Artículo de método

Caracterización y predicción funcional de bacterias en tejidos ováricos

DOI:

10.3791/61878

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23 de octubre de 2021

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1Department of Obstetrics and Gynecology, First Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, 2School of Social Sciences, University of Manchester, 3Department of Pathology, First Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, 4Omega Bioservices Inc

* These authors contributed equally

En este artículo

Resumen

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Se realizó la tinción inmunohistoquímica y la secuenciación del gen arn ribosómico 16S (gen 16S rRNA) con el fin de descubrir y distinguir bacterias en tejidos ováricos cancerosos y no cancerosos in situ. Las diferencias composicionales y funcionales de las bacterias se predijeron mediante el uso de BugBase y Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unbserved States (PICRUSt).

Resumen

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La teoría de un tracto reproductivo superior femenino "estéril" ha estado encontrando una creciente oposición debido a los avances en la detección bacteriana. Sin embargo, aún no se ha confirmado si los ovarios contienen bacterias. Aquí, se introdujo un experimento para detectar bacterias en los tejidos ováricos. Elegimos pacientes con cáncer de ovario en el grupo de cáncer y pacientes no cancerosas en el grupo de control. La secuenciación del gen 16S rRNA se utilizó para diferenciar las bacterias en los tejidos ováricos de los grupos de cáncer y control. Además, predijimos la composición funcional de las bacterias identificadas mediante el uso de BugBase y PICRUSt. Este método también se puede utilizar en otras vísceras y tejidos, ya que se ha demostrado que muchos órganos albergan bacterias en los últimos años. La presencia de bacterias en las vísceras y los tejidos puede ayudar a los científicos a evaluar los tejidos cancerosos y normales y puede ser de ayuda en el tratamiento del cáncer.

Introducción

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Recientemente, se ha publicado un número creciente de artículos que prueban la existencia de bacterias en las vísceras sólidas abdominales, como el riñón, el bazo, el hígado y el ovario1,2. Geller et al. encontraron bacterias en tumores pancreáticos, y estas bacterias eran resistentes a la gemcitabina, un fármaco quimioterapéutico2. S. Manfredo Vieira et al. concluyeron que Enterococcus gallinarum era portátil a los ganglios linfáticos, hígado y bazo, y podía conducir a la autoinmunidad3.

Dado que el cuello u....

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Protocolo

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Este estudio fue aprobado por el Comité de Ética Institucional Médica del Primer Hospital Afiliado de la Universidad Xi'an Jiaotong (No. XJTUIAF2018LSK-139). Se obtuvo el consentimiento informado de todos los pacientes inscritos.

1. Criterios para ingresar al grupo de cáncer y al grupo de control

  1. Para el grupo de cáncer, inscriba a pacientes que son diagnosticadas principalmente con cáncer de ovario, y después de la laparotomía, se demuestra que tienen cáncer de ovario seroso por hallazgos patológicos.
  2. Para el grupo de control, inscriba a pacientes que son diagnosticadas principalmente con mioma uterino ....

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Resultados

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Pacientes
Un total de 16 pacientes calificados fueron incluidos en el estudio. El grupo de control incluyó a 10 mujeres con un diagnóstico de tumor uterino benigno (entre ellas, 3 pacientes fueron diagnosticadas con mioma uterino y 7 pacientes fueron diagnosticadas con adenomiosis uterina). Mientras tanto, el grupo de cáncer contenía 6 mujeres con un diagnóstico de cáncer de ovario seroso (entre ellas, 2 pacientes fueron diagnosticadas con estadio II, y 2 de ellas fueron diagnosticadas con estadio III.......

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Discusión

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El cáncer de ovario tiene una influencia notable en la fertilidad de las mujeres25. La mayoría de las pacientes con cáncer de ovario se diagnostican en etapas tardías, y la tasa de supervivencia a 5 años es inferior al 30%18. Se ha publicado la confirmación de bacterias en las vísceras sólidas abdominales, incluyendo el hígado, el páncreas y el bazo. La existencia de bacterias en el tracto reproductivo femenino superior se produce porque el cuello uterino no está encerrado<.......

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Divulgaciones

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Los autores no tienen nada que revelar.

Agradecimientos

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Este trabajo fue apoyado por el Premio de Investigación Clínica del Primer Hospital Afiliado de la Universidad Xi'an Jiaotong, China (XJTU1AF-2018-017, XJTU1AF-CRF-2019-002), el Proyecto Principal de Investigación Básica de Ciencias Naturales del Departamento Provincial de Ciencia y Tecnología de Shaanxi (2018JM7073, 2017ZDJC-11), el Proyecto Clave de Investigación y Desarrollo del Departamento Provincial de Ciencia y Tecnología de Shaanxi (2017ZDXM-SF-068, 2019QYPY-138), el Proyecto Provincial de Innovación Tecnológica Colaborativa de Shaanxi (2 017XT-026, 2018XT-002), y el Proyecto de Investigación Médica del Plan de Orientación para el Desarrollo Social de Xi'an (2....

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
2200 TapeStation SoftwareAgilgent
Estados Unidos
AmpliSeq para la preparación, los índices y los accesorios de la biblioteca Illumina
Image-pro plus 7Media Cybernetics
Leica ASP 300SLeica Biosystems División de Leica Microsystems
Leica EG 1150Leica Biosystems División de Leica Microsystems
Leica RM2235Leica Biosystems División de Leica Microsystems
Anticuerpo monoclonal LPS Core, clon WN1 222-5Hycult Biotech
Mag-Bind RxnPure Plus perlas magnéticasOmega BiotekM1386-00
Mag-Bind Universal Pathogen 96 KitOmega BiotekM4029-01
MiSeqIlluminaSY-410-1003
SilvaInstituto Max Planck de Microbiología Marina y Universidad Jacobs
el sistema QuantiFluor dsDNAPromegaE2670
TrimmomaticBjö rn Usadel
ZytoChem Plus (HRP) Kit Anti-Conejo (DAB) SistemasZytomedHRP008DAB-RB
Base de datos , ,

Referencias

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  1. Manfredo Vieira, S., et al. Translocation of a gut pathobiont drives autoimmunity in mice and humans. Science. 359 (6380), 1156-1161 (2018).
  2. Geller, L. T., et al. Potential role of intratumor bacteria in mediating tumor resistanc....

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Etiquetas

Ovarian Tissue Bacteria16S rRNA SequencingImmunohistochemistry StainingBugBase AnalysisPICRUSt Functional PredictionSterile Tissue ProcessingDNA Library PreparationQIIME Data AnalysisAlpha Diversity MetricsStatistical Significance Testing

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