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Artículo de método

Formulación y caracterización de nanodiscos que contienen agentes bioactivos

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DOI:

10.3791/65145

17 de marzo de 2023

En este artículo

Resumen

Aquí, describimos la producción y caracterización de agentes bioactivos que contienen nanodiscos. Los nanodiscos de anfotericina B se toman como ejemplo para describir el protocolo de manera gradual.

Resumen

El término nanodisco se refiere a un tipo discreto de nanopartícula compuesta por un lípido formador de bicapa, una proteína de andamio y un agente bioactivo integrado. Los nanodiscos están organizados como una bicapa lipídica en forma de disco cuyo perímetro está circunscrito por la proteína del andamio, generalmente un miembro de la familia de apolipoproteínas intercambiables. Numerosos agentes bioactivos hidrófobos se han solubilizado eficientemente en nanodiscos mediante su integración en el medio hidrofóbico de la bicapa lipídica de la partícula, produciendo una población en gran medida homogénea de partículas en el rango de 10-20 nm de diámetro. La formulación de nanodiscos requiere una proporción precisa de componentes individuales, una adición secuencial apropiada de cada componente, seguida de la sonicación en baño de la mezcla de formulación. La proteína del andamio anfipático contacta y reorganiza espontáneamente la bicapa dispersa formando una mezcla de lípidos / agentes bioactivos para formar una población discreta y homogénea de partículas de nanodiscos. Durante este proceso, la mezcla de reacción pasa de una apariencia opaca y turbia a una muestra clarificada que, cuando está completamente optimizada, no produce precipitado tras la centrifugación. Los estudios de caracterización implican la determinación de la eficiencia de solubilización del agente bioactivo, microscopía electrónica, cromatografía de filtración en gel, espectroscopia de absorbancia ultravioleta visible (UV / Vis) y / o espectroscopia de fluorescencia. Esto normalmente es seguido por una investigación de la actividad biológica utilizando células cultivadas o ratones. En el caso de los nanodiscos que albergan un antibiótico (es decir, el antibiótico polieno macrólido anfotericina B), se puede medir su capacidad para inhibir el crecimiento de levaduras u hongos en función de la concentración o el tiempo. La relativa facilidad de formulación, versatilidad con respecto a las partes componentes, tamaño de partícula a nanoescala, estabilidad inherente y solubilidad acuosa permite innumerables aplicaciones in vitro e in vivo de la tecnología de nanodiscos. En el presente artículo, describimos una metodología general para formular y caracterizar nanodiscos que contienen anfotericina B como agente bioactivo hidrófobo.

Introducción

Las lipoproteínas discoidales de alta densidad (HDL) nacientes son progenitores naturales del HDL esférico mucho más abundante presente en el sistema circulatorio humano. Estas partículas nacientes, también denominadas pre-ß HDL, poseen propiedades estructurales únicas y distintivas1. De hecho, en lugar de existir como una partícula esferoidal, las HDL nacientes tienen forma de disco. Extensos estudios de caracterización estructural en HDL discoidales naturales y reconstituidas han revelado que están compuestas por una bicapa de fosfolípidos cuyo perímetro está circunscrito por una apolipoproteína anfipática intercambiable (apo), como apoA-I. En el metabolismo de las lipoproteínas humanas, las HDL nacientes circulantes acumulan lípidos de las células periféricas y maduran en HDL esféricas en un proceso que depende de mediadores de proteínas clave, incluido el transportador de casete de unión a ATP A1 y la lecitina: aciltransfersade colesterol 2. Este proceso representa un componente crítico de la vía de transporte inverso del colesterol que se considera protector contra las enfermedades del corazón. Armados con este conocimiento y la capacidad de reconstituir HDL discoidales, los investigadores han empleado estas partículas como una intervención terapéutica para tratar la aterosclerosis3. En esencia, la infusión de HDL reconstituido (rHDL) en pacientes promueve el flujo de colesterol de los depósitos de placa y lo devuelve al hígado para su conversión en ácidos biliares y excreción del cuerpo. Varias empresas biotecnológicas/farmacéuticas están aplicando esta estrategia de tratamiento4.

