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Se presenta una cadena de herramientas de tomografía computarizada (TC) de rayos X para obtener el ancho del anillo del árbol (TRW), la densidad máxima de la madera tardía (MXD), otros parámetros de densidad y datos cuantitativos de la anatomía de la madera (QWA) sin la necesidad de un tratamiento de superficie intensivo en mano de obra ni ninguna preparación de muestra física. En este caso, la atención se centra en los núcleos de incremento y los procedimientos de escaneo con resoluciones que van desde 60 μm hasta 4 μm. Se definen tres escalas en las que se debe observar la madera: (i) escala entre anillos, (ii) escala de anillos, es decir, análisis de anillos de árboles y escala de densitometría, así como (iii) escala anatómica, esta última acercándose a la calidad convencional de sección delgada. Los portamuestras diseñados a medida para cada una de estas básculas permiten el escaneo de alto rendimiento de múltiples núcleos de incremento. Se desarrollaron específicamente una serie de rutinas de software para tratar de manera eficiente las imágenes de TC de rayos X tridimensionales de los núcleos de los árboles para TRW y densitometría. En este trabajo se explican brevemente los principios básicos de la TC, necesarios para una correcta comprensión del protocolo. Se presenta el protocolo para algunas especies conocidas que se utilizan habitualmente en dendrocronología. La combinación de estimaciones aproximadas de densidad, datos TRW y MXD, así como datos cuantitativos de anatomía, nos permite ampliar y profundizar los análisis actuales para las reconstrucciones climáticas o la respuesta de los árboles, así como desarrollar aún más el campo de la dendroecología/climatología y la arqueología.