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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aquí se describe una plataforma de microextracción-gas-cromatografía de gases en fase sólida para una identificación y cuantificación volátil rápida, confiable y semiautomatizada en frutas maduras de grosella negra. Esta técnica se puede utilizar para aumentar el conocimiento sobre el aroma de la fruta y para seleccionar cultivares con sabor mejorado con el propósito de la cría.
Existe un creciente interés en medir los compuestos orgánicos volátiles (COV) emitidos por las frutas maduras con el fin de mejorar variedades o cultivares con características organolépticas mejoradas y, por lo tanto, aumentar la aceptación del consumidor. Recientemente se han desarrollado plataformas metabolómicas de alto rendimiento para cuantificar una amplia gama de metabolitos en diferentes tejidos vegetales, incluidos los compuestos clave responsables del sabor y la calidad del aroma de la fruta (volatilomics). Aquí se describe un método que utiliza la microextracción de fase sólida del espacio de cabeza (HS-SPME) junto con cromatografía de gases-espectrometría de masas (GC-MS) para la identificación y cuantificación de los COV emitidos por las frutas maduras de grosella negra, una baya muy apreciada por su sabor y beneficios para la salud.
Los frutos maduros de las plantas de grosella negra (Ribes nigrum) se cosecharon y congelaron directamente en nitrógeno líquido. Después de la homogeneización del tejido para producir un polvo fino, las muestras se descongelaron e inmediatamente se mezclaron con una solución de cloruro de sodio. Después de la centrifugación, el sobrenadante se transfirió a un vial de vidrio con espacio para la cabeza que contenía cloruro de sodio. Los COV se extrajeron utilizando una fibra de microextracción en fase sólida (SPME) y un cromatógrafo de gases acoplado a un espectrómetro de masas de trampa de iones. La cuantificación volátil se realizó en los cromatogramas iónicos resultantes mediante la integración del área de pico, utilizando un ion m/z específico para cada COV. La anotación correcta de COV se confirmó comparando los tiempos de retención y los espectros de masas de los estándares comerciales puros que se ejecutan en las mismas condiciones que las muestras. Se identificaron más de 60 COV en frutas maduras de grosella negra cultivadas en lugares europeos contrastantes. Entre los COV identificados, los compuestos aromáticos clave, como los terpenoides y los volátiles C6, se pueden utilizar como biomarcadores para la calidad de la fruta de grosella negra. Además, se discuten las ventajas y desventajas del método, incluidas las posibles mejoras. Además, se ha hecho hincapié en el uso de controles para la corrección de lotes y la minimización de la intensidad de la deriva.
El sabor es un rasgo de calidad esencial para cualquier fruta, lo que afecta la aceptación del consumidor y, por lo tanto, afecta significativamente la comercialización. La percepción del sabor implica una combinación de los sistemas gustativo y olfativo y depende químicamente de la presencia y concentración de una amplia gama de compuestos que se acumulan en partes de plantas comestibles, o en el caso de los COV, son emitidos por la fruta madura1,2. Mientras que la cría tradicional se ha centrado en rasgos agronómicos como el rendimiento y la resistencia a las plagas, la mejora de los rasgos de calidad de la fruta, incluido el sabor, se ha descuidado durante mucho tiempo debido a la complejidad genética y la dificultad para fenotipar adecuadamente estas características, lo que lleva al descontento del consumidor3,4. Los avances recientes en plataformas metabolómicas han tenido éxito en la identificación y cuantificación de compuestos clave responsables del sabor y aroma de la fruta5,6,7,8. Además, la combinación de perfiles de metabolitos con herramientas genómicas o transcriptómicas permite dilucidar la genética subyacente al sabor de la fruta, lo que a su vez ayudará a los programas de mejoramiento a desarrollar nuevas variedades con características organolépticas mejoradas2,4,9,10,11,12,13,14.
