Este protocolo combina la hibridación in situ con la inmunofluorescencia para identificar genes de receptores olfativos y vomeronasales expresados en neuronas sensoriales olfativas después de la activación por estímulos químicos en el ratón.
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Artículo de método
Este protocolo combina la hibridación in situ con la inmunofluorescencia para identificar genes de receptores olfativos y vomeronasales expresados en neuronas sensoriales olfativas después de la activación por estímulos químicos en el ratón.
Los animales dependen de la comunicación química para transmitir y percibir información ambiental relevante, que va desde la evaluación de la calidad de los alimentos hasta la detección de parejas de apareamiento disponibles o amenazas. En ratones, esta tarea es ejecutada principalmente por el sistema olfativo y sus subsistemas subyacentes, incluidos los sistemas olfativos principal y accesorio. Ambos tienen órganos periféricos poblados por neuronas sensoriales que expresan receptores acoplados a la proteína G capaces de unirse a señales químicas que llegan a la cavidad nasal. A pesar de que las características moleculares de estos receptores se conocen bien, se sabe poco sobre sus ligandos específicos afines. El método descrito aquí combina la detección de hibridación in situ de receptores olfativos o vomeronasales con la inmunodetección de la proteína ribosómica fosforilada S6 (pS6), un marcador de activación neuronal. Este protocolo fue ideado para identificar las neuronas activadas después de un solo evento de exposición a estímulos químicos purificados o complejos detectados por los órganos olfativos. Es importante destacar que esta técnica permite la investigación de neuronas desencadenadas en contextos biológicamente relevantes. Idealmente, este método debería usarse para sondear la biología molecular del sistema olfativo y para estudiar los comportamientos olfativos.
La quimioseñalización es la forma de comunicación más extendida en los animales. En los mamíferos, la detección de señales químicas está mediada principalmente por el olfato y es primordial para encontrar alimento, localizar posibles parejas de apareamiento y evitar posibles depredadores 1,2,3. El sistema olfativo del ratón se divide a su vez en diferentes subsistemas, cada uno con sus propias propiedades anatómicas, fisiológicas y moleculares4. Entre estos, el sistema olfativo principal (MOS) y el sistema olfativo accesorio (AOS) son los más estudiados y mejor caracterizados.
El MOS es el principal responsable de la detección de moléculas químicas volátiles que llegan a la cavidad nasal. Esto se logra gracias a las neuronas sensoriales olfativas (OSN), que pueblan la interfaz sensorial del sistema, el epitelio olfativo principal (MOE). Cada OSN expresa uno de los miles de receptores olfativos (OR) de forma monogénica y monoalélica5. Además, los OR tienden a ser ampliamente afinados6, y un solo odorante puede unirse a más de un OR, generando un código combinatorio para los olores7.
A su vez, el AOS es el principal responsable de la detección de feromonas y kairomonas. Estos ligandos activan los neuros sensoriales vomeronasales (VSN) en el órgano vomeronasal (VNO). Las VSNs de la zona apical del VNO expresan receptores de la familia del receptor vomeronasal 1 (V1Rs)8, mientras que las neuronas de la zona basal expresan la familia del receptor vomeronasal 2 (V2Rs)9. Es importante destacar que se ha demostrado que algunas VSNs co-expresan más de un receptor vomeronasal 10,11,12.
A pesar de toda la información disponible sobre las características moleculares de los OR y los VR, el conocimiento sobre sus ligandos afines es todavía muy limitado. La identificación de neuronas olfativas específicas responsables de la detección de una molécula o estímulo complejo es una tarea importante para quienes investigan el olfato, los comportamientos impulsados por el olfato y las respuestas fisiológicas. Se han intentado varias estrategias para desorfanizar los receptores olfativos, incluyendo la obtención de imágenes de calcio7, la secuenciación de ARN unicelular13,14, la expresión de receptores heterólogos15 y estrategias basadas en genes tempranos inmediatos (IEGs)16. Más recientemente, se han empleado algunas técnicas para evaluar los efectos moduladores de los odorantes en las neuronas sensoriales, utilizando imágenes de calcio in vivo 17,18 y estrategias de secuenciación de ARN unicelular marcado con proteínas fluorescentes19. La mayoría de estas técnicas exigen una configuración artificial o se realizan en neuronas disociadas, lo que hace imposible evaluar simultáneamente los comportamientos desencadenados por los olores utilizados.