Al mismo tiempo, la capacidad de generar estas partículas en el laboratorio ha provocado una ráfaga de actividades de investigación que ha llevado a nuevas aplicaciones y nuevas tecnologías. Una aplicación destacada implica el uso de partículas de rHDL como una membrana en miniatura para albergar proteínas transmembrana en un ambiente nativo5. Hasta la fecha, cientos de proteínas se han incorporado con éxito en la rHDL discoidal, y la investigación ha demostrado que estas proteínas conservan tanto la conformación nativa como la actividad biológica como receptores, enzimas, transportadores, etc. Estas partículas, denominadas "nanodiscos", también han demostrado ser susceptibles de caracterización estructural, a menudo a alta resolución6. Este enfoque para las investigaciones de proteínas transmembrana se reconoce como superior a los estudios con micelas detergentes o liposomas y, como resultado, está avanzando rápidamente. Es importante reconocer que se han reportado dos métodos distintos que son capaces de formar una rHDL. El método de "diálisis de colato"13 es popular para aplicaciones relacionadas con la incorporación de proteínas transmembrana en la bicapa5 de rHDL. Esencialmente, este método de formulación implica mezclar una bicapa formando fosfolípido, una proteína de andamio y la proteína transmembrana de interés en un tampón que contiene el detergente colato de sodio (o desoxicolato de sodio; peso molecular de micela [MW] de 4.200 Da). El detergente solubiliza eficazmente los diferentes componentes de la reacción, permitiendo que la muestra se dialice contra el tampón que carece de detergente. Durante el paso de diálisis, a medida que se retira el detergente de la muestra, se forma espontáneamente una rHDL. Cuando este enfoque se utiliza para atrapar una proteína transmembrana de interés, las partículas del producto se han denominado nanodiscos5. Sin embargo, los intentos de utilizar este método para incorporar agentes bioactivos hidrófobos de moléculas pequeñas (MW <1.000 Da) han sido en gran medida infructuosos. A diferencia de las proteínas transmembrana, los agentes bioactivos de moléculas pequeñas pueden escapar de la bolsa de diálisis junto con el detergente, disminuyendo en gran medida su eficiencia de incorporación en las rHDL. Este problema se resolvió omitiendo detergentes de la mezcla de formulación14. En cambio, los componentes se agregan a un tampón acuoso secuencialmente, comenzando con la bicapa formando lípidos, formando un agente bioactivo estable que contiene rHDL, denominado nanodisco. Otros han utilizado la rHDL para la incorporación y transporte de agentes de imagen in vivo 7. Más recientemente, se han empleado en estudios de unión de ligandos rHDL especializados compuestos por un andamio de apolipoproteína y el glicerofosfolípido aniónico, cardiolipina. Estas partículas proporcionan una plataforma para estudios de la interacción de la cardiolipina con varios ligandos solubles en agua, incluyendo calcio, citocromo c y el agente anticancerígeno doxorrubicina8.

El presente estudio se centra en la formulación de rHDL que poseen un agente bioactivo hidrofóbico incorporado de manera estable (es decir, nanodisco). La capacidad de estos agentes para integrarse en el medio lipídico de las partículas discoidales de rHDL les confiere efectivamente solubilidad acuosa. Como tal, los nanodiscos tienen el potencial para aplicaciones terapéuticas in vivo . Al formular nanodiscos, se requieren condiciones específicas de incubación / reacción para incorporar con éxito agentes bioactivos hidrófobos discretos en la partícula del producto, y el objetivo de este informe es proporcionar información práctica detallada que pueda usarse como plantilla fundamental para crear nuevas partículas de nanodiscos para aplicaciones específicas. Por lo tanto, en el contexto de este manuscrito los términos nanodisco y nanodisco no son intercambiables. Mientras que nanodisco se refiere a un rHDL formulado para contener una proteína transmembrana incrustada en su bicapa lipídica5, el término nanodisco se refiere a un rHDL formulado para incorporar agentes bioactivos hidrófobos de bajo peso molecular (< 1.000 Da), como la anfotericina B14.

Una variedad de métodos están disponibles para la adquisición de proteínas de andamio adecuadas. Es posible comprar proteínas de andamio de fabricantes [por ejemplo, apoA-I (SRP4693) o apoE4 (A3234)], sin embargo, el costo puede ser un factor limitante. Un enfoque preferido es expresar proteínas de andamio recombinantes en Escherichia coli. Se publican protocolos para la apoA-I9 humana, apoE410, así como para la proteína hemolinfática del insecto apolipoforina-III11. Para los experimentos descritos en la presente invención, se utilizó el dominio N-terminal (NT) apoE4 humano recombinante (aminoácidos 1-183). La secuencia de nucleótidos que codifica apoE4-NT humano se sintetizó y se insertó en un vector de expresión pET-22b (+) directamente adyacente a la secuencia líder pelB codificada por vectores. Esta construcción conduce a la expresión de una proteína de fusión pelB leader sequence-apoE4-NT. Después de la síntesis de proteínas, la secuencia líder bacteriana pelB dirige la proteína recién sintetizada al espacio periplásmico donde la peptidasa líder escinde la secuencia pelB. La proteína apoE4-NT resultante, sin etiquetas de secuencia ni colas, escapa posteriormente de las bacterias y se acumula en el medio de cultivo11,12, simplificando el procesamiento posterior.

