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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
DetectSyn es un ensayo fluorescente rápido e imparcial que mide los cambios en el número relativo de sinapsis (compromiso pre y postsináptico) en todos los tratamientos o estados de enfermedad. Esta técnica utiliza una técnica de ligadura de proximidad que se puede utilizar tanto en neuronas cultivadas como en tejido fijo.
Las sinapsis son el sitio de comunicación entre las neuronas. La fuerza del circuito neuronal está relacionada con la densidad sináptica, y la descomposición de las sinapsis es característica de estados de enfermedad como el trastorno depresivo mayor (TDM) y la enfermedad de Alzheimer. Las técnicas tradicionales para investigar los números de sinapsis incluyen la expresión genética de marcadores fluorescentes (por ejemplo, proteína fluorescente verde (GFP)), colorantes que llenan una neurona (por ejemplo, colorante de carbocianina, DiI) y detección inmunofluorescente de marcadores de columna vertebral (por ejemplo, densidad postsináptica 95 (PSD95)). Una advertencia importante a estas técnicas de proxy es que solo identifican cambios postsinápticos. Sin embargo, una sinapsis es una conexión entre un terminal presináptico y una columna vertebral postsináptica. El estándar de oro para medir la formación / eliminación de sinapsis requiere técnicas de microscopía electrónica o tomografía de matriz que consumen mucho tiempo. Estas técnicas requieren capacitación especializada y equipo costoso. Además, solo se puede evaluar un número limitado de neuronas y se utilizan para representar cambios en toda una región del cerebro. DetectSyn es una técnica fluorescente rápida que identifica cambios en la formación o eliminación de sinapsis debido a un estado de enfermedad o actividad farmacológica. DetectSyn utiliza un ensayo de ligadura de proximidad rápida para detectar proteínas pre y postsinápticas yuxtapuestas y microscopía fluorescente estándar, una técnica fácilmente disponible para la mayoría de los laboratorios. La detección fluorescente de la puntería resultante permite un análisis rápido e imparcial de los experimentos. DetectSyn proporciona resultados más representativos que la microscopía electrónica porque se pueden analizar áreas más grandes que un número limitado de neuronas fluorescentes. Además, DetectSyn funciona para neuronas cultivadas in vitro y cortes de tejido fijo. Finalmente, se proporciona un método para analizar los datos recopilados de esta técnica. En general, DetectSyn ofrece un procedimiento para detectar cambios relativos en la densidad de sinapsis a través de tratamientos o estados de enfermedad y es más accesible que las técnicas tradicionales.
Las sinapsis son la unidad fundamental de comunicación entre neuronas1. Muchas sinapsis entre neuronas dentro de las mismas regiones dan lugar a circuitos que median el comportamiento2. Las sinapsis consisten en un terminal presináptico de una neurona que libera neurotransmisores o neuropéptidos que transmiten información a los receptores postsinápticos de otra neurona. La suma de señales presinápticas determina si la neurona postsináptica disparará un potencial de acción y propagará el mensaje a otras neuronas.
La sinaptopatología, la descomposición de las sinapsis, surge en enfermedades y trastornos marcados por la disminución del volumen neural, como la enfermedad de Alzheimer y el trastorno depresivo mayor, lo que resulta en circuitos que ya no funcionan de manera óptima 3,4,5. La restauración de la densidad de la sinapsis probablemente subyace a la eficacia de los posibles tratamientos para estos trastornos. Por ejemplo, recientemente se demostró que el aumento de las sinapsis subyace a la eficacia conductual de los antidepresivos rápidos6. Para detectar rápidamente posibles tratamientos de sinaptopatología, los investigadores requieren técnicas que identifiquen rápidamente los cambios en los números de sinapsis.
Las metodologías actuales consumen mucho tiempo y son costosas (microscopía electrónica, tomografía de matriz), o solo examinan los cambios postsinápticos sin incorporar el compromiso presináptico (análisis de la columna vertebral, inmunofluorescencia / colocalización). Los colorantes como DiI o las proteínas fluorescentes como GFP ayudan a visualizar las neuronas y caracterizar las espinas postsinápticas. Sin embargo, el análisis de la columna vertebral utiliza proporciones definidas por el investigador para determinar la morfología, lo que puede disminuir la reproducibilidad7. Además, todavía se está descubriendo cómo las diferentes clases de columna vertebral se relacionan con las sinapsis funcionales8. La formación de la columna vertebral puede ser transitoria y puede reflejar plasticidad postsináptica, pero estas espinas podrían eliminarse antes de estabilizarse en una sinapsis con una neurona presináptica9.
