Todos los experimentos con animales se realizaron según las pautas para el cuidado y uso de animales de laboratorio y fueron aprobados por las autoridades responsables (Regierung von Oberbayern, Munich, Alemania y Stanford institucional Animal cuidado y Use Comité, Stanford, CA, USA). Se proporciona una lista de todos los plásmidos para la clonación (paso 1 a 4) en la tabla suplementaria S1.
1. clonación de un transgen para la expresión del gen constitutivo
- Diseño de cebadores para el transgen amplificación13,14.
- Agregar a sitios de restricción para PacI (TTAATTAA) en el extremo 5' del primer avance. Añadir sitios de restricción para AscI (GGCGCGCC) o FseI (GGCCGGCC) en el extremo 5' del primer revés.
- Amplificar el transgén por PCR usando condiciones optimizadas para el transgen deseado14. Purificar mediante un kit de purificación de DNA disponible comercialmente.
Nota: Tiempo del recocido depende de los cebadores diseñados en el paso 1.1., tiempo de alargamiento depende de la longitud de la construcción. Por ejemplo, para una construcción de 1.000 bp longitud uso 60 s tiempo de elongación.
- Digerir el transgen y vector de expresión constitutiva del gen15 con nucleasas de restricción respectivas (ver paso 1.2) y tampón en un volumen total de 50 μl a 37 ° C durante la noche. Digerir por ejemplo, construir con PacI de 5 unidades y 5 unidades FseI si procede (consulte el paso 1.2).
- Gel de purificar el vector digerido e insertar usando un kit de extracción de gel comercial según las instrucciones del fabricante. Realizar una ligadura estándar de 100 ng del vector y 100 – 1.000 ng de insertar usando 400 U T4 ligasa a 14 ° C por 16 h. calor inactivar a 65 ° C durante 10 minutos.
- Transformar las bacterias competentes usando un estándar de protocolo de shock de calor16.
- Placa en agar las placas que contienen ampicilina 100 de μg/mL. Incubar a 30 ° C por 24 h.
- Pick solo colonias, purificar DNA plasmídico utilizando un kit comercial miniprep según las instrucciones del fabricante y verificar la secuencia de secuenciación de Sanger17 (cartilla de la secuencia: 5' TGCTGGAGTTCTTCGCC 3').
- Uso positivo de colonias para maxi escalan de amplificación de ADN plásmido y purifican mediante un plásmido libre de endotoxina preparación kit18 según las instrucciones del fabricante.
- Construcción está lista para la inyección, por lo tanto continúe con el paso 5.
2. clonación de un transgen para expresión génica Inducible
- Diseño de cebadores para el transgen amplificación13,14.
- Agregar sitios de restricción de KpnI (GGTACC), SacI (GAGCTC) y SpeI (ACTAGT) al extremo 5' del primer avance. Añadir sitios de restricción NotI (GCGGCCGC) o XhoI (CTCGAG) en el extremo 5' del primer revés.
- Amplificar el transgén por PCR usando condiciones optimizadas para el transgen deseado14. Purificar mediante un kit comercial de purificación de ADN.
- Digerir el transgén purificado y 4 μg del vector de entrada (pEN_TTmcs-Vector, véase Tabla de materiales)19 por separado con nucleasas de restricción apropiado (véase el paso 2.2) y tampón en un volumen total de 50 μl a 37 ° C durante la noche.
- Gel de purificar el vector digerido e insertar usando un kit de extracción de gel comercial según las instrucciones del fabricante. Realizar ligadura estándar con 100 ng de vector y 100 – 1.000 ng de insertar usando 400 U T4 ligasa a 14 ° C por 16 h. calor inactivar a 65 ° C durante 10 minutos.
- Transformar las bacterias competentes usando un estándar de protocolo de shock de calor16.
- Placa en agar las placas que contienen Gentamicina 15 μg/mL. Incubar a 37 ° C por 16 h.
- Pick solo colonias, purificar DNA plasmídico y verificar inserción secuenciación17 utilizando la cartilla adelante pCEP: 5' AGAGCTCGTTTAGTGAACCG 3'.
Nota: PCR sobre colonias solo puede realizarse sin una previa purificación con cartillas pCEP adelante y atrás pCEP (5' AGA AAG CTG GGT CTA GAT ATC TCG 3'). Este paso puede útil para la selección de las colonias positivas.
- Proceda al paso 4.
3. clonación de un miR-shRNA Inducible Gene Knock-down
- Diseño de oligonucleótidos de miR-shRNA según pSLIK clonación protocolo19. Recocido y purificar oligonucleótidos y diluir 1:20 en el ddH2O.
- Recopilación 3 μg de vectores de entrada con 5 BfuAI de U a 50 ° C por 3 h, luego inactivar la reacción a 65 ° C por 20 min.
