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Los begomovirus (género Begomovirus,familia Geminiviridae)son transmitidos por las moscas blancas del complejo Bemisia tabaci de una manera persistente y circulativa. Teniendo en cuenta los extensos daños causados por los begomovirus a la producción de cultivos en todo el mundo, es imperativo entender la interacción entre los begomovirus y su vector de mosca blanca. Para ello, la localización y cuantificación del virus en los tejidos vectoriales es crucial. Aquí, utilizando el virus del rizo de hoja amarilla de tomate (TYLCV) como ejemplo, describimos un protocolo detallado para localizar begomovirus en las moscas blancas, glándulas salivales primarias y ovarios por inmunofluorescencia. El método se basa en el uso de anticuerpos específicos contra una proteína de capa de virus, anticuerpos secundarios etiquetados con tinte y un microscopio confocal. El protocolo también se puede utilizar para colocalizar proteínas begomovirales y de mosca blanca. Además, describimos un protocolo para la cuantificación de TYLCV en las moscas blancas, las glándulas salivales primarias, la hemolinfa y los ovarios por PCR cuantitativo (qPCR). Utilizando imprimaciones diseñadas específicamente para TYLCV, los protocolos para la cuantificación permiten la comparación de la cantidad de TYLCV en diferentes tejidos de la mosca blanca. El protocolo descrito es potencialmente útil para la cuantificación de begomovirus en el cuerpo de una mosca blanca y una planta infectada por el virus. Estos protocolos se pueden utilizar para analizar la vía de circulación de begomovirus en la mosca blanca o como complemento a otros métodos para estudiar las interacciones entre mosca blanca y begomovirus.