Los péptidos penetrantes en las células (CPP) se definen como portadores que son capaces de cruzar la membrana plasmática y transferir una carga a las células. Una de las principales características comunes requeridas para esta actividad resultó de las interacciones de los CPP con la membrana plasmática (lípidos) y más particularmente con componentes de la matriz extracelular de la propia membrana (sulfato de heparápalo). De hecho, independientemente de la translocación directa o de la internalización dependiente de la endocitosis, las bicapas lipídicas están implicadas en el proceso de internalización tanto a nivel de la membrana plasmática como a nivel del tráfico intracelular (vesículas endosómicas). En este artículo, presentamos un protocolo detallado que describe los diferentes pasos de una gran formulación, purificación, caracterización y aplicación de vesículas unilamelares (LUV) en el ensayo de fuga de fluorescencia para detectar una posible desestabilización / interacción de la membrana CPP y abordar su papel en el mecanismo de internalización. Las UDV con una composición lipídica que refleja el contenido de la membrana plasmática se generan para encapsular tanto un tinte fluorescente como un quencher. La adición de péptidos en el medio extravesicular y la inducción de interacciones péptido-membrana en las UDV podrían inducir de manera dependiente de la dosis un aumento significativo de la fluorescencia que revela una fuga. Aquí se proporcionan ejemplos con los péptidos anfipáticos (WRAP) ricos en triptófano (W) y arginina (R) recientemente desarrollados, que mostraron una entrega rápida y eficiente de siRNA en varias líneas celulares. Finalmente, se discute la naturaleza de estas interacciones y la afinidad por los lípidos para comprender y mejorar la translocación de la membrana y / o el escape endosomal.