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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Las espinas dendríticas son características celulares importantes del sistema nervioso. Aquí se describen los métodos de imágenes en vivo para evaluar la estructura y función de las espinas dendríticas en C. elegans. Estos enfoques apoyan el desarrollo de pantallas mutantes para genes que definen la forma o función de la columna dendrítica.
Las espinas dendríticas son sitios especializados de inervación sináptica modulados por la actividad y sirven como sustratos para el aprendizaje y la memoria. Recientemente, las espinas dendríticas se han descrito para las neuronas DD GABAérgicas como los sitios de entrada de las neuronas colinérgicas presinápticas en el circuito motor de Caenorhabditis elegans. Este circuito sináptico ahora puede servir como un nuevo y poderoso modelo in vivo de morfogénesis y función de la columna vertebral que explota la genética fácil y la fácil accesibilidad de C. elegans a imágenes de células vivas.
Este protocolo describe estrategias experimentales para evaluar la estructura y función de la columna vertebral DD. En este enfoque, se utiliza una estrategia de imágenes de súper resolución para visualizar las formas intrincadas de las espinas dendríticas ricas en actina. Para evaluar la función DD de la columna vertebral, la opsina activada por la luz, Chrimson, estimula las neuronas colinérgicas presinápticas, y el indicador de calcio, GCaMP, informa de los transitorios de calcio evocados en las espinas DD postsinápticas. Juntos, estos métodos comprenden enfoques poderosos para identificar determinantes genéticos de las espinas dendríticas en C. elegans que también podrían dirigir la morfogénesis y la función de la columna vertebral en el cerebro.
Las espinas dendríticas son estructuras celulares especializadas que reciben información de las neuronas vecinas para la transmisión sináptica. La activación de los receptores de neurotransmisores eleva el calcio intracelular y las vías de señalización aguas abajo en estas protuberancias neuronales características1. Debido a la importancia fundamental de las espinas dendríticas para la neurotransmisión y su mala regulación en las enfermedades del neurodesarrollo1, el descubrimiento de factores que modulan la morfogénesis y función de la columna dendrítica es de gran interés para el campo de la neurociencia.
Recientemente, se han identificado espinas dendríticas en el sistema nervioso de C. elegans basadas en características clave compartidas con espinas de mamíferos2. Esta determinación es crucial porque abre la posibilidad de explotar las ventajas de C. elegans para investigar la biología de la columna vertebral. Las espinas dendríticas en las neuronas motoras Dorsal D (DD) reciben información de las neuronas colinérgicas (VA y VB) en el cordón nervioso ventral (Figura 1A)2,3,4. Aquí, se presentan métodos de imagen para explorar la estructura de las espinas dendríticas DD y su función in vivo en un sistema nervioso intacto que es fácilmente accesible para imágenes en vivo y análisis genético. Para monitorear la forma de las espinas dendríticas, (1) proteínas fluorescentes citosólicas, que llenan el proceso dendrítico y las espinas; (2) proteínas fluorescentes unidas a la membrana, que decoran el borde de las espinas dendríticas y dendritas; o (3) se utilizan los marcadores de actina, LifeAct5 o Utrophin6, que están enriquecidos en espinas dendríticas, revelando así su forma. Para monitorear la funcionalidad de las espinas DD, la fluorescencia GCaMP se utiliza para detectar transitorios de Ca++ evocados por la activación de la opsina desplazada al rojo, Chrimson, en neuronas colinérgicas presinápticas7. Se espera que ambas estrategias faciliten el estudio de las espinas dendríticas DD en animales silvestres y mutantes.
1. Determinación de la estructura de las espinas dendríticas DD
2. Evaluación de la activación de las espinas dendríticas DD mediante señalización colinérgica presináptica
Las mediciones con tres marcadores independientes (mCherry citosólico, LifeAct::GFP, MYR::mRuby) arrojaron una densidad promedio de 3.4 ± 1.03 espinas dendríticas DD por 10 μm de dendrita DD en adultos jóvenes de tipo salvaje (Figura 1B, C). Para este análisis, se excluyeron las mediciones obtenidas con el marcador GFP::Utrophin que produjo una densidad de columna significativamente menor (2.4 ± 0.74, Figura 1) debido a las interacciones de Utrophin con el citoesqueleto de actina6 que potencialmente impulsa la morfogénesis de la columna vertebral15. Las mediciones de la densidad de la columna vertebral en el microscopio óptico son comparables al valor de 4,2 espinas/10 μm de dendrita obtenido de la reconstrucción de 12 espinas a partir de micrografías electrónicas de la neurona DD12. El enfoque de imágenes de células vivas confirmó que la morfología delgada / en forma de hongo de las espinas DD predomina en las formas de columna vertebral adultas frente a las alternativas (por ejemplo, filopodionas, rechonchas, ramificadas) (Figura 2B), que también es típica de las espinas en el sistema nervioso de mamíferos maduros16.