Las bayas de grosella negra (Ribes nigrum) son muy apreciadas por su sabor y propiedades nutricionales, siendo ampliamente cultivadas en las zonas templadas de Europa, Asia y Nueva Zelanda15. La mayor parte de la producción se procesa para productos alimenticios y bebidas, que son muy populares en los países nórdicos, principalmente debido a las propiedades organolépticas de las bayas. El intenso color y sabor de la fruta son el resultado de una combinación de antocianinas, azúcares, ácidos y COV presentes en las frutas maduras16,17,18. El análisis de los volátiles de la grosella negra se remonta a la década de 196019,20,21. Más recientemente, varios estudios se han centrado en los COV de grosella negra, identificando compuestos importantes para la percepción del aroma de la fruta y evaluando el impacto del genotipo, el medio ambiente o las condiciones de almacenamiento y procesamiento en el contenido de COV5,17,18,22,23.
Debido a sus numerosas ventajas, la técnica de elección para el perfilado volátil de alto rendimiento es HS-SPME/GC-MS24,25. Una fibra de sílice, recubierta con una fase polimérica, se monta en un dispositivo de jeringa, lo que permite la adsorción de los volátiles en la fibra hasta que se alcanza una fase de equilibrio. La extracción del espacio de cabeza protege la fibra de los compuestos no volátiles presentes en la matriz24. SPME puede aislar con éxito un alto número de COV presentes en concentraciones muy variables (partes por billón a partes por millón)25. Además, es una técnica libre de disolventes que requiere un procesamiento de muestras limitado. Otras ventajas de HS-SPME son la facilidad de automatización y su costo relativamente bajo.
Sin embargo, su éxito puede ser limitado, dependiendo de la naturaleza química de los COV, el protocolo de extracción (incluyendo el tiempo, la temperatura y la concentración de sal), la estabilidad de la muestra y la disponibilidad de suficiente tejido frutícola26,27. Este artículo presenta un protocolo para COV de grosella negra aislados por HS-SPME y analizados por cromatografía de gases junto con un espectrómetro de masas de trampa de iones. Se logró un equilibrio entre la cantidad de material vegetal, la estabilidad de la muestra y la duración de la extracción y la cromatografía para poder procesar un alto número de muestras de grosella negra, algunas de ellas presentadas en este estudio. En particular, los perfiles de COV y/o cromatogramas de cinco cultivares ('Andega', 'Ben Tron', 'Ben Gairn', 'Ben Tirran' y 'Tihope') se presentarán y discutirán como datos de ejemplo. Además, el mismo protocolo se ha puesto en práctica con éxito para la medición de COV en otras especies de bayas de frutas como la fresa (Fragaria x ananassa), la frambuesa (Rubusidaeus) y el arándano (Vaccinium spp.).
1. Cosecha de frutas
2. Preparación de muestras de frutas y reactivos
3. Preparación de la muestra
4. Adquisición de datos HS-SPME/GC-MS
5. Análisis de cromatogramas de perfiles GC-MS: identificación y semicuantificación de COV
El perfil de COV de alto rendimiento en un gran conjunto de cultivos frutales cultivados en diferentes condiciones o ubicaciones o que pertenecen a genotipos distintos es necesario para un fenotipado aromático preciso. Aquí, se presenta una plataforma HS-SPME/GC-MS rápida y semiautomatizada para la cuantificación relativa de COV en cultivares de grosella negra. La detección e identificación de COV se basó en una biblioteca que se desarrolló para perfilar las especies de frutos de bayas (Tabla 1). En la Figura 1A se muestra un perfil volátil típico de fruta de grosella negra madura (cromatograma iónico total) obtenido por HS-SPME/GC-MS en las condiciones antes mencionadas. En total, se identificaron 63 COV, pertenecientes a varias clases químicas, la mayoría de los cuales son ésteres (27), aldehídos (12), alcoholes (8), cetonas (7), terpenos (5) y furanos (3) (Tabla 1).
