Ha habido un aumento dramático en el interés científico y popular sobre la contribución de la microbiota intestinal a la salud animal. La microbiota, formada por bacterias, virus, hongos y arqueas que habitan diferentes nichos en el intestino del animal, está implicada directa o indirectamente en la regulación de enfermedades inflamatorias, infecciosas y metabólicas que afectan no solo a las especies de mamíferos sino también al ganado, como las avesde corral 1. Se desarrollaron varios modelos animales para estudiar mejor la contribución de la microbiota intestinal a la salud y la enfermedad. Por ejemplo, los animales libres de gérmenes y gnotobióticos permiten estudiar la ausencia completa de microbios o de una microbiota conocida, respectivamente, sobre la fisiopatología de las infecciones 2,3. Sin embargo, generar y mantener estos animales requiere técnicas e instalaciones especializadas, y los costos, la mano de obra y las habilidades requeridas para mantenerlos limitan su acceso a muchos investigadores. De hecho, los animales libres de gérmenes deben ser monitoreados regularmente para detectar una posible contaminación utilizando una combinación de métodos de cultivo de bacterias, microscopía, serología, morfología gruesa y técnicas de detección basadas en secuenciación. Procedimientos similares también se aplican a otras especies, como el ganado, donde los animales son generalmente más grandes y requieren instalaciones más grandes para su cría y mantenimiento, lo que puede obstaculizar, en cierta medida, la investigación sobre la microbiota.
Las aves de corral, más específicamente los pollos, son la piedra angular de la producción ganadera en todo el mundo, con una población de bandadas que puede superar los 40 mil millones de aves por año. Es la fuente más importante de proteína animal en el mundo (http://www.fao.org/poultry-production-products/en/). Además, no hay tabúes culturales o religiosos asociados a la cría o el consumo de pollos. La microbiota intestinal de las aves de corral está involucrada de manera importante en el crecimiento de los animales, la relación de conversión alimenticia, la inmunidad, la resistencia a los patógenos, entre muchos otros procesos nutricionales, fisiológicos o patológicos4. Por lo tanto, la generación de pollos libres de gérmenes es indispensable para subrayar el diálogo entre la microbiota y su huésped4. Incluso si las comunidades microbianas habitan en el oviducto del pollo5, el contenido de un huevo recién puesto por una gallina sana está en su mayoría libre de microorganismos, la cáscara del huevo y las membranas poseen barreras mecánicas para evitar la invasión de microorganismos4. Además, los polluelos se crían fácilmente en ausencia de sus parientes, lo que, a diferencia de los mamíferos, permite la producción de animales libres de gérmenes sin la crianza de los padres en condiciones estériles.
La instalación experimental "Infectiology of Farm, Model and Wild Animals" (PFIE, UE-1277, Centre INRAE Val de Loire, Nouzilly, Francia, https://doi.org/10.15454/1.5572352821559333e12) forma parte de la Red Nacional de Infraestructuras de Francia EMERG'IN (https://www.emergin.fr/). PFIE ha dominado la producción de pollos libres de gérmenes para realizar diversos estudios experimentales durante más de 40 años 7,8,9,10,11. Estos animales se produjeron a partir de huevos específicos libres de patógenos (SPF) a partir de una línea de puesta de leghorn blanco criada en cría cerrada desde la década de 1970. Utilizadas principalmente para estudios microbiológicos 7,8,9, las aves libres de gérmenes están experimentando un resurgimiento de interés con preguntas como la contribución de la microbiota intestinal al comportamiento13, la utilización de nutrientes14, el desarrollo inmunológico15 y la actividad endocrina. Incluso si algunos estudios se han publicado utilizando líneas de pollos de engorde libres de gérmenes16, estos estudios siguen estando subrepresentados en comparación con los estudios que utilizan líneas de capas experimentales. La evolución de las cuestiones científicas hacia la diafonía entre la microbiota y su huésped en la salud y el bienestar de las aves de corral nos ha llevado a adaptar nuestro protocolo histórico para producir pollos de engorde libres de gérmenes de la línea Ross PM3, la línea de pollos de engorde más utilizada del mundo.