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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo describe el aislamiento de astrocitos y microglía purificados de la médula espinal de ratones adultos, lo que facilita aplicaciones posteriores como el análisis de ARN y el cultivo celular. Incluye métodos detallados de disociación celular y procedimientos diseñados para mejorar tanto la calidad como el rendimiento de las células aisladas.
Los astrocitos y la microglía desempeñan un papel fundamental en el desarrollo del sistema nervioso central, las respuestas a lesiones y las enfermedades neurodegenerativas. Estas células altamente dinámicas exhiben respuestas rápidas a los cambios ambientales y muestran una heterogeneidad significativa en términos de morfología, perfiles transcripcionales y funciones. Si bien nuestra comprensión de las funciones de las células gliales en la salud y la enfermedad ha avanzado sustancialmente, sigue siendo necesario realizar análisis in vitro específicos de células en el contexto de lesiones o lesiones para caracterizar de manera exhaustiva las distintas poblaciones celulares. El aislamiento de células del ratón adulto ofrece varias ventajas sobre las líneas celulares o los animales neonatos, ya que permite el análisis de células en condiciones patológicas y en momentos específicos. Además, centrarse en el aislamiento específico de la médula espinal, excluyendo la afectación cerebral, permite investigar patologías de la médula espinal, incluida la encefalomielitis autoinmune experimental, la lesión de la médula espinal y la esclerosis lateral amiotrófica. Este protocolo presenta un método eficiente para aislar astrocitos y microglía de la médula espinal del ratón adulto, lo que facilita el análisis inmediato o futuro con aplicaciones potenciales en estudios funcionales, moleculares o proteómicos posteriores.
Los astrocitos y la microglía son células gliales versátiles que desempeñan funciones vitales en el sistema nervioso central (SNC), abarcando responsabilidades como la regulación de la función neuronal, la contribución al desarrollo del SNC, el mantenimiento de la barrera hematoencefálica y la participación en otros procesos críticos 1,2,3,4 . Además de su papel en el mantenimiento de la homeostasis, estas células gliales también desempeñan un papel fundamental en los mecanismos de lesión y reparación. Las microglías son bien conocidas por sus capacidades fagocíticas, inflamatorias y migratorias después de lesiones o lesiones 5,6,7. Las respuestas de los astrocitos en la enfermedad son igualmente diversas, abarcando contribuciones a la inflamación, la formación de cicatrices gliales y el compromiso de la barrera hematoencefálica 8,9. Aunque nuestra comprensión de las funciones perjudiciales y reparadoras de la microglía y los astrocitos en el SNC ha crecido, la heterogeneidad inherente tanto en su estructura como en su función requiere herramientas sólidas para estudiarlos en diversos contextos.
Obtener más información sobre el papel de la microglía y los astrocitos en la salud y la enfermedad requiere un enfoque combinado de investigaciones in vivo e in vitro . Las técnicas in vivo aprovechan la intrincada diafonía entre las células gliales y las neuronas dentro del SNC, mientras que las metodologías in vitro resultan valiosas a la hora de evaluar las funciones o respuestas de una sola célula bajo estímulos específicos. Cada método ofrece ventajas únicas; Los estudios in vitro son esenciales para comprender las funciones específicas de estos tipos de células sin la entrada directa o indirecta de células vecinas. Además, los ensayos in vitro que utilizan líneas celulares inmortales presentan ciertos beneficios, incluida la capacidad de proliferar indefinidamente, la rentabilidad y la facilidad de mantenimiento. Sin embargo, es importante tener en cuenta que las células primarias imitan más de cerca las respuestas fisiológicas normales en comparación con las líneas celulares. Esta relevancia fisiológica es crucial en los ensayos funcionales y en los análisis transcriptómicos.
Uno de los retos en la obtención de células primarias, particularmente de la médula espinal de ratones adultos, radica en la cantidad y viabilidad de las muestras. La médula espinal adulta, al ser más pequeña que el cerebro y contener una cantidad significativa de mielina, plantea dificultades únicas. Si bien existen varios protocolos publicados que detallan el aislamiento de células gliales puras y viables de animales neonatos o del cerebro de ratón adulto 10,11,12,13, estas metodologías pueden no ser adecuadas para estudiar enfermedades y lesiones específicas de la médula espinal. En este protocolo, ofrecemos un procedimiento integral para aislar de manera eficiente la microglía y los astrocitos puros y viables de la médula espinal del ratón adulto, lo que facilita las aplicaciones posteriores en cultivos celulares y análisis transcriptómicos. Este protocolo se ha empleado con éxito para aislar estas células de ratones adultos de 10 semanas a 5 meses, lo que demuestra su utilidad en varios contextos, incluidos estudios con ratones knockout condicionales, respuestas a fármacos, investigación del desarrollo y modelos relacionados con la edad.