Se ha descrito que los compuestos terpenoides, ésteres y compuestos C6 dominan la volutlima de grosella negra y son importantes para el aroma de la fruta fresca5,17. De acuerdo con estos estudios previos, algunos de los picos más abundantes observados en la Figura 1A corresponden a dos monoterpenos (linalool y terpineol) y dos compuestos C6 ((E)-2-hexenal y (Z)-3-hexenal). Los espectros de masas de ejemplo obtenidos a partir de perfiles de grosella negra y su comparación con espectros de estándares comerciales puros se muestran para (E)-2-hexenal y terpineol en la Figura 1B y la Figura 1C, respectivamente.

Figura 1: Cromatogramas representativos de fruta madura de grosella negra obtenidos por HS-SPME/GC-MS (del cultivar 'Andega'). (A) Cromatograma iónico total. Los picos (Z)-3-hexenal (tiempo de retención 14.33 min), (E)-2-hexenal (15.86 min), linalool (21.65 min) y terpineol (24.01 min) se indican con los números 1, 2, 3 y 4, respectivamente. (B) Espectro de masas correspondiente al pico (E)-2-hexenal de un perfil de grosella negra y comparación con un estándar comercial puro. (C) Espectro de masas correspondiente al pico de terpineol de un perfil de grosella negra y comparación con un estándar comercial puro. Abreviatura: HS-SPME/GC-MS = microextracción en fase sólida del espacio de cabeza junto con cromatografía de gases-espectrometría de masas. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Mientras que los terpenos se han descrito como indicadores de la frescura de la fruta de grosella negra, los compuestos C6 se conocen como "volátiles de hojas verdes", impartiendo notas "verdes" al aroma de frutas y verduras34. Por lo tanto, la semicuantificación de estos COV emitidos por frutas maduras de diferentes variedades de grosella negra puede ser el primer paso para mejorar los rasgos relacionados con el sabor. Además, dado que el medio ambiente y las condiciones de crecimiento de las plantas afectan fuertemente al contenido de COV de la fruta, que es uno de los principales inconvenientes para el mejoramiento del aroma, uno de los objetivos de este estudio fue validar la hipótesis de que la semicuantificación de los COV identificados en los mismos cultivares ('Ben Tron', 'Ben Gairn', 'Ben Tirran' y 'Tihope') era reproducible en lugares europeos diametralmente opuestos como Polonia y Escocia. Como era de esperar, el análisis del componente principal (PCA) de los perfiles de COV de cuatro cultivares diferentes de grosella negra mostró que el medio ambiente afecta fuertemente el contenido volátil, ya que el componente principal (PC) 1 separa las muestras en función de su ubicación (Figura 2). Sin embargo, el efecto del genotipo se puede observar con PC2, ya que 'Ben Tirran' está claramente separado de los cultivares restantes (Figura 2).
La Figura 3 muestra el contenido relativo de linalool y (E)-2-hexenal en los cuatro cultivares de grosella negra evaluados. Para ambas ubicaciones, el contenido de COV se normalizó a la misma muestra de control, para la cual la semicuantificación confirmó que el contenido de linalool era generalmente más alto en Polonia que en Escocia, mientras que (E)-2-hexenal muestra la tendencia opuesta (Figura 3). Este resultado demuestra el impacto ambiental en el contenido de COV en las frutas de grosella negra, aunque la proporción de los dos volátiles presentes en los cuatro cultivares evaluados fue constante, con los cultivares 'Ben Tirran' y 'Ben Tron' mostrando las mayores cantidades de linalool y (E)-2-hexenal, respectivamente (Figura 3). Tomados en conjunto, estos resultados indican que el método propuesto es válido para el fenotipo de contenido de COV, y combinado con enfoques genéticos, puede utilizarse con el propósito de la mejora de la calidad de la fruta.

