traducirse en la clínica.