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El objetivo de este protocolo es detectar y cuantificar los cambios en la expresión de proteínas de una manera dependiente del ciclo celular utilizando células individuales aisladas de la epidermis de la piel del ratón. Hay siete pasos importantes: separación de la epidermis de la dermis, digestión de la epidermis, tinción de las poblaciones de células epidérmicas con cisplatino, código de barras de muestra, tinción con anticuerpos metálicos etiquetados para marcadores de ciclo celular y proteínas de interés, la detección de anticuerpos marcados con metal por citometría de masas y el análisis de la expresión en las distintas fases del ciclo celular. La ventaja de este enfoque sobre los métodos histológicos es el potencial de probar el patrón de expresión de >40 marcadores diferentes en una sola celda en diferentes fases del ciclo celular. Este enfoque también permite el análisis de correlación multivariante de la expresión de proteínas que es más cuantificable que los métodos histológicos/imágenes. La desventaja de este protocolo es que se necesita una suspensión de células individuales, lo que resulta en la pérdida de información de ubicación proporcionada por la tinción de secciones de tejido. Este enfoque también puede requerir la inclusión de marcadores adicionales para identificar diferentes tipos de células en suspensiones de células brutas. La aplicación de este protocolo es evidente en el análisis de modelos de enfermedades hiperplásticas de la piel. Además, este protocolo se puede adaptar para el análisis de un subtipo específico de células (por ejemplo, células madre) mediante la adición de anticuerpos específicos de linaje. Este protocolo también se puede adaptar para el análisis de células de la piel en otras especies experimentales.