Aquí, se desarrolla un sistema de bicapa lipídica soportado por nanobarras para proporcionar una membrana sintética con una curvatura definida que permite la caracterización de proteínas con capacidad de detección de curvatura in vitro.
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Artículo de método
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Aquí, se desarrolla un sistema de bicapa lipídica soportado por nanobarras para proporcionar una membrana sintética con una curvatura definida que permite la caracterización de proteínas con capacidad de detección de curvatura in vitro.
La curvatura de la membrana juega un papel importante en varios procesos esenciales de las células, como la migración celular, la división celular y el tráfico de vesículas. No solo es generado pasivamente por actividades celulares, sino que también regula activamente las interacciones de proteínas y está involucrado en muchas señales intracelulares. Por lo tanto, es de gran valor examinar el papel de la curvatura de la membrana en la regulación de la distribución y dinámica de proteínas y lípidos. Recientemente, se han desarrollado muchas técnicas para estudiar la relación entre la membrana curva y la proteína in vitro. En comparación con las técnicas tradicionales, la bicapa lipídica (SLB) soportada por nanobar, recientemente desarrollada, ofrece un alto rendimiento y una mejor precisión en la generación de curvatura de membrana al formar una bicapa lipídica continua en matrices de nanobarras con patrones con una curvatura de membrana predefinida y control plano local. Tanto la fluidez lipídica como la sensibilidad proteica a las membranas curvas se pueden caracterizar cuantitativamente utilizando imágenes de microscopía de fluorescencia. Aquí, se presenta un procedimiento detallado sobre cómo formar un SLB en superficies de vidrio fabricadas que contienen matrices de nanobarras y la caracterización de proteínas sensibles a la curvatura en dicho SLB. Además, se cubren los protocolos para la reutilización de nanochips y el procesamiento de imágenes. Más allá del nanobar-SLB, este protocolo es fácilmente aplicable a todos los tipos de chips de vidrio nanoestructurado para estudios de detección de curvatura.
La curvatura de la membrana es un parámetro físico crítico de una célula que ocurre en una variedad de procesos celulares como la morfogénesis, la división celular y la migración celular1. Ahora se reconoce ampliamente que la curvatura de la membrana va más allá de un simple resultado de eventos celulares; En cambio, se ha convertido en un regulador eficaz de las interacciones de proteínas y la señalización intracelular. Por ejemplo, se encontró que varias proteínas involucradas en la endocitosis mediada por clatrina se unen preferentemente a la membrana curva, lo que resulta en la formación de un punto caliente para la endocitosis
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1. Limpieza del nanochip
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El diseño de nanobarras se recomienda para sondear proteínas de detección de curvatura positiva, que contiene un medio círculo en cada extremo con curvatura definida por el ancho de nanobarra y un control de curvatura plana / cero localmente en el centro (Figura 2A, B). La formación exitosa del SLB en nanobarras da como resultado señales de marcadores lipídicos distribuidos uniformemente en toda la superficie de la nanobarra, como se muestra en la Figura.......
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El sistema nanobar-SLB descrito aquí ofrece una combinación única de las ventajas en varios ensayos in vitro existentes. Revela eficientemente la unión preferencial de proteínas a membranas altamente curvadas como el ensayo de flotación o sedimentación de liposomas, pero requiere muchas menos muestras y ofrece una curvatura definida con mayor precisión en nanobarras individuales 8,29. También ofrece una amplia gama de curvatura controlada con precisión p.......
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Los autores declaran que no hay ningún interés financiero en conflicto en este trabajo.
Agradecemos al Centro de Nanofabricación de Nanyang (N2FC) y al Centro de Tecnologías Fotónicas Disruptivas (CDPT) de la Universidad Tecnológica de Nanyang (NTU) por apoyar la fabricación de nanoestructuras e imágenes SEM, la Plataforma de Producción de Proteínas (PPP) de la Escuela de Ciencias Biológicas NTU para la purificación de proteínas, y la Escuela de Ingeniería Química y Biomédica NTU para el microscopio confocal. Este trabajo está financiado por el Ministerio de Educación de Singapur (MOE) (W. Zhao, RG112/20, RG95/21 y MOE-T2EP30220-0009), el Instituto de Análisis y Ciencia Molecular Digital (IDMxS) apoyado por fondos del Ministerio de Educación bajo el esqu....
