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Research Article
Abhijeet Patra1, Tao Ding2, Minghui Hong3, Arthur Mark Richards2, Ten It Wong4, Xiaodong Zhou4, Chester Lee Drum2
1NUS Nanoscience and Nanotechnology Initiative,National University of Singapore, 2Cardiovascular Research Institute, Yong Loo Lin School of Medicine,National University of Singapore, 3Department of Electrical and Computer Engineering,National University of Singapore, 4Institute of Materials Research Engineering,A*STAR (Agency for Science, Technology and Research)
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este trabajo describe un método de litografía de nanoimprinting para fabricar matrices de detección alta calidad que trabajan en el principio de transmisión óptica extraordinaria. El biosensor es bajo costo, robusto, fácil de usar y puede detectar troponina I en suero en concentraciones clínicamente relevantes (99th percentil corte ∼10-400 pg/mL, según el ensayo).
Para que una plataforma de biosensores para tener importancia clínica en ajustes de point-of-care (POC), análisis de sensibilidad, reproducibilidad y capacidad de vigilar confiablemente los analitos con el trasfondo de suero humano son cruciales.
Nanoimprinting litografía (NIL) se utilizó para fabricar, a bajo costo, detección de áreas tan grandes como 1,5 x 1,5 mm. La superficie de detección fue hecha de arreglos de discos de alta fidelidad de nanoholes, cada uno con un área de alrededor de 140 nm2. La gran reproducibilidad de NIL posible emplear una estrategia de un chip, una medida de 12 superficies fabricadas individualmente, con mínima variación chip a chip. Estos chips de resonancia (LSPR) nanoimprinted localizada plasmón superficial fueron probados extensivamente en su capacidad para medir fiablemente un bioanalyte en concentraciones que varían desde 2.5 a 75 ng/mL en el fondo de un complejo biofluid-en este caso suero humano. La alta fidelidad de NIL permite la generación de grandes zonas de detección, que a su vez elimina la necesidad de un microscopio, este biosensor puede ser interconectado fácilmente con una fuente de luz de laboratorio comúnmente disponibles. Estos biosensores pueden detectar troponina en suero con una sensibilidad alta, en un límite de detección (LOD) de 0.55 ng/mL, que es clínicamente relevante. También muestran baja variación chip a chip (debido a la alta calidad del proceso de fabricación). Los resultados son conmensurables con análisis ampliamente utilizado enzima-ligado del inmunosorbente (ELISA)-basado en ensayos, pero la técnica conserva las ventajas de una plataforma de detección LSPR-basado (es decir, receptividad a la miniaturización y la multiplexación, lo que más factible para las aplicaciones POC).
Sensores químicos basados en arreglos de discos de nanohole han sido objeto de numerosas investigaciones desde que se publicó el primer informe sobre transmisión óptica extraordinaria (EOT) por Ebbesen et en 19981. Cuando la luz incide sobre arreglos periódicos de nanohole estructuras de dimensiones sub-longitud de onda, mayor la transmisión ocurre a longitudes de onda específicas. Esto ocurre cuando la luz del incidente parejas con onda de Bloch superficie polaritones (BW-SPP) o localizada plasmones de superficie (LSP)2.
El principio físico subyacente aprovechado cuando biodetección con tales matrices periódicas es simple. Adsorción de moléculas sobre o cercana a la interfase del metal cambia la constante dieléctrica del medio en contacto con el metal, a su vez cambiando la ubicación de las bandas de transmisión en el espectro. El espectro se puede ajustar por nano-ingeniería de la forma, tamaño y separación distancia3,4,5. Por diseño, sensores basados en EOT tienen bandas características en sus espectros que facilitan tareas específicas6,7,8 durante la investigación de eventos de enlace molecular. Esto es una ventaja crucial sobre plataformas de resonancia (SPR) de plasmón superficial disponible en el mercado.
