Este artículo describe un flujo de trabajo de técnicas empleadas para probar nuevos mediadores candidatos de metástasis de melanoma y sus mecanismos de acción.
Artículo de método
Este artículo describe un flujo de trabajo de técnicas empleadas para probar nuevos mediadores candidatos de metástasis de melanoma y sus mecanismos de acción.
La metástasis es un proceso complejo que requiere que las células superen barreras que solo se modelan de manera incompleta mediante ensayos in vitro . Se estableció un flujo de trabajo sistemático utilizando modelos in vivo robustos y reproducibles y métodos estandarizados para identificar nuevos actores en la metástasis del melanoma. Este enfoque permite la inferencia de datos en etapas experimentales específicas para caracterizar con precisión el papel de un gen en la metástasis. Los modelos se establecen mediante la introducción de células de melanoma modificadas genéticamente a través de inyecciones intracardíacas, intradérmicas o subcutáneas en ratones, seguidas de monitoreo con imágenes seriales in vivo . Una vez que se alcanzan los criterios de valoración preestablecidos, los tumores primarios y / o los órganos portadores de metástasis se extraen y procesan para diversos análisis. Las células tumorales se pueden clasificar y someter a cualquiera de varias plataformas "ómicas", incluida la secuenciación de ARN unicelular. Los órganos se someten a análisis de imagen e inmunohistopatológicos para cuantificar la carga general de metástasis y mapear su ubicación anatómica específica. Esta tubería optimizada, que incluye protocolos estandarizados para el injerto, monitoreo, recolección de tejidos, procesamiento y análisis, se puede adoptar para cultivos a corto plazo derivados de pacientes y líneas celulares humanas y murinas establecidas de varios tipos de cáncer sólido.
La alta mortalidad asociada con el melanoma metastásico combinada con una incidencia creciente de melanoma en todo el mundo1 (un aumento estimado del 7,86% para 2025) requiere nuevos enfoques de tratamiento. Los avances en el descubrimiento de objetivos dependen de modelos reproducibles de metástasis, un proceso altamente complejo. A lo largo de los pasos de la cascada metastásica, las células de melanoma deben superar innumerables barreras para lograr la evasión del sistema inmune y la colonización de tejidos distantes2. La resiliencia y adaptabilidad de las células de melanoma surgen de multitud de factores, entre ellos su elevada carga mutacional genética3 y su origen en la cresta neural, que confieren una plasticidad fenotípica crucial 3,4,5. En cada paso, los programas transcripcionales permiten que las células de melanoma en metástasis cambien de un estado a otro en función de las señales de la diafonía con el microambiente, que comprende el sistema inmune6, el medio extracelular 7,8 y la arquitectura celular de las barreras físicas9 con las que entran en contacto. Por ejemplo, las células de melanoma escapan a la vigilancia inmune al regular a la baja la expresión de importantes factores secretos por tumores inmunocebadores6.
Los estudios describen un "nicho premetastático", en el que las células de melanoma secretan quimiocinas y citoquinas para preparar el órgano "objetivo" distante para la metástasis10. Estos hallazgos plantean preguntas importantes sobre el tropismo de los órganos de las células de melanoma metastásico y la ruta anatómica que toman para acceder a tejidos distantes. Después de la intravasación, se sabe que las células de melanoma hacen metástasis a través de los linfáticos (diseminación linfática) y los vasos sanguíneos (diseminación hematógena)2,11. Si bien la mayoría de los pacientes presentan enfermedad localizada, un pequeño subconjunto de casos se presenta con enfermedad metastásica a distancia y sin diseminación linfática (afectación negativa de los ganglios linfáticos)11, lo que sugiere la existencia de vías metastásicas alternativas para el melanoma.