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Protocolo

1. Transformación, expresión y purificación del componente proteico del andamio

  1. Transformación bacteriana BL21 con plásmido que contiene apoE4-NT
    1. Descongele un tubo de células competentes BL21 (DE3) en hielo durante 10 min.
    2. Una vez que todo el hielo se haya derretido, mezclar suave y cuidadosamente pipetear 50 μL de las células en un tubo de transformación sobre hielo.
    3. Añadir 5 μL que contengan 50 ng de ADN plásmido (para la secuencia, véase la Tabla suplementaria 1) a la mezcla celular. Mueva cuidadosamente el tubo cuatro o cinco veces para mezclar. No vorágice.
    4. Coloque la mezcla en hielo durante 30 minutos.
    5. Choque térmico de la mezcla exactamente a 42 °C durante 10 s.
    6. Colocar sobre hielo durante 5 min.
    7. Pipetear 950 μL de medio S.O.C. en el tubo a temperatura ambiente.
    8. Colocar el tubo en una incubadora de agitación a 37 °C durante 60 minutos con oscilación ajustada a 250 rpm.
    9. Mezclar bien las células moviendo e invirtiendo, luego extienda 100 μL de solución celular en una placa de selección de caldo Luria + agar de 20 ml tratada con ampicilina a una concentración de 0,1 mg / ml.
    10. Incubar durante la noche a 37 °C, o hasta que las colonias visibles hayan crecido.
  2. Con un pipete electrónico, transferir 25 ml de medio estéril NZCYM a un matraz cónico estéril de 250 ml a temperatura ambiente y añadir ampicilina a una concentración final de trabajo de 0,1 mg/ml.
  3. Utilizando un bucle de inoculación estéril, transferir una colonia individual de la placa de selección que contiene la cepa bacteriana adecuadamente transformada y añadir directamente al matraz que contiene 25 ml de medio NZCYM + ampicilina.
  4. Introducir los 25 ml de matraz de cultivo de semillas NZCYM en una incubadora de agitación a 37 °C con oscilación orbital ajustada a 250 rpm.
    NOTA: Se recomienda que este cultivo de semillas se cultive durante la noche para alcanzar una concentración bacteriana adecuada (~ 1.5-2.0 unidades de densidad óptica), medida con un espectrofotómetro ajustado a longitud de onda = 600 nm.
  5. Transfiera 250 ml de medio estéril de NZCYM a cuatro matraces deflectores de 1 L y agregue ampicilina antibiótico a una concentración de trabajo de 0,1 mg / ml.
  6. En condiciones estériles, transferir 5 ml de cultivo de semillas saturadas a cada uno de los cuatro matraces de 250 ml que contienen cultivo y colocarlo en una incubadora de agitación a 37 °C con oscilación orbital ajustada a 250 rpm.
    NOTA: En este punto, el cultivo se denominará cultivo de expansión y el crecimiento exponencial se supervisará utilizando un espectrofotómetro UV1800. Se permite que el crecimiento continúe hasta que la densidad óptica del cultivo a 600 nm (OD600) alcance un valor entre 0.6-0.8.
  7. Una vez que el cultivo de expansión haya alcanzado el valor deseado de OD600 de 0,6-0,8, añadir 59,6 mg de isopropil β-D-1-tiogalactopiranosido (IPTG) a cada cultivo de 250 ml que contenga matraz para obtener una concentración final de 1 mM para inducir la expresión de proteínas. En este punto, la cultura de expansión se conoce como la expresión cultura. Iniciar la expresión por un período de 5 h.
  8. Al final del período de expresión de 5 h, retirar los cuatro matraces de la incubadora de agitación y pipetear 125 ml en seis frascos de centrífuga de 250 ml (750 ml en total).
  9. Equilibre cada botella de centrífuga para asegurarse de que la masa total esté dentro de ±0,5 mg entre sí.
    NOTA: Este paso es esencial para garantizar el funcionamiento seguro del dispositivo centrífugo.
  10. Prepare el dispositivo centrífugo girando primero el interruptor de encendido a la posición de encendido. Haga clic en el botón "Set/Actual" y ajuste los parámetros a "JA-14", "9,400 x g", 20.00 min y 4 °C usando los diales correspondientes.
  11. Cargue las seis botellas de centrífuga balanceadas en un rotor de centrífuga del tamaño adecuado y colóquelas en la centrífuga asegurándose de que se sigan los parámetros de seguridad específicos.
    NOTA: Continúe este paso hasta que se hayan centrifugado todos los cultivos celulares bacterianos y se hayan recolectado sobrenadantes.
  12. Filtrar el sobrenadante bacteriano aislado a través de un aparato de filtración al vacío o equivalente equipado con un filtro de 0,45 micras para eliminar cualquier residuo residual.
  13. Purificación de heparina de la proteína andamio apoE4-NT recombinante
    NOTA: El procedimiento de purificación de la columna se lleva a cabo a temperatura ambiente.
    1. Equilibre la columna de heparina Hi-trap aplicando 10 volúmenes de columna (50 ml) de tampón fosfato de sodio de 10 mM, pH 7.2, y eluyendo a una velocidad de 5 mL/min.
    2. Aplique el medio enriquecido con apoE4-NT a la columna a una velocidad de 2,5 ml / min hasta que se haya aplicado todo el volumen de 1 L de medio y deseche el flujo.
    3. Lave la columna con 10 volúmenes de columna (50 ml) de tampón fosfato de sodio de 10 mM, pH 7.2, y deseche el flujo.
    4. Eluya la proteína apoE4-NT deseada aplicando tres volúmenes de columna (15 ml) de tampón de elución (tampón fosfato de sodio 10 mM + 1.5 M NaCl, pH 7.2) a la columna y recoja el eluido.
  14. Diálisis del eluido de apoE4-NT
    1. Prepare una sección de tubo de diálisis (las dimensiones del tubo de diálisis utilizado fueron 22 cm de longitud, 12 mm de diámetro interno y 10,000 MWCO) remojándolo completamente en agua destilada desionizada (ddi) durante 10 min.
    2. Preparar 1 L de solución salina tamponada con fosfato (PBS) (10 mM de fosfato sódico + 150 mM de NaCl, pH 7,2) en un vaso de precipitados de plástico de 1 L o equivalente.
    3. Con una abrazadera de tubo de diálisis, sujete un extremo del tubo de diálisis empapado, asegurándose de que la abrazadera esté asegurada y que no pueda escapar ningún líquido.
    4. Inserte un embudo de cuello estrecho en el extremo abierto del tubo de diálisis y vierta los 15 ml de eluido de apoE4-NT en el tubo de diálisis.
      NOTA: Es imperativo verificar si hay fugas en este paso.
    5. Retire el embudo y sujete el extremo del tubo de diálisis con otra pinza para tubo de diálisis.
    6. Coloque un flotador de diálisis de espuma en uno de los extremos sellados del tubo de diálisis y coloque el tubo de diálisis ensamblado en el vaso de precipitados que contiene 1 L de tampón PBS.
    7. Coloque una barra de agitación magnética en la parte inferior del vaso de precipitados y ajuste el control de agitación a "bajo", asegurándose de que no se forme un vórtice.
    8. Una vez concluida la diálisis, decantar el retentado en un tubo cónico de 50 ml y almacenar a -20 °C.
      NOTA: Se recomienda que esta diálisis se realice a 4 °C durante la noche.