El protocolo aquí descrito permite la identificación de neuronas sensoriales activadas después de un solo evento de exposición al olor, mediante la combinación de ribosondas que detectan OR o VR específicas con la inmunodetección de la proteína ribosómica S6 fosforilada (pS6), un proxy de la activación neuronal. Este método es una forma fiable de investigar la identidad de las neuronas sensoriales activadas por diferentes quimioseñales en un contexto biológicamente relevante.
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Los procedimientos con animales se llevaron a cabo de acuerdo con el Protocolo Animal #1883-1, aprobado por la Universidad de Campinas (Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales del Instituto de Biología - Comité de Ética en el Uso de Animales en Investigación), que sigue las directrices establecidas por el Consejo Nacional de Control de Experimentación Animal (CONCEA) federal.
1. Preparación del material
2. Síntesis de ribosonda
NOTA: El siguiente procedimiento para sintetizar sondas de ARNc marcadas con digoxigenina de 1 kb para hibridación in situ mediante transcripción in vitro se basa en los protocolos publicados anteriormente 20,21,22,23.
3. Exposición de ratones a estímulos olfativos
4. Disección y congelación de tejidos
5. Protocolo de hibridación in situ paso a paso
6. Inmunotinción de pS6
7. Imágenes de microscopía
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El protocolo actual tiene como objetivo obtener imágenes de microscopía en las que el gen de interés del experimentador y el marcador de actividad neuronal pS6 estén marcados con fluorescencia. El método descrito implica la amplificación de señal de tiramida, que produce un etiquetado claro y fuerte con poco o ningún antecedente. La inmunotinción de pS6 aparece como una señal fluorescente citoplasmática que generalmente llena todo el cuerpo de la célula neuronal, mientras que la señal de hibridación in situ para...
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El protocolo descrito aquí identifica de forma fiable las neuronas sensoriales activadas por señales químicas en el sistema olfativo mediante una combinación de detección in situ de receptores OR o VR con inmunodetección de pS6, un marcador indirecto de la actividad neuronal. El experimentador debe tener especial cuidado para mantener la integridad histológica y realizar todos los pasos antes de la hibridación en condiciones libres de ARNasa. De lo contrario, se puede producir l...
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Los autores declaran que no tienen intereses contrapuestos de ningún tipo.
Agradecemos a GAG Pereira y JA Yunes por los recursos, a APF Ferreira y WO Bragança por su ayuda administrativa y técnica, y al personal del Centro de Ciencias de la Vida (LaCTAD-UNICAMP) por su ayuda con la microscopía confocal. Este trabajo contó con el apoyo de la Fundación de Apoyo a la Investigación Científica del Estado de São Paulo (FAPESP; subvenciones 2009/00473-0 y 2015/50371-0 a F.P.), del PRP/UNICAMP (subvenciones 2969/16, 725/15, 348/14 y 315/12 a F.P.), de las becas de la FAPESP a V.M.A.C. (2014/25594-3, 2012/21786-0, 2012/01689-0), T.S.N. (2012/04026-1) y de la Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) a la T.S.N.
