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Determinación de la eficiencia de apareamiento de haploides en Saccharomyces cerevisiae

DOI:

10.3791/64596

December 2nd, 2022

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Summary

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En este trabajo, se describe un método robusto para la cuantificación de la eficiencia de apareamiento en la levadura Saccharomyces cerevisiae . Este método es particularmente útil para la cuantificación de barreras precigóticas en estudios de especiación.

Abstract

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Saccharomyces cerevisiae es un organismo modelo ampliamente utilizado en genética, evolución y biología molecular. En los últimos años, también se ha convertido en un organismo modelo popular para estudiar problemas relacionados con la especiación. El ciclo de vida de la levadura implica fases reproductivas asexuales y sexuales. La facilidad para realizar experimentos de evolución y el corto tiempo de generación del organismo permiten el estudio de la evolución de las barreras reproductivas. La eficiencia con la que los dos tipos de acoplamiento (a y α) se acoplan para formar el diploide a/α se conoce como eficiencia de acoplamiento. Cualquier disminución en la eficiencia de apareamiento entre haploides indica una barrera precigótica. Por lo tanto, para cuantificar el grado de aislamiento reproductivo entre dos haploides, se requiere un método robusto para cuantificar la eficiencia de apareamiento. Con este fin, se presenta aquí un protocolo simple y altamente reproducible. El protocolo implica cuatro pasos principales, que incluyen parchear los haploides en una placa YPD, mezclar los haploides en números iguales, diluir y chapar para colonias individuales y, finalmente, calcular la eficiencia basada en el número de colonias en una placa de abandono. Los marcadores auxotrofos se emplean para hacer claramente la distinción entre haploides y diploides.

Introduction

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Saccharomyces cerevisiae, comúnmente llamada levadura en ciernes, es un eucariota unicelular. Tiene dos tipos de apareamiento, a y α, y exhibe ciclos reproductivos asexuales y sexuales. Los tipos de apareamiento a y α son haploides y pueden dividirse mitóticamente en ausencia del otro tipo de apareamiento en el entorno circundante, que representa el ciclo asexual de la levadura. Cuando los dos tipos de apareamiento están muy cerca, dejan de dividirse mitóticamente y se fusionan para formar una célula diploide. La levadura diploide puede dividirse mitóticamente cuando los nutrientes están pres....

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Protocol

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NOTA: El protocolo implica ampliamente los siguientes pasos: (1) parchear los haploides en las rejillas de eficiencia de apareamiento en una placa YPD, (2) mezclar los haploides en números iguales después de 24 h de incubación y dar a los haploides mixtos unas horas para aparearse (7 h en este estudio), (3) colocar las células mixtas en YPD para aislar colonias individuales después de 7 h a 30 ° C, y finalmente, (4) determinar el número de diploides formados utilizando los marcadores auxotróficos. Estos pasos se describen en detalle a continuación (consulte también la figura 2).

1. Parcheo de haploides e....

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Results

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Cuantificación de la eficiencia de apareamiento de los dos tipos de apareamiento
El protocolo descrito aquí se utilizó para cuantificar la eficiencia de apareamiento entre dos cepas de levadura, entre SK1AM a y SK1AM α y entre ScAMa y ScAMα (Figura 3A). En estos experimentos, el apareamiento entre los dos haploides se repitió al menos 12 veces. En cada una de las repeticiones del experimento, al menos 100.......

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Discussion

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La cuantificación de la eficiencia de apareamiento en S. cerevisiae es esencial para llevar a cabo estudios relacionados con los genes implicados en las vías de apareamiento o estudiar la influencia del medio externo en el comportamiento de apareamiento. En las últimas dos décadas, S. cerevisiae también se ha convertido en un modelo popular para abordar cuestiones relacionadas con la especiación 14,36,37,38.

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Disclosures

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Los autores declaran que no tienen intereses contrapuestos en este trabajo. Los autores están felices de compartir las cepas derivadas de SK1 para todo uso sin fines de lucro.

Acknowledgements

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Este trabajo fue financiado por una subvención DBT/Wellcome Trust (India Alliance) (IA/S/19/2/504632) a S.S. P.N. es un becario de investigación apoyado por una subvención DBT/Wellcome Trust (India Alliance) (IA/S/19/2/504632). A.M. cuenta con el apoyo del Consejo de Investigación Científica e Industrial (CSIR), Gobierno de la India, como investigador principal (09/087(0873)/2017-EMR-I). Los autores agradecen a Paike Jayadeva Bhat por las discusiones.

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
AdeninaSigma Life ScienceA8626
Polvo de agar de grado regular para bacteriologíaSRL19661 (0140186)
Sulfato de amonio, Hi-ARHiMediaGRM1273
D-(+)-glucosaSigma Life ScienceG8270
Placas de Petri de vidrioHiMediaPW008  Dimensiones de 90 mm x 15 mm
L-ArgininaSigma Life ScienceA8094
Ácido L-aspárticoSigma Life ScienceA7219
L-Histidina monocloruro monohidratoSigma Life ScienceH5659
L-IsoleucinaSigma AldrichI2752
L-LeucinaSigma Life ScienceL8912
L-LisinaAldrich62840
L-metioninaSigma Ciencias de la VidaM5308
L-fenilalaninaSigma Ciencias de la VidaP5482
L-TreoninaSigma AldrichT8625
L-TirosinaSigma Ciencias de la VidaT8566
L-ValinaSigma Ciencias de la VidaV0513
Apareamiento Rejilla de eficiencia1 cm x 1,5 cm Rejilla rectangular dibujada en la placa de Petri
BD Difco233520
Tubos de microcentrífuga Tarsons 500010 Peptona HiMedia RM001 Uracil Sigma Life Science U0750 Extracto de Levadura en Polvo HiMedia RM027 Base de Nitrógeno de Levadura sin Aminoácidos y Sulfato de Amonio

References

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  1. Neiman, A. M. Sporulation in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. Genetics. 189 (3), 737-765 (2011).
  2. Duina, A. A., Miller, M. E., Keeney, J. B. Budding yeast for budding geneticists: A primer on the Saccharomyces cerevisiae model system. Genetics.

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Mating EfficiencySaccharomyces CerevisiaeHaploid MatingYeast SpeciationAuxotrophic MarkersYPD AgarDiploid IdentificationOptical DensityGene FlowReproductive Isolation

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