2. Formulación de agentes bioactivos que contienen nanodiscos

  1. Preparación de alícuota fosfolípida
    1. Pesar 5 mg de un fosfolípido apropiado (por ejemplo, dimiristoilfosfatidilcolina [DMPC]) y transfiéralo a un tubo de ensayo de vidrio.
    2. Disolver los 5 mg de fosfolípidos añadiendo 300 μL de CHCl 3 y 100 μL de CH 3 OH para una proporcióntotal de3:1 v/v.
    3. Evapore el disolvente orgánico colocando el tubo de ensayo de vidrio bajo una corriente suave de gasN2 durante 10-15 min, de modo que se forme una película delgada de fosfolípidos secos a lo largo de las paredes de la parte inferior del tubo.
  2. Liofilización de alícuotas de fosfolípidos
    1. Preparar las alícuotas de fosfolípidos para la liofilización cubriendo la abertura del tubo de ensayo de vidrio con parafilm.
    2. Perforar el parafilm con una aguja de 24 G aproximadamente 10-15 veces.
    3. Coloque las alícuotas perforadas en un recipiente de liofilización apropiado y asegúrese de que la tapa de goma esté sellada correctamente.
    4. Conecte el recipiente de liofilización al colector de vacío ubicado en la parte superior de la máquina de liofilización y asegúrese de que todas las demás válvulas estén bien cerradas.
    5. Encienda la máquina de liofilización girando el interruptor de encendido y presionando el botón de inicialización de vacío.
    6. Una vez que el sistema haya alcanzado el vacío total, haga clic en el botón de inicialización de refrigeración para comenzar el proceso de liofilización.
      NOTA: Se recomienda que las muestras se licofilicen durante la noche.
  3. Formulación de nanodiscos de anfotericina-B (amp-B)
    1. Pipetear 0,45 ml de PBS a la alícuota de fosfolípidos liofilizados y vórtice durante ~30 s para dispersar el lípido.
      NOTA: La muestra resultante aparecerá opaca y turbia.
    2. Pipetear 50 μL de una solución madre ampB de 20 mg/ml (20 mg de ampB disuelta en 1 ml de dimetilsulfóxido [DMSO], almacenada a -20 °C en un recipiente ámbar cerrado) en la muestra de fosfolípidos dispersos y el vórtice.
      NOTA: Al seleccionar un disolvente para utilizar en la preparación de una solución madre del agente bioactivo hidrófobo, las dos consideraciones generales son 1) la solubilidad del agente bioactivo y 2) la miscibilidad del disolvente con el tampón acuoso utilizado en la formulación. Mientras que el DMSO se utiliza a menudo 15,16,17,18,19, la dimetilformamida 20,21 o el tetrahidrofurano 22 también se han empleado con éxito 23.
    3. Pipetear 0,5 ml de proteína de andamio apoE4-NT (concentración de ~4 mg/ml) al tubo de ensayo de vidrio que contiene el fosfolípido disperso y ampB. El volumen final de la muestra debe ser de aproximadamente 1 ml.
    4. Bañar sonicar la muestra a 24 °C hasta que la solución se aclare (generalmente 10-15 min).
  4. Centrifugación de nanodiscos
    1. Transfiera la solución clarificada de nanodisco ampB a un tubo de microcentrífuga estéril de 1,7 ml.
    2. Coloque el tubo en un rotor de microcentrífuga de mesa con la adición de un tubo de equilibrio colocado directamente enfrente.
    3. Apriete la tapa del rotor y cierre la tapa de la centrífuga.
    4. Programe la centrífuga para que gire durante 10 minutos a ~ 11,000 x g utilizando los diales correspondientes ubicados en la parte frontal de la unidad de microcentrífuga.
      NOTA: En este punto, un pellet puede ser visible. Este pellet consiste en fosfolípidos no incorporados y/o ampB.
    5. Retire el sobrenadante y transfiéralo a otro tubo de microcentrífuga limpio de 1,7 ml.
  5. Diálisis de muestra de nanodisco ampB
    1. Prepare una sección de tubo de diálisis (las dimensiones del tubo de diálisis utilizado fueron de 3 cm de longitud, 16 mm de diámetro interno y 10,000 MWCO) remojando completamente en agua ddi durante 10 min.
    2. Preparar una solución tampón de 1 L de PBS (10 mM de fosfato de sodio + 150 mM de NaCl, pH 7,2) en un vaso de precipitados de plástico de 1 L o equivalente.
    3. Con una abrazadera de tubo de diálisis, sujete un extremo del tubo de diálisis empapado, asegurándose de que la abrazadera esté asegurada y que no pueda escapar ningún líquido.
    4. Inserte un embudo de cuello estrecho en el extremo abierto del tubo de diálisis y transfiera la muestra de nanodisco ampB al tubo de diálisis.
    5. Retire el embudo y sujete el extremo del tubo de diálisis con otra pinza para tubo de diálisis.
    6. Coloque un flotador de diálisis de espuma en uno de los extremos sellados del tubo de diálisis y coloque el tubo de diálisis ensamblado en el vaso de precipitados que contiene 1 L de tampón PBS.
    7. Coloque una barra de agitación magnética en la parte inferior del vaso de precipitados y ajuste el control de agitación a "bajo", asegurándose de que no se forme un vórtice. Deje que la diálisis continúe durante la noche a 4 °C.

