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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aquí, presentamos un implante único imprimible en 3D para ratas, llamado TD Drive, capaz de registros simétricos de electrodos de alambre bilaterales, actualmente en hasta diez áreas cerebrales distribuidas simultáneamente.
Las intrincadas interacciones entre múltiples áreas del cerebro subyacen a la mayoría de las funciones atribuidas al cerebro. El proceso de aprendizaje, así como la formación y consolidación de recuerdos, son dos ejemplos que dependen en gran medida de la conectividad funcional a través del cerebro. Además, la investigación de las similitudes y/o diferencias hemisféricas va de la mano con estas interacciones multizonas. Por lo tanto, los estudios electrofisiológicos que intentan dilucidar aún más estos procesos complejos dependen del registro de la actividad cerebral en múltiples lugares simultáneamente y, a menudo, de manera bilateral. Aquí se presenta un implante imprimible en 3D para ratas, llamado TD Drive, capaz de realizar grabaciones simétricas de electrodos de alambre bilaterales, actualmente en hasta diez áreas cerebrales distribuidas simultáneamente. El diseño de código abierto se creó empleando principios de diseño paramétrico, lo que permite a los posibles usuarios adaptar fácilmente el diseño de la unidad a sus necesidades simplemente ajustando parámetros de alto nivel, como las coordenadas antero-posteriores y mediolaterales de las ubicaciones de los electrodos de registro. El diseño del implante se validó en n = 20 ratas Lister Hooded que realizaron diferentes tareas. El implante era compatible con grabaciones de sueño atadas y grabaciones de campo abierto (Object Exploration), así como con la grabación inalámbrica en un gran laberinto utilizando dos sistemas de grabación comerciales diferentes y headstages. Así, se presenta aquí el diseño y montaje adaptable de un nuevo implante electrofisiológico, facilitando una rápida preparación e implantación.
La naturaleza multiárea de las interacciones cerebrales durante la vigilia y el sueño dificulta el estudio exhaustivo de los procesos fisiológicos en curso. Si bien enfoques como la resonancia magnética funcional (fMRI) y la ecografía funcional (fUS) permiten muestrear la actividad cerebral de cerebros completos 1,2, explotan el acoplamiento neurovascular para inferir la actividad cerebral a partir de la actividad hemodinámica, limitando su resolución temporal2. Además, la resonancia magnética funcional requiere la colocación del sujeto de investigación en un escáner de resonancia magnética, lo que prohíbe los experimentos con animales que se mueven libremente. La obtención de imágenes ópticas de la dinámica del calcio con imágenes de uno o varios fotones permite el registro simultáneo de cientos de neuronas específicas del tipo de célula3. Sin embargo, los microscopios montados en la cabeza, como el Miniscope3, que permiten el movimiento libre, generalmente se limitan a obtener imágenes de áreas corticalessuperficiales en cerebros intactos. Si bien el diámetro de su campo de visión en la corteza puede ser del orden de 1 mm, los requisitos de espacio de estos microscopios montados en la cabeza pueden dificultar el objetivo de varias áreas, especialmente las adyacentes. Por lo tanto, para capturar con precisión la dinámica cerebral multiárea en vigilia y sueño, la electrofisiología extracelular, registrada con electrodos implantados en las áreas cerebrales de interés, es uno de los métodos de elección debido a su alta resolución temporal y precisión espacial5. Además, permite la caracterización de la dinámica del sueño en animales compatible con análisis obtenidos a partir de EEG humano, incrementando el valor traslacional de este método6.
Clásicamente, los estudios que registran la actividad cerebral con electrodos extracelulares han empleado electrodos de alambre individuales o haces de electrodos,como los tetrodes. Las sondas de última generación como la sonda Neuropixels8 permiten apuntar a varias áreas simultáneamente, dado que están alineadas en un eje que permite implantar la sonda a lo largo de ese eje sin perjudicar al animal. Sin embargo, los registros simultáneos precisos de múltiples áreas separadas espacialmente siguen siendo un desafío, ya que los métodos existentes son costosos o requieren mucho tiempo.
En los últimos años, los métodos de fabricación aditiva, como la estereolitografía, se han vuelto ampliamente disponibles. Esto permitió a los investigadores desarrollar nuevos implantes de electrodos que se adaptaban a sus requisitos experimentales9, por ejemplo, la focalización repetible simplificada de múltiples áreas cerebrales. Con frecuencia, estos diseños de implantes también se comparten con la comunidad académica como hardware de código abierto, lo que permite a otros investigadores adaptarlos a sus propios fines. El grado de adaptabilidad de los implantes específicos varía tanto en función de cómo se diseña el implante como de cómo se comparte. El modelado paramétrico10 es un enfoque popular en el diseño asistido por computadora, en el que los diferentes componentes del diseño están vinculados por parámetros interdependientes y un historial de diseño definido. La implementación de un enfoque paramétrico para el diseño de implantes aumenta su reutilización y adaptabilidad10, ya que el cambio de parámetros individuales actualiza automáticamente los diseños completos sin la necesidad de una remodelación compleja del diseño. Una necesidad consecuente es que el diseño en sí se comparta en un formato editable que conserve las relaciones paramétricas y la historia del diseño. Los formatos de archivo que solo representan primitivas geométricas, como STL o STEP, hacen que las modificaciones paramétricas posteriores de los modelos publicados sean inviables.
Si bien los hiperimpulsoresde tetrodo 11,12,13 permiten grabaciones de docenas de tetrodos, su ensamblaje e implantación requieren mucho tiempo y su calidad depende en gran medida de la habilidad y experiencia del investigador individual. Además, suelen combinar los tubos guía que dirigen los electrodos de registro a su ubicación objetivo en uno o dos haces más grandes, lo que limita el número y la dispersión de las áreas que se pueden apuntar de manera eficiente.
