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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Describimos protocolos para preparar ovocitos y purificar esporozoitos para el estudio de la infección de organoides intestinales y de las vías respiratorias humanas por Cryptosporidium parvum. Demostramos los procedimientos para la microinyección de parásitos en el lumen organoide intestinal y la inmunomancha ción de organoides. Por último, describimos el aislamiento de los ovocitos generados de los organoides.
Cryptosporidium parvum es una de las principales causas de la enfermedad diarreica humana. Para entender la patología del parásito y desarrollar fármacos eficientes, se necesita un sistema de cultivo in vitro que recapitula las condiciones en el huésped. Los organoides, que se asemejan mucho a los tejidos de su origen, son ideales para estudiar las interacciones huésped-parásito. Los organoides son estructuras tridimensionales (3D) derivadas del tejido que se derivan de células madre adultas y crecen en cultivo durante largos períodos de tiempo sin someterse a ninguna aberración o transformación genética. Tienen una polaridad bien definida con superficies apicales y basolaterales. Los organoides tienen varias aplicaciones en pruebas de drogas, biobanca, y modelado de enfermedades y estudios de interacción huésped-microbio. Aquí presentamos un protocolo paso a paso de cómo preparar los ovocitos y esporozoítos de Cryptosporidium para infectar los organoides intestinales y de las vías respiratorias humanas. A continuación, demostramos cómo se puede utilizar la microinyección para inyectar los microbios en el lumen organoide. Existen tres métodos principales por los que los organoides se pueden utilizar para los estudios de interacción huésped-microbio: microinyección, cizallamiento mecánico y chapado, y mediante la fabricación de monocapas. La microinyección permite el mantenimiento de la estructura 3D y permite un control preciso de los volúmenes del parásito y el contacto lateral apical directo para los microbios. Proporcionamos detalles para el crecimiento óptimo de organoides para la creación de imágenes u ovocitos. Por último, también demostramos cómo los ovocitos recién generados se pueden aislar del organoide para un mayor procesamiento y análisis aguas abajo.
El desarrollo de fármacos o vacunas para el tratamiento y la prevención de la infección por Cryptosporidium se ha visto obstaculizado por la falta de sistemas in vitro que imitan con precisión la situación in vivo en los seres humanos1,2. Muchos de los sistemas disponibles actualmente sólo permiten la infección a corto plazo (<5 días) o no soportan el ciclo de vida completo del parásito3,4. Otros sistemas que permiten el desarrollo completo del parásito se basan en líneas celulares inmortalizadas o líneas celulares cancerosas que no recapitulan fielmente la situación fisiológica en los seres humanos5,6,7 . Los organoides o 'mini-órganos' son estructuras derivadas de tejido 3D que se cultivan en una matriz extracelular complementada con varios factores de crecimiento específicos del tejido. Los organoides se han desarrollado a partir de diversos órganos y tejidos. Son genéticamente estables y recapitulan la mayoría de las funciones de los órganos de su origen, y pueden mantenerse en cultivo durante largos períodos de tiempo. Hemos desarrollado un método para infectar los organoides intestinales y pulmonares humanos con Cryptosporidium que proporciona un modelo in vitro preciso para el estudio de las interacciones huésped-parásito relevantes para la criptosporidiosis intestinal y respiratoria8 ,9,10,11,12,13. A diferencia de otros modelos de cultivo publicados, el sistema organoide es representativo de las interacciones del parásito huésped de la vida real, permite completar el ciclo de vida para que se puedan estudiar todas las etapas del ciclo de vida del parásito y mantiene la propagación del parásito hasta 28 días10.