3. Análisis espectral de muestras de nanodiscos ampB

  1. Inicialización del espectrofotómetro seguida de blanco automático
    1. Encienda el espectrofotómetro girando el interruptor de encendido y conéctese a una computadora de soporte correspondiente presionando el botón etiquetado "Control de PC".
    2. En la computadora de soporte, abra el software etiquetado "UVProbe 2.61" y conéctese al espectrofotómetro haciendo clic en el botón "Conectar" en la esquina inferior izquierda.
    3. Haga clic en el botón etiquetado Spectrum en la barra de herramientas superior dentro del software UVProbe.
    4. Haga clic en el botón Método en la barra de herramientas superior.
    5. Haga clic en la pestaña Medición e ingrese "500" en el cuadro de texto Inicio ubicado en "Rango de longitud de onda (nm)" y "300" en el cuadro de texto "Fin".
    6. Haga clic en el menú desplegable junto a la pestaña etiquetada Velocidad de escaneo y configúrela en Media.
    7. Preparar una muestra en blanco transfiriendo 1 ml de DMSO a dos cubetas de cuarzo (QS 1.000).
    8. Cargue ambas cubetas en los respectivos puertos de muestra del espectrofotómetro, haga clic en Autoblank y registre un espectro de 300-500 nm haciendo clic en Inicio en la esquina inferior izquierda.
  2. Preparación y análisis espectral del estándar ampB
    1. Preparar 20 μg/ml ampB patrón retirando la cubeta del puerto de muestra frontal y añadiendo 20 μL de una solución madre de ampB de 1 mg/ml (20 μg de ampB en total).
    2. Cargue la cubeta de nuevo en el puerto de muestra del espectrofotómetro y haga clic en Iniciar para registrar la absorbancia de la muestra.
    3. Retire la cubeta del puerto de muestra y decanta el contenido líquido en un recipiente de residuos debidamente etiquetado.
    4. Enjuague bien la cubeta con tres lavados de agua desionizada seguidos de tres lavados con etanol al 70%.
  3. Preparación y análisis espectral de la muestra de ampB-nanodisco interrumpido
    1. Preparar una muestra de nanodisco ampB interrumpida (que contenga 20 μg/ml como ampB) pipeteando 20 μL de un material de nanodiscos ampB de 1 mg/ml en 1 ml de DMSO. Incubar durante al menos 1 minuto antes de grabar el espectro.
    2. Cargue la cubbeta en el puerto de muestra frontal del espectrofotómetro y haga clic en Iniciar para registrar la absorbancia de la muestra.
  4. Preparación y análisis espectral de un espacio en blanco de tampón PBS
    1. Prepare un tampón PBS en blanco transfiriendo 1 ml de tampón PBS a dos cubetas de cuarzo (QS 1.000).
    2. Cargue las cubetas en los respectivos puertos de muestra del espectrofotómetro, haga clic en Autoblank y registre el espectro de 300-500 nm.
  5. Preparación y análisis espectral de una muestra de nanodisco ampB no interrumpida
    1. Prepare una muestra de nanodisco ampB no interrumpida (que contenga 20 μg/ml como ampB) retirando la cubeta del puerto de muestra frontal e introduciendo 20 μL de una muestra de nanodisco ampB de 1 mg/ml en el tampón PBS.
    2. Cargue la cubeta de nuevo en el puerto de muestra del espectrofotómetro, haga clic en Inicio y registre el espectro de muestra.
      NOTA: Todos los desechos químicos deben eliminarse en un contenedor de desechos debidamente etiquetado siguiendo las pautas aceptadas.

