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Artículo de método

Construcción de vectores adenovirales utilizando tecnología de ensamblaje de ADN

1.6K vistas

DOI:

10.3791/64033

16 de junio de 2022

* These authors contributed equally

En este artículo

Resumen

En este estudio, se construyó un clon infeccioso de adenovirus humano tipo 7 (HAdV-7) y se estableció un sistema de vectores HAdV-7 con deleción E3 modificando el clon infeccioso. Esta estrategia utilizada aquí se puede generalizar para crear vectores de transferencia de genes de otros adenovirus de tipo salvaje.

Resumen

Los vectores adenovirales se han utilizado como herramienta de transferencia de genes en la terapia génica durante más de tres décadas. Aquí, presentamos un protocolo para construir un vector adenoviral mediante la manipulación del ADN genómico de HAdV-7 de tipo salvaje mediante el uso de un método de ensamblaje de ADN. En primer lugar, se generó un clon infeccioso de HAdV-7, pKan-Ad7, mediante la fusión del ADN genómico viral con un producto de PCR a partir de la columna vertebral del plásmido, que comprende el gen resistente a la kanamicina y el origen de la replicación (Kan-Ori), a través del ensamblaje del ADN. Esto se hizo mediante el diseño de un par de cebadores de PCR, que contenían ~ 25 nucleótidos de la secuencia terminal de la repetición terminal invertida (ITR) de HAdV-7 en el extremo 5', un sitio de enzima de restricción no cortador para el genoma de HAdV-7 en el medio y una secuencia específica de plantilla para el cebado de PCR en el extremo 3'. En segundo lugar, se empleó una estrategia intermedia basada en plásmidos para reemplazar la región E3 con elementos que expresan transgenes en el clon infeccioso para generar un vector adenoviral. Brevemente, pKan-Ad7 se digirió con la enzima de restricción Hpa I de doble corte, y el fragmento que contiene la región E3 se ligó a otro producto de PCR de la columna vertebral del plásmido mediante el ensamblaje de Gibson para construir un plásmido intermedio pKan-Ad7HpaI. Para mayor comodidad, se utilizó el ensamblaje de restricción para designar el método de clonación de plásmidos de digestión y ensamblaje de restricción combinados. Usando el ensamblaje de restricción, los genes E3 en pKan-Ad7HpaI se reemplazaron con un casete de expresión de proteína fluorescente verde (GFP), y la región E3 modificada se liberó del plásmido intermedio y se restauró al clon infeccioso para generar un plásmido adenoviral pKAd7-E3GFP. Finalmente, pKAd7-E3GFP se linealizó por digestión de Pme I y se utilizó para transfectar celdas de empaquetamiento HEK293 para rescatar el virus HAdV-7 recombinante. Para concluir, aquí se introdujo una estrategia basada en el ensamblaje de ADN para construir vectores adenovirales en laboratorios generales de biología molecular sin la necesidad de materiales e instrumentos especializados.

Introducción

En las últimas tres décadas, los vectores adenovirales recombinantes se han utilizado ampliamente en el desarrollo de vacunas y la terapia génica 1,2,3,4, así como en la investigación básica debido a sus excelentes propiedades biológicas, como la alta eficiencia de la transducción de genes, la no integración con el genoma del huésped, el genoma viral manipulador y la facilidad de producción a gran escala.

En la actualidad, los vectores adenovirales más utilizados se construyen a p....

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Protocolo

NOTA: Los adenovirus se clasifican como Nivel de Bioseguridad 2 (BSL-2); Todos los pasos para utilizar los virus se llevaron a cabo en un laboratorio de nivel 2 de bioseguridad. El HAdV-7 de tipo salvaje se aisló en 2017 a partir de la muestra de aspirado nasofaríngeo de un bebé de 10 meses que fue hospitalizado con infección aguda del tracto respiratorio en el Hospital Infantil de Beijing20. Las existencias de virus se almacenaron a -80 °C.

1. Extracción de ADN genómico HAdV-7

  1. Siembre 2,0 x 106 células HEK293 en un matraz T-25 que contenga 5 m....

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Resultados

La estrategia para la construcción de un clon infeccioso de HAdV-7 se muestra en la Figura 1 y la Figura 2. Se seleccionaron aleatoriamente dos plásmidos clonales infecciosos y se identificaron mediante BstZ17 I, BamH I y EcoR V, respectivamente. Los resultados mostraron que los fragmentos fueron consistentes con el tamaño esperado (Figura 2A), lo que indica que los plásmidos fueron construidos correctamente. Se pudieron ver focos d.......