Cryptosporidium parvum es un parásito apicomplexiano que infecta el epitelio de las vías respiratorias e intestinales, causando una enfermedad diarreica prolongada. La etapa ambiental resistente es el ovocitos, que se encuentra en los alimentos contaminados y el agua14. Una vez ingeridos o inhalados, el ovocitos y libera cuatro esporozoitos que se unen a las células epiteliales. Los esporozoítos se deslizan sobre las células de los huésped y atraen a los receptores de células huésped, pero el parásito no invade completamente la célula, y parece inducir a la célula huésped a engullirla15. El parásito, que se internaliza dentro de un compartimento intracelular pero extractitoplasma, permanece en la superficie apical de la célula, replicando dentro de una vacuola parasitoforosa. Se somete a dos rondas de reproducción asexual, un proceso llamado merogonía. Durante la merogonía, se desarrollan merontas tipo I que contienen ocho merozoitas que se liberan para invadir nuevas células. Estos merozoítos invaden nuevas células para convertirse en merontas de tipo II que contienen cuatro merozoitas. Estos merozoítos, cuando se liberan, infectan las células y se convierten en macrogamontes y microgamontes. Los microgametos se liberan y fertilizan los macrogametos que producen cigotes que maduran en ovocitos. Los ovocitos maduros se liberan posteriormente en el lumen. Los ovocitos son de paredes delgadas que se exquistan inmediatamente para reinfectar el epitelio, o paredes gruesas que se liberan en el medio ambiente para infectar al siguiente huésped14. Todas las etapas del ciclo de vida de Cryptosporidium han sido identificadas en el sistema de cultivo organoide previamente desarrollado por nuestro grupo10.
Dado que los organoides humanos replican fielmente los tejidos humanos9,11,13, y apoyan todas las etapas replicativas de Cryptosporidium10,son el sistema de cultivo de tejido ideal para estudiar Biología criptosporidio e interacciones huésped-parásito. Aquí describimos los procedimientos para infectar organoides con ovocitos de Cryptosporidium y esporozoitos exquistes, y aislar los nuevos ovocitos producidos en este sistema de cultivo de tejidos.
Todo el manejo y resección de tejidos se realizó bajo protocolos aprobados por la Junta de Revisión Institucional (IRB) con el consentimiento del paciente.
1. Preparación de C. parvum Oocysts for Injection
NOTA: Los ovocitos de Cryptosporidium se compraron en una fuente comercial (ver la Tabla de Materiales). Estos ovocitos se producen en terneros y se almacenan en solución salina con fosfato tampón (PBS) con antibióticos. Se pueden almacenar durante unos 3 meses a 4 oC y nunca deben congelarse. Normalmente usamos ovocitos dentro de un mes. Los organoides pueden estar infectados con ovocitos intactos, o los esporozoitos pueden aislarse de los ovocitos exquistes y utilizarse para infectar organoides si es importante no tener oocistos de arrastre del inóculo original.
2. In Vitro Purificación de Esporozoritas de C. parvum Oocysts
3. In Vitro Culture of Human Intestinal and Lung Organoids for Microinjection
4. Microinyección de oquistes/esporozoitos en el Lumen Organoide
5. Mancha de inmunofluorescencia de los organoides
6. Aislamiento de los ovocitos de los organoides
Los protocolos presentados aquí dan como resultado la purificación eficiente de ovocitos y esporozoitos(Figura 1A)listos para la microinyección. El protocolo de excystation da como resultado la liberación de esporozoitos de aproximadamente el 70-80% de los ovocitos, por lo tanto, es esencial filtrar los ovocitos y conchas restantes a través de un filtro de 3 m. La filtración da como resultado una purificación de casi 100% esporozoita(Figura 1B). Además, la adición de un tinte verde ayuda a asegurar la inyección de todos los organoides y permite la visualización de organoides inyectados durante al menos 24 h después de la inyección(Figura 2B).
Estos protocolos para la preparación de ovocitos y esporozoítos son sencillos y se han utilizado durante muchos años, por lo que se espera que los ovocitos tratados y los esporozoitos purificados sean viables e infecciosos. Sin embargo, en nuestros estudios, utilizamos microscopía electrónica de barrido para asegurar que el proceso de excestación no dañó los esporozoitos u ovocitos(Figura 2A)10. La inyección de cantidades iguales de ovocitos en el lumen organoide puede confirmarse visualmente mediante imágenes microscópicas simples(Figura 2C). Una porción de organoides infectados debe configurarse para verificar la propagación de parásitos por PCR cuantitativo como hemos descrito10.