4. Análisis del ensayo de viabilidad de levaduras

NOTA: Se realizaron ensayos de viabilidad de levaduras con el fin de evaluar la actividad biológica de ampB y determinar si el proceso de formulación o incorporación en nanodiscos, afectó su actividad de inhibición del crecimiento de levaduras.

  1. Formular dos muestras de nanodiscos ampB (volumen final = 1 ml) para contener 1 mg de ampB por 5 mg de DMPC y 0,1 mg de ampB por 5 mg de DMPC siguiendo el método descrito anteriormente (2.3-2.4.1).
    NOTA: Para hacer un ampB de 1 mg/ml y 0,1 mg/ml por 5 mg de DMPC, pipetear 50 μL y 5 μL, respectivamente, de un ampB de 20 mg/ml en existencias de DMSO en cada vial de muestra.
  2. Preparación de un cultivo de levadura saturada
    1. Transfiera 25 ml de medio estéril de extracto de levadura-peptona-dextrosa (YPD) a un tubo cónico estéril de 50 ml.
    2. Utilice un bucle de inoculación estéril para transferir una sola colonia de Saccharomyces cerevisiae (BY4741) a los 25 ml de medio YPD.
    3. Cultivar la levadura en una incubadora agitadora fijada a 30 °C, con oscilación ajustada a 200 rpm durante 18 h.
  3. Preparación de muestras individuales de ensayos de inhibición del crecimiento
    1. Transfiera 5 ml de medio YPD estéril a 30 tubos de cultivo estériles de 13 ml.
    2. Trate tres juegos de tubos de cultivo agregando 20, 10 y 5 μL de la muestra de nanodisco ampB de 1 mg/ml, que representa 20, 10 y 5 μg de ampB, respectivamente.
    3. Tratar tres conjuntos de tubos de cultivo agregando 20, 10 y 5 μl de la muestra de nanodiscos ampB de 0,1 mg/ml, que representan 2, 1 y 0,5 μg de ampB, respectivamente.
    4. Trate cuatro juegos de tubos de cultivo agregando 20 μL de PBS, DMSO, rHDL de control (sin ampB) o 20 μg de ampB en DMSO.
      NOTA: Cada conjunto de tubos de cultivo representa una réplica independiente. Por lo tanto, siguiendo estos métodos da como resultado un valor n global de n = 3.
  4. Inicialización del ensayo de viabilidad de levadura
    1. Iniciar el experimento inoculando cada muestra con 100 μL (2% vol/vol) del cultivo de levadura saturada
    2. Cultivar la levadura utilizando una incubadora agitadora a 30 °C, con oscilación ajustada a 200 rpm durante un máximo de 18 h.
  5. Mediciones de viabilidad de levaduras
    1. Encienda el espectrofotómetro girando el interruptor de encendido, luego haga clic en el botón Ir a WL y establezca el valor en 600 nm.
    2. Transfiera 1 ml de medio YPD estéril a dos cubetas de plástico, cárguelo en los puertos de muestra respectivos del espectrofotómetro y haga clic en Autoblank.
    3. Transfiera 1 ml de cada muestra a una cubeta de plástico, asegurándose de cambiar las cubetas cada vez y cargue la cubeta en el puerto de muestra frontal del espectrofotómetro.
    4. Mida y registre la densidad óptica de cada muestra a 600 nm y deseche cada cubeta gastada en un contenedor de desechos de riesgo biológico debidamente etiquetado.

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Resultados

Proceso de formulación de nanodiscos de agentes bioactivos
En el procedimiento de formulación de nanodiscos ampB descrito, la reacción se considera completa cuando la apariencia de la muestra pasa de turbia a clara (Figura 1). Este cambio indica que se han formado nanodiscos y que el agente bioactivo ha sido solubilizado. A menudo, los agentes bioactivos absorben la luz en la región de longitud de onda visible (por ejemplo, ampB, curcumina, luteína, coenzima Q10

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Discusión

La formulación de un agente bioactivo que contiene nanodiscos proporciona un método conveniente para solubilizar compuestos hidrófobos insolubles. Debido a que los nanodiscos de agentes bioactivos del producto son completamente solubles en medios acuosos, proporcionan un método de administración útil para una amplia gama de moléculas hidrófobas (Tabla 1). Estos incluyen moléculas pequeñas, drogas naturales y sintéticas, fitonutrientes, hormonas, etc. La estrategia de formulación generalmente sigue un pro...

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Divulgaciones

Los autores no tienen nada que revelar.

Agradecimientos

Este trabajo fue apoyado por una subvención de los Institutos Nacionales de Salud (R37 HL-64159).

