Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido. Inicie sesión o comience su prueba gratuita.

Artículo de método

Estudios termoquímicos de complejos ternarios de Ni(II) y Zn(II) utilizando movilidad iónica-espectrometría de masas

2.1K visualizaciones

⸱

DOI:

10.3791/63722

⸱

8 de junio de 2022

En este artículo

Resumen

Este artículo describe un protocolo experimental que utiliza espectrometría de masas de movilidad de iones por electrospray, cálculos cuánticos semiempíricos y disociación inducida por colisión de umbral resuelta por energía para medir la termoquímica relativa de la disociación de complejos metálicos ternarios relacionados.

Resumen

Este artículo describe un protocolo experimental que utiliza electrospray-ion mobility-mass spectrometry (ES-IM-MS) y energía resuelta umbral de disociación inducida por colisión (TCID) para medir la termoquímica de la disociación de complejos ternarios [amb+M(II)+NTA]- cargados negativamente en dos canales de producto: [amb+M(II)] + NTA o [NTA+M(II)]-  + amb, donde M = Zn o Ni y NTA es ácido nitrilotriacético. Los complejos contienen uno de los heptapéptidos alternativos de unión metálica (amb) con las estructuras primarias acetil-His 1-Cys 2-Gly 3-Pro 4-Tyr 5-His 6-Cys 7 o acetil-Asp 1-Cys 2-Gly 3-Pro 4-Tyr 5-His 6-Cys 7, donde los aminoácidos' Aa1,2,6,7 Las posiciones son los sitios potenciales de unión de metales. Los estados estacionarios optimizados por geometría de los complejos ternarios y sus productos se seleccionaron a partir de cálculos de química cuántica (actualmente el hamiltoniano semiempírico PM6) comparando sus energías electrónicas y sus secciones transversales de colisión (CCS) con las medidas por ES-IM-MS. A partir de los cálculos de frecuencia de PM6, los parámetros moleculares del complejo ternario y sus productos modelan las intensidades dependientes de energía de los dos canales de productos utilizando un método TCID competitivo para determinar las energías umbral de las reacciones que se relacionan con las entalpías 0 K de disociación (ΔH0). Las correcciones térmicas y de entropía de la mecánica estadística utilizando las frecuencias rotacionales y vibracionales PM6 proporcionan las entalpías de disociación de 298 K (ΔH298). Estos métodos describen una rutina EI-IM-MS que puede determinar la termoquímica y las constantes de equilibrio para un rango de complejos de iones metálicos ternarios.

Introducción

Este estudio describe una nueva técnica utilizando un espectrómetro de masas de movilidad iónica disponible comercialmente que permite la determinación de la termoquímica relativa para la disociación de un complejo metálico ternario de unión metálica alternativa (amb) [amb + M (II) + NTA], donde M = Zn o Ni y NTA = ácido nitrilotriacético (Figura 1). Estas reacciones modelan la disociación de la proteína recombinante marcada con AMB unida al metal inmovilizado con NTA durante la cromatografía de afinidad metálica inmovilizada (IMAC)1,2. Como ejemplo, este método se describe utiliz....

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Protocolo

NOTA: La figura 1 muestra una descripción general del protocolo.

1. Preparación de los reactivos

  1. Compre péptidos amb liofilizados (>98% de pureza) y guárdelos en un congelador de -80 °C.
  2. Compre >99% de pureza de zinc (II) nitrato hexahidratado y níquel (II) nitrato hexahidratado.
    PRECAUCIÓN: El nitrato de níquel (II) hexahidratado presenta un peligro para el medio ambiente y la salud.
  3. Compre el ácido nitrilotriacético, polímeros de poli-DL-alanina, acetato de amonio de grado ultrapuro / traza, hidróxido de amonio, ácido acético glacial y acetonitrilo de grado HP....