Se utilizó una estrategia optogenética para preguntar si las presuntas espinas dendríticas detectadas por microscopía óptica de alta resolución (Figura 1 y Figura 2) responden a la liberación de neurotransmisores de sitios presinápticos, un sello distintivo característico de las espinas dendríticas en las neuronas de mamíferos. Se utilizó luz verde (561 nm) para activar una variante de canalrodopsina, Chrimson, en neuronas colinérgicas presinápticas y luz azul (488 nm) para detectar fluorescencia dependiente de Ca++ emitida por una sonda citoplasmática GCaMP en espinas dendríticas DD postsinápticas. Este experimento detectó ráfagas transitorias de señal GCaMP en espinas DD inmediatamente después de la activación optogenética de Chrimson en neuronas VA presinápticas (Figura 3). El éxito de este experimento depende de la expresión confiable de Chrimson en todas las neuronas VA presinápticas. En este caso, se utilizó un cromosómico integrado17 del marcador Punc-4::Chrimson para asegurar una expresión consistente de VA. Este experimento también podría llevarse a cabo con una matriz extracromosómica. La expresión carmesí en una neurona VA específica puede confirmarse de forma independiente, por ejemplo, acoplando el transgén Chrimson a una secuencia líder transplicada SL2 con una GFP localizada nuclearmente aguas abajo como marcador de coexpresión2. Es esencial realizar un experimento de control en ausencia de ATR para confirmar que la señal GCaMP medida depende de la activación optogenética de Chrimson, que es estrictamente dependiente de ATR (Figura 4D). Finalmente, debido a que las señales evocadas de Ca++ son transitorias, es crucial adoptar un protocolo de imagen que permita la conmutación rápida (<1 s) entre la excitación de 561 nm y la adquisición de señales GCaMP con el láser de 488 nm (Figura 4).

Figura 1: Etiquetado de espinas dendríticas DD . (A) (Arriba) Seis neuronas Dorsales D (DD1-DD6) en el cordón nervioso ventral de C. elegans. (Abajo) En los adultos, las espinas DD (punta de flecha) dirigidas ventralmente contactan con los terminales presinápticos de las neuronas motoras Ventral A (VA) y Ventral B (VB) (magenta), y las comisuras DD se extienden al cordón nervioso dorsal para proporcionar salida GABAérgica a los músculos del cuerpo (flecha)18. Esta cifra ha sido modificada de la Referencia2. (B) Micrografías fluorescentes (Airyscan) de espinas DD marcadas con mCherry citosólico, mRuby miristoilado (MYR::mRuby), LifeAct::GFP y GFP::Utrophin en gusanos adultos jóvenes. Las puntas de flecha grises apuntan a las espinas. Barra de escala = 2 μm. (C) Densidad (espinas/10 μm) de espinas dendríticas de la neurona DD marcadas con mCherry citosólico (3.77 ± 0.9), MYR::mRuby (3.09 ± 0.8), LifeAct::GFP (3.44 ± 1.1) o GFP::Utrophin (2.41 ± 0.8). Todas las muestras se distribuyen normalmente. One-Way ANOVA muestra que las densidades de columna vertebral para mCherry, MYR::mRuby y LifeAct::GFP citosólicos no son significativamente (NS) diferentes, mientras que la densidad de la columna vertebral se reduce para GFP::Utrophin vs. mCherry marcado citosólicamente (p = 0,0016) y LifeAct::GFP (p = 0,0082). La línea roja discontinua representa la densidad de la columna vertebral de las neuronas DD evaluadas a partir de la reconstrucción EM 3D (4,2 espinas / 10 μm). Esta cifra ha sido modificada de la Referencia2. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Imágenes de espinas dendríticas DD. (A) (Arriba) Esquema de las formas de la columna vertebral. (Abajo) Imágenes de Airyscan de cada tipo de columna vertebral (barra de escala = 500 nm) etiquetadas con LifeAct::GFP (verde) y reconstrucciones 3D mediante micrografías electrónicas seriadas de un adulto congelado a alta presión (azul). (B) Frecuencia de la columna vertebral por tipo, visualizada con LifeAct::GFP: Delgado/Hongo (55.5 ± 14.5%), Filopodial (10.3 ± 8.70%), Rechoncho (18.8 ± 10.7%), Ramificado (15.42 ± 6.01%). Frecuencia de espinas por tipo visualizadas con MYR::mRuby: Delgada/Seta (52,2 ± 16,5%), Filopodial (5,68 ± 7,0%), Rechoncha (33,1 ± 14,8%), Ramificada (9,02 ± 9,6%). Prueba T no pareada, filopodial (p = 0,0339); Las espinas Stubby (p = 0.0009) y Branched (p = 0.011) etiquetadas con el marcador MYR::mRuby son significativamente diferentes de LifeAct::GFP. Esta cifra ha sido modificada de la Referencia2. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Estrategias para adquirir imágenes de alta resolución de espinas DD . (A-B) (Arriba) Imágenes fluorescentes de dendritas DD1 marcadas con un marcador citosólico (mCherry) por (A) detector Airyscan y (B) adquisición de Nyquist. (Abajo) La dendrita DD (rojo) se representa con un software de análisis de imágenes (opción de trazador automático de filamentos), y las espinas DD (azul) se ilustran gráficamente utilizando el módulo de detección de espinas semiautomático. La flecha apunta a la columna vertebral ramificada agrandada en C y D. Las puntas de flecha denotan espinas delgadas / hongo vecinas agrandadas en C y D. Barra de escala = 2 μm. (C-D) Ejemplos ampliados de espina ramificada (flecha) (flecha) y (abajo) dos espinas delgadas / hongo vecinas (puntas de flecha) obtenidas con (C) detector Airyscan o por (D) adquisición de Nyquist. Barra de escala = 500 nm. Datos reproducidos de2. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Evaluación de la función de las espinas DD. (A) Las neuronas motoras DD expresan el indicador Ca++ GCaMP6s (verde), y las neuronas motoras VA expresan la variante canalrodopsina, Chrimson (magenta)7. (B) Método de representación esquemática para montar gusanos para mediciones de Ca++ . (1) En un portaobjetos de microscopio limpio, (2) coloque 2 μL de perlas de polietileno de 0.05 μm, (3) use un alambre de platino ("pico de gusano") para agregar un pequeño glóbulo de súper pegamento y (4) gire en la solución para generar hebras filamentosas de pegamento. (5) Añadir 3μL de tampón M9. (6) Coloque aproximadamente diez larvas L4 en la solución, (7) aplique el cubreobjetos y selle los bordes con vaselina/cera. (C-D) La activación de las neuronas VA se correlaciona con transitorios de Ca++ en las espinas DD1. La imagen de fluorescencia GCaMP6s (a intervalos de 0,5 s) con activación periódica de la luz de Chrimson (intervalos de 2,5 s) evoca transitorios de Ca++ con (C) + ATR (n = 12) pero no en controles (D) (-ATR, n = 12). Los paneles son instantáneas a lo largo del tiempo (s), antes y después del pulso de luz de 561 nm (línea rosa vertical). Barras de escala = 2 μm. La señal GCaMP6s se adquiere de un ROI (Región de interés) en la punta de cada columna vertebral. (E) Fluorescencia GCaMP6s durante el período de grabación de 10 s trazado para +ATR (verde) vs -ATR (control, gris) (n = 12 videos). Las barras rosadas verticales denotan iluminación de 561 nm (por ejemplo, activación Chrimson). Cada animal fue estimulado 4 veces con luz de 561 nm. Las mediciones se recogieron antes y después de cada pulso de luz de 561 nm. (F) Gráfico de la fluorescencia GCaMP6s antes y después de cada pulso de luz de 561 nm. La fluorescencia GCaMP6s se midió 1 s después de cada pulso de luz de 561 nm. Debido a que las muestras no se distribuyen normalmente, se aplicó una prueba de Friedman no paramétrica pareada para corregir las comparaciones múltiples de la fluorescencia GCaMP6s antes vs. después de una estimulación lumínica de 561 nm para gusanos cultivados con ATR (+ATR, verde) (*** p = 0,0004, n = 48 mediciones) o en ausencia de ATR (-ATR, gris) (NS, no significativo, p = 0,0962, n = 48 mediciones). Esta cifra ha sido modificada de la Referencia2. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Archivo complementario 1: Lista de plásmidos utilizados en el estudio. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo complementario 2: Composición y preparación del tampón M9. Haga clic aquí para descargar este archivo.