Sensores con EOT típicamente involucran una fuente de luz alineada ópticamente tal que un haz colimado es incidente sobre la superficie de detección. Técnicas para generar nanohole grandes superficies, como plantillas de copolímero e interferencia y litografía nanosphere, tienen pobre reproducibilidad9. Debido a estas limitaciones en la fabricación precisa de grandes superficies que muestran el fenómeno EOT, un microscopio óptico fue requerido para posicionar correctamente el detector y la fuente de luz. Para simplificar la técnica, la litografía de alta calidad nanoimprinting fue empleado (NIL)10 . Esto permitió la producción de sensores grandes superficies11 (escala de mm), eliminando la necesidad de un microscopio buscar la superficie de detección en un chip. En cambio, este sensor se podría interconectar fácilmente con un cable óptico de fibra estándar.
Desde los picos de transmisión para esta matriz nanohole están contenidos en el espectro visible a la región del infrarrojo cercano (NIR), se adapta perfectamente a la detección de eventos de enlace de biomoléculas en un ambiente acuoso. Se simuló el comportamiento óptico de la matriz nanohole. El resultado entonces se verificó a través de estudios con líquidos estándar índices de refracción (RI). Esta matriz entonces fue utilizada para medir la concentración de troponina cardíaca I (cTnI) en el complejo fondo de suero humano. cTnI es el criterio clínico para el diagnóstico de infarto agudo de miocardio.
Con este sensor, es posible detectar y cuantificar la cTnI en suero humano en un límite de detección (LOD) de 0.55 ng/mL, que es clínicamente relevante. La detección es mucho más rápida que la más utilizada la tecnología en este dominio, análisis enzima-ligado del inmunosorbente (ELISA). Además, la superficie de detección puede fácilmente ser regenerada y por lo tanto reutilizados. Por lo tanto, este trabajo demuestra la promesa de nanohole matrices como viable tecnología point-of-care (POC) para biodetección en biofluidos complejo.
1. fabricación de los sensores y adquisición de los datos
. Para la dosis de exposición a 110 μC cm−2, el tiempo de vivienda e la viga en cada punto expuesto es 0,5 μs12. Puesto que la matriz de captura un área de 1,8 mm2, hay un total de 36 parches de 300 μm2 zonas suturan a forma un array de nanohole grande, oro.2. sensor prueba de sensibilidad a granel
3. sensor modificación superficial
4. ensayo de cTnI
5. medición de resonancia (SPR) de plasmón superficial
La configuración óptica para medición se muestra en la figura 1A. Una imagen de la matriz nanohole real se da en la figura 1B. Para entender la física de conducir el proceso de detección, se utilizó el software de simulación de COMSOL para simular la distribución de la plasmónica campo en un ambiente acuoso. Los resultados de la simulación fueron entonces relacionadas con la medición real. Un estudio previamente publicado contiene detalles de los supuestos y los parámetros utilizados en la simulación11,13. Las dimensiones físicas que se utilizan para simular el campo plasmónica para la matriz nanohole era como sigue: p = 400 nm, D = 150 nm y T = 100 nm. Absorción y efectos de la dispersión también se tienen en cuenta14 al calcular el espectro de transmisión. El espectro simulado es comparado con el espectro medido experimentalmente en la figura 1. La simulación y los espectros medidos transmitan la existencia de cuatro bandas de 450 a 850 nm. La banda a 495 nm corresponde a la transición interbanda de oro. Las tres bandas posteriores, de aquí en adelante llamadas bandas I-III en orden creciente de longitud de onda, se encuentra a 560 nm, 645 nm y 712 nm, respectivamente. Bandas-III fueron observados para tener una alineación aceptable a las bandas medidas experimentalmente, en 558 nm, 638 nm y 724 nm. Como los nanoholes fabricados casi de forma circulares, estas bandas no deben ser sensibles a la polarización de la luz incidente. Además, la simulación COMSOL permite la visualización directa de la distribución de cerca de campo de estas bandas como que ocurriría en una celda unidad de la estructura periódica (figura 1). La unidad en la barra de color es la distribución de campo óptico (V/m) expresada en una escala logarítmica. La intensidad máxima observada fue alrededor de 4.7 (50.119 V/m). En comparación con la intensidad de la incidencia en la simulación (4.340 V/m), esta magnitud representa una mejora del 11.5-fold campo. Los campos electromagnéticos para las bandas que i y III estábamos localizados en la superficie del sustrato de vidrio. En cambio, banda II fue localizada predominantemente en el borde superior de la nanohole y fue elegido para la detección de la bioanalyte. Figura 1E muestra los espectros de transmisión de la matriz nanohole en líquidos conocidos índices de refracción, que varió de 1.31 a 1,39. Tres bandas de transmisión, correspondiente a las bandas I, II y III, se observaron en la gama del espectro de 400-900 nm. Un cambio de rojo se observó un cambio en la RI. La magnitud del cambio seguido la venda de la secuencia II > banda I > banda III. Figura 1F es una consolidación de la red observada cambia de bandas I, II y III. La sensibilidad a granel calculado para banda fue 322 nm/RIU, para banda II 345 nm/RIU y para banda II fue 202 nm/RIU.