El progreso a través del ciclo de vida del parásito se puede visualizar mediante la recopilación de organoides infectados en diferentes puntos de tiempo después de la infección y el análisis por microscopía electrónica de transmisión o por inmunofluorescencia combinada con 4o,6-diamidino-2-fenilindolo ( DAPI) tinción de núcleos parásitos10. Por ejemplo, se pueden utilizar anticuerpos contra antígenos superficiales de merozoita, como gp40 y gp1517 para identificar etapas merontas; los meronts de tipo I tendrán 8 núcleos y merontas de tipo II, 4 núcleos10. Recientemente, un panel de anticuerpos monoclonales específicos de trophozoites, merozoites, tipo I frente a ii meronts, y macrogamonts ha estado disponible18. Estos anticuerpos también serían muy eficaces para marcar el progreso del parásito a través de sus diversas etapas del ciclo de vida en los organoides.
Los ensayos de inmunofluorescencia también se pueden utilizar para explorar qué tipos de células están infectadas por Cryptosporidium. Esto era especialmente importante para mirar en los organoides de las vías respiratorias como muy poco se sabe acerca de la criptosporidiosis respiratoria, y la célula huésped exacta para el parásito no se conocía. Realizamos ensayos de inmunofluorescencia en organoides infectados por Cryptosporidium,colocalizando CC10, un marcador para las células del club y encontramos que Cryptosporidium infectó células CC10- negativas y positivas(Figura 3). Estos resultados fueron corroborados por TEM en los que observamos Cryptosporidium infectando células secretoras y no secretoras en los organoides de las vías respiratorias10.
Después de que los organoides diferenciados se han infectado durante cinco días, debe haber un número significativo de ovocitos que se producen. En nuestras manos, la infección de organoides de una placa de seis pocillos produjo alrededor de 4000 ovocitos, que podrían ser fácilmente identificados y contados en un hemocitómetro mediante el etiquetado con un anticuerpo específico de ovis. La presencia de cuatro esporozoitos en los ovocitos podría confirmarse secando una porción de los ovocitos en una corredera adhesiva, fijando con metanol y combinando la tinción DAPI con un anticuerpo específico de ovocitos(Figura 4). La verificación de la producción de ovocitos de paredes gruesas podría realizarse mediante el análisis TEM10.

Figura 1: Preparación y purificación de ovocitos y esporozoítos de Cryptosporidium. (A) Representación esquemática del método utilizado para la preparación de ovocitos y esporozooítos para la infección. (B) Imagen que muestra la excestación in vitro de ovocitos. La filtración de ococitos y conchas no exquistadas proporciona una solución purificada de esporozoítos. Barra de escala a 10 m. Por favor, haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Microinyección de ovocitos en el lumen organoide. Esta cifra ha sido modificada de Heo et al.10. (A) escanear imágenes de microscopía electrónica (SEM) de ovocitos y esporozoitos. (B) Imagen que muestra organoides inyectados con ovis. El tinte verde ayuda a visualizar la inyección de cada organoide y persiste durante al menos 24 h. (C) Imagen de un organoide inyectado con ovocitos. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Imagen de inmunofluorescencia del organoide infectado por Cryptosporidium. Mucina está etiquetada con anticuerpo anti-mucina 5 (rojo) en el lumen del organoide, las células del club están etiquetadas con anti-CC10 (amarillo), Cryptosporidium se detecta con anticuerpo específico de oocisto (verde), y los núcleos celulares se tiñen con DAPI (azul). El panel B es una ampliación del área indicada en el cuadrado en el panel A. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Imagen de inmunofluorescencia del ovis aislado de organoides intestinales diferenciados. La pared de Ooccyst está etiquetada con anticuerpoespecífico sorquista en verde y los cuatro núcleos de esporozoita se visualizan con DAPI (azul) Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Los autores no tienen nada que revelar.