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| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| 10x solución salina tamponada con fosfato (PBS) | Thermo Fisher Scientific | AM9625 | n/a |
| 20x diluyente de amplificación (tampón de reacción de Kit Alexa Fluor 555 Tyramide SuperBoost) | Thermo Fisher Scientific | B40923 o B40922 | referido como tampón de amplificación A en soluciones de trabajo para la amplificación de señal de tiramida-Alexa 488 o tiramida-Alexa 555 |
| 20x SSC | Merck (Calbiochem) | 8310-OP | n/a |
| 30% Albúmina sérica bovina (BSA) | Merck (Sigma-Aldrich) | A9576 | n/a |
| Peróxido de hidrógeno al 30% (H2O2) | Merck (Sigma-Aldrich) | H1009 | n/a |
| Anhídrido acético | Merck (Sigma-Aldrich) | 320102 | n/a |
| Agarosa | Merck (Sigma-Aldrich) | A9539 | n/a |
| Diluyente de amplificación (del kit de biotina TSA) | Akoya Biosciences (Perkin Elmer) | SAT700001EA | denominado tampón de amplificación B en solución de trabajo para la amplificación de señales de tiramida-biotina |
| Anti-pS6 (Ser 244/247) anticuerpo policlonal de conejo | Thermo Fisher Scientific | Cat# 44-923G, RRID:AB_2533798 | n/a |
| Tampón de bloqueo 1x (del kit Alexa Fluor 488 Tyramide SuperBoost) | Thermo Fisher Scientific | B40923 o B40922 | referido como solución bloqueante B en la etapa de desarrollo de la señal de tiramida |
| Reactivo de bloqueo (del kit de biotina TSA) | Akoya Biosciences (Perkin Elmer) | SAT700001EA | referido como reactivo de bloqueo A en la formulación del tampón TNB |
| DAPI tinción nuclear | Thermo Fisher Scientific | D1306 | n/a |
| Solución de Denhardt (50x) | Merck (Sigma-Aldrich) | D9905 | n/a |
| Formamida desoinizada | Merck (Sigma-Aldrich) | F9037 | n/a |
| Solución de sulfato de dextrano (50%) | Merck (Chemicon) | S4030 | n/a |
| Ácido etilen-diamina-tetraacético (EDTA) | Merck (Sigma-Aldrich) | E9884 | n/a |
| Tinción nuclear Hoechst 33342 Thermo | Fisher Scientific | H1399 | n/a |
| Ácido clorhídrico (HCl) | Merck ( Sigma-Aldrich) | 320331 | n/a |
| Estímulos olfativos | n/a | Papes et al. (2010), Carvalho et al. (2015), Nakahara er al. (2016), Carvalho et al. (2020) | n/a |
| Paraformaldehído | Merck (Sigma-Aldrich) | P6148 | n/a |
| Anticuerpo anti-digoxigenina conjugado con peroxidasa (Fab fragments) | Merck (Roche)11207733910 | ; RRID:AB_514500 | referido como anticuerpo anti-DIG conjugado con peroxidasa |
| Anticuerpo secundario anti-conejo conjugado con peroxidasa (reactivo anti-conejo de cabra conjugado con polyHRP de Kit Alexa Fluor 488 Tyramide SuperBoost) | Thermo Fisher Scientific | B40922 | n/a |
| Estreptavidina conjugada con peroxidasa (del kit de biotina TSA) | Akoya Biosciences (Perkin Elmer) | SAT700001EA | n/a |
| ProLong Gold montador antidecoloración | Thermo Fisher Scientific | P36934 | referido como medio de montaje antidecoloración |
| Agua ultrapura libre de ARNasa | Thermo Fisher Scientific | 10977015 | n/a |
| Cloruro de sodio (NaCl) | Merck (Sigma-Aldrich) | S9888 | n/a |
| Dodecil sulfato de sodio (SDS) | Merck (Sigma-Aldrich) | 436143 | n/a |
| Hidróxido de sodio (NaOH) | Merck (Sigma-Aldrich) | S8045 | n/a |
| Sacarosa | Merck (Sigma-Aldrich) | S0389 | n/a |
| Trietanolamina | Merck (Sigma-Aldrich) | T58300 | n/a |
| Triton X-100 | Merck (Sigma-Aldrich) | X100 | n/a |
| Clorhidrato de Trizma (Tris-Cl) | Merck (Sigma-Aldrich) | T5941 | n/a |
| Tween-20 | Merck (Sigma-Aldrich) | 822184 | n/a |
| Conjugado Tyramide-Alexa 488 (del kit Alexa Fluor 488 Tyramide SuperBoost) | Thermo Fisher Scientific | B40922 | n/a |
| Conjugado de tiramida-Alexa 555 (del kit Alexa Fluor 555 Tyramide SuperBoost) | Thermo Fisher Scientific | B40923 | n/a |
