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Se ha utilizado un método combinado de homogeneidad regional (ReHo) y conectividad funcional (FC), un tipo de método de resonancia magnética funcional (fMRI) no invasivo, para evaluar los cambios sincrónicos en la actividad neuronal en la retinosis pigmentaria (RP). El propósito de este estudio es describir nuestro método para el análisis de las sincronizaciones intra e interregionales de los cambios en la actividad neuronal en pacientes con RP. Las ventajas del método combinado de ReHo y FC son que no es invasivo y es lo suficientemente sensible como para investigar los cambios en la actividad neuronal sincrónica cerebral in vivo. Aquí, 16 pacientes con RP y 14 controles sanos estrechamente emparejados en edad, sexo y educación se sometieron a resonancias magnéticas funcionales en estado de reposo. Se realizaron dos pruebas t de muestra para comparar ReHo y FC en todos los grupos. Nuestros resultados mostraron que la desconexión de la red visual y la reorganización de la vía retino-talamocortical y del flujo visual dorsal ocurrieron en los pacientes con RP. Aquí, describimos los detalles de este método, su uso y el impacto de sus parámetros clave de manera paso a paso.