Describimos protocolos para preparar ovocitos y purificar esporozoitos para el estudio de la infección de organoides intestinales y de las vías respiratorias humanas por Cryptosporidium parvum. Demostramos los procedimientos para la microinyección de parásitos en el lumen organoide intestinal y la inmunomancha ción de organoides. Por último, describimos el aislamiento de los ovocitos generados de los organoides.
Estamos agradecidos a Deborah A. Schaefer de la Escuela de Ciencias Biomédicas Animales y Comparadas, Facultad de Agricultura y Ciencias de la Vida, Universidad de Arizona, Tucson, AZ, EE. UU. por ayudarnos con la producción y análisis de ovocitos. También agradecemos a Franceschi Microscopy and Imaging Center y a D.L. Mullendore de la Universidad Estatal de Washington por la preparación de TEM y la toma de imágenes de ovocitos organoides aislados.
D.D. es beneficiario de una subvención VENI de la Organización Neerlandesa de Investigación Científica (NWO-ALW, 016.Veni.171.015). I.H. es galardonado con una beca VENI de la Organización Neerlandesa de Investigación Científica (NWO-ALW, 863.14.002) y recibió el apoyo de becas Marie Curie de la Comisión Europea (Propuesta 330571 FP7-PEOPLE-2012-IIF). La investigación que ha llevado a estos resultados ha recibido financiación del Consejo Europeo de Investigación en virtud del Acuerdo Avanzado de Subvenciones DEL ERC no 67013 y del NIH NIAIH en virtud de R21 AT009174 a RMO. Este trabajo es parte del Instituto Oncode, que es financiado en parte por la Sociedad Holandesa contra el Cáncer y fue financiado por una subvención de la Sociedad Holandesa contra el Cáncer.
| Extracto de membrana basal (matriz extracelular) | amsbio | 3533-010-02 | |
| Anticuerpo Crypt-a-Glo (anticuerpo específico de ooquiste) | Waterborne, Inc | A400FLR-1X | Concentración final = Use 2-3 gotas/diapositiva |
| Crypto-Grab IgM recubierta de perlas magnéticas | Waterborne, Inc | IMS400-20 | |
| Bastidor Dynamag 15 | Thermofisher Scientific | 12301D | |
| Dynamag 2 bastidor | Thermofisher Scientific | 12321D | |
| EMD Millipore Filtros de membrana de policarbonato isopore- 3µ m | EMD-Millipore | TSTP02500 | |
| Tinte verde rápido | SIGMA | F7252-5G | |
| Microinyector Femtojet 4i | Eppendorf | 5252000013 | |
| Capilares de vidrio de 1 mm de diámetro | WPI | TW100F-4 | |
| Matrigel (matriz extracelular) | Corning | 356237 | |
| Tubo de microfuga 1,5 mL | Eppendorf | T9661-1000EA | |
| Puntas de microcargador | Eppendorf | 612-7933 | |
| Extractor de micropipetas P-97 | Instrumento de obturación | P-97 | |
| Suero de burro normal | Bio-Rad | C06SB | |
| Penstrep | Gibco | 15140-122 | |
| Hipoclorito de sodio (usar 5%) | Clorox | 50371478 | |
| Correderas Super stick | Waterborne, Inc | S100-3 | |
| Swinnex-25 47 mm Portafiltros de policarbonato | EMD-Millipore | SX0002500 | |
| Ácido taurocólico sodio sal hidrato | SIGMA | T4009-5G | |
| Tween-20 | Merck | 8221840500 | |
| Agente de montaje Vectashield | Vector Labs | H-1000 | |
| Vortex Genie 2 | Industrias científicas, Inc | SI0236 | |
| DMEM | Invitrogen | 12634-010 | 500 mL |
| Penstrep | Gibco | 15140-122 | 5 mL de stock en 500 mL DMEM |