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Anfotericina BCayman Chemical Company11636ND Formulación & Preparación estándar
AmpicilinaFisher ScientificBP17925Transformación & Expansión
ApoE4-NT PlásmidoGenScriptN/ATransformación
Matraz deflectorNew Brunswick ScientificN/AExpansión & Expresión
BL21 competente E coli NewEngland BiolabsC2527I
Frascos de centrífuga deNalgene3140-0250Expresión
CloroformoFisher ScientificG607-4ND Formulación
DMSOSigma Aldrich472301Prepartación estándar
DimiristoilfosfatidilcolinaAvanti Lípidos850345PND Formulación
Matraz ErlenmeyerBellco BiotechnologyN/AExpansión & Expresión
Tubos FalconSarstedt Ag & CoD51588Ensayo de viabilidad de levadura
Tubos de borosilicato de vidrioVWR47729-570ND Formulación
GraphPad (software)DotmaticsN/AEnsayo de viabilidad de levadura
Baño de sonicación calentadoVWRN/AND Formulaton
Módulo de calentamiento y nitrógenoThermo ScientificTS-18822ND Formulación
HiTrap Heparina HP (5 mL)GE Healthcare17-0407-03Purificación
de isopropilo β-D-1-tiogalactopiranósido Fisher ScientificBP1755Expresión
J-25 CentrífugaBeckman CoulterJ325-IM-2Expresión
JA-14 RotorBeckman Coulter339247Expresión
LiofilizadorLabconco 7755030ND
Formulación MetanolFisher ScientificA452-4ND
Formulación Nitrógeno gaseosoPraxairUN1066ND Formulación
NZCYM mediosRPI Productos de investigaciónN7200-1000.0Expansión & Expresión
Vector Pet-22BGenScriptN/ATransformación
Placa de PetriFisher ScientificFB0875718Transformación &
Cubetas de cuarzoFisher Brand14385 928AIncubadora de agitación de análisis espectral
New Brunswick ScientificM1344-0004Transformación, expansión y
Expresión Slide-A-Lyzer boyasThermo Scientific66430Purificación
SnakeSkin tubo de diálisisThermo Scientific68100Purificación
SnakeSkin tubo de diálisisThermo Scientific88243purificación
cloruro de sodioFisher ScientificS271purificación
fosfato de sodio dibásicoFisher ScientificS374-500Purificación
Fosfato de sodio monobásicoFisher ScientificBP329-500
Purificación Spectra/POR Tapones ponderadosSpectrum Medical Industries132736
EspectrofotómetroShimadzu UV-1800220-92961-01análisis espectral
Centrífuga de mesaBeckman Coulter366816ND Formulación
UVProbe 2.61 (Software)ShimadzuN/AAnálisis espectral
Filtro de vacíoMillipore9004-70-0Expression & Bomba
vacíoGAST Manufacturing IncDOA-P704-AAExpression & Vórtice de purificación
Fisher Scientific12-812ND Formulación
LevaduraN/ABY4741Ensayo de viabilidad de levadura
Extracto de levadura-Peptona-DextrosaBD242820Ensayo de viabilidad de levadura
transformación de expansión de purificación de de purificación