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Resultados

La disociación competitiva inducida por colisión de los complejos ternarios [amb+M(II)+NTA]- de A y H en [amb+M(II)]- + NTA o [NTA+M(II)]- + amb, se muestra en la Figura 3. El amb se muestra como A o H y M = Zn o Ni. El complejo ternario [A+Zn(II)+NTA]- (Figura 3A) exhibe umbrales aparentes de aproximadamente 0,7 eV de energía de colisión (CE) para producir [A+Zn.......

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Discusión

Pasos críticos
Análisis de disociación inducida por colisión por umbral (TCID) de ES-IM-MS. El TCID utilizó la célula de onda T de transferencia en presencia de argón como célula de colisión. Antes de la disociación, los iones precursores son termalizados por colisiones de baja energía con gas nitrógeno a medida que pasan a través de la celda de movilidad iónica (IM). Esto da como resultado un TCID de energía resuelta más reproducible que el que se logra utilizando la trampa como celd.......

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Divulgaciones

Los autores no tienen ningún conflicto de intereses que revelar.

Agradecimientos

Este material se basa en el trabajo apoyado por la National Science Foundation bajo 1764436, NSF REU program (CHE-1659852), NSF instrument support (MRI-0821247), Physics and Astronomy Scholarship for Success (PASS) NSF project (1643567), Welch Foundation (T-0014), y recursos informáticos del Departamento de Energía (TX-W-20090427-0004-50) y L3 Communications. Los autores agradecen a Kent M. Ervin (Universidad de Nevada - Reno) y Peter B. Armentrout (Universidad de Utah) por compartir el programa CRUNCH y por los consejos sobre ajuste de PBA. Los autores agradecen al grupo de Michael T. Bower en la Universidad de California - Santa Bárbara por compartir el programa Sig....

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Acetonitrilo de grado HPLCFisher Scientific (www.Fishersci.com)A998SK-4
Péptidos de unión de metales alternativos (amb)PepmicCo (www.pepmic.com)se sintetizaron por encargo
Acetato de amonio (ultrapuro)VWR97061-014
Hidróxido de amonio (grado de metal traza)Fisher Scientific (www.Fishersci.com)A512-P500
Driftscope 2.1 programa de softwareWaters (www.waters.com)programa de análisis de software
Gaussian 09Software de modelado de estructuras electrónicasgaussianas
GaussViewgaussianapara visualizar cálculos
Ácido acético glacial (grado Optima)Fisher Scientific (www.Fishersci.com)A465-250
Método de Lennard-Jones (LJ) a escala iónicaSigmaMichael T. Bowers del grupo MassLynx
4.1Waters (www.waters.com)programa de análisis de software
Tubos de microcentrífugaVWR87003-2941,7 mL, polipropileno
Tubos de microcentrífugaVWR87003-2982,0 mL, polipropileno
Ni(II) nitrato hexahidratado (99% de pureza)Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)A15540
Poly-DL-alaninaSigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)P9003-25MG
Waters Synapt G1 HDMSWaters (www.waters.com)  cuadrupolo - movilidad iónica- tiempo de vuelo espectrómetro de masas
Zn(II) nitrato hexahidratado (99%+ pureza)Alfa Aesar (www.alfa.com)12313
Los péptidos diseñados por Interfaz gráfica

Referencias

  1. Kim, Y. -M., Chen, P. Ligand binding energy in [(bipy)Rh(PCH)]+ by collision-induced dissociation threshold measurements. International Journal of Mass Spectrometry. 202 (1-3), 1-3 (2000).
  2. Plattner, D.

Acceso restringido. Inicie sesión o comience una prueba gratuita para ver este contenido.

Reimpresiones y permisos

Etiquetas

Complejos metálicos ternariosdisociación inducida por colisión de umbralanálisis termoquímicocomplejo de ácido nitrilotriacéticocomplejos de níquelcomplejos de zinccálculos de química cuánticaunión de metales a péptidossección eficaz de colisión