| Conjugado de tiramida-biotina (del kit TSA Biotin) | Akoya Biosciences (Perkin Elmer) | SAT700001EA | n/a |
| ARNt de levadura | Merck (Roche) | 10109495001 | n/a |
| Critical Commercial Assays and Animals | |||
| Kit Alexa Fluor 488 Tyramide SuperBoost | Thermo Fisher Scientific | B40922 | n/a |
| Alexa Fluor 555 Kit Tyramide SuperBoost | Thermo Fisher Scientific | B40923 | n/a |
| Kit de etiquetado de ARN DIG (SP6/T7) | Merck (Roche) | 11175025910 | n/a |
| Reactivos de análisis ScreenTape de ARN de alta sensibilidad (tampón, escalera y cinta) | Agilent | 5067-5580, 5067-5581 y 5067-5579 | referido como sistema de electroforesis automatizado |
| Ratón: cepa endogámica C57BL/6J | Jackson | Laboratories Nº de inventario: 000664; RRID:IMSR_JAX:000664) | n/a |
| ProbeQuant G-50 Micro Columnas | Cytiva Biosciences | 28903408 | denominado kit de purificación basado en filtración en gel |
| QIAquick kit de extracción de gel | Qiagen | 28506 | denominado kit de purificación de gel basado en mini columna |
| RNeasy MinElute | Qiagen | 74204 | denominado kit de purificación de ARN basado en mini columna |
| TSA Kit de biotina | Akoya Biosciences (Perkin Elmer) | SAT700001EA | n/a |
| 5' – AAACTTCATCCTTACAGAATGG CAG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Olfr692 |
| 5' – ACTGGCTTTGGGACAGTGTGAC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5'- GGTAATATCTCCATTATCCTAGTT TCCC – 3' | Tecnologías integradas de ADN | n/a | Olfr124 |
| 5' – TTGACCCAAAACTCCTTTGTTAG TG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – ATGGGAGCTCTAAATCAAACAA GAG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Olfr1509 |
| 5' – TAGAAAACCGATACCACCTTGTC G – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – TACATCCTGACTCAGCTGGGGA ACG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Olfr1512 |
| 5' – GGGCACATAGTACACAGTAACA ATAGTC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – GAGGAAGCTCACTTTTGGTTTG G – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Olfr78 |
| 5' – CAGCTTCAATGTCCTTGTCACA G – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – TGGGTTGGAGGCTTATCATACC TG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Olfr691 |
| 5' – AAGAACAACACAGAGTCTTGAT GTC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – AGAAGTAACTAACACCACTCAT GGC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Olfr638 |
| 5' – TTAGTGCACCTTTTTTTGCAAC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – TAACAGCTCTTCCCATCCCCTG TTC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Olfr569 |
| 5' – TAGGGTTGAGCATGGGAGGAAC AAGC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – CACTGGATCAACTCTAGCAGCA CTG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r1 |
| 5' – CTGCCCTTCTTGACATCTGCTG AG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – ATCGGATCCACTGCTTTAGCATT TCTTACAGGACAG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r2 |
| 5' – ATCCTCGAGTCATGCCTCTCCAT AAGCAAGGAATTCCAC – 3'Tecnologías | ADN integradas | n/a | |
| 5' – TAGGAAGCTATTTGCCTTGTTTC CAC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r13 |
| 5' – AGGAGATTTTACCAACCAGATTC CAG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – CTCTAAGAACAGCAGTAAAATGG ATCT – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r89 |
| 5' – ATGGGAATGACCAACTTAGGTGC A – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – ATCCCATGGCTGAGAACATGTGC TTCTGGAG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r118 |
| 5' – ATCCTCGAGTCAGTCTGCATAAG CCAGATATGTCAC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – ATCGGATCCGCTGATTTTATTTCT CCCAGATGCTTTTGG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r116 |
| 5' – ATCCTCGAGTCATGGTTCTTCAT AGCTGAGAAATACAAC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – TGGGTGTCTTCTCTCTCCTCAA GA – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r28 |