Cuando colonizan un sitio metastásico, las células de melanoma experimentan adaptaciones epigenéticas y metabólicas12,13. Para acceder e invadir nuevos compartimentos, las células de melanoma emplean proteasas14 y modificaciones citoesqueléticas 11,15, que les permiten atravesar y crecer en su nueva ubicación. La dificultad para atacar las células de melanoma reside en la complejidad y el número de tales adaptaciones; por lo tanto, el campo debe hacer esfuerzos para recrear experimentalmente tantos pasos y adaptaciones como sea posible. A pesar de los numerosos avances en ensayos in vitro como organoides y cultivos 3D16,17, estos modelos solo recapitulan incompletamente la cascada metastásica in vivo.
Los modelos murinos han demostrado valor al lograr un equilibrio entre la reproducibilidad, la viabilidad técnica y la simulación de enfermedades humanas. Las células de melanoma implantadas intravascular, ortotópica y heterotópicamente a partir de xenoinjertos derivados del paciente o cultivos a corto plazo en ratones inmunocomprometidos o humanizados representan la columna vertebral del descubrimiento de dianas en el melanoma metastásico. Sin embargo, estos sistemas a menudo carecen de una restricción biológica crucial en la metástasis: el sistema inmunológico. Los modelos de metástasis de melanoma singénico que poseen esta restricción son relativamente escasos en el campo. Estos sistemas, desarrollados en ratones inmunocompetentes, incluyendo B16-F1018, la familia YUMM de líneascelulares 19, SM120, D4M321, RIM322 o más recientemente, las líneas celulares de melanoma RMS23 y M1 (Mel114433), M3 (HCmel1274), M4 (B2905)24 , facilitan la investigación del complejo papel de la respuesta inmune del huésped en la progresión del melanoma.
Aquí, se presenta una tubería para la identificación del objetivo de metástasis de melanoma. Con el aumento y la generación de conjuntos de datos ómicos a partir de cohortes de pacientes con melanoma, postulamos que los estudios que tienen la promesa más clínica son los que se derivan de la integración de big data, lo que lleva a un meticuloso interrogatorio funcional y mecanicista 25,26,27,28. Mediante el uso de modelos de ratón para estudiar objetivos potenciales en el proceso metastásico, se pueden tener en cuenta los eventos específicos in vivo y las interacciones tisulares, lo que aumenta la probabilidad de traducción clínica. Se describen múltiples métodos para cuantificar la carga metastásica, proporcionando datos complementarios sobre los resultados de cualquier experimento dado. Se describe un protocolo para el aislamiento unicelular de tumores en varios órganos para ayudar a la caracterización imparcial de la expresión génica en células metastásicas, que puede preceder a la secuenciación de ARN unicelular o a granel.
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NOTA: Los procedimientos de animales involucrados en el siguiente protocolo fueron aprobados por el Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales de la Universidad de Nueva York (IACUC). Todos los procedimientos se llevan a cabo en instalaciones aprobadas por la Association for Assessment and Accreditation of Laboratory Animal Care International (AAALAC). La Figura 1 muestra el enfoque experimental general.
1. Cultivos a corto plazo de melanoma derivado del paciente (STC)

Figura 1: Esquema que ilustra el flujo de trabajo descrito, desde la integración de datos de pacientes hasta la generación y análisis de datos in vivo de ratones. Abreviaturas: LOF = pérdida de función; GOF = ganancia de función. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
2. Implantación de xenoinjerto
NOTA: Los procedimientos experimentales descritos aquí se llevan a cabo en ratones que tienen sistemas inmunes adaptativos e innatos deteriorados, NOD.Cg-PrkdcscidIl2rgtm1Wjl / SzJ (NSG) ratones; o en ratones que carecen solo de inmunidad adaptativa, como los ratones atímicos/desnudos (NU/J) deficientes en células T. Los animales son de sexo masculino, de 8 a 10 semanas de edad. Las mujeres a menudo exhiben una alta incidencia de metástasis gonadales tras la inyección intracardíaca de células tumorales, lo que reduce su supervivencia.
