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Se han validado varias técnicas de limpieza de tejidos para su uso en el cerebro: hidrogel, hidrófilo e hidrófobo. Estas técnicas tienen como objetivo hacer que un tejido sea transparente a través de la delipidación, la decoloración y la descalcificación a través de la administración de disolventes. Una vez que el índice de refracción de la muestra de tejido coincide con el índice de refracción del medio de imagen elegido, se puede obtener una imagen clara de la muestra. Las técnicas basadas en hidrogel, como CLARITY, aseguran las biomoléculas en el tejido uniéndolas a hidrogeles a base de acrilo, lo que evita el daño estructural y la pérdida de proteínas1. Sin embargo, las técnicas de hidrogel utilizan productos químicos agresivos que tienen el potencial de dañar tejidos más frágiles, y las muestras de tejido más densas pueden no ser compatibles con el protocolo de hidrogel. Ciertas técnicas de hidrogel pueden requerir equipos costosos o conducir a la expansión del tejido. Las técnicas hidrófilas, como CUBIC, preservan la estructura 3D a través de la formación de enlaces de hidrógeno dentro del tejido2. La expansión del tejido también puede ocurrir en cierto protocolo hidrófilo. La capacidad de limpieza de las técnicas hidrofílicas a menudo no coincide con la capacidad que tienen las técnicas hidrofóbicas, lo cual es importante para tejidos más densos y gruesos3.
Las técnicas hidrofóbicas suelen ser rápidas, no requieren equipos especiales y producen una muestra que es fácil de manejar y almacenar. iDISCO es una técnica hidrofóbica que elimina la contracción que puede producirse en otros protocolos hidrófobos. Originalmente, la técnica de limpieza de tejidos iDISCO fue descrita por Renier et al.4 para los embriones y órganos densos y adultos de ratones. Esta técnica elimina el agua del tejido en el paso inicial de deshidratación, reduciendo así la dispersión de la luz. El tejido se permeabiliza durante el pretratamiento para permitir la penetración profunda de anticuerpos. Los colorantes Alexa Fluor en el espectro rojo lejano se utilizan para el inmunoetiquetado para evitar la autofluorescencia del tejido en longitudes de onda más bajas5. El tejido que se ha sometido a protocolos de limpieza hidrofóbica se puede manejar fácilmente y se puede obtener imágenes varias veces debido a la longevidad de los tintes Alexa Fluor. Si se almacenan adecuadamente, los tejidos pueden proporcionar imágenes durante meses a un año después del procesamiento inicial.
En el presente protocolo, el anticuerpo tirosina hidroxilasa (TH), el anticuerpo Iba1 y la subunidad B de la toxina del cólera (CTB) se utilizaron en el control masculino y femenino y en los cerebros de ratas transgénicas (Tg) del VIH-1. La rata VIH-1 Tg posee siete de los nueve genes que componen el genoma viral del VIH-1, lo que conduce a un modelo no infeccioso de exposición a largo plazo a la proteína VIH-16,7,8. Las alteraciones dopaminérgicas se han demostrado previamente en la rata VIH-1 Tg, y el VIH-1 en sí es una enfermedad inflamatoria, por lo que la elección del anticuerpo fue relevante para el diseño experimental9,10,11,12. CTB es un trazador que se adhiere a las neuronas a través de la unión gangliósido y se puede utilizar para rastrear proyecciones aferentes en el cerebro. CTB se ha utilizado previamente para estudiar proyecciones desde el núcleo accumbens hasta el área de la sustancia negra, dos áreas del cerebro muy involucradas con las vías dopaminérgicas13,14,15.
En este protocolo, TH servirá como marcador para la producción de dopamina, e Iba1 marcará la microglía activada. El anticuerpo TH utilizado marca selectivamente una sola banda a aproximadamente 62 kDa que corresponde a la tirosina hidroxilasa. El anticuerpo Iba1 corresponde a la secuencia carboxi-terminal Iba1. Ambos anticuerpos fueron criados en conejo y eran policlonales. CTB se utilizará para el rastreo retrógrado de neuronas desde el área del núcleo accumbens hasta el área de la sustancia negra. El protocolo actual también ofrece una guía para el ajuste del protocolo iDISCO original de dos maneras distintas: 1) reducción general de la tinción de fondo mediante el cambio de los reactivos séricos en los pasos de bloqueo, y 2) escalado del tiempo de incubación para que sea adecuado para muestras de tejido más grandes. En general, el presente protocolo proporciona evidencia continua de que las técnicas de limpieza hidrofóbica son factibles en los tejidos cerebrales de la rata, no tienen interacciones perjudiciales discernibles con las proteínas virales del VIH-1 y son compatibles con el anticuerpo TH, el anticuerpo Iba1 y el CTB.