Nota: Si se desea la coexpresión de la proteína verde fluorescente (GFP), use el pEN_TTGmiRc19 como un vector de entrada, si no uso pEN_TTmiRc219.
- Gel de purificar el vector digerido como en el paso 2.5. Realizar ligadura estándar de 100 ng del vector y 1 μl de purificada y diluida shRNA oligonucleótidos (paso 3.1) con 400 U T4 ligasa a temperatura ambiente durante 1 h. calor inactivar a 65 ° C durante 10 minutos.
- Transformar las bacterias competentes usando un estándar de protocolo de shock de calor16.
- Placa en agar las placas que contienen Gentamicina 15 μg/mL. Incubar a 37 ° C por 16 h.
- Pick solo colonias, purificar DNA plasmídico y verificar inserción por Sanger secuenciación17 (cartilla de la secuencia: 5' TAGTCGACTAGGGATAACAG 3').
- Proceda al paso 4.
4. recombinational de clonación para generar Clones listos para la inyección
- Mezcla 150 ng del vector de entrada (del paso 2 o del paso 3) y 150 ng de pTC TET-vector20.
- Añadir buffer TE a un volumen total de 8 μl (pH = 8).
- Transferir la mezcla de enzima clonase LR II (véase Tabla de materiales) para hielo, Incube por 2 minutos vórtice dos veces.
- Añadir 2 μl de mezcla de enzima clonase LR II a la reacción e incubar a 25 ° C durante 1 hora.
- Detener la reacción agregando 1 μl de proteinasa K solución. Incubar a 37 ° C durante 10 minutos.
- Transformar Stbl3 bacterias competentes con 2 μl de clonación recombinational mezclan utilizando un estándar de protocolo de shock de calor16.
- Placa en agar las placas que contienen ampicilina 100 de μg/mL. Incubar a 30 ° C por 24 h.
- Seleccionar colonias solo, purificar DNA plasmídico utilizando un plásmido libre de endotoxina preparación kit18 según las instrucciones del fabricante y confirmar la integridad de vector por Sanger secuenciación17 (cartilla de la secuencia 5' AGGGACAGCAGAGATCCAGTTTGG 3').
- Construcción está lista para la inyección, continúe con el paso 5.
5. preparación de solución para inyección en la vena hidrodinámica cola
Nota: Preparación de construcciones para expresión génica inducible y constitutiva se describen en el paso 1, 2, 3 y 4.
- Preparación de solución salina 0.9% estéril para inyección (hacer no uso PBS). Utilice el volumen correspondiente a cerca del 10% del peso corporal de ratón. Ejemplo: para un ratón de 20 g de peso, preparar 2 mL de solución.
- Preparación de vectores de inyección que se purificaron usando un plásmido libre de endotoxina purificación kit18 (ver paso 1.8 o 4.8, respectivamente).
- Añadir 10 μg o 15 μg del constructo de vector libre de endotoxina de la bella durmiente (del paso 1 Utilice 10 μg, de paso 4 uso 15 μg, respectivamente) y 1 μg de endotoxina libre pc-HSB521 por mL de solución salina estéril.
- Solución para un máximo de 4 h a 4 ° C. No congelar.
6. realizar la inyección en la vena hidrodinámica cola
- Utilizar un limitador para la inyección de la vena de la cola (comercial o preparada de un tubo cónico de 50 mL con agujeros de respiración y de la cola). Llene el fondo del tubo con papel de seda.
- Para la inyección, utilizar ratones de unos 8 – 10 semanas de edad con pesos de 20-25 g.
- Pesar ratones antes de la inyección y preparar el volumen de inyección según el peso corporal (correspondiente al 10% del peso corporal, consulte el paso 5.1). Preparar una estéril 3 mL-jeringa con una aguja de 27 G para inyección y relleno con el volumen requerido.
- Coloque el ratón en el limitador. Ajustar la cantidad de papel de seda (ver paso 6.1) para dejar un mínimo espacio para el movimiento pero suficiente espacio para respirar.
- Asegúrese de que el ratón está respirando regularmente.
- Caliente la cola con una lámpara infrarroja para 30-60 s. con cuidado para observar signos de sobrecalentamiento.
- Limpiar la cola con un algodón embebido en alcohol.
- Inserte la aguja casi horizontalmente en una de las dos venas laterales de la cola cerca de la base de la cola.
Nota: Si coloca con éxito, una pequeña cantidad de sangre puede fluir hacia el cono de la aguja. No se recomienda aspirar activamente ya que cualquier movimiento adicional de la aguja podría provocar su desplazamiento y/o lesiones de la vena.
- Inyectar el volumen total en la vena de la cola en s 8-10.
- Inmediatamente Quite el ratón el limitador. Comprimir la inyección de la herida para menos de 30 s o hasta que el sangrado ceda.
- Coloque el ratón en una jaula separada. Una vez que el ratón se ha recuperado del procedimiento (unos 30-60 min), transferir el ratón a su jaula original. Compruebe en el ratón regularmente para las próximas 24 horas.
