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Utilizando el procedimiento descrito anteriormente es posible realizar un ensayo inmuno-DNA FISH en CTC (u otras células equivalentes) enriquecido por el alambre funcionalizado. Antes de configurar este protocolo, la compatibilidad de las dos técnicas fue determinada (inmuno-fluorescencia con pescado) sobre soportes 2D estándar. Se seleccionaron dos diferentes NSCLC líneas celulares expresan EpCAM (necesaria para adherirse al cable juntado con los anticuerpos contra EpCAM). Tienen un diverso estado ALK, que es útil para probar diferentes condiciones iniciales. La primera, NCI-H1975, tienen genes ALK de tipo salvaje (WT), mientras que el segundo, NCI-H3122, se caracteriza por desplazamientos de ALK.
Se utilizó un sistema de detección rotura aparte de gene ALK para el ensayo FISH. El sistema consta de dos sondas, uno (naranja) cruza por hibridación a la región proximal dentro de ALK en 23 p 2 y (verde) hibridación distal a ALK. Soporte 2D, inmuno-DNA FISH proporciona señales bien definidas para el anticuerpo y la punta de prueba (figura 2). En particular, tanto de células demostrada la localización de membrana EpCAM bien definido. Además, las señales de la sonda aparecían brillante y aguda: las células NCI-H1975 mostraron superposición sondas naranjas y verdes, confirmando el estado de tipo salvaje del gen ALK (Figura 2a, b). Por el contrario, las células NCI-H3122 demostraron señales superpuestas y solo puntos verdes, lo que refleja una canceladura del gene de ALK (figura 2C, d). Cuando se realizó el ensayo de inmuno-DNA FISH en el 3D ayuda alambre funcionalizado, señales de la sonda y el anticuerpo eran generalmente menos definidas que en el soporte 2D. EpCAM coloración era visible. ALK sonda señales eran menos definido pero aún refleja el estado esperado de ALK (figura 3). Los resultados mostraron que tinción de inmunofluorescencia no interfirió con las señales de ADN de peces. Las sondas hibridación específicamente con sus objetivos. Línea de celular NCI-H3122 mostró un estado aberrante del gene ALK (figura 3b), en contraste con NCI-H1975, con un gene de ALK de tipo salvaje (figura 3a).

Figura 1 : Funcionalizados alambre, arreglo esquemático de ALK break-apart sondas, esquema de patrones esperados de cambio de ALK y soporte especial. (a) rojo cajas de destacan las tres partes principales del alambre: funcionalizados punta, tapón de alambre y la punta no funcionalizado. La punta funcionalizada es la parte más delicada del alambre y no debe ser tocada durante la manipulación para evitar daño o desprendimiento de la célula. (b) el verdes y rojos las puntas de prueba cada que respectivamente se unen a secuencias ascendentes y descendentes de los lugares geométricos del gene de ALK (a la izquierda). A la derecha, se muestran patrones ejemplificativo de arreglos de ALK. Señales de localización Co rojo y verde en las células normales; las señales verdes y rojas separadas indican una rotura ALK gen cromosoma (translocación del gen ALK) y la señal de una colocalización de verde-naranja (célula aberrante-1). Una señal roja y dos señales verdes que indican la pérdida de una señal roja, lo que sugiere un desplazamiento cromosómico y una canceladura (célula aberrante-2). (c) alambre de soporte; Cajas rojas destacan las áreas donde se necesita cuidado al manipular el cable durante el análisis de microscopía. El cable puede someterse a un análisis de 360 °, girando el rotor. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2 : Ensayo de inmuno-ADN FISH en soporte 2D (cubreobjetos). (a, b) NCI-H1975 células débilmente positiva para EpCAM. FITC EpCAM señales eran apreciables. Las sondas de color naranjas y verdes de ALK break-apart comprometidos, confirmando el estado de la WT de gene de ALK en línea celular de NCIH1975. Mostrar más de dos señales apareadas las células estaban presentes debido a su aneuploide. (c, d) En la alta línea de celular de NCIH3122 expresando EpCAM, inmunofluorescencia señales eran brillantes, que se acentuó en las ensambladuras de la célula. PESCADO análisis confirmadas canceladuras del gene de ALK, típico de esta línea celular. Flechas rojas indican solo verdes las puntas de prueba (sin sondas naranja correspondientes), reflejando la canceladura del gene de ALK. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Inmuno-DNA FISH ensayo utilizando el alambre funcionalizado como soporte 3D. (un) representante de imagen de las células NCI-H1975 en el cable. Aunque la forma 3D de las células en el cable son difíciles de adquirir imágenes totalmente en el enfoque, EpCAM señal es bien visible en todas las células. imagen de (b) representante de las células NCI-H3122 en el cable. Sondas ALK demostraron la canceladura del gene (flechas rojas), como se ha visto en el soporte 2D. Las señales de fondo visibles eran probablemente debido a la presencia de la capa de polímero. Sin embargo, no afectó significativamente el análisis identificación o fluorescencia de la célula. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Tampón de | Composición | Nota | Existencias |
| Medio de cultivo completo celular | RPMI 1640 + 2 mM glutamina + 5-10% suero bovino fetal (FBS). | | RPMI: 4 ° C; Glutamina, FBS:-20 ° C |
| Tampón de dilución de anticuerpo | 1% de BSA, 0.3% Tritón X-100 en PBS 1 x | | Sello de excelencia con la película de laboratorio. |
| 20 x SSC solución | Cloruro de sodio de 3 M, citrato trisódico 300 mM disuelto en ddH20 | Filtrar la solución y el pH = 7.0 +-0.1 con ácido clorhídrico | Sello de excelencia con la película de laboratorio. |
| 0,4 x SSC solución | Diluir stock 20 x SSC en agua destilada H2O | Filtrar la solución y el pH = 7.0 +-0.1 con ácido clorhídrico | RT. |
Sello con la película de laboratorio.
2 x SSC + solución Tween 20 al 0,05%
Diluir la acción 20 x SSC en agua destilada H
2O + 0,05% Tween 20
Filtrar la solución y el pH = 7.0 +-0.1 con ácido clorhídrico
Sello de excelencia con la película de laboratorio.
DAPI solución 30 nM
Diluir la acción 1.43 μm en PBS 1 x
-20 ° C en estado oscuro listo para usar alícuotas
Tabla 1: Recetas de soluciones.