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| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| Etanol anhidro | Sigma-Aldrich | 100983 | |
| Papel de aluminio | Vial de diamante | RN0879999FU | |
| ámbar | Sigma-Aldrich | 27115-U | |
| Brain PS: L-α-fosfatidilserina (cerebro, cerdo) (sal de sodio) | Avanti Polar Lipids, Inc. | ||
| Vaso de precipitados de 10 mL | Schott-Duran | SCOT211060804 | |
| 50 mL Vaso de precipitados | Schott-Duran | SCOT211061706 | |
| 1000 mL Vaso de precipitados | Schott-Duran | SCOT211065408 | El segundo contenedor |
| Cloroformo | Sigma-Aldrich | V800117 | |
| Bastoncillos de algodón | Watsons | ||
| 18:1 DGS-NTA(Ni): 1,2-dioleoil-sn-glicero-3-[(N-(5-amino-1-carboxipentil)ácido iminodiacético)succinil] (sal de níquel) | Avanti Polar Lipids, Inc. | ||
| Huevo PC: L-&alfa;-fosfatidilcolina (Huevo, pollo) | Avanti Polar Lipids, Inc. | ||
| de proteínas F-BAR | Plaftorm, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Tecnológica de Nanyang, Singapur | Proteínas y péptidos | |
| F-BAR+IDR | Producción de proteínas Plaftorm, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Tecnológica de Nanyang, Singapur | Proteínas y péptidos | |
| GFP | Producción de proteínas Plaftorm, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Tecnológica de Nanyang, Singapur | Proteínas y péptidos | |
| GFP-His | Producción de proteínas Plaftorm, Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Tecnológica de Nanyang, Singapur | Proteínas y péptidos | |
| Prisma GraphPad Prisma | GraphPad | V9.0.0 | |
| Peróxido de hidrógeno, 30% (ACS certificado) | Thermo Scientific | H325-500 | |
| IDR de FBP17 humano | Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. | ||
| ImageJ | Institutos Nacionales de Salud | 1.50d | |
| Microscopía confocal de escaneo láser | Zeiss | LSM 800 con objetivo de aceite Airyscan | 100x (N.A.1.4). |
| Metanol | Fisher científico | 10010240 | |
| Mini-extuder | Avanti Polar Lipids, Inc. | 610000-1EA | |
| Microtubos de 1,5 mL | Greiner | 616201 | |
| MATLAB | Mathworks | R2018b | |
| Membrana hidrofílica de nucleporos, 0,1 μ m | Whatman | 800309 | |
| Phosphate Bufferen Saline (PBS) | Life Technologies Holdings Pte Ltd. | 70013 | |
| Base de polidimetilsiloxano (PDMS) | Dow Corning Corporation | SYLGARD 184 | |
| Reticulante de polidimetilsiloxano (PDMS) | Dow Corning Corporation | SYLGARD 184 | |
| Limpiador de plasma | HARRICK PLASMA | PDC-002-HP | |
| Nanochip de cuarzo | Condado de Donghai Productos de cuarzo alfa CO., LTD | ||
| Hidróxido de sodio | Sigma-Aldrich | 795429 | |
| Ácido sulfúrico | Sigma-Aldrich | 258105 | |
| Texas Red DHPE: Texas Red 1,2-Dihexadecanoyl-sn-Glycero-3-Phosphoethanolalamin, Sal de trietilamonio | Life Technologies Holdings Pte Ltd. | Pinza | |
| T1395MP Gooi | PDC-002-HP | ||
| Limpiadores ultrasónicos | Elma | D-78224 | |
| Voterx | Scientific Industries | G560E | |
| Desecador al vacío | NUCERITE | 5312 | |
| Baño de agua | Julabo | TW8 |
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