3. Cirugía de supervivencia por etapas (SSS)
4. Imágenes in vivo (Figura 2A)
5. Resonancia magnética ex vivo
6. Procesamiento de tejidos para la secuenciación de ARN unicelular o a granel
7. Perfusión de tejidos animales y preparación para análisis inmunohistológicos

Figura 2: Ejemplos de imágenes de tinción BLI, campo brillante, fluorescencia ex vivo y H&E que ilustran el enfoque múltiple para el análisis de los efectos de los genes candidatos en la metástasis del melanoma. (A) BLI, (B) BF, (C) fluorescencia ex vivo y (D) imágenes de tinción H&E. Las imágenes utilizadas con fines ilustrativos corresponden a un experimento en el que se inyectaron células de melanoma 131/6-4L transducidas con un shRNA de control no dirigido (shNTC) o un shRNA dirigido a FUT8 en ratones inmunodeficientes (NSG). El silenciamiento de FUT8 perjudicó la diseminación metastásica de las células de melanoma. Barras de escala y barra de color = p/seg/cm2/sr × 106 (A), 100 mm (B, C), 100 μm (D). Abreviaturas: BLI = imágenes de bioluminiscencia; H&E = hematoxilina y eosina; shRNA = ARN de horquilla corta; shNTC = shRNA de control no dirigido; NSG = gamma de inmunodeficiencia combinada severa diabética no obesa; FUT8 = fucosiltransferasa 8; BF = campo brillante. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
8. Tinción de proteínas del aparato mitótico nuclear (NuMA) (Figura 3)
9. Inmunofluorescencia en rodajas tisulares
Para identificar la etapa metastásica en la que se requiere un candidato a gen en particular (por ejemplo, extravasación vs. supervivencia después de la siembra), se puede determinar la inmunofluorescencia de corte de tejido en diferentes puntos de tiempo para rastrear la progresión de las células tumorales desde la inyección hasta la invasión de órganos a distancia, la siembra y el crecimiento. Este enfoque permite la adición de marcadores para que las células vecinas capturen el evento de extravasación y los cambios en el microambiente tumoral circundante33.
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Las siguientes figuras ilustran cómo se ha aplicado el flujo de trabajo descrito para la identificación de nuevos impulsores de la metástasis del melanoma. La Figura 2 resume los resultados de un estudio publicado en el que se estudiaron los efectos del silenciamiento de la fucosiltransferasa FUT8 en metástasis de melanoma in vivo 26. Brevemente, el análisis de los datos glucómicos del paciente humano (obtenidos por matrices de lectinas) y el perfil transcrip...
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El objetivo de este informe técnico es ofrecer un flujo de trabajo estandarizado de arriba a abajo para la investigación de actores potenciales en la metástasis del melanoma. Como los experimentos in vivo pueden ser costosos y llevar mucho tiempo, las estrategias para maximizar la eficiencia y aumentar el valor de la información obtenida son primordiales.
Es imperativo utilizar enfoques complementarios para validar los hallazgos dentro del mismo experimento. Por ejemplo, tanto la tinc...
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Los autores no tienen conflictos de intereses que declarar.
Agradecemos a la División de Tecnologías de Investigación Avanzada (DART) de NYU Langone Health, y en particular, al Laboratorio de Investigación de Patología Experimental, el Centro de Tecnología del Genoma, el Laboratorio de Citometría y Clasificación Celular, el Núcleo de Imágenes Preclínicas, que cuentan con el apoyo parcial de la Subvención de Apoyo del Centro de Cáncer Perlmutter NIH / NCI 5P30CA016087. Agradecemos al NYU Interdisciplinary Melanoma Cooperative Group (PI: Dr. Iman Osman) por proporcionar acceso a cultivos a corto plazo de melanoma derivado de pacientes + (10-230BM y 12-273BM), que se obtuvieron a través de protocolos aprobados por IRB (estudio de consentimiento universal #s16-00122 y estudio del Grupo Cooperativo interdisciplinario de melanoma # 10362). Agradecemos al Dr. Robert Kerbel (Universidad de Toronto) por proporcionar líneas celulares de melanoma 113/6-4L y 131/4-5B1* y al Dr. Meenhard Herlyn (Instituto Wistar) por proporcionar cultivos a corto plazo de melanoma WM 4265-2, WM 4257s-1, WM 4257-2*. E.H. cuenta con el apoyo de NIH/NCI R01CA243446, P01CA206980, un Premio científico del equipo de la American Cancer Society-Melanoma Research Alliance y una ESPORA de melanoma de los NIH (NCI P50 CA225450; PI: I.O.). La figura 1 se creó con Biorender.com.