Figura 2A contiene el esquema del fenómeno de la percepción en acción. Figura 2B muestra el cambio en los espectros de transmisión después de que las moléculas de troponina se unen a la superficie del chip funcionalizados. A bajas concentraciones, hay un cambio lineal en la banda con el nivel de troponina. El cambio en la posición de la banda puede colocarse a un isoterma obligatorio con un valor de2 R de 0.995. Sobre la observación más cercana, 30 ng/mL parece ser la concentración en la cual el isoterma indica el inicio de la saturación (figura 2).
Figura 3A muestra la sensorgram de la interacción de suero con la superficie del chip de un chip modificado de GLC en una configuración de XPR36. La captura de cTnI es demostrada por el aumento de la señal. En consecuencia, la disociación de cTnI en un medio de SAFT (1 x PBS, 0,05% tween 20) puede observarse como las disminuciones de la señal de glicina de inyectables s. 120-660 (la solución de regeneración) durante 1 min reducción la señal a 0, que indica la regeneración de la superficie de detección a través de la completa retirada de cTnI. En el recuadro de la Figura 3Ase muestra el sensorgram para la posterior Asociación de cTnI a la superficie del chip regenerado. Se utilizó el mismo protocolo (es decir, sumergir en solución de glicina de 1 min) para regenerar la superficie de la matriz de nanohole. Figura 3B muestra que la posición de banda 2 cambia a su posición original, confirmando así el éxito de la etapa de regeneración.

Figura 1 : Caracterización de la matriz nanohole. Simplificado (A) esquema de la instalación experimental. Imagen de microscopio electrónico de barrido (B) de la matriz nanohole. (C) comparación entre el espectro simulado y el espectro de transmisión medido experimentalmente en un ambiente acuoso. Distribución (D) el campo cercano como simulada de COMSOL para las bandas I y III, visto en una vista de sección. El rojo representa la distribución de cerca de campo más fuerte. Es la unidad que se muestra en la barra de color | E |, la distribución del campo óptico, en escala logarítmica. (E) experimentalmente medir espectros de transmisión de la matriz nanohole en ambientes con líquidos de índice de refracción estándar (1.31 a 1,39). (F) a granel las sensibilidades de las bandas de tres transmisión (I-III) a los cambios en la RI en la visible a la gama NIR. Cuadrado negro: banda I, círculo rojo: Banda II, triángulo azul: Banda III. Se ha modificado la figura de Ding et al. 14 bajo una licencia CC BY. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2 : Matriz nanohole utilizada como un biosensor. (A) esquema de la matriz nanohole siendo utilizada como un biosensor para detectar cTnI. (B) el cambio en la transmisión de espectro del biosensor a interactuar con cTnI humano en una concentración de 30 ng/mL en un fondo de suero. Azul: antes de interacción, rojo: después de la interacción. El círculo punteado indica la banda siendo rastreada. (C) el cambio en la longitud de onda para la banda II a diferentes concentraciones de troponina (2,5 ng/mL 7,5 ng/mL, 30 ng/mL y 75 ng/mL).Las barras de error muestran la desviación estándar entre n = 3 virutas usadas para cada medición. Se ha modificado la figura de Ding et al. 14 bajo una licencia CC BY. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3 : Regeneración de la superficie del sensor. (A) un sensorgram SPR de XPR36 que muestra la inyección de analito (cTnI) seguida por la inyección de glicina para regenerar la superficie del sensor. Medidas de detección posterior de diferentes concentraciones de cTnI en el contexto de suero se muestran en el recuadro. La barra roja representa el valor inicial, mientras que la barra negra muestra la medición después de la regeneración de la superficie con el protocolo descrito en el texto. (B) el cambio en las longitudes de onda de la banda observada después de la regeneración de un chip de biosensor nanohole. Σ: desviación estándar de los cambios en la longitud de onda de la posición de la banda. Se ha modificado la figura de Ding et al. 14 bajo una licencia CC BY. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Los autores tienen intereses financieros que compiten.
