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Research Article
Gaëlle Hayot1, Daniel Marcato1,2, Christina A. Cramer von Clausbruch1, Giuseppina Pace1, Uwe Strähle1,3, John K. Colbourne4, Christian Pylatiuk5, Ravindra Peravali1, Carsten Weiss1, Stefan Scholz6, Thomas Dickmeis1
1Institute of Biological and Chemical Systems - Biological Information Processing,Karlsruhe Institute of Technology - Campus Nord, 2DITABIS AG - Digital Biomedical Imaging Systems AG, 3Centre for Organismal Studies,Heidelberg University, 4School of Biosciences,University of Birmingham, 5Institute for Automation and Applied Informatics,Karlsruhe Institute of Technology - Campus Nord, 6Department of Bioanalytical Ecotoxicology,Helmholtz-Centre for Environmental Research - UFZ
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Describimos el flujo de trabajo y el análisis de datos de un sistema de cribado para evaluar la toxicidad de compuestos químicos en función de la respuesta de sobresalto por vibración del embrión de pez cebra. El sistema registra los movimientos de los embriones de pez cebra tras la exposición a un estímulo vibratorio y permite una evaluación integrada de la toxicidad/letalidad general y la toxicidad neuromuscular.
Desarrollamos un sistema de cribado sencillo para la evaluación de la toxicidad neuromuscular y general en embriones de pez cebra. El sistema modular consta de transductores electrodinámicos sobre los que se pueden colocar placas de cultivo de tejidos con embriones. Se pueden combinar varios pares de placas de cultivo de tejidos de este tipo. Los estímulos vibracionales generados por los transductores electrodinámicos inducen una respuesta característica de sobresalto y escape en los embriones. Un accionamiento lineal accionado por correa coloca secuencialmente una cámara encima de cada altavoz para registrar el movimiento de los embriones. De esta forma, se pueden visualizar y cuantificar las alteraciones en la respuesta de sobresalto debidas a la letalidad o toxicidad neuromuscular de los compuestos químicos. Presentamos un ejemplo del flujo de trabajo para el cribado de compuestos químicos utilizando este sistema, incluyendo la preparación de embriones y soluciones de tratamiento, el funcionamiento del sistema de registro y el análisis de datos para calcular los valores de concentración de referencia de los compuestos activos en el ensayo. El montaje modular basado en componentes simples disponibles en el mercado hace que este sistema sea económico y se adapte de manera flexible a las necesidades de configuraciones particulares de laboratorio y fines de detección.
En los últimos años, el pez cebra se ha convertido en un organismo modelo muy popular para la evaluación de los efectos de los compuestos químicos, abarcando áreas de investigación que van desde el desarrollo de fármacos hasta latoxicología ambiental. Como vertebrados, el pez cebra comparte muchos aspectos de su composición genética y fisiología general con los humanos 2,3. Por lo tanto, los resultados obtenidos en este modelo a menudo son directamente relevantes para la salud humana. Varios candidatos a fármacos actualmente en ensayos clínicos han sido identificados en cribados compuestos utilizando pez cebra4.
La evaluación de la toxicidad es una de las principales aplicaciones en las que las pruebas con estadios embrionarios de pez cebra son de interés. Existen varias directrices de ensayo de la Organización para la Cooperación y el Desarrollo Económicos (OCDE) para el uso del pez cebra en los ensayos de toxicidad ambiental 5,6. El pequeño tamaño y el rápido desarrollo de los embriones de pez cebra los hacen muy adecuados para los enfoques de cribado en una escala de rendimiento medio a alto 1,3,4. Los criterios de valoración toxicológicos a los que se dirigen estos cribados incluyen las malformaciones embrionarias y la letalidad7, la disrupción endocrina8, la toxicidad orgánica9 y las evaluaciones conductuales indicativas de toxicidad neuronal10,11. Los ensayos conductuales son posibles porque los embriones de pez cebra muestran varios tipos de respuestas locomotoras a diferentes estímulos dependiendo de su etapa de desarrollo. Por ejemplo, los embriones 1 día después de la fecundación (dpf) muestran un enrollamiento espontáneo de la cola12 y responden a una secuencia de pulsos de luz con una secuencia típica de movimientos, la llamada respuesta fotomotora (PMR)10. Después de la eclosión, que suele ocurrir alrededor de 48-72 horas después de la fertilización (hpf), los eleuteroembriones que nadan libremente13 desarrollan gradualmente respuestas de sobresalto y escape a los estímulos vibratorios a partir de alrededor de 4 dpf14. Estas respuestas se caracterizan por una curvatura