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| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| #15 Hoja de Scapel | WPI | 500242 | Para procedimientos quirúrgicos |
| #3 Mango Scapel WPI 500236 | Para procedimientos quirúrgicos | ||
| Jeringa de tuberculina de 1 mL, punta deslizante | BD | 309626 | Injections jeringa de |
| 10 mL, punta deslizante | BD | 301029 | Perfusión |
| 10% Formalina Sódica Tamponada EK Industries | 4499-20L | Para perfusión/fijador tisular | |
| 15 mL | Corning cónico | 430052 | Cultivo celular |
| 15 mL Tubos de centrífuga de polipropileno cónico | Falcon | 352196 Cultivo celular | |
| Etanol de 200 pruebas | Deacon Labs | 04-355-223 | Histología |
| 22G – Aguja de 22 mm | BD | 305156 | Perfusión |
| 4-0 Sutura de Vicryl | Ethicon | J464G | Sutura |
| 4% de fosfato de Carson tamponado paraformaldehído | EMS | 15733-10 | Para perfusión/fijador tisular |
| 40µ m | Corning | 431750 | Procesamiento de tejidos |
| 5-0 Sutura absorbible | Ethicon | 6542000 | Tapón |
| 50 mL Cónico | Corning | 430828 | Cultivo celular |
| 50mL Tubos de centrífuga de polipropileno cónico | Falcon | 352070 | Cultivo celular |
| 7-0 Sutura de seda | FST | 18020-70 | Ligadura |
| 70µ m | Corning | 431751 | Procesamiento |
| de tejidos Medios de montaje antidecoloración | Vector Labs | H-1000-10 | Aproximador de inmunofluorescencia |
| que aplica fórceps, 10 cm | WPI | 14189 | Para procedimientos microquirúrgicos |
| Avance | Bruker | 3 HD | Consola de RMN |
| Biospec 7030 | Bruker | 7030 | Micro MRI |
| BSA | Bioreg | A941 | NuMA Tinción |
| Pinzas de sutura Castroviejo, puntas rectas Plataforma de atado de 5,5 mm, 11 cm | WPI | WP5025501 | Para procedimientos microquirúrgicos |
| Coplin Staining Jar | Bel-Art | F44208-1000 | Histología |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542-1MG | Inmunofluorescencia |
| dCas9-KRAB | Addgene | 110820 | Manipulación genética |
| DNasa I | NEB | M0303L | Procesamiento de tejidos |
| DPBS | Corning | 21-030-CM Procesamiento de | tejidos |
| Cuchilla de un solo filo extra afilada sin recubrimiento GEM | 62-0167 | Procesamiento de tejidos | |
| Sustrato de matriz extracelular | Corning | 354234 | considerar el factor de crecimiento reducido ( como alternativa |
| FBS | Cytiva | SH30910.03 | Cultivo celular |
| Fiji Image J | Fiji Image J | Software | Immunofluorescence |
| Goat anti-rabbit HRP conjugado multimer | Thermo Fisher | A16104 | NuMA Tinción Suero |
| cabra | Gibco | PCN5000 | Inmunofluorescencia |
| HBSS | Corning | 21-020-CV | Procesamiento de tejidos |
| Hematoxilina | Richard-Allan Scientific | 7231 | Histología |
| Illumina III | PerkinElmer | CLS136334 | BLI Instrument |
| Jeringa de insulina 28G - aguja de 8 mm | BD | 329424 | Inyecciones |
| Jeringa de insulina 31G - aguja de 6 mm | BD | 326730 | Inyecciones Pinzas de |
| iris, 10,2 cm, curva completa, | dentadas | WPI 504478 | Para perfusión y procedimientos quirúrgicos |
| Isoflurano USP | Covetrus | 11695067772 | Anesthesia |
| Jewelers #7 Pinzas de titanio 11 cm 0,07 x 0,01 mm Punta | WPI | WP6570 | Para procedimientos microquirúrgicos |
