Resultados cuantitativos de LC-MS/MS se encuentran en forma de ion-cromatogramas para el cromatograma de iones totales (TIC) y los cromatogramas de iones extraídos (EIC) de transiciones específicas química productos químicos medidos (figura 1). El área de pico integrado de una transición química se relaciona con la abundancia compuesta y puede ser utilizado para calcular la concentración exacta utilizando una curva de calibración normalizada a un estándar interno (figura 2). Respuesta baja o plana de analitos individuales indica que el intervalo de calibración está fuera del rango lineal del espectrómetro de masas, o que el instrumento requiere de ajuste y calibración. Mala precisión de repeticiones indica un problema con la inyección de la muestra o cromatografía inconsistente que requiere modificación de los parámetros de la LC.
Análisis no-dirigido usando un análisis completo de MS1 produce un TIC para muestras (figura 3), que permite la generación ad hoc de EIC para los iones individuales (figura 4). Cualquier punto del tiempo cromatográfico dado contiene señales de especies químicas y cuando se utiliza un espectrómetro de masas alta resolución, la huella isotópica del compuesto. Identificación de compuestos a partir de la exploración de MS1 se realiza mediante programación de un algoritmo de peak-picking utilizando uno de varios enfoques38,39,40. Picking de picos rinde características químicas con una masa exacta medida y tiempo de retención cromatográficos, así como el espectro de masas de los iones y el área del pico cromatográfico. Esta información se almacena normalmente en un formato de base de datos digital para posterior procesamiento y filtrado, pero la naturaleza anidada e interconectada de los datos puede entenderse conceptualmente (figura 5).
Se filtra la lista de funciones para la reunión de varios criterios para ser seleccionado para la posterior investigación de compuestos. La primera y más sencilla es filtrado por defecto de masa (la diferencia entre la masa exacta de una función y su masa nominal). PFAS compuestos tienen defectos de masa negativo (figura 6) debido a su preponderancia de átomos de flúor y compuestos polifluorado defectos de masa positivas, pero substancialmente más pequeños que materiales orgánicos homólogo31,34 . Un segundo método de filtrado paso es identificar serie homóloga que contiene unidades que se repiten comunes a especies de caídas, como CF2 o CF2O. identificación de éstos se puede hacer con masa de Kendrick defecto parcelas17,36, o paquetes de software como R nontarget paquete35 (figura 7).
Después de filtrado, asignación de identidad química de la lista de observados altamente diferenciado o tentativamente por / polifluorado especies pueden comenzar. Masa exacta proporciona una lista relativamente pequeña de fórmulas químicas posibles para emparejar pero es insuficiente para la identificación sin la adición de coincidencia espectral al patrón de isótopos del espectro de masas41. De alta resolución MS1 datos, uno o más supuestos fórmulas químicas se compara con la huella isotópica del espectro de masas y anotó (figura 8). Fórmulas para emparejar puede ser generadas usando ab initio un grupo definido de átomos o puede ser origen de una combinación de literatura informó compuestos y el contenido de una o más bases de datos. Los anfitriones nos EPA química Dashboard (https://comptox.epa.gov/dashboard/) una lista constantemente actualizada de PFAS compuestos identificados por la agencia, así como las listas compilada por otras organizaciones como la de NORMAN Network42.
Fórmulas químicas se pueden confirmar aún más, y cierta información estructural se puede garnered de espectros MS/MS (figura 9). Estructuras del candidato son de química bases de datos grandes tales como el tablero de instrumentos de química EPA, Pubchem, el registro de CAS, etcetera. Espectros previstos pueden ser generados o adquirieron usando una variedad de programas de fragmentación y asignado,43 o espectros MS/MS pueden interpretarse manualmente.
Una matriz de datos de ejemplo está disponible en la información complementaria que contiene una matriz de toda característica de diez muestras (5 arriba, 5 abajo) recopilada aguas arriba y aguas abajo de una fuente puntual de fluoroquímicos. Cada fila representa una característica química con tiempo de retención asociada, masa neutra, espectro de masa y abundancia de materia prima para cada muestra. (Tabla suplementaria, hoja 1). Inicial de filtrado (Tabla suplementaria, hoja 2) para el defecto de masa negativa y significación estadística en un t-test no pareado entre aguas arriba y aguas abajo reducen el número de características "interesantes" química ~ 120. Fórmulas químicas previstas fueron obtenidos de Agilent IDBrowser y búsquedas contra el EPA Comptox productos químicos tablero de mandos, que volvió posible coincide con (Tabla suplementaria, hoja 3). El "top-hit" para cada fórmula química basada en fuentes de datos37 fue asignado (Tabla suplementaria, hoja 4). Tenga en cuenta que más de la mitad de las restantes características no tienen partidos de alta calidad. Características identificadas con ninguna coincidencia pueden ser el resultado de la formación en fuente fragmentación/aducción, pobre asignación fórmula, o la identificación de PFAS no se encuentra en la base de datos de origen. Interpretación de los espectros crudos con el fin de validar las tareas está fuera del alcance de este manuscrito, pero más información se puede encontrar en las obras citadas15,30,31,44, 45.
