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Artículo de método

Aplicaciones para paneles de iluminación compatibles con microplacas de código abierto

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DOI:

10.3791/60088

3 de octubre de 2019

En este artículo

Resumen

Microplate Assistive Pipetting Light Emitter (M.A.P.L.E.) es un dispositivo accionado por computadora que ilumina sistemáticamente los pozos de microtíter para proporcionar orientación para la preparación manual de microplacas.  M.A.P.L.E. mejora la precisión de la preparación de microplacas al tiempo que automatiza el mantenimiento de registros de datos.  Además, puede ayudar con el examen de la calidad de la microplaca o ayudar en la detección de errores.

Resumen

Las microplacas se utilizan comúnmente en el entorno de laboratorio moderno para una amplia variedad de tareas tanto en operaciones de sobremesa de laboratorio a pequeña escala como en campañas de cribado de alto rendimiento (HTS) a gran escala. Aunque la automatización de laboratorio ha aumentado considerablemente la utilidad de las microplacas, siguen existiendo casos en los que la instrumentación basada en automatización no es factible, rentable o compatible con las necesidades de formato de microplacas. En estos casos, las microplacas deben prepararse manualmente. La problemática de las manipulaciones manuales de microplacas es que pueden surgir una serie de dificultades relacionadas con el seguimiento preciso de las operaciones de muestra, el mantenimiento de registros de datos y la inspección de control de calidad (QC) para artefactos de pozos o errores de formato. A medida que aumentan las densidades de pozos de microplacas (es decir, 96 pocillos, 384 pocillos, 1536-bien) también aumenta drásticamente la posibilidad de introducir errores.  Además, para las pequeñas operaciones de laboratorio de sobremesa existe la necesidad de mejorar la facilidad y precisión de la manipulación de muestras de una manera rentable. Aquí, describimos un sistema que actúa como una guía de pipeteo semi-automatizada conocida como el Emisor de Luz de Pipeteo Assistivo Microplaca (M.A.P.L.E.).  M.A.P.L.E. tiene múltiples usos para apoyar la recolección de impactos compuestos y la preparación de microplacas para el desarrollo de ensayos en pruebas de alto rendimiento o operaciones de sobremesa de laboratorio, así como la evaluación de diagnóstico de control de calidad (QA) de microplacas calidad o visualizar errores de formato de pozos.

Introducción

Como se publicó recientemente1, el laboratorio de identificación de plomo de Scripps Research2 ha desarrollado y publicado un panel de iluminación de código abierto para la preparación de microplacas, conocido como emisor de luz de pipeteo de asistencia microplaca (M.A. P.L.E.). La preparación manual de microplacas, ya sea para la gestión de compuestos o las necesidades de bioensayo, puede ser propensa a errores humanos que aumentan drásticamente, así como la densidad de la microplaca aumenta. Además, el mantenimiento de registros adecuado y el registro de datos del contenido/formato de microplacas también son propensos ....

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Protocolo

1. Preparación semiautomática de transferencia de muestras "placa a placa"

  1. Genere un archivo CSV como se muestra en la Figura 1 que contiene las placas de origen y de destino mediante una aplicación de edición de hojas de cálculo. El archivo CSV que se genera debe tener las siguientes columnas de encabezado en el orden indicado: Source_barcode; Destination_barcode; Source_well; Dest_well; Transfer_volume.
  2. En las columnas de encabezado, asegúrese de incluir una fila en el archivo CSV para cada operación de pipeteo deseada (es decir, transferencia de muestra) con la siguiente información:
    1. Source_barcode: código d....

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Resultados

La plataforma M.A.P.L.E. es capaz de iluminar pozos en microplacas de 96 y 384 pocillos en una variedad de formas configurables por el usuario, permitiendo un control directo e independiente del color y la intensidad de la luz en cada pocómetro. Al ayudar a reducir las oportunidades de error en las operaciones de pipeteo manual, M.A.P.L.E. ayuda a los usuarios a preparar microplacas con mayor confianza en que cada pozo contiene el contenido deseado. La transferencia de muestras entre placas y la preparación de placas de .......

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Discusión

Al lanzar M.A.P.L.E. como una plataforma de código abierto, hemos introducido una herramienta de laboratorio que proporciona utilidad, pero también se puede ampliar fácilmente para satisfacer las necesidades cambiantes del usuario final. La preparación de muestras de microplacas de sobremesa es una tarea común que se realiza en una amplia variedad de entornos de laboratorio y esta tarea se puede mejorar demostrablemente con una tecnología como M.A.P.L.E.

La plataforma M.A.P.L.E. ha sido diseña.......

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Divulgaciones

Los autores no tienen intereses financieros ni conflictos de intereses con ninguno de los componentes fabricados sugeridos en la construcción del dispositivo M.A.P.L.E. Las fuentes presentadas son estrictamente para la comodidad del usuario y cualquier componente compatible de fuentes alternativas se puede utilizar según sea necesario.

Agradecimientos

Los autores quieren reconocer a Lina DeLuca, Fakhar Singhera, Hannah Williams, Lynn Deng, Osinachi Nwosu y Sarah Wachtman por su ayuda en la prueba de la plataforma M.A.P.L.E.

....

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
de96 o 384 pocillos
Emisor de luz de pipeteo de asistencia de microplacapipeta
Óptica OceánicaUSB-650 Marea
Microplaca https://en.wikipedia.org/wiki/MicroplateEspectrómetro de https://www.jove.com/science-education/5033/an-introduction-to-the-micropipettor de de https://github.com/pierrebaillargeon/Microplate-Assistive-Pipetting-Light-Emitter de código abierto Roja

Referencias

  1. Baillargeon, P., et al. Design of Microplate-Compatible Illumination Panels for a Semiautomated Benchtop Pipetting System. SLAS TECHNOLOGY: Translating Life Sciences Innovation. , (2019).
  2. Baillargeon, P., et al.

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Reimpresiones y permisos

Etiquetas

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