Figura 2: PCA para evaluar la varianza entre los perfiles de COV en los cuatro cultivares de grosella negra cultivados en Polonia y Escocia. PC1 (entorno) explica el 46,2% de la variabilidad, mientras que PC2 (genotipo) aporta el 24,8% de la varianza en el conjunto de datos. Abreviaturas: PCA = análisis de componentes principales; PC1 = primer componente principal; PC2 = segundo componente principal; COV = compuesto orgánico volátil. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Contenido relativo de dos COV representativos en perfiles de aroma de grosella negra: linalool y (E)-2-hexenal, cosechados en Escocia y Polonia. Se evaluaron cuatro cultivares diferentes de grosella negra ('Ben Gairn', 'Ben Tirran', 'Ben Tron' y 'Tihope'). Las barras representan los valores medios de dos réplicas biológicas, y las barras de error representan la desviación estándar. Las comparaciones estadísticas se realizaron mediante ANOVA unidireccional seguido de la prueba post-hoc de Tukey para determinar diferencias significativas en el contenido de COV entre cultivares y países. Para los contenidos de COV con las mismas letras minúsculas (a, ab, b), no se observaron diferencias significativas en P < 0,05. Abreviaturas: COV = compuestos orgánicos volátiles; ANOVA = análisis de varianza. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Tabla 1: Lista de COV identificados por HS-SPME/GC-MS en frutos de grosella negra. Se indica el tiempo de retención (min), el ion m/z seleccionado para la identificación y semicuantificación de COV, la descripción del aroma, la clase química y la fórmula, y el número CAS. Abreviaturas: HS-SPME/GC-MS = microextracción en fase sólida del espacio de cabeza junto con cromatografía de gases-espectrometría de masas; COV = compuestos orgánicos volátiles; KRI = índice de retención de Kovats; Número CAS = Número de registro del Servicio de Resúmenes Químicos. Haga clic aquí para descargar esta tabla.
Los autores declaran no tener conflicto de intereses.
Aquí se describe una plataforma de microextracción-gas-cromatografía de gases en fase sólida para una identificación y cuantificación volátil rápida, confiable y semiautomatizada en frutas maduras de grosella negra. Esta técnica se puede utilizar para aumentar el conocimiento sobre el aroma de la fruta y para seleccionar cultivares con sabor mejorado con el propósito de la cría.
Los autores agradecen a los Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación de la Universidad de Málaga las mediciones de HS-SPME/GC-MS. Agradecemos la asistencia de Sara Fernández-Palacios Campos en la cuantificación volátil. También agradecemos a los miembros del consorcio de GoodBerry por proporcionar el material de fruta.
| Viales de espacio de cabeza con tapa de rosca de 10 ml | Thermo Scientific | 10-HSV | |
| Tapón de rosca de 18 mm Silicona/PTFE | Thermo Scientific | 18-MSC | |
| Tubo de 5 ml con tapón de rosca de PEAD | VWR | 216-0153 | |
| Centrífuga | Thermo Scientific | 75002415 | |
| metanol para HPLC | Merck | 34860-1L-R | |
| N-pentadecano (D32, 98%) | Cambridge Isotope Laboratories | DLM-1283-1 | |
| Cloruro de sodio | Merck | S9888 | |
| SPME fibra PDMS/DVB | Merck | 57345-U | |
| Tarros de molienda de acero inoxidable para TissueLyser | Qiagen | 69985 | |
| TissueLyser II | Qiagen | 85300 | Puede ser sustituido por mortero o molino criogénico |
| Cromatógrafo de gases Trace GC-ITQ900 espectrómetro de masas con trampa de iones | Thermo Scientific | ||
| Triplus RSH con dispositivo SPME automatizado | Thermo Scientific | 1R77010-0450 | |
| Agua para HPLC | Merck | 270733-1L | |
| Xcalibur 4.2 SP1 | Software Thermo Scientific |