La colocalización proporciona un mejor indicador de las sinapsis que el análisis de la columna vertebral porque se puede inmunotintar las proteínas presinápticas y postsinápticas. Sin embargo, las proteínas sinápticas pueden producir valores bajos de colocalización porque las proteínas se yuxtaponen y pueden no superponerse consistentemente. Por lo tanto, debido a que las proteínas no están totalmente superpuestas, las técnicas de colocalización pueden no medir con precisión los cambios en la formación de sinapsis debido a esta información faltante. Finalmente, aunque tanto la microscopía electrónica (EM) como la tomografía de matriz proporcionan imágenes de alta resolución de sinapsis, consumen mucho tiempo. La EM requiere además equipo especializado, y los investigadores están limitados a pequeños volúmenes de tejido para cualquier experimento dado. Si bien la tomografía de matriz proporciona elegantemente la capacidad de detectar muchas proteínas en secciones ultrafinas y se puede combinar con EM10, esta técnica puede ser demasiado laboriosa y estar más allá del alcance de los experimentos que necesitan escanear rápidamente en busca de cambios en la formación de sinapsis.
DetectSyn es una aplicación específica del ensayo de ligadura de proximidad Duolink. El ensayo de PLA permite la detección general de interacciones proteína-proteína. DetectSyn une las medidas postsinápticas proxy amplificando una señal fluorescente emitida por proteínas pre y postsinápticas etiquetadas dentro de los 40 nm entre sí. Si las proteínas sinápticas están dentro de los 40 nm, como dentro de una hendidura sináptica, entonces los anticuerpos secundarios, que contienen sondas de ADN, se hibridarán en ADN circular. Este ADN circular hibridado expresa una sonda fluorescente, que luego se amplifica y detecta con técnicas estándar de microscopía fluorescente (ver Figura 1). Crucialmente, a diferencia de la EM y la tomografía de matriz, esta técnica no requiere equipo especializado y toma aproximadamente la misma cantidad de tiempo que la inmunohistoquímica estándar. La accesibilidad de esta técnica, por lo tanto, permite a los investigadores fuera de las instituciones intensivas en investigación participar en la investigación sinaptopatología. Además, esta técnica puede examinar los cambios en la densidad sináptica en múltiples regiones del cerebro dentro de un solo experimento, ofreciendo una representación más holística de los cambios sinápticos debido a una enfermedad o tratamiento.
El aislamiento de células y tejidos de animales se realizó de acuerdo con la Guía para el Cuidado y Uso de Animales de Laboratorio de los Institutos Nacionales de Salud y fue aprobado por el Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales de Wake Forest
NOTA: Este protocolo se utiliza en muestras ya tratadas y fijadas según paradigmas y requisitos experimentales específicos. Para fines de demostración, la formación de sinapsis debido al tratamiento antidepresivo rápido se utiliza para resaltar esta técnica de detección de sinapsis6. Las neuronas previamente cultivadas en cápsulas, tratadas, fijadas en paraformaldehído al 4% (PFA) y almacenadas en solución salina tamponada con 1x fosfato (PBS) se utilizarán para resaltar los procedimientos in vitro. Se utilizará tejido del hipocampo previamente cortado (25 μm de espesor) de ratones tratados, perfundido transcárdicamente con PBS helado y PFA al 4%, y luego almacenado en crioprotector para resaltar los procedimientos de rebanada. Consulte11,12 para obtener más información sobre cómo cultivar neuronas o perfundir roedores transcárdicos. Consulte la Figura 1 para obtener una representación gráfica de este procedimiento.