distintiva hacia la dirección opuesta a la dirección del estímulo (la llamada curva C o inicio en C), que es seguida por una contracurva más pequeña y un comportamiento de natación 14,15,16,17. En particular, los comportamientos embrionarios están gobernados por circuitos neuronales que utilizan varios sistemas de neurotransmisores, lo que permite sondear los efectos de los compuestos químicos dirigidos a estos sistemas. Por ejemplo, el ensayo PMR reveló los efectos de compuestos que interfieren con la señalización colinérgica, adrenérgica y dopaminérgica10, mientras que la respuesta de sobresalto involucra a las neuronas colinérgicas, glutamatérgicas y glicinérgicas 16,18. Además, los compuestos que dañan los músculos o la interfaz neuromuscular también afectarán estos comportamientos, al igual que los compuestos tóxicos para las células ciliadas del oído interno/línea lateral19,20. Por lo tanto, observar el comportamiento locomotor del pez cebra en respuesta a un estímulo es un medio adecuado para evaluar no solo la neurotoxicidad, sino también la ototoxicidad y la miotoxicidad. La puntuación del comportamiento locomotor también sirve como un indicador para la evaluación general de la toxicidad/letalidad, ya que los embriones muertos no se mueven. Por lo tanto, los comportamientos de locomoción embrionaria representan una lectura integradora para un enfoque de detección de toxicidad de primer nivel, que indica efectos letales y compuestos neuromusculares en una sola configuración. Dado que los eleuteroembriones ya son capaces de metabolizar compuestos, el abordaje también puede detectar los efectos de los productos de transformación metabólica 7,21,22. Es importante destacar que los embriones de pez cebra no se consideran una etapa de vida protegida según algunas legislaciones de protección animal hasta la etapa de alimentación libre después de 120 hpf13. Por lo tanto, se consideran una alternativa a los ensayos de toxicidad en animales.

Figura 1: Configuración del sistema de respuesta a sobresaltos por vibración. (A) Descripción general del sistema. Las placas con embriones expuestos a los compuestos de prueba se colocan en el conjunto de transductores electrodinámicos ("altavoces"). La cámara se mueve secuencialmente mediante el accionamiento lineal accionado por correa hasta la posición de grabación por encima del transductor de destino. (B) Vista detallada del transductor/altavoz con placa de cultivo de tejidos insertada en la parte superior. Las placas están iluminadas desde abajo por una lámina de luz LED a 4000-5000 lux. Una luz LED junto al altavoz se enciende mientras se administra el estímulo. (C) Imagen fija de video grabada por la cámara sobre la estimulación de los embriones. (D) Captura de pantalla del archivo de configuración. (E) Captura de pantalla de la interfaz del software de grabación. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Aquí, describimos un protocolo de prueba para la evaluación de los efectos de los compuestos en la respuesta de sobresalto por vibración utilizando un dispositivo de prueba simple construido internamente basado en estímulos de vibración generados por transductores electrodinámicos junto con una grabación de video automatizada de varios embriones que se mueven libremente en una placa de cultivo de tejidos23. El sistema es modular y permite el registro secuencial de varias placas de cultivo de tejidos en paralelo. En la configuración utilizada actualmente, cinco transductores electrodinámicos proporcionan un estímulo vibracional (500 Hz, duración 1 ms) a las placas de cultivo de tejidos que contienen 20 embriones colocados encima de ellas (Figura 1). Las placas se iluminan desde abajo a 4000-5000 lux con láminas de luz LED. Una luz LED al lado de cada transductor indica los períodos de aplicación del estímulo, y un osciloscopio indica las formas de onda y la frecuencia del estímulo aplicado (para más detalles, consulte la Ref. 23). El comportamiento de los embriones es registrado por una cámara de alta velocidad (Tabla de Materiales) a 1000 fotogramas por segundo (fps), que se mueve por encima del altavoz objetivo mediante un accionamiento lineal accionado por correa. Esta velocidad de grabación es necesaria para resolver de forma fiable la respuesta de sobresalto. El sistema proporciona una alternativa de bajo costo y adaptable individualmente a los sistemas comerciales actuales. El flujo de trabajo preciso que se detalla a continuación se realiza actualmente en el marco de la iniciativa de Toxicología de Precisión24 con el fin de determinar las condiciones de exposición adecuadas para la adquisición de datos OMICS de embriones de pez cebra tratados con un conjunto seleccionado de sustancias tóxicas.