Nota: Sedación suave del ratón se observa rutinariamente hasta 2 h después de la inyección.
- Antes de proceder a los experimentos adicionales (es decir, paso 7), espere 10 a 15 días para el despacho de vectores no integradas.
7. inducción de CreER Transfected con tamoxifeno
PRECAUCIÓN: El tamoxifeno es perjudicial, puede ser canceroso o dañar la fertilidad. Por favor consulte la hoja de datos de seguridad.
- Plan de inyecciones intraperitoneales de tamoxifeno durante tres días consecutivos.
- El día 1, disolver 10 mg de tamoxifeno en etanol al 40 μl. Incubar a 55 ° C durante 10 minutos Vortex varias veces hasta que se disuelva el tamoxifeno.
- Añadir el aceite de maíz μl 960. Incubar por 5 minutos a 55 ° C. Vórtice varias veces para obtener una solución clara.
- Preparar la solución en una jeringa de insulina 1 mL con una aguja de 27 G.
- Pescuezo del ratón agarrando el cuello del ratón cuidadosamente con el pulgar y el dedo segundo, fijar la cola entre la base de la mano y los dedos cuarto y quinto.
- Inyectar 0.1 mL (= 1 mg de tamoxifeno) de la solución por vía intraperitoneal en el cuadrante inferior izquierdo del abdomen.
- Repetir las inyecciones en los días dos y tres.
8. inducción de genes dependientes de la tetraciclina o shRNA expresión
PRECAUCIÓN: La doxiciclina puede ser perjudicial. Por favor consulte la hoja de datos de seguridad.
Nota: Dependiendo del tipo y duración del experimento, doxiciclina puede suministrarse en el agua potable (paso 8.1) o chow (paso 8.2)
-
Para los experimentos a corto plazo (< 10 días) administrar doxiciclina a través de agua potable utilizando el siguiente protocolo.
- Disolver el sacarosa 5 g en 100 mL de agua. Autoclave.
- Disolver 100 mg de Doxiciclina hiclato en 5 mL de solución de sacarosa (paso 8.1.1) en un tubo cónico de 15 mL.
- Utilizando una jeringa de 10 mL, filtro estéril la solución mediante filtro 0.2 μm. Añadir a la solución de sacarosa preparada en el paso 8.1.1.
- Suministro de solución de sacarosa de doxiciclina como agua potable para el ratón. Compruebe diariamente y reemplazar cuando la solución se vuelve turbia indicando crecimiento excesivo bacteriano (Reemplace la solución clara después de tres días a más tardar).
- Para los experimentos de largo plazo (> 10 días) o experimentos sensibles a los cambios metabólicos, uso comercial doxiciclina-chow (por ejemplo, Doxiciclina hiclato Chow 0,625 g/kg) para evitar la deshidratación y los cambios inducidos por la sacarosa en los hígados de los animales tratados.
9. preparación de hígado de ratón para análisis por inmunotinción
PRECAUCIÓN: Paraformaldehído puede ser perjudicial. Por favor consulte la hoja de datos de seguridad.
Nota: El punto cuando se analizarán de ratones depende el experimento. Se recomienda analizar el tejido del hígado después de no menos de tres días de tratamiento doxiciclina para garantizar suficiente inducción de la expresión del transgen o shRNA.
- Preparar una jeringa de 1 mL con una aguja de 27 G con 1 mL de solución al 4% paraformaldehido (PFA).
- Eutanasia el ratón mediante un método adecuado según un protocolo aprobado del animal.
Nota: Las directrices para los métodos adecuados de la eutanasia pueden variar dependiendo de la institución.
- Con tijeras de disección y pinzas anatómicas, abra cuidadosamente la cavidad abdominal con una laparotomía mediana para exponer el hígado. Mover el intestino delgado hacia la derecha para exponer la vena porta y la vena cava inferior (IVC).
- Inserte la aguja de la jeringa preparada (ver paso 9.1) en la vena cava inferior y corte la vena porta. Inyectar 1 mL de PFA lentamente en la vena cava inferior para inundar el tejido del hígado y quitar auto-fluorescente glóbulos rojos (deseables si se realizará la coloración inmunofluorescente).
- Retirar el hígado. Enjuague con agua y traslado a 5 – 10 mL de solución 4% de la PFA.
- Para secciones de parafina, parche tejido para 36 a 48 h. tejido está listo para la deshidratación y la inclusión en parafina.
-
Para secciones congeladas, fijar tejido en 4% PFA durante 1 hora.
- Para crioprotección, transferencia a la solución de sacarosa al 10%. Incubar 60 min.
- Traslado a la solución de sacarosa al 20%. Incubar 60 min.
- Traslado a la solución de sacarosa al 30%. Incubar 12 – 16 h. Embed en la encajadura para secciones congeladas y congelar a-20 ° C.