Todos los procedimientos experimentales y de cuidado de los animales se llevaron a cabo tras la aprobación del Comité de Cuidado y Uso de Animales de la Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud de la Universidad George Washington (Washington, D.C., EE. UU.; IACUC#2021-004). El estudio utilizó ratones machos y hembras C57BL/6J de tipo salvaje (WT) de 10 semanas a 5 meses, que se obtuvieron de un proveedor comercial (ver Tabla de materiales) y se alojaron en la Universidad George Washington. En la Figura 1 se presenta una descripción general del flujo de trabajo del protocolo.
1. Preparación de la médula espinal
2. Disociación enzimática de células
3. Disociación celular mecánica
4. Eliminación de mielina
5. Aislamiento de microglía y astrocitos
6. Células de siembra para ensayos in vitro
NOTA: Si las células no se van a sembrar y se van a utilizar inmediatamente para el análisis de ARN, continúe con el paso 8.
7. Inmunohistoquímica
NOTA: Es mejor realizar análisis inmunohistoquímicos después de al menos 3 días cuando el medio se ha reemplazado al menos una vez. Esto asegura que se hayan eliminado los residuos y que las células se hayan adherido completamente al cubreobjetos.
8. Extracción de ARN
NOTA: Lo ideal es que haya al menos 100.000 células para extraer suficiente ARN para su análisis. Si es necesario, se pueden combinar células de 2-3 médula espinal.
Los métodos descritos en este protocolo permiten aislar la microglía y los astrocitos puros y viables de la médula espinal del ratón adulto, lo que facilita diversas aplicaciones posteriores, incluidos los ensayos funcionales o histológicos in vitro y el análisis de ARN.
Un aislamiento exitoso para estudios in vitro dará como resultado una proliferación celular continua durante varios días. Las células adultas exhiben una tasa de proliferación más lenta en comparación con las células aisladas de animales neonatos, y algunos desechos pueden estar presentes en los primeros días. A los 4 días in vitro (DIV), las células deben estar en gran parte libres de residuos, y la mayoría de las células deben adherirse al fondo del matraz. Los astrocitos comenzarán a formar procesos más largos, mientras que la microglía asumirá una forma ovalada con husos más cortos (Figura 2). A las 7 DIV, los astrocitos deberían formar una capa confluente conectada, y la microglía debería mostrar menos procesos y más cortos (Figura 3).
La pureza puede confirmarse mediante el doble marcaje de células clasificadas por ACSA2 con GFAP y O4 para evaluar la contaminación por oligodendrocitos en cultivos de astrocitos y células clasificadas por CD11b con Iba1 y GFAP para evaluar la contaminación de astrocitos en cultivos de microglía (Tabla 1).
Un protocolo exitoso también producirá ARN de alta calidad con una degradación mínima y una cantidad suficiente (Figura 4A). Los electroferogramas de ARN extraído de células aisladas deben exhibir picos prominentes de 18S y 28S. La disociación excesiva de las células o el tiempo prolongado entre la perfusión y la clasificación celular pueden conducir a la degradación del ARN (Figura 4B). Una disociación enzimática y/o mecánica insuficiente o una eliminación inadecuada de mielina pueden dar lugar a una reducción del rendimiento celular y del ARN (Figura 4C). Los astrocitos aislados se pueden secuenciar para identificar marcadores inflamatorios. La comparación de astrocitos sanos con astrocitos activados por inflamación (p. ej., de un animal experimental con encefalomielitis autoinmune) revelará ininhibiciones relativas de las vías inflamatorias en astrocitos sanos frente a astrocitos inflamatorios (Figura 4D).

Figura 1: Descripción general de la preparación de la médula espinal, la disociación de tejidos y la clasificación celular. La figura proporciona una visión general del proceso de preparación de la médula espinal, incluida la disociación de tejidos y la clasificación celular. Después de la disección de la médula espinal, los tejidos sufren disociación enzimática y mecánica. Se elimina la mielina y las células se marcan con anticuerpos anti-ACSA2 o anti-CD11b para atacar los astrocitos y la microglía. Las células clasificadas se pueden utilizar para cultivos celulares y análisis de ARN. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Imágenes de contraste de fase de astrocitos y microglía a los 4 días in vitro (4DIV). (A) Representa un ejemplo representativo de células clasificadas por ACSA2+ con procesos extendidos. (B) Las células CD11b+ muestran cuerpos celulares de forma ovalada y procesos cortos. Barra de escala = 50 μm. Esta figura es una adaptación de Ahn, J. J. et al.16. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Imágenes fluorescentes de astrocitos y microglía a los 8 días in vitro (8DIV). (A) Las células ACSA2+ marcadas con GFAP (verde) y O4 (rojo) exhiben una tinción mínima de O4 y forman una capa confluente conectada de astrocitos. (B) Las células CD11b+ marcadas con Iba1 (verde) y GFAP (rojo) muestran una presencia mínima de GFAP. Barra de escala = 50 μm. Esta figura es una adaptación de Ahn, J. J. et al.16. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Electroferogramas representativos de muestras de ARN. (A) Se espera ARN de alto rendimiento y alta calidad después de un aislamiento celular exitoso. (B) Se puede esperar ARN de bajo rendimiento y baja calidad o (C) ARN de bajo rendimiento y alta calidad en casos de muerte celular, disociación insuficiente o eliminación inadecuada de desechos. (D) El análisis de secuenciación de ARN de vías inflamatorias seleccionadas en astrocitos sanos frente a astrocitos inflamatorios revela una inhibición relativa de la inflamación en astrocitos sanos clasificados en comparación con astrocitos inflamatorios. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Tipo de célula | Recuento total de células | Celdas ordenadas | % Ordenado/Total | % medio de viabilidad |
| ACSA2 | 6.3 x 105 | 1.7 x 105 | 27 | 92 |
| CD11b | 6.3 x 105 | 8.0 x 104 | 12.7 | 93 |
Tabla 1: Rendimiento, pureza y viabilidad de las células después de la clasificación de las células ACSA-2 y CD11b. Esta tabla es una adaptación de Ahn, J. J. et al.16.