Figura 1: Representación gráfica del ensayo DetectSyn. Después de permeabilizar las membranas celulares, los anticuerpos primarios para Synapsin1 y PSD95 se unen a estas proteínas sinápticas. Los secundarios con etiquetas de oligonucleótidos se unen a los anticuerpos primarios. Si Synapsin1 y PSD95 están dentro de los 40 nm, como en una sinapsis, entonces los oligonucleótidos interactúan y se amplifica una etiqueta fluorescente. Esta señal fluorescente puede ser fotografiada a través de microscopía estándar y analizada. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
1. Enjuague las muestras
2. Bloquear y permeabilizar muestras
3. Incubar muestras en anticuerpos primarios
4. Lavar las muestras, luego incubar en anticuerpos secundarios
5. Ligadura
6. Amplificación
7. Montaje
8. Obtener imágenes digitales con un microscopio confocal
9. Análisis
Los datos modificados de Heaney et al.6 se presentan para demostrar un experimento en el que se espera una mayor formación de sinapsis (consulte6 para obtener más información y una discusión más profunda del mecanismo). Anteriormente, se demostró que los antidepresivos rápidos requieren la activación del receptor metabotrópico inhibidor, GABAB (gamma-aminobutyric acid subtype B), para serefectivos 13. Además, los datos anteriores indicaron que los antidepresivos rápidos aumentan los marcadores postsinápticos14; por lo tanto, DetectSyn se utilizó para probar la hipótesis de que los antidepresivos rápidos aumentan el número de sinapsis para ser efectivos.
En neuronas cultivadas, se prueban cuatro condiciones. En primer lugar, en el panel superior de la Figura 2A, las neuronas cultivadas fueron tratadas con el vehículo en las mismas condiciones que el control experimental. Sin embargo, se omite el anticuerpo primario PSD95 para proporcionar un control técnico para el ensayo DetectSyn (consulte la Figura 1 para saber cómo contribuye cada componente a la señal). A continuación, en el panel de control, las neuronas vuelven a ser tratadas con el vehículo pero reciben las primarias PSD95 y Synapsin1. A continuación, las neuronas cultivadas se tratan solo con el antidepresivo rápido Ro-25-6981 (Ro) o Ro más el agonista GABAB, baclofeno (Bac). Como se demostró anteriormente13, tanto el antidepresivo rápido Ro-25-6981 como el agonista GABAB baclofeno son necesarios para la eficacia in vitro de Ro-25-6981. Por lo tanto, un aumento en la formación de sinapsis se demuestra por un aumento en la puncta blanca (Figura 2A). Sin baclofeno, no se observa un aumento en la formación de sinapsis in vitro .
In vivo, los niveles basales de GABA son suficientes para que el antidepresivo rápido funcione13, por lo que solo el antidepresivo rápido Ro-25-6981 se administra mediante inyección intraperitoneal a ratones (Figura 2B). El panel izquierdo de la Fig. 2B representa otro control técnico para el ensayo DetectSyn. El tejido del hipocampo de un ratón tratado con solución salina se sondeó con ambos primarios para PSD95 y Synapsin1, pero se omitió uno de los secundarios. Un aumento en la formación de sinapsis debido al tratamiento con el antidepresivo rápido Ro-25-6981 en comparación con los ratones tratados con solución salina se demuestra en los paneles medio y derecho de la Figura 2B.
Se muestran imágenes representativas para controles técnicos in vitro y ex vivo . En la Figura 2A, se omite uno de los primarios para los pares sinápticos (es decir, PSD95), y en la Figura 2B, se omite uno de los secundarios. Si bien algunos puntos aparecen en las imágenes de control técnico, generalmente no son del mismo tamaño, como lo demuestra la mota blanca en el panel superior de la Figura 2A en comparación con los grandes puntos en los otros paneles. Además, estos puntos no están en la misma ubicación que los puntos cuantificados, como lo demuestran algunos puntos que aparecen dentro del soma del control técnico en la Figura 2B. Por lo general, los puntos inespecíficos ocurren dentro de los núcleos, tal vez debido a la presencia de ADN.
Para analizar los resultados representativos en la Figura 2A, las dendritas (visualizadas por tinción MAP2 y representadas aquí en un contorno gris) se trazaron utilizando una herramienta de dibujo a mano alzada para crear regiones de interés (ROI). En primer lugar, el área de los ROI map2 se obtuvo utilizando la función ELEMENTOS NIS, Datos de ROI en la pestaña Resultados de medición automatizada . A continuación, se detectaron puntos utilizando la función Umbral en Elementos NIS. Esta función crea una máscara binaria de objetos que se encuentran dentro de un umbral de intensidad definido. Luego, se detectó el número de objetos binarios dentro de los ROI MAP2 utilizando la función Elementos NIS, Binario en ROI, en la pestaña Resultados de medición automatizada . Los datos presentados en el gráfico a la derecha de la Figura 2A son los valores normalizados de la punta divididos por el área del ROI.