| ID | Nombre de la muestra | Tipo de muestra | STD Conc | Frasco | Método de LC | Método de MS |
| 1 | DB_001 | En blanco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 2 | DB_002 | En blanco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 3 | DB_003 | En blanco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 4 | DB_004 | En blanco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 5 | DB_005 | En blanco | | 1:, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 6 | FB | En blanco | | 1:, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 7 | 10 enfermedades de transmisión sexual | Estándar | 10 | 1:, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 8 | 25 enfermedades de transmisión sexual | Estándar | 25 | 1:, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 9 | 50 std | Estándar | 50 | 1:, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 10 | 100 std | Estándar | 100 | 1:, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 11 | 250 std | Estándar | 250 | 1:, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 12 | 500 std | Estándar | 500 | 1:, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 13 | 750 std | Estándar | 750 | 1:B, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 14 | 1000 std | Estándar | 1000 | 1:B, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 15 | DB_006 | En blanco | | 1:B, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 16 | SB_DUP1 | Analito | | 1:B, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 17 | SB_DUP2 | Analito | | 1:B, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 18 | Sitio SW 03 | Analito | | 1:B, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 19 | Sitio SW 16 | Analito | | 1:B, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 20 | Sitio SW 30 | Analito | | 1:B, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 21 | DB_007 | Analito | | 1: C, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 22 | Sitio SW 19 | Analito | | 1, 2: C | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 23 | Sitio SW 48 | Analito | | 1: C, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 24 | SW sitio 49 | Analito | | 1: C, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 25 | Sitio SW 05 | Analito | | 1, 5: C | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 26 | Sitio SW 47 | En blanco | | 1: C, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 27 | DB_008 | Analito | | 1: C, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 28 | 19_DUP sitio de SW | Analito | | 1: C, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 29 | Sitio SW 20 | Analito | | 1, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 30 | Sitio SW 21 | Analito | | 1, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 31 | SW sitio 46 | Analito | | 1, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 32 | Sitio SW 47 | Analito | | 1, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 33 | DB_009 | En blanco | | 1, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 28 | Sitio SW 32 | Analito | | 1, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 29 | Sitio SW 50 | Analito | | 1, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 30 | Sitio SW 25 | Analito | | 1, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 31 | 21_DUP sitio de SW | Analito | | 1:E, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 32 | Sitio SW 52 | Analito | | 1:E, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 33 | DB_010 | En blanco | | 1:E, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 34 | FB | En blanco | | 1:, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 35 | 10 enfermedades de transmisión sexual | Estándar | 10 | 1:, 3 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 36 | 25 enfermedades de transmisión sexual | Estándar | 25 | 1:, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 37 | 50 std | Estándar | 50 | 1:, 5 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 38 | 100 std | Estándar | 100 | 1:, 6 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 39 | 250 std | Estándar | 250 | 1:, 7 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 40 | 500 std | Estándar | 500 | 1:, 8 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 41 | 750 std | Estándar | 750 | 1:B, 1 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 42 | 1000 std | Estándar | 1000 | 1:B, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 43 | DB_011 | En blanco | | 1:B, 2 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
