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Artículo de método

Definición de las funciones genéticas en la tumorigénesis mediante la ablación ex vivo de alelos floxados en células tumorales malignas de la vaina del nervio periférico

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DOI:

10.3791/62740

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25 de agosto de 2021

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En este artículo

Resumen

Aquí, presentamos un protocolo para realizar knockouts de genes que son embrionarios letales in vivo en tumores derivados de modelos de ratón genéticamente modificados y luego evaluamos el efecto que el knockout tiene sobre el crecimiento tumoral, la proliferación, la supervivencia, la migración, la invasión y el transcriptoma in vitro e in vivo.

Resumen

El desarrollo de nuevos fármacos que se dirigen con precisión a proteínas clave en los cánceres humanos está alterando fundamentalmente la terapéutica del cáncer. Sin embargo, antes de que estos medicamentos puedan ser utilizados, sus proteínas diana deben ser validadas como dianas terapéuticas en tipos específicos de cáncer. Esta validación a menudo se realiza eliminando el gen que codifica el objetivo terapéutico candidato en un modelo de cáncer de ratón genéticamente modificado (GEM) y determinando qué efecto tiene esto en el crecimiento del tumor. Desafortunadamente, los problemas técnicos como la letalidad embrionaria en los knockouts convencionales y el mosaicismo en los knockouts condicionales a menudo limitan este enfoque. Para superar estas limitaciones, se desarrolló un enfoque para ablacionar un gen letal embrionario floxed de interés en cultivos a corto plazo de tumores malignos de la vaina nerviosa periférica (MPNST) generados en un modelo GEM.

Este artículo describe cómo establecer un modelo de ratón con el genotipo apropiado, derivar cultivos tumorales a corto plazo de estos animales y luego extirpar el gen letal embrionario floxed utilizando un vector adenoviral que expresa Cre recombinasa y proteína fluorescente verde mejorada (eGFP). A continuación, se detalla la purificación de las células transducidas con adenovirus mediante clasificación celular activada por fluorescencia (FACS) y la cuantificación de los efectos que la ablación génica ejerce sobre la proliferación celular, la viabilidad, el transcriptoma y el crecimiento del aloinjerto ortotópico. Estas metodologías proporcionan un enfoque eficaz y generalizable para identificar y validar dianas terapéuticas in vitro e in vivo. Estos enfoques también proporcionan una fuente renovable de células derivadas de tumores de bajo paso con artefactos de crecimiento in vitro reducidos. Esto permite estudiar el papel biológico del gen objetivo en diversos procesos biológicos como la migración, la invasión, la metástasis y la comunicación intercelular mediada por el secretoma.

Introducción

Antes de las últimas dos décadas, el tratamiento de los cánceres humanos se basaba en gran medida en la radioterapia y los agentes quimioterapéuticos que se dirigían ampliamente a las poblaciones celulares que proliferaban rápidamente al dañar el ADN o inhibir la síntesis de ADN. Aunque estos enfoques inhibieron el crecimiento de células cancerosas, también tuvieron efectos secundarios perjudiciales en los tipos de células normales que proliferan rápidamente, como las células epiteliales intestinales y las células del folículo piloso. Más recientemente, la terapia contra el cáncer ha comenzado a utilizar agentes quimioterapéuticos que se dirigen con precisión a las pr....

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Protocolo

Antes de realizar cualquier procedimiento con ratones, todos los procedimientos deben ser revisados y aprobados por el Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales. El protocolo descrito en este manuscrito fue aprobado por el Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales de la Universidad Médica de Carolina del Sur. Este protocolo fue realizado por personal debidamente capacitado siguiendo las pautas institucionales de cuidado de animales de MUSC.

1. Generación de ratones que desarrollan MPNST homocigotos para alelos flox Erbb4

  1. Producir la generación F1 de P 0-GGFβ3; Trp53....

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Resultados

La Figura 4 ilustra un resultado típico obtenido al transducir P 0-GGFβ3; Trp53-/+; Células MPNST Erbb4fl/fl con el adenovirus Ad5CMV-eGFP o el adenovirus Ad5CMV-Cre/eGFP (Figura 4A). Los cultivos se observan con microscopía de fluorescencia para identificar células que expresan eGFP y mediante microscopía de contraste de fase para determinar el número total de células presentes en el mismo campo a 10x (arriba) .......

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Discusión

Los métodos detallados presentados aquí se desarrollaron utilizando un modelo GEM de MPNST. Sin embargo, si el tejido tumoral de interés se puede dispersar en células individuales, estas metodologías son fácilmente adaptables para varios tipos de tumores que surgen en los GEM. Es importante asegurarse de que el alelo floxed no resulte en i) disminución de la supervivencia que puede dificultar la obtención de suficientes ratones para detectar tumores, o ii) aumento de la latencia tumoral que puede dificultar la obtención .......

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Divulgaciones

Los autores no tienen conflictos de intereses que revelar.