Para analizar los resultados representativos de la Figura 2B, se trazó el estrato radiatum del CA1 utilizando una herramienta de dibujo a mano alzada para crear un ROI. En primer lugar, el área del ROI se obtuvo utilizando la función de datos de ROI, como se describe en el párrafo anterior. A continuación, se detectaron puntos de puntuación utilizando la función Detección de puntos - Puntos brillantes , ubicada en el menú Binario . A continuación, se eligieron los valores de diámetro y contraste en función de la inspección visual de múltiples cortes de todos los tratamientos. Una vez que se decidieron estos valores, se aplicaron de manera uniforme en todas las imágenes analizadas. La función Detección de puntos crea máscaras binarias de objetos dentro del conjunto de parámetros de diámetro y contraste definidos. Luego, se detectó el número de objetos binarios dentro de los ROI MAP2 utilizando la función Elementos NIS, Binario en ROI, en la pestaña Resultados de medición automatizada . Los datos presentados en el gráfico a la derecha de la Figura 2B son los valores normalizados de la punta divididos por el área del ROI.

Figura 2: Detección de sinapsis mediante el ensayo DetectSyn. Las puntas blancas representan las sinapsis detectadas con detectSyn PSD95-Synapsin1 ensayo de ligadura de proximidad (puntas de flecha amarillas) en (A) neuronas primarias del hipocampo cultivadas in vitro y (B) estrato radiatum CA1 ex vivo . En (A), el contorno gris representa la tinción MAP2. En (A), el panel superior etiquetado como control PLA representa muestras tratadas solo con vehículo, como el Control. Sin embargo, el primario PSD95 no se incluyó en la reacción. En los dos últimos paneles, las neuronas fueron tratadas con el antidepresivo rápido Ro-25-6981 (Ro, 10 μM) o Ro más el agonista GABAB baclofeno (Bac, 50 μM) durante 90 min. El aumento del número de puntas (identificadas con puntas de flecha amarillas) indica que in vitro, la formación de sinapsis solo aumenta cuando se administra el antidepresivo rápido Ro-25-6981 con el agonista GABAB. En (B), el verde representa las dendritas teñidas con MAP2, y el azul representa los núcleos teñidos con DAPI. Las dendritas individuales, delineadas en rectángulos amarillos en las imágenes combinadas, se aíslan debajo de imágenes representativas para demostrar que las puntitas se localizan en dendritas. Los animales fueron tratados con Ro-25-6981 (10 mg/kg), y el tejido se recolectó 45 min después del tratamiento. El aumento del número de puntas (identificados por puntas de flecha amarillas) indica que in vivo, el número de sinapsis aumenta con la señalización basal de GABA y el antidepresivo rápido Ro-25-6981. La cuantificación de resultados representativos está representada por los gráficos de barras e indica el número promedio de puntos detectSyn dividido por el área MAP2. Los resultados se normalizan al control experimental. Las imágenes se obtuvieron utilizando un microscopio confocal Nikon A1plus. Barras de escala = (A) 10 μm; (B, arriba) 50 μm; (B, abajo) 5 μm. Las barras representan el error estándar medio +/- de la media. Resultados analizados por ANOVA unidireccional: * p < 0,05, ** p < 0,01, *** p < 0,001, **** p < 0,0001 mediante análisis post-hoc. La figura ha sido modificada a partir de Heaney et al.6. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Los autores no reportan ningún conflicto de intereses.
DetectSyn es un ensayo fluorescente rápido e imparcial que mide los cambios en el número relativo de sinapsis (compromiso pre y postsináptico) en todos los tratamientos o estados de enfermedad. Esta técnica utiliza una técnica de ligadura de proximidad que se puede utilizar tanto en neuronas cultivadas como en tejido fijo.