| 44 | DB_012 | En blanco | | 1:E, 4 | PFAS grad 400uL/min - 9 min run | PFCMXA + HFPO-DA MS/MS - 9 min |
Tabla 1: Ejemplo worklist para el análisis objetivo y cuantificación de las propuestas utilizando LC-MS/MS de
hora (min) 0 | % A (acetato de amonio 2,5 mM en MeOH 5%) 90 | % B (acetato de amonio 2,5 mM en el 95% MeOH) 10 |
| 5 | 15 | 85 |
| 5.1 | 0 | 100 |
| 7 | 0 | 100 |
| 7.1 | 90 | 10 |
| 9 | 90 | 10 |
Tabla 2: Gradiente de ejemplo para la separación de la LC en análisis específicos
| Capilary voltaje (kv) | 1.97 |
| Cono de voltaje (V) | 15 |
| Extractor de voltaje (V) | 3 |
| Lente de RF (V) | 0.3 |
| Temp de la fuente | 150 |
| Desolvation Temp | 40 |
| Desolvation Gas caudal (L/hr) | 300 |
| Flujo de Gas del cono (L/hr) | 2 |
Tabla 3: Parámetros de fuente de ionización para el análisis objetivo
| CMP | Precursor | Producto | Tiempo de permanencia | Cono de voltaje (V) | Energía de la colisión (eV) |
| PFBA | 212.80 | 168.75 | 0.01 | 15 | 10 |
| C 13 4-PFBA ES | 216.80 | 171.75 | 0.01 | 15 | 10 |
| PFPeA | 262.85 | 218.75 | 0.01 | 15 | 9 |
| PFBS ° 1 | 298.70 | 79.90 | 0.01 | 40 | 30 |
| PFBS ° 2 | 298.70 | 98.80 | 0.01 | 40 | 28 |
| PFHxA ° 1 | 312.70 | 118.70 | 0.01 | 13 | 21 |
| PFHxA ° 2 | 312.70 | 268.70 | 0.01 | 13 | 10 |
| 13C 2-PFHxA es | 314.75 | 269.75 | 0.01 | 13 | 9 |
| HFPO-DA 1° | 329.16 | 168.90 | 0.01 | 10 | 12 |
| HFPO-DA 2° | 329.16 | 284.90 | 0.01 | 10 | 6 |
| HFPO-DA ES DE 1° | 332.16 | 168.90 | 0.01 | 10 | 12 |
| HFPO-DA ES 2° | 332.16 | 286.90 | 0.01 | 10 | 6 |
| PFHpA ° 1 | 362.65 | 168.65 | 0.01 | 14 | 17 |
| PFHpA ° 2 | 362.65 | 318.70 | 0.01 | 14 | 10 |
| PFHxS ° 1 | 398.65 | 79.90 | 0.01 | 50 | 38 |
| PFHxS ° 2 | 398.65 | 98.80 | 0.01 | 50 | 32 |
| C 13 4-PFHxS es | 402.65 | 83.90 | 0.01 | 50 | 38 |
| PFOA ° 1 | 412.60 | 168.70 | 0.01 | 15 | 18 |
| PFOA ° 2 | 412.60 | 368.65 | 0.01 | 15 | 11 |
| C 13 4-PFOA ES | 416.75 | 371.70 | 0.01 | 15 | 11 |
| PFNA ° 1 | 462.60 | 218.75 | 0.01 | 15 | 17 |
| PFNA ° 2 | 462.60 | 418.60 | 0.01 | 15 | 11 |
| PFNA ES | 467.60 | 422.60 | 0.01 | 15 | 11 |
| PFOS ° 1 | 498.65 | 79.90 | 0.01 | 60 | 48 |
| PFOS ° 2 | 498.65 | 98.80 | 0.01 | 60 | 38 |
| C 13 4-PFOS ES | 502.60 | 79.70 | 0.01 | 60 | 48 |
| PFDA ° 1 | 512.60 | 218.75 | 0.01 | 16 | 18 |
| PFDA ° 2 | 512.60 | 468.55 | 0.01 | 16 | 12 |
| 13 2 - PFDA ES | 514.60 | 469.55 | 0.01 | 16 | 12 |
Tabla 4: Tabla de transición del ejemplo y parámetros de MS/MS para el contenido de experimentada-MXA, junto con HFPO-DA
hora (min) | % A (acetato de amonio 2,5 mM en MeOH 5%) | % B (acetato de amonio 2,5 mM en el 95% MeOH) |
| 0 | 90 | 10 |
| 0.5 | 90 | 10 |
| 3 | 50 | 50 |
| 3.5 | 50 | 50 |
| 5.5 | 40 | 60 |
| 6 | 40 | 60 |
| 7 | 0 | 100 |
| 11 | 0 | 100 |
Tabla 5: Gradiente de ejemplo para la separación de la LC en análisis no dirigidos
| Parámetro de profinder | Valor de ajuste |
| Extracción máxima altura filtro | 800 cuentas |
| Ion(s) permitido | -H / H |
| Modelo de isótopo de extracción característica | Moléculas orgánicas comunes |
| Estados de carga permitida | 2 - Jan |
| Compuesto iónico cuenta umbral | Dos o más iones |
| Tolerancia de alineación RT | 0,40 min + 0.0% |
| Tolerancia total alineación | 20,00 ppm + 2.0mDa |
| Post-Processing de altura absoluta de filtro | > = 10000 puntos en una muestra |
| Procesamiento posterior filtro de puntuación de MFE | > = 75 en una muestra |
| Algoritmo de integración de pico | 2 ágil |
| Máxima integración altura filtro | > = 5000 puntos |
| Buscar por filtro de altura absoluta de Ion | > = 7500 puntos en una muestra |
| Buscar por filtro de puntuación de Ion | > = 50.00 en una muestra |
Tabla 6: Característica Molecular extracción alineación configuración y software Profinder. Todos los valores conservan su configuración predeterminada para el procesamiento de datos.