Ninguno
Este protocolo describe el aislamiento de astrocitos y microglía purificados de la médula espinal de ratones adultos, lo que facilita aplicaciones posteriores como el análisis de ARN y el cultivo celular. Incluye métodos detallados de disociación celular y procedimientos diseñados para mejorar tanto la calidad como el rendimiento de las células aisladas.
Agradecemos a Castle Raley, del Centro de Genómica de la Universidad George Washington, por los análisis de ARN y a Q2 Lab Solutions por los análisis de secuenciación de ARN. Este trabajo fue apoyado por el Instituto Nacional de Trastornos Neurológicos y Accidentes Cerebrovasculares [subvención número F31NS117085] y la Fundación de Investigación Vivian Gill al Dr. Robert H. Miller. La figura 1 se creó con BioRender.com.
| 2,2,2-tribromoetanol | Sigma Aldrich | T48402 | |
| placa de cultivo de tejidos de 24 pocillos | Avantor | 10861-558 | |
| 2-metil-2-butanol, 98% | Thermo Fisher | A18304-0F | |
| 4',6-diamidino-2-fenilindol, diclorhidrato | Invitrogen | D1306 | 1:1000 |
| solución de glucosa al 45% | Corning | 25-037-CI | |
| Tubos tapados de 5 mL | Eppendorf | 30122305 | |
| Ácido acético | Sigma-Adlrich | A6283 | |
| Kit de disociación cerebral para adultos | Miltenyi | 103-107-677 | |
| Kit de microesferas anti-ACSA2 | Miltenyi | 130-097-679 | |
| Anti-IBA1 | Wako | 019-1974 | |
| Bioanalizador | Agilent Tecnologías | G2939BA | |
| ratones de tipo salvaje (WT) C57BL/6J | Jackson Laboratories | ||
| CD11b (Microglía) MicroBeads | Miltenyi | 130-093-634 | |
| Celltrics 30 µ Filtro M | Sysmex Partec | 04-004-2326 | |
| Cámara de recuento (hemacitómetro) | Hausser Scientific Co | 3200 | |
| Desoxirribonucleasa I de páncreas bovino | Sigma Aldrich | D4527-40KU | |
| Agua destilada | TMO | 15230001 | |
| DMEM/F12 | Thermo Fisher | 11320074 | |
| DNasa para la purificación de ARN | Qiagen | 79254 | |
| Solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco | Thermo Fisher | 14040117 | |
| Suero fetal bovino | Thermo Fisher | A5209401 | |
| anticuerpo GFAP (ratón) | Santa Cruz | sc-33673 | 1:500 |
| Anticuerpo GFAP (conejo) | Dako | Z0334 | 1:500 |
| Cabra anti-ratón 594 IgG | Invitrogen | a11032 | 1:500 |
| Cabra anti-ratón 594 IgM | Invitrogen | a21044 | 1:300 |
| Cabra anti-Conejo 488 IgG | Invitrogen | a11008 | 1:500 |
| Iba1 anticuerpo (conejo) | Wako | 019-1974 | 1:500 |
| MACS Separador | Miltenyi | 130-042-303 | |
| Masterflex C/L Sistema de bomba | Thermo Fisher | 77122-22 | |
| MEM | Corning | 15-015-CV | |
| Metanol | Sigma-Adlrich | 439193 | |
| Medio de montaje | Vector Laboratories | H-1000-10 | |
| MS Columnas | Miltenyi | 130-042-401 | |
| O4 Anticuerpo | R& D | MAB1326 | |
| Penicilina-estreptomicina | Gibco 15070063 | ||
| Pipeta pasteur de vidrio taponada de 9" | VWR | 14672-412 | |
| RNeasy Plus Micro Kit | Qiagen | 74034 | |
| Royal-tek Hoja de bisturí quirúrgico n.º 10 | Fisher scientific | 22-079-683 | |
| Set de infusión de venas pequeñas, 23 G x 19 mm | Kawasumi | D3K2-23G |