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Discusión

Los diferentes adenovirus tienen varios tropismos tisulares, y la prevalencia de la inmunidad preexistente del huésped contra diferentes adenovirus puede fluctuar intensamente en los seres humanos24, lo que atrae el interés en la construcción de nuevos vectores adenovirales para la terapia génica o el desarrollo de vacunas. Sin embargo, el establecimiento de un nuevo sistema de vectores adenovirales sigue siendo engorroso para los laboratorios genéricos de biologí.......

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Divulgaciones

Los autores declaran no tener conflictos de intereses.

Agradecimientos

Esta investigación fue financiada por la Fundación de Ciencias Naturales de Beijing (7204258), la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (82161138001, 82072266), el Fondo de Innovación CAMS para Ciencias Médicas (2019-I2M-5-026), y la investigación y aplicación sobre el rastreo molecular de patógenos respiratorios esenciales en Beijing, por el Capital Health Development and Research of Special (2021-1G-3012).

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Tubo de microcentrífuga de polipropileno de 1,5 mLAxygenMCT-150-CAlmacenamiento de virus Tubos de
centrífuga de polipropileno de 15 mLCorning430790Almacenamiento de virus Placas de
cultivo tratadas con TC de 150 mmCorning430599 Crecimiento de células HEK29E
Casete de diálisis MWCO de 20 KThermoFisher Scientific66005Diálisis de virus
Ácido acéticoAmresco714Extracción de ADN
Afl IINEBR0520Digestión
AgarosaTakara5260Electroforesis
Age INEBR0552Digestión
Asc INEBR0558Digestión
BamH INEBR0136Digestión
Benzonasa NucleasaSigmaE8263-25KUPurificación de virus
BsrG INEBR0575Digestión
Elevadorde células Corning3008Raspar las células 
CsClSigmaC3032Kit de recuperación de gel de ADN de purificación de virus
ZymoD4045Recuperación de ADN
Dulbecco' Águila modificada' s medio (DMEM)CytivaSH30022.01HEK293 células medio
E.coli TOP10 células competentesTIANGEN BIOTECH (BEIJING) CO.,LTD.CB-104Transformación del producto de montaje
EcoR VNEBR3195Digestión
EDTAThermo Fisher ScientificR3104Extracción de ADN
Suero fetal bovino (FBS)CytivaSV30208.02Cultivo de células HEK293
ADN genómico Kit de limpieza y concentraciónZymoD4065Purificación de ADN
GlicerolShanghai Macklin Biochemical Co., LtdG810575Diálisis de células del virus
HEK293ATCCCRL-1573Amplificación del virus
polimerasa de alta fidelidadNEBM0491PCR
Hind IIINEBR3104Digestión
Sulfato de kanamicinaAmresco408Selección de plásmido
Kpn INEBR3142Digestión
Lambda/HindIII Marcador de ADNTakara3403Electroforesis
Caldo LBBD240230LB placa para bacterias
LB medioSolarbio Life ScienceL1010Medio para bacterias
MgCl2Sigma63068Diálisis de virus
MicrocentrífugaThermo Fisher ScientificSorvall Legend Micro 21RExtracción de ADN
NaClSigmaS5886Diálisis del virus
NdeI NEBR0111Digestión
NEBuilder HiFi Ensamblaje de ADN Master MixNEBE2621Ensamblaje de ADN
NheI NEBR0131Digestión
Fosfato tamponado solución salinaCytiva SH30256.01Lavado de células
PipetaThermo Fisher ScientificMatrixAspirate el medio
Plasmid Maxprep Kit VigorousBiotechnology Beijing Co., Ltd.N001Extracción de
plásmido de ADN Miniprep KitTIANGEN BIOTECH (BEIJING) CO., LTD.DP103Extracción de ADN
Pme INEBR0560
Digestión Acetato de potasioAmresco698Extracción de ADN
proteasa KThermo Fisher ScientificAM2542Extracción de ADN
pShuttle-CMVStratagene240007PCR template
RNasaBeyotimeD7089Extracción de ADN
Sal INEBR0138Digestión
Sbf INEBR3642Digestión
SDSAmresco227Extracción de ADN
Rotor de cubo oscilanteHITACHIS52STPurificación de
virus Matraz de células T-25Corning430639Crecimiento de células HEK29E
Matraz de células T-75Corning 430641Crecimiento de células HEK29E
Reactivo de transfecciónPolyplus-transfection114-15Transfección
Microscopio electrónico de transmisiónFEITECNAI 12Objetación del virus
Tris-HClAmresco234Diálisis del virus
UltracentrífugaHITACHIHimac CS120GXIIPurificación del virus
ADN

Referencias

  1. Lasaro, M. O., Ertl, H. C. New insights on adenovirus as vaccine vectors. Molecular Therapy. 17 (8), 1333-1339 (2009).
  2. Fuchs, J. D., et al. Safety and immunogenicity of a recombi....

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