| 5' – GGTGACCCATATTCTCTGTATAA CTGT – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – GATGTTCATTTTCATGAGAGTCT TCC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r41 |
| 5' – CATTTGTGGATGACATCACAATT TGG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – TTTATGGCAAATTTCACTGATCCC G – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r46 |
| 5' – AGTGGGTTTTTCTTAGAAAGGAG TG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – ACATGAACCAGAATTTGAAGCAG GC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r69 |
| 5' – GCCAAGAAAGCTACAGTGAAAC C – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – AGGTGAAGAAATGGTATTCTTCC AG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r58 |
| ACTGTGGCCTTGAATGCAATAACT – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – TTCCTAAAGAACACCCTACTGA AGCATCG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r90 |
| 5' – CATATTCCACAGAAGAAGAAGT TGGAC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – TTGAGGTGAGAGTCAACAGT TTAGAC – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r107 |
| 5' – CCCTTGTTGCACACAAAATGAT GATGTGA – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | |
| 5' – ATCCCATGGAGTCAGAGTAT CTACTACACCATGATGG – 3' | Tecnologías de ADN integradas | n/a | Vmn2r83 |
| 5' – ATCCTCGAGTCAATCATTAT AGTCCAGAAAGGTGACAG – 3' | Integrated DNA Technologies | n/a | |
| Recombinant DNA | |||
| pGEM-T-Easy vector | Promega | A1360 | recomendado PCR clonación vector |
| Otros materiales | |||
| 1mL jeringas | Fisher Scientific | 14-829-10F | n/a |
| Tubos cónicos (15 mL y 50 mL) | Fisher Scientific | 14-432-22, 14-959-49B | n/a |
| Frascos Coplin | Fisher Scientific | 12-567-099, 07-200-81 | n/a |
| Cryostat | Leica Biosystems | CMS 1850 | n/a |
| Herramientas de disección y pinzas | Roboz | RS-6802, RS-8124, RS-7110, RS-5111 | n/a |
| Baño seco | n/a | n/a | n/a |
| Electroforesis equipo | Fisher Scientific | 09-528-110B | n/a |
| Pinceles de punta fina | Winsor & Newton | 10269097 | n/a |
| Microscopio de fluorescencia o confocal | Leica Microsystems | TCS SP5II | n/a |
| Placa calefactada | Fisher Scientific | HP88850200 | n/a |
| Cámara humidificada (si se usa a temperaturas más altas, deberá sellarse dentro de un recipiente de plástico Tupperware) | Thermo Fisher Scientific | 22-045-034 | n/a |
| Toallitas Kimwipes de laboratorio sin pelusa | Kimberly-Clark | 34120 | se refiere al papel tisú de laboratorio sin pelusa |
| Microcentrífuga | Eppendorf | 5401000013 n/a | |
| Jaulas de ratón | InnoVive | M-BTM, MVX1 | n/a |
| Termociclador PCR | Thermo Fisher Scientific | 4375786 | n/a |
| Pipeta p1000, p200 y p20 puntas desechables | Fisher Scientific | 02-707-408, 02-707-411, 02-707-438 | n/a |
| Molde de inclusión de histología plástica | Thermo Fisher Scientific | 22-19 | n/a |
| Qubit 4 Fluorímetro | Thermo Fisher Scientific | Q33238 | referido como método fluorométrico de alta sensibilidad |
| Hojas de afeitar o bisturíes | Fisher Scientific | 12-640 | n/a |
| Estación de cinta de ARN o BioAnalyzer | Agilent | 4200 TapeStation System o 2100 Bioanalizador Instrumento | n/a |
| Cilindros y vasos de precipitados graduados de vidrio o plástico sin ARNasa | Fisher Scientific | 10-462-833, 02-555-25B, 02-555-25D | n/a |
| Microscopio estereoscópico | Leica Microsystems | M80 | n/a |
| Portaobjetos de microscopio SuperFrost Plus | Thermo Fisher Scientific | 12-550-15 | denominados portaobjetos de microscopio con carga positiva |
| Parafilm | Bemis Company | PM999 | denominada película de laboratorio termoplástica |
| Baño de agua | Thermo Fisher Scientific | TSCIR19 | n/a |
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