| Ketamina HCl 100 mg / mL | Mylan Ind. | 1049007 | Anestesia |
| lentiCRISPRv2 | Addgene | 98290 | Manipulación genética |
| Lycopersicon Esculentum (Tomate) Lectina, DyLight 649 | Invitrogen | L32472 | Marcador de células endoteliales |
| vasculares MEM aminoácidos no esenciales X 100 | Corning | 25-025-CI | |
| Tijeras Metzenbaum | WPI | 503269 | Para cirugía procedimientos |
| Unidad de microinyección | KOPF | 5000 | Inyecciones intracardíacas NaCl |
| Fisher | S25877 | Tinción NuMA | |
| Aguja 30G x 25mm | BD | 305128 | Aguja de Inyección Intracardíaca |
| 33G x 15mm | Hamilton | 7747-01 | Inyección Intracarotídea |
| Soporte de Aguja, Castroviejo, 14cm, con cerradura, 1.2mm Mordazas dentadas | WPI | 14137-G | Para procedimientos microquirúrgicos |
| NOD. Ratones Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ | El Laboratorio Jackson 005557 | Ratones NU | |
| /J modelo murino | El Laboratorio Jackson | 002019 | modelo murino |
| Aparato mitótico nuclear Proteína policlonal conejo anti-humano | Abcam | 97585 | NuMA Tinción |
| de penicilina-estreptomicina 10000U/mL | Gibco | 15140122 | Cultivo celular |
| Percoll | GE | 0891-01 | solución de separación por densidad |
| PI Guantes Quirúrgicos Clásicos | Cardinal Health | 2D72PT75X | Cirugía |
| pLKO Tet-On | Addgene | 21915 | Manipulación genética |
| Povidona-Yodo 10% Solución Medline | MDS093943 | Cirugía | |
| Proparacaína Gotas 0.5% | Akorn Pharma | AX0501 | Anestésico local oftálmico |
| Puralube Petrolatum Pomada Oftálmica | Dechra | 83592 | |
| Cuchilla de afeitar de anestesia Cuchillas de doble filo | EMS | 72000 | Afeitado y corte de cerebro con vibrótomo |
| Reflex 9mm EZ Clip | Braintree | EZC- KIT | Cierre de herida |
| RPMI 1640 | Corning | 10-040-CM | Tijeras para cultivo celular |
| , resorte 10,5 cm Str, 8 mm Cuchillas | WPI | 501235 | Para procedimientos microquirúrgicos |
| Cuchilla vibratoria semiautomática Microtomo | Leica | VT1200 | Brain Slice Inmunofluorescencia |
| Anestesia de un solo canal Sistema de vaporizador | Kent Scientific | VetFlo-1210S | anestesia |
| Smartbox Sistema de cámara de sobremesa y soplador de escape | EZ Systems | TT4000 | CO2 Eutanasia |
| Estéril Fenestrado Paño Desechable | Medline | NON21002 | Surgery |
| Batas quirúrgicas Aurora estériles no reforzadas con fundas de ajuste | Medline | DYNJP2715 | Surgery |
| T25 Flask | Corning | 430639 | Cultivo celular |
| Tris | Corning | 46-031-CM | Tinción NuMA Triton |
| X-100 | Sigma-Aldrich | X100-500ML | |
| Pinza de atado Troutman de inmunofluorescencia, 10 cm, patrón G curvado, punta de 0,52 mm con plataforma de atado | WPI | WP505210 | Para procedimientos microquirúrgicos |
| Clips de vasos 10G Presión 5x 0,8 mm Mandíbulas, 5/paquete | WPI | 15911 | Para procedimientos microquirúrgicos |
| Visiopharm | Visiopharm | Visiopharm | NuMA Software de cuantificación de tinciones |
| Xilasina 100mg/mL | Akorn Pharma | 59399-111-50 | Anestesia |
| Xileno | Fisher | X3P-1GAL | Histología |
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