| Umbral de la abundancia de iones | Umbrales de la característica | Umbral de replicar (n = 5) | Tiempo de ejecución | Funciones | Pasar el umbral de replicar | Pasar el umbral de CV | Características hasta el 90% de las TIC |
| 1 x S/N | 2000 | Ninguno | 8.15 | 987 | 505 | 421 | 91 |
| 2 x S/N | 5000 | Ninguno | 5.02 | 707 | 357 | 313 | 93 |
| 3 x S/N | 10000 | Ninguno | 2.3 | 308 | 249 | 230 | 93 |
| 1 x S/N | 2000 | 100% | 3.3 | 603 | 339 | 297 | 92 |
| 2 x S/N | 35000 | 100% | 1,58 | 310 | 248 | 229 | 93 |
| 3 x S/N | 10000 | 100% | 1.45 | 202 | 190 | 182 | 92 |
Tabla 7: Comparación del tiempo de procesamiento de la muestra e identificaciones de característica química para umbrales de extracción de características diferentes.

Figura 1 : Total cromatograma de iones y cromatogramas de iones extraídos de un subconjunto de estándares de éter perfluorado. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2 : Curvas de calibración representante para compuestos demostrando calidad decreciente de la curva analítica construcción. Panel de la izquierda indica una calibración de alta calidad; El panel central indica un compuesto con mala precisión en duplicados de preparación, particularmente en concentraciones más altas; Panel derecho indica una curva con mala precisión y un bajo rango dinámico lineal, dando por resultado una respuesta plana en el extremo superior de la gama de calibración y no hay señal detectable en el extremo inferior. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3 : Overlaid cromatogramas de iones totales (TIC) para aguas superficiales extractos recogidos aguas arriba y aguas abajo de un sitio de producción de fluoroquímicos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4 : Cromatogramas de iones extraídos (EIC) para todos identificaron características química de una muestra de agua superficial que contiene múltiples clases de fluoroquímicos. Cada rastro químico es un color diferente para la diferenciación de. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5 : Diagrama conceptual de la información cruda y prevista para una característica química identificada como ácido de dímero de oxido de hexafluoropropileno (HFPO-DA). Características químicas se compilan de extracción del software de datos de MS medidas y contienen cromatográficos (p. ej., tiempo de retención (RT)) e información de espectrometría de masas. Fórmula prevista, estructuras e identidades químicas se generan a partir de mediciones de materia prima para cada función. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 6 : Parcela de defecto de masa de elementos químicos identificados en un emisario de fabricación (rojo, izquierda) y agua de la superficie de referencia (azul, derecha). Compuestos fluorados caen cerca y por debajo de la punteada línea cero. Tenga en cuenta la persistente serie PFOS/PFOA en la muestra de agua de la superficie de fondo (derecha). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 7 : Parcela de defecto de masa masa vs no identificados características química de una muestra de agua superficial con serie homóloga identificado y etiquetado por el nontarget paquete R. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 8 : Espectro de masa de un desconocido características químicas con intensidades isotópicas previstas de tres fórmula química posible con el mismo monoisotopic Massachusetts Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 9 : Espectro de fragmentación de un éter perfluorado compuesto con anotado fragmento picos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 10 : Representación gráfica de los umbrales de filtrado. De izquierda a derecha, umbral de abundancia de ion para espectros de masas característica química, cuentan con umbral de abundancia para las características cromatográficas extraídos y replicar el umbral para la frecuencia de detección de función en un experimento de inyección por triplicado. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.