No declaramos ningún conflicto de intereses.
Las espinas dendríticas son características celulares importantes del sistema nervioso. Aquí se describen los métodos de imágenes en vivo para evaluar la estructura y función de las espinas dendríticas en C. elegans. Estos enfoques apoyan el desarrollo de pantallas mutantes para genes que definen la forma o función de la columna dendrítica.
Las imágenes y el análisis de Imaris se realizaron en el recurso compartido de imágenes celulares de Vanderbilt (CIRS) respaldado por NIH (CA68485, DK20593, DK58404, DK59637 y EY08126). El LSM 880 está respaldado por la subvención 1S10OD201630. Las imágenes de un disco giratorio de Nikon se realizaron en el Centro de Excelencia de Nikon. Agradecemos a Jenny Schafer, director de CISR, y Bryan Millis por la capacitación y las discusiones perspicaces y a los miembros del laboratorio de Burnette: Dylan Burnette, Aidan Fenix y Nilay Taneja por sus consejos. Este trabajo fue apoyado por subvenciones de los Institutos Nacionales de Salud a DMM (R01NS081259 y R01NS106951) y una subvención de la American Heart Association a ACC (18PRE33960581).
| All-trans retinal (ATR) | Sigma-Aldrich | R2500-100MG | Cofactor necesario para la excitación neuronal con Chrimson |
| diH2O | MilliQ | Para preparar tampón M9 | |
| Etanol 100% | Sigma | 64-17-5 | Para diluir ATR y hacer placas de control para la excitación neuronal |
| Sal de metanosulfonato de etilo 3-aminobenzoato (tricaína) | Para inmovilizar animales para obtener imágenes de espinas dendríticas | ||
| ImageJ | NIH | (Schindelin J et al., 2012) | Software de procesamiento de imágenes de código abierto |
| KH2PO4 | Fisher Bioreagents | 7758-11-4 | Para preparar el tampón M9 |
| Clorhidrato de levamisol Sigma | 16595-80-5 | Para inmovilizar animales para la obtención de imágenes de espinas dendríticas | |
| MgSO4 | Fisher Chemical | M63-500 | Para preparar el tampón M9 |
| Cubreobjetos para microscopio | Fisherbrand | 12542B | Para montar animales para la adquisición de microscopía |
| Na2HPO4 | Fisher Scientific | S369-500 | Para preparar el tampón M9 |
| NaCl | Fisher Chemical | S671-3 | Para preparar el tampón M9 |
| NIS Elements versión 05.21 | Nikon | Para analizar imágenes y películas (p. ej., deconvolución, alineación de imágenes) | |
| Microesferas de carboxilato de poliperlas de 0,05 um | Polysciences, Inc | 15913-10 | Para inmovilizar animales para obtener imágenes de transitorios de Ca++ |
| Prisma | Para análisis estadísticos y gráficos de transitorios de Ca++ normalizados | ||
| SeaKen ME agarosa | Lonza | 50014 | Para hacer almohadillas de agarosa para montar animales para la obtención de imágenes |
| Super Glue | The gorilla company | Para inmovilizar animales para la obtención de imágenes de transitorios de Ca++ | |
| Portaobjetos de microscopio Superfrost | Fisherbrand | 22-034-980 | Para montar animales para la adquisición de microscopía |
| vaselina | Covidien 8884430300 | Para sellar muestras para instantáneas confocales | |
| Cera | Fisherbrand | 23-021-399 | |
| Microscopio > medio de inclusión < tejido Paraplast para imágenes de superresolución | |||
| LSM880 | DetectorZeiss | AiryScan Zeiss||
| Plan Apochromat (aceite) 63x/ 1,40 NA, WD = 0,19 mm | |||
| Líneas | láser | ||
| Controlador de escenario | |||
| Microscopio > < Nyquist para adquisición de imágenes Nyquist | |||
| A1R Confocal | Nikon | ||
| Plan Fluor (aceite) 40x/1.3 NA, WD 0.24 mm | |||
| 488 nm, 16mW | |||
| 561 nm, 17mW | |||
| confocal Nikon | |||
| Andor DU-897 EMCCD | Cabeza de disco giratorio CSU-X1 Yokogawa Apo TIRF (aceite) 100x/1.49 NA ,WD 0.12 mm 488 nm, 65mW|||
| 561 nm, 86 mW | , | ||
| 525 nm (+/- 18 nm) | |||
| 605 nm (+/- 35 nm) |