Toda la cría y manipulación del pez cebra se realizó de acuerdo con las normas alemanas de protección animal y fue aprobada por el Gobierno de Baden-Württemberg, Regierungspräsidium Karlsruhe, Alemania (Aktenzeichen 35-9185.64/BH KIT).
1. Preparación de soluciones madre de productos químicos que se van a probar
2. Recolección y cría de embriones de pez cebra
3. Preparación de la dilución de trabajo de los productos químicos que se van a probar
4. Exposición de los embriones a los productos químicos que se van a analizar
5. Realización del ensayo de sobresalto por vibración
NOTA: Analice las placas en el mismo orden que se registró en el paso 4.5. Cada ejecución debe incluir una placa de control E3.
6. Análisis de datos
La Figura 2A muestra el porcentaje de embriones inmóviles en 48 nidadas de embriones salvajes no tratados (cepa AB2O2). En promedio, el 14,33% de los embriones de tipo salvaje no tratados no reaccionan al estímulo de vibración. En 4 nidadas, el porcentaje de larvas inmóviles alcanzó el 50%, pero el 75% de las nidadas tenían un porcentaje de larvas inmóviles por debajo del 20%.
La Figura 2B,C muestra un ejemplo de un cálculo típico de una concentración/dosis de referencia (BMC/BMD29,30) para los efectos de los compuestos sobre la motilidad con el flujo de trabajo del ensayo de sobresalto por vibración, tal como se realiza actualmente en el consorcio PrecisionTox24. Los valores de BMC10, BMC25 y BMC50 corresponden a las concentraciones en las que el 10%, 25% y 50% de los embriones presentan niveles de inmotilidad superiores a los de fondo, respectivamente. En este cálculo solo se incluyen los embriones que son completamente inmóviles, no los que todavía muestran respuestas parciales, como solo una flexión en C sin natación de escape posterior o solo movimientos de cola (Figura 2B). Los embriones fueron expuestos a 8 concentraciones del inhibidor de los canales de sodio metanosulfonato de tricaína, que se utiliza con frecuencia para la anestesia de peces31. Los datos indican un nivel de fondo de alrededor del 25% de inmovilidad en respuesta al estímulo de vibración. A partir del 1% de tricaína, la motilidad se reduce y luego cesa por encima del 2,5%. El flujo de trabajo de KNIME calcula el BMC50 como 164,9 μM, lo que corresponde a un 1,07 % de tricaína y un nivel de inmotilidad del 75 % (Figura 2C). Los pequeños intervalos de confianza del 95% (indicados por los tonos grises de la curva) indican una robusta reproducibilidad de los valores de motilidad en este ensayo.
La Figura 2D muestra un ejemplo de una ejecución de ensayo subóptima, cuyos datos no deben utilizarse para los cálculos de BMC. Se muestran cinco grupos control tratados con E3 con diferentes embriones derivados de la misma nidada (AB2O2 [cepa de tipo salvaje] se replica 1-5). Solo el primer grupo muestra una respuesta cercana a la normalidad, mostrando alrededor de un 25% de inmotilidad que es consistente con los valores de la literatura32 y los obtenidos en el ensayo aquí descrito, como se muestra en la Figura 2A, mientras que todos los demás grupos muestran respuestas conductuales reducidas y/o incompletas (p. ej., mostrando solo una flexión en C no seguida de actividad de natación, o motilidad sin una curva en C clara al principio). Tal respuesta puede ocurrir cuando los embriones no se desarrollan adecuadamente y se encuentran en un estado inmaduro debido a un retraso en el desarrollo, lo que afecta la robustez de la respuesta de sobresalto14,33.