Este trabajo fue apoyado por los Institutos Nacionales de Salud NINDS R01 NS105005 (KRG) y NS105005-03S1 (KRG), el Departamento de Defensa USAMRMC W81XWH-14-1-0061 (KRG), NIAAA R01AA016852, NIAAA T32AA007565 (CFH), y una subvención de FRAXA Research (CFH) y la Asociación de Alzheimer, AARG-NTF-21-852843 (KRG), AARF-19-614794-RAPID (KRG).
| 10x PBS | Fisher Scientific BP39920 | PBS también hicieron obras internas. | |
| Placas de 24 pocillos | Fisher Scientific | FB012929 | En el caso de las rebanadas de tejido, es posible que no sean necesarias placas preesterilizadas. |
| Tubos cónicos de 50 mL | Fisher Scientific | 14-432-22 | |
| Papel de aluminio | Fisher Scientific | 15-078-290 | |
| Pollo anticuerpo anti-MAP2 | Abcam | ab5392 | |
| Esmalte de uñas transparente | Fisher Scientific | NC1849418 | Otros esmaltes de uñas transparentes también funcionan. |
| Bloque frío | Fisher Scientific | 13131012 | |
| Estación de trabajo informática | HP | ||
| Microscopio confocal o fluorescente | Nikon | A1R HD25 | |
| Burro anti-pollo FITC | Fisher Scientific | SA1-72000 | |
| Duolink burro anti-Ratón PLUS | Sigma | DUO92001 | |
| Duolink burro anti-Conejo MENOS | Sigma | DUO92005 | |
| Duolink Reactivos de detección in situ Far Red | Sigma | DUO92013 | Contiene material de ligadura, material de amplificación, ligasa y polimerasa. |
| Medio de montaje in situ Duolink con DAPI | Sigma | DUO82040 | |
| tampones de lavado in situ Duolink, fluorescencia | Sigma | DUO82049 | contiene tampón de lavado A y tampón de lavado B; diluya el tampón de lavado B al 1% en diH20 para un tampón de lavado B al 1%. |
| El pincel de punta fina | Fisher Scientific | NC9691026 | pelo de marta, tamaño 00 o 000, también se puede encontrar en las tiendas de manualidades |
| Fisherbrand Cover Glasses: Rectángulos | Fisher Scientific | 12545MP | Cover glass es innecesario para las neuronas cultivadas que ya están en cubreobjetos de vidrio. |
| Portaobjetos de microscopio Superfrost Plus | de Fisherbrand Fisher Scientific | 1255015 | Para las neuronas cultivadas que ya están en cubreobjetos de vidrio, los portaobjetos Superfrost pueden ser innecesarios. |
| Congelador, -20 grados; C | VWR | 76449-108 | |
| Cubreobjetos de vidrio | Fisher Scientific | 125480 | |
| Glycine | Fisher Scientific | BP381-1 | |
| Software de procesamiento de imágenes | , p. ej. NIS Elements, ImageJ | ||
| Incubator | Fisher Scientific | 15-015-2633 | |
| Placa de Petri grande, 100 mm | Fisher Scientific | FB0875712 | |
| Agua de grado molecular | Fisher Scientific | BP24701 | |
| Anticuerpo anti-Synapsin1 para ratones | Synaptic Systems | 106-011 | |
| Suero de burro normal | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 | |
| Agitador orbital | Fisher Scientific | 02-106-1013 | |
| Parafilm | Fisher Scientific | 13-374-10 | |
| Puntas de pipeta | Fisher Scientific | 02-707-025 | |
| Pipetas | Fisher Scientific | 14-388-100 | Los volúmenes de trabajo oscilan entre 3 y micro; L a 500 y micro; L |
| Pipeta pasteur de plástico | Fisher Scientific | 02-708-006 | |
| Pinzas de precisión/foreceps | Fisher Scientific | 12-000-122 | |
| Anticuerpo anti-PSD95 de conejo | Abcam | ab18258 | Otros pares de anticuerpos también pueden funcionar con optimización. |
| Frigorífico | VWR | 76470-402 | |
| Placa de Petri pequeña, 60 mm | Fisher | Scientific FB0875713A | |
| Temporizador | Fisher Scientific | 14-649-17 | |
| Tween 20 | Fisher Scientific | BP337-100 |