| Glutamax | Gibco | 35050038 | 5 mL de stock en 500 mL DMEM |
| Hepes | Gibco | 15630056 | 5 mL de stock en 500 mL DMEM |
| fuerte> | fuerte>Concentración final | ||
| A83-01 | Tocris | 2939-50mg | 0.5 y micro; M |
| Adv+++ | Preparación de hasta 100 mL | ||
| B27 | Invitrogen | 17504044 | 1x |
| EGF | Peprotech | AF-100-15 | 50 ng/mL |
| Gastrin | Tocris | 3006-1mg | 10 nM |
| NAC | Sigma | A9125-25G | 1.25 mM |
| NIC | Sigma | N0636-100G | 10 mM |
| Noggin CM | En casa* | 10% | |
| Inhibidor de P38 (SB202190) | Sigma | S7076-25 mg | 10 y micro; M |
| PGE2 | Tocris | 2296/10 | 10 nM |
| Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | 1 mL/500 mL medios |
| RSpoI CM | En casa* | 20% | |
| Wnt3a CM | En casa* | 50% | |
| En la casa* - se proporcionarán líneas celulares a pedido | |||
| Para diferenciar los organoides, los organoides del intestino delgado en expansión se cultivaron en un medio rico en Wnt durante seis a siete días después de la división, y luego se cultivaron en un medio de diferenciación (retiro de Wnt, nicotinamida, SB202190, en un medio de diferenciación (retiro de Wnt, nicotinamida, SB202190, prostaglandina E2 de un medio rico en Wnt u OME) | |||
| Adv+++ | Preparación de hasta 100 mL | ||
| ALK-I A83-01 | Tocris | 2939-50mg | 500 nM |
| B27 | Invitrogen | 17504044 | 0.07638888889 |
| FGF-10 | Peprotech | 100-26 | 100 ng/mL |
| FGF-7 | Peprotech | 100-19 | 25 ng/mL |
| N-acetilcisteína | Sigma | A9125-25G | 1.25 mM |
| Nicotinamida | Sigma | N0636-100G | 5 mM |
| Noggin UPE | U-Protein Express | Contactar con la empresa directamente | 10% |
| p38 MAPK-I | Sigma | S7076-25 mg | 1 y micro; M |
| Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | 1:500 |
| RhoKI Y-27632 | Abmole Bioscience | M1817_100 mg | 2.5 µ m |
| Rspo UPE | U-Protein Express | Contactar directamente | con la empresa10% |
| L-Glutatión reducido | Sigma | G4251-10MG | 0.5 μ g/μ L de OME/OMD/LOM |
| Betaína | Sigma | 61962 | 0,5 μ g/μ L de OME/OMD/LOM |
| L-Cisteína | Sigma | 168149-2.5G | 0.5 μ g/μ L de ácido linoleico OME/OMD/LOM |
| Sigma | L1376-10MG | 6.8 μ g/mL de OME/OMD/LOM | |
| Taurina | Sigma | T0625-10MG | 0.5 μ g/μ L de tampón bloqueante < OME/OMD/LOMfuerte |
| > (para la tinción por inmunofluorescencia) | |||
| Burro/Suero de cabra | Bio-Rad | C06SB | 2% |
| PBS | Thermo-Fisher | 70011044 | Fabricación de hasta 100 mL |
| Tween 20 | Merck | P1379 | 0.1% |
| Alexa 568 cabra anti-conejo | Invitrogen | A-11011 | Dilución-1:500; RRID: AB_143157 |
| Kit completo Crypt-a-Glo- Anticuerpo marcado con fluoresceína Crypto-Glo | Waterborne, Inc | A400FLK | Dilución- 1:200 |
| Crypta-Grab IMS Beads- Perlas magnéticas recubiertas de anticuerpo monoclonal reactivo | Waterborne, Inc | IMS400-20 | Dilución-1:500 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D1306 | Dilución-1:1,000; RRID : AB_2629482 |
| Phalloidin-Alexa 674 | Invitrogen | A22287 | Dilución-1:1.000; RRID: AB_2620155 |
| Anticuerpo anti-gp15 de conejo generado por R. M. O' Connor (coautor). | A petición | A petición | Dilución-1:500 |
| Sporo-Glo | Waterborne, Inc | A600FLR-1X | Dilución- 1:200 |