Figura 2: Ejemplo de un resultado típico, incluido el cálculo de la dosis de referencia. (A) Porcentaje de embriones que no responden después del pulso de sonido para larvas de tipo salvaje no tratadas durante 48 nidadas (n = 10 por nidada). La media (14,33%) y la desviación estándar (±16,19%) se indican en rojo. (B) Evaluación del comportamiento de respuesta de sobresalto de embriones (n = 20 por condición) tratados con la concentración indicada de tricaína en medio E3 o con E3 solo como control. El comportamiento se clasifica de acuerdo con el esquema de colores y las caricaturas indicadas a la derecha del gráfico, con cada embrión asignado a una sola de las siguientes clases: "inmóvil": embrión no muestra ningún movimiento; "movimiento de la cola": el embrión muestra movimiento de la cola, pero no se dobla en C ni se comporta nadando; "móvil": el embrión muestra movimiento de natación, pero no una flexión en C en respuesta al estímulo vibratorio; "C-bend only": el embrión muestra C-bend, pero no escapa de la natación; "C-bend + móvil": el embrión muestra un comportamiento típico de C-bend seguido de natación de escape (la típica respuesta de sobresalto completo). Los diferentes comportamientos se muestran como un porcentaje del número total de embriones para cada tratamiento. (C) Gráfico de cálculo de BMC generado por el flujo de trabajo KNIME, que indica el porcentaje de embriones "inmóviles" para cada concentración de tratamiento. Las líneas azules, rojas y negras indican los valores de BMC10, BMC25 y BMC50, es decir, las concentraciones a las que el 10%, 25% y 50% de los embriones muestran niveles de inmotilidad superiores a los del fondo, respectivamente. (D) Ejemplo de una ejecución de ensayo descartada. Se muestran cinco series de control tratadas con E3 con diferentes embriones de tipo salvaje AB2O2 derivados de la misma nidada (replicación 1-5). Solo la réplica 1 muestra una respuesta casi normal, mientras que los embriones de las carreras restantes no muestran la respuesta típica de flexión en C + natación de escape. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Tabla 1: Parámetros estadísticos para estimar la bondad de ajuste y umbrales para aceptar los valores de CMO determinados. Haga clic aquí para descargar esta tabla.
Tabla 2: Propiedades de una selección de sistemas de ensayo de respuesta vibracional a sobresaltos. Haga clic aquí para descargar esta tabla.
Archivo complementario 1: Plantilla de Excel para el archivo de configuración. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo complementario 2: Plantilla de entrada KNIME con un conjunto de datos de ejemplo. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo complementario 3: Ejemplo de archivo de salida KNIME. Haga clic aquí para descargar este archivo.
No tenemos nada que revelar.
Describimos el flujo de trabajo y el análisis de datos de un sistema de cribado para evaluar la toxicidad de compuestos químicos en función de la respuesta de sobresalto por vibración del embrión de pez cebra. El sistema registra los movimientos de los embriones de pez cebra tras la exposición a un estímulo vibratorio y permite una evaluación integrada de la toxicidad/letalidad general y la toxicidad neuromuscular.
Agradecemos la excelente asistencia técnica del personal de apoyo en las instalaciones de peces y el centro de selección de peces de IBCS-BIP. Este trabajo ha recibido financiación del programa de investigación e innovación Horizonte 2020 de la Unión Europea en virtud del Acuerdo de Subvención n.º 965406 (PrecisionTox). Este resultado refleja únicamente la opinión de los autores, y la Unión Europea no se hace responsable del uso que pueda hacerse de la información contenida en él.
| Tamices de prueba finos, marco de latón, tamaño de poro 250 μ m | Sigma-Aldrich | Z289744-1EA | O material comparable |
| Cámara de alta velocidad | XIMEA | MQ013MG-ON USB 3 | |
| Frascos de laboratorio, cuello estrecho, con tapón de rosca | VWR | 215-3261 Número de | referencia para 50 ml, disponible hasta 20 l. O material comparable |
| Punta de pipeta, volumen de trabajo: 10 y micro; L | SARSTEDT | 70.3010.210 | O material comparable |
| Punta de pipeta, volumen de trabajo: 1000 µ L | SARSTEDT | 70.3050.100 | O material comparable |
| Punta de pipeta, volumen de trabajo: 20 µ L | SARSTEDT | 70.3020.210 | O material comparable |
| Punta de pipeta, volumen de trabajo: 200 µ L | SARSTEDT | 70.3030.100 | O material comparable |
| Pipeta serológica 10 mL | SARSTEDT | 86.1254.001 | O material comparable |
| Pipeta serológica 25 mL | SARSTEDT | 86.1685.001 | O material comparable |
| Pipeta serológica 5 mL | SARSTEDT | 86.1253.001 | O material comparable |
| Placa de cultivo de tejidos 60,0 mm/15,0 mm ventilada (Poliestireno) | Greiner bio-one | 628102 | O material comparable |
| Placa de cultivo de tejidos 100, suspensión (Poliestireno) | SARSTEDT | 83.3902.500 | O material comparable |
| Pipeta de transferencia 6 mL | SARSTEDT | 86.1175 | O material comparable |
| Tubo 15 mL 120 mm x 17 mm PP | SARSTEDT | 62.554.502 | O material comparable |
| Tubo 50 mL 114mm x 28 mm PP | SARSTEDT | 62.5472.54 | O material comparable |