Referencias

  1. Fox, C. A., Moschetti, A., Ryan, R. O. Reconstituted HDL as a therapeutic delivery device. Biochimica et Biophysica Acta. Molecular and Cell Biology of Lipids. 1866 (11), 159025(2021).
  2. Ong, K. L., Cochran, B. J., Manandhar, B., Thomas, S., Rye, K. A. HDL maturation and remodelling. Biochimica et Biophysica Acta. Molecular and Cell Biology of Lipids. 1867 (4), 159119(2022).
  3. Nicholls, S. J., et al. Effect of serial infusions of CER-001, a pre-β high-density lipoprotein mimetic, on coronary atherosclerosis in patients following acute coronary syndromes in the CER-001 Atherosclerosis Regression Acute Coronary Syndrome Trial: a randomized clinical trial. JAMA Cardiology. 3 (9), 815-822 (2018).
  4. Kingwell, B. A., Chapman, M. J., Kontush, A., Miller, N. E. HDL-targeted therapies: progress, failures and future. Nature Reviews Drug Discovery. 13 (6), 445-464 (2014).
  5. Denisov, I. G., Sligar, S. G. Nanodiscs for structural and functional studies of membrane proteins. Nature Structure & Molecular Biology. 23 (6), 481-486 (2016).
  6. Hoel, C. M., Zhang, L., Brohawn, S. G. Structure of the GOLD-domain seven-transmembrane helix protein family member TMEM87A. eLife. 11, e81704(2022).
  7. Pérez-Medina, C., et al. PET imaging of tumor-associated macrophages with 89Zr-labeled high-density lipoprotein nanoparticles. Journal of Nuclear Medicine. 56 (8), 1272-1277 (2015).
  8. Fox, C. A., Ryan, R. O. Studies of the cardiolipin interactome. Progress in Lipid Research. 88, 101195(2022).
  9. Ryan, R. O., Forte, T. M., Oda, M. N. Optimized bacterial expression of human apolipoprotein A-I. Protein Expression and Purification. 27 (1), 98-103 (2003).
  10. Argyri, L., Skamnaki, V., Stratikos, E., Chroni, A. A simple approach for human recombinant apolipoprotein E4 expression and purification. Protein Expression and Purification. 79 (2), 251-257 (2011).
  11. Lethcoe, K., Fox, C. A., Ryan, R. O. Foam fractionation of a recombinant biosurfactant apolipoprotein. Journal of Biotechnology. 343, 25-31 (2022).
  12. Fisher, C. A., et al. Bacterial overexpression, isotope enrichment, and NMR analysis of the N-terminal domain of human apolipoprotein E. Biochemistry and Cell Biology. 75 (1), 45-53 (1997).
  13. Jonas, A. Reconstitution of high-density lipoproteins. Methods in Enzymology. 128, 553-582 (1986).
  14. Ryan, R. O. Nanodisks: hydrophobic drug delivery vehicles. Expert Opinion on Drug Delivery. 5 (3), 343-351 (2008).
  15. Oda, M. N., et al. Reconstituted high density lipoprotein enriched with the polyene antibiotic amphotericin B. Journal of Lipid Research. 47 (2), 260-267 (2006).
  16. Redmond, K. A., Nguyen, T. S., Ryan, R. O. All-trans-retinoic acid nanodisks. International Journal of Pharmaceutics. 339 (1-2), 246-250 (2007).
  17. Ghosh, M., et al. Curcumin nanodisks: formulation and characterization. Nanomedicine. 7 (2), 162-167 (2011).
  18. Yuan, Y., et al. Synthetic high-density lipoproteins for delivery of 10-hydroxycamptothecin. International Journal of Nanomedicine. 11, 6229-6238 (2016).
  19. Zhao, P., et al. Sphingadienes show therapeutic efficacy in neuroblastoma in vitro and in vivo by targeting the AKT signaling pathway. Investigational New Drugs. 36 (5), 743-754 (2018).
  20. Moschetti, A., et al. Assembly and characterization of biocompatible coenzyme Q10 enriched lipid nanoparticles. Lipids. 55 (2), 141-149 (2020).
  21. Krishnamoorthy, A., Witkowski, A., Ryan, R. O. Nutlin-3a nanodisks induce p53 stabilization and apoptosis in a subset of cultured glioblastoma cells. Journal of Nanomedicine and Nanotechnology. 8 (4), 454(2017).
  22. Moschetti, A., Fox, C. A., McGowen, S., Ryan, R. O. Lutein nanodisks protect retinal pigment epithelial cells from UV light induced damage. Frontiers in Nanotechnology. 4, 955022(2022).
  23. Scheetz, L. M., et al. Synthetic HDL nanoparticles delivering docetaxel and CpG for chemoimmunotherapy of colon adenocarcinoma. International Journal of Molecular Sciences. 21 (5), 1777(2020).
  24. Duivenvoorden, R., et al. A statin-loaded reconstituted high-density lipoprotein nanoparticle inhibits atherosclerotic plaque inflammation. Nature Communications. 5, 3065(2014).
  25. Hargreaves, P. L., Nguyen, T. S., Ryan, R. O. Spectroscopic studies of amphotericin B solubilized in nanoscale bilayer membranes. Biochimica et Biophysica Acta. 1758 (1), 38-44 (2006).
  26. Tufteland, M., Pesavento, J. B., Bermingham, R. L., Hoeprich Jr, P. D., Ryan, R. O. Peptide stabilized amphotericin B nanodisks. Peptides. 28 (4), 741-746 (2007).
  27. Tufteland, M., Ren, G., Ryan, R. O. Nanodisks derived from amphotericin B lipid complex. Journal of Pharmaceutical Sciences. 97 (10), 4425-4432 (2008).
  28. Nguyen, T. S., et al. Amphotericin B induces interdigitation of apolipoprotein stabilized nanodisk bilayers. Biochimica et Biophysica Acta. 1778 (1), 303-312 (2008).
  29. Ryan, R. O. Nanobiotechnology applications of reconstituted high density lipoprotein. Journal of Nanobiotechnology. 8, 28(2010).
  30. Lalefar, N. R., Witkowski, A., Simonsen, J. B., Ryan, R. O. Wnt3a nanodisks promote ex vivo expansion of hematopoietic stem and progenitor cells. Journal of Nanobiotechnology. 14 (1), 66(2016).
  31. Crosby, N. M., et al. Anti-CD20 single chain variable antibody fragment-apolipoprotein A-I chimera containing nanodisks promote targeted bioactive agent delivery to CD20-positive lymphomas. Biochemistry and Cell Biology. 93 (4), 343-350 (2015).
  32. Ghosh, M., Ren, G., Simonsen, J. B., Ryan, R. O. Cationic lipid nanodisks as an siRNA delivery vehicle. Biochemistry and Cell Biology. 92 (3), 200-205 (2014).
  33. Fox, C. A., Ellison, P., Ikon, N., Ryan, R. O. Calcium-induced transformation of cardiolipin nanodisks. Biochimica et Biophysica Acta. Biomembranes. 1861 (5), 1030-1036 (2019).
  34. Fox, C. A., Lethcoe, K., Ryan, R. O. Calcium-induced release of cytochrome c from cardiolipin nanodisks: Implications for apoptosis. Biochimica et Biophysica Acta Biomembranes. 1861 (12), 183722(2021).
  35. Fox, C. A., Ryan, R. O. Dye binding assay reveals doxorubicin preference for DNA versus cardiolipin. Analytical Biochemistry. 594, 113617(2020).
  36. Fox, C. A., Romenskaia, I., Dagda, R. K., Ryan, R. O. Cardiolipin nanodisks confer protection against doxorubicin-induced mitochondrial dysfunction. Biochimica et Biophysica Acta Biomembranes. 1864 (10), 183984(2022).

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