Ahora es bien sabido que los linfocitos T desempeñan un papel crítico en el desarrollo de varias enfermedades cardiovasculares1,2,3,4,5. Por ejemplo, estudios de nuestro grupo han demostrado que la hipertensión se asocia a una acumulación excesiva de células T en los vasos y en el riñón durante el desarrollo de la hipertensión experimental6. Una vez en estos tejidos, las células T producen varias citocinas que afectan tanto a la función vascular como a la renal, lo que conduce a la vasoconstricción y a la retención de sodio y agua1,2. Para comprender completamente cómo las células T causan enfermedades cardiovasculares y renales, es importante poder identificar y cuantificar los subconjuntos específicos de células T presentes en estos tejidos. Los subconjuntos de linfocitos T se definen por una combinación de marcadores de superficie, las citocinas que secretan y los factores de transcripción que expresan. La complejidad de la población de linfocitos T hace que la citometría de flujo y la tinción intracelular sean una técnica invaluable para diseccionar los fenotipos de los linfocitos presentes en los tejidos. Aquí, proporcionamos un protocolo detallado para identificar los marcadores de superficie e intracelulares (citocinas y factores de transcripción) en células T aisladas de ganglios linfáticos murinos de riñón, aorta y drenaje aórtico en un modelo de hipertensión inducida por angiotensina II. Se describen en detalle los siguientes pasos: aislamiento de los tejidos, generación de las suspensiones unicelulares, estimulación ex vivo, fijación, permeabilización y tinción. Además, se discuten varios principios fundamentales de los análisis de citometría de flujo, incluida la elección de los controles adecuados y las estrategias de compuerta adecuadas.