Agradecimientos

Este trabajo fue apoyado por subvenciones del Instituto Nacional de Enfermedades Neurológicas y Accidentes Cerebrovasculares (R01 NS048353, R01 NS109655), el Instituto Nacional del Cáncer (R01 CA122804), el Departamento de Defensa (X81XWH-09-1-0086, W81XWH-11-1-0498, W81XWH-12-1-0164, W81XWH-14-1-0073 y W81XWH-15-1-0193), y The Children's Tumor Foundation (2014-04-001 y 2015-05-007).

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Ad5CMV-eGFPNúcleo de vector de transferencia de genes, Universidad de IowaVVC-U de Iowa-4
Ad5CMVCre-eGFPNúcleo de vector de transferencia de genes, Universidad de IowaVVC-U de Iowa-1174
Alexa 568 anticuerpo secundarioThermo/FisherGaR A11036
Bioconductor Software de código abierto para bioinformáticaBioconductorhttp://www.bioconductor.orgHerramienta de análisis estadístico alternativa utilizada para el paso 4.4
CD31Abcamab28364
Celigo Citómetro de imagenNexcelom BioscienceN/A
CellStripper Corning25-056-Clmezcla de quelantes kit de
tinción DABVector LabsMP-7800
DAVID (Base de datos para anotación, visualización y descubrimiento integrado)DAVIDhttps://david.ncifcrf.govsoftware de análisis de enriquecimiento funcional utilizado para el paso 4.5
DMEMCorning15-013-Cl
DreamTaq y Buffer (Genotyping PCR)Thermo/FisherEP0701 y K1072
Anticuerpos erbB4Santa Cruzsc-284
erbB4anticuerpos Abcamab35374
erbB4 anticuerposMilliporeHFR1: 05-1133
FACS SorterBD BiosciencesAria II
ForskolinSigmaF6886
GenomeSpace Herramientas y fuentes de datosGenomeSpacehttps://genomespace.org/support/tools/recurso general para varios tipos de herramientas bioinformáticas de código abierto para el paso 4.5
GlutaminaCorning25-005-
Gorilla Gene Ontology enRIchment anaLysis and visuaLizLizAtion toolGorillaN/A, http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.ilsoftware de análisis de enriquecimiento funcional utilizado para el paso 4.5
GSEA Gene Set Enrichment AnalysisBroad InstituteN/A, https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp software deanálisis de enriquecimiento funcional utilizado para el paso 4.5
HSD: Ratones Athymic Nude-FOxn1nuEnvigo (anteriormente Harlan Labs)69
Illumina HiSeq2500 (secuenciador de ADN de próxima generación)Secuenciador de ADN IlluminaHi Seq 2500utilizado para el paso 4.2
Lasergene: Expresión génica ArrayStar y análisis de variantesDNAStar Software LaserGeneN/Aanálisis estadístico y de normalización utilizado para el paso 4.4
Lasergene: Ensamblaje de alineación de secuencias SeqMan NGenAlineación de software utilizada para el paso 4.3/Autilizada para el paso 4.3
Matrigel, matriz de membrana basal de bajo factor de crecimientoCorning354230
NRG1-betaInternamente Generado por SLC, también disponible comercialmente en R & D Sistemas (396-HB-050/CF).
Tinción nuclear Hoeschst 33342Thermo62249
Sistema de clasificación de ontologías genéticasPanther Softwarede análisis de enriquecimiento funcional http://pantherdb.org utilizado para el paso 4.5
Partek (alineador y analizador BWA)Partek, Ver 7N/Aalineación de software y estadística/normalización utilizada para el paso 4.3
Pen/StrepCorning30-002-CL
Imprimación 1: 5′-CAAATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTGT
GTCTG- 3′
Eurofins GenomicsPrimer 1 + 2: 250  bp ErbB4 producto nulo y un 350  producto bp Floxed ErbB4;
Primer 2: 5′-TTTTGCCAAGTTCTAATTCCATC
AGAAGC-3′
Eurofins GenomicsPrimer 1 + 2: 250  bp ErbB4 producto nulo y un 350  producto bp Floxed ErbB4;

Primer 3: 5′-TATTGTGTTCATCTCTATCATTGCA
ACCCAG-3′

Eurofins GenomicsPrimer 1 + 3: 350  producto ErbB4 de tipo salvaje.
Propidium IodoFisher51-351-0
Perfilador de proteoma Matrices de fosfoquinasaR& D SystemsARY003B
Ensayo de viabilidad celular bioluminiscenteGlo PromegaG9712tiempo real
ToppGene SuiteToppGenehttps://toppgene.cchmc.orgsoftware de análisis de enriquecimiento funcional utilizado para el paso 4.5
Trizol (reactivo basado en ácido-cuanidinio-fenol y cloroformo)Invitrogen15596026
Kit de amplificación de señal de tiramidaPerkin ElmerNEL721001EA
Cl software de Alineación de software N de en

Referencias

  1. Ricciuti, B., et al. Antibody-drug conjugates for lung cancer in the era of personalized oncology. Seminars in Cancer Biology. 69, 268-278 (2019).
  2. Litak, J., Mazurek, M., Grochowski, C., Kamieniak, P., Rolinski, J. PD-L1/PD-1 axis in glioblast....

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