Microscopía de superresolución ha sido ampliamente utilizado para el estudio de las interacciones entre proteínas y estructuras subcelulares en muchos organismos. En organismos fotosintéticos, sin embargo, la resolución lateral de proyección de imagen de súper-resolución es sólo de ~ 100 nm. La baja resolución es principalmente debido al fondo de la autofluorescencia alta de células fotosintéticas causados por rayos láser de alta intensidad que se requieren para la proyección de imagen de súper-resolución, tales como microscopía óptica estocástica de la reconstrucción (tormenta). Aquí, describimos un asistida por photobleaching tormenta método desarrollado recientemente para la proyección de imagen la picocyanobacterium Marina Prochlorococcus. Después de photobleaching, el autofluorescence de Prochlorococcus es reducido por lo que la tormenta se puede realizar con una resolución lateral de ~ 10 nm. Usando este método, adquiere la organización en vivo tridimensional (3D) de la proteína FtsZ y caracterizar cuatro diferentes morfologías de anillo de FtsZ durante el ciclo celular de Prochlorococcus. El método que se describe aquí puede adoptarse para la proyección de imagen de súper-resolución de otros organismos fotosintéticos.