Este trabajo describe un método de litografía de nanoimprinting para fabricar matrices de detección alta calidad que trabajan en el principio de transmisión óptica extraordinaria. El biosensor es bajo costo, robusto, fácil de usar y puede detectar troponina I en suero en concentraciones clínicamente relevantes (99th percentil corte ∼10-400 pg/mL, según el ensayo).
AP agradece el apoyo de Prof T Venkatesan, Director, NUS Nanociencia y nanotecnología iniciativa y oficina del Presidente del diputado (Universidad Nacional de Singapur) (R-398-000-084-646). CLD reconoce el apoyo de la Singapur Ministerio de salud nacional Consejo de investigación médica bajo su médico científico esquema de financiación, NMRC/CSA/035/2012 y la Universidad Nacional de Singapur. Los fundadores no tenían ningún papel en el diseño del estudio, recopilación de datos y análisis, publicación o preparación del manuscrito.
| Configuración de litografía por haz de electrones | Elionix ELS 700 | ||
| o-Xileno | Sigma Aldrich | 95662 | |
| EB resist | Sumitomo | NEB-22A2 | |
| Reactivo revelador | Shipley Company | Microposit MF 321 | |
| Máquina de galvanoplastia | Technotrans AG RD 50 | ||
| Decapante fotorresistente | Materiales electrónicos de Rohm y Haas LLC | Microposit Remover 1165 | |
| Sistema de grabado | Trion Phantom | ||
| Heptadecafluoro-1,1,2,2-tetrahidrodecil)triclorosilano | Gelest (PA, EE. UU.) | 78560-44-8 | |
| Recubridor SAM | Sorona Inc. | AVC 150M | |
| fotocurable NIL resist | micro resist technology GmbH | mr-UVCur21-300nm | |
| Sistema de fotocurado | Dymax | Modelo 2000 Flood Máquina | |
| de deposición de haz E | E | , espectrómetro UV-visible Denton Explorer||
| Óptica oceánica HR2000+ (Dunedin, FL, EE. UU.) | |||
| Líquidos con índice de refracción estándar | Cargill Inc (Cedar Grove, EE. UU.) | 18032 | |
| Software de trazado | Origin | Origin Pro 9 | |
| 10-carboxi-1-decanethiol | Laboratorios Dojindo (Japón) | C385-10 | |
| 1-octanethiol | Sigma-Aldrich, MO, EE. UU | . 471386 | |
| Sulfo-N-hidroxisuccinimida y 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil) carbodiimida | BioRad (CA, EE. UU.) | 1762410 | |
| Anticuerpo anti-troponina 560 | Hytest (Finlandia) | 4T21 | |
| Solución de etanolamina-HCl | BioRad (CA, EE. UU.) | 1762450 | |
| Configuración de resonancia de plasmón de superficie | BioRad XPR36 (Haifa, Israel) | ||
| Chip SPR multiplexado | BioRad | GLC | |
| Estándar de cTnI humano | Phoenix Productos farmacéuticos | EK -311-05 | |
| Glicina-HCl | BioRad (CA, EE. UU.) | 1762221 |