Otros implantes 14,15 exponen todo el cráneo y permiten la libre colocación de múltiples microdrives individuales que llevan los electrodos de registro. Si bien la colocación de microunidades independientes16 durante el tiempo de cirugía maximiza la flexibilidad, aumenta el tiempo de cirugía y puede dificultar el enfoque de múltiples áreas adyacentes debido a los requisitos de espacio de las microunidades individuales. Además, aunque los implantes son de código abierto, solo se publican como archivos STL, lo que dificulta su modificación.
Un ejemplo de una unidad con una filosofía paramétrica más inherente es el RatHat17. Al proporcionar una plantilla quirúrgica que cubre toda la superficie dorsal del cráneo, permite apuntar con precisión a múltiples objetivos cerebrales sin el uso de un marco estereotáctico durante la cirugía. Están disponibles múltiples variaciones de implantes para cánulas, optrodes o tetrodes. Sin embargo, aunque la unidad es de uso gratuito para fines académicos, no se publica de código abierto, lo que crea un obstáculo para que los investigadores evalúen y utilicen el implante.
En este artículo se presenta el TD Drive (ver Figura 1), un novedoso implante imprimible en 3D para el registro de electrodos extracelulares en ratas. El TD Drive tiene como objetivo superar algunos de los inconvenientes de las soluciones existentes: permite dirigirse a múltiples áreas del cerebro, reflejadas en ambos hemisferios, con electrodos de cable independientes simultáneamente. Debido a su diseño simple, puede ser ensamblado en unas pocas horas a un costo relativamente bajo por investigadores menos experimentados. El TD Drive se publica de código abierto, en formatos de archivo fácilmente modificables para permitir a los investigadores ajustarlo a sus necesidades específicas. La incorporación de un enfoque de modelado 3D paramétrico desde el principio del proceso de diseño del TD Drive permite abstraer los parámetros necesarios para cambiar: para cambiar las ubicaciones de los objetivos, los investigadores pueden simplemente editar los parámetros que representan sus coordenadas dorsoventral y anteroposterior, sin necesidad de rediseñar el accionamiento ellos mismos. Los archivos para modificar y fabricar el TD Drive se pueden encontrar en https://github.com/3Dneuro/TD_Drive.

Figura 1: Descripción general de la TD Drive. (A) Representación de una TD Drive con una tapa protectora. (B) Renderizado con las partes internas mostradas. El TD Drive cuenta con (a) múltiples ubicaciones de grabación ajustables paramétricamente para cables de electrodos fijos y móviles, un EIB con (b) un conector Omnetics de alta densidad compatible con sistemas comunes de adquisición de datos conectados e inalámbricos, y (c) un mapeo de canales intuitivo optimizado para grabaciones con sistemas Intan/Open Ephys (ver Figura complementaria 1) y (d) una tapa para proteger el implante durante las grabaciones atadas y cuando no hay ningún cabezal conectado. (C) Una plantilla de guía en la parte inferior del TD Drive facilita la colocación de cánulas guía y sirve como una verificación redundante de las ubicaciones de los implantes durante la cirugía. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
El diseño del implante se pilotó en n = 4, se validó en n = 8 y se confirmó en n= 8 ratas Lister Hooded que realizaron diferentes tareas. Los primeros 4 animales se utilizaron para desarrollar el accionamiento y ajustar los parámetros. Luego, se ejecutó un piloto completo con 8 animales (se muestra en los resultados). Se realizó una segunda cohorte de 8 animales y se incluyó en el análisis de supervivencia del implante. El implante era compatible con grabaciones de sueño atadas y grabaciones de campo abierto (Object Exploration), así como con la grabación inalámbrica en un gran laberinto (HexMaze 9 m x 5 m) utilizando dos sistemas de grabación comerciales diferentes y headstages. Las dos cohortes de 8 se grabaron con dos sistemas de adquisición diferentes: atado para grabaciones de sueño más largas e inalámbrico para grabaciones de exploración de laberintos grandes. Podemos concluir que este simple cable permite experimentos de larga duración con cohortes más grandes por parte de investigadores menos experimentados para permitir el análisis de las etapas del sueño, así como el análisis de la oscilación en múltiples áreas del cerebro. Esto contrasta con la mayoría de los implantes de electrofisiología hasta la fecha, que, debido a la dificultad y la intensidad del tiempo, permiten cohortes de animales más pequeñas y, por lo general, necesitan experimentadores muy experimentados. Sin embargo, con este impulso, no se puede registrar la actividad de las neuronas individuales; por lo tanto, el uso se limita a las investigaciones del potencial de campo local (LFP) y la actividad de sumatoria.
El presente estudio fue aprobado por la Comisión Central Holandesa Dierproeven (CCD) y se llevó a cabo de acuerdo con la Ley de Experimentos con Animales (códigos de protocolo: 2020-0020-006 y 2020-0020-010). Se utilizaron ratas macho Lister Hooded de 9-12 semanas a su llegada. Los reactivos y el equipo utilizado en el protocolo se enumeran en la Tabla de Materiales. Consulte la Figura complementaria 1 y la Figura complementaria 2 para conocer los pasos del proceso de construcción de la unidad.
1. Ajuste y creación de modelos 3D y datos de la placa de interfaz de electrodos (EIB)
2. Impresión de los modelos 3D y fabricación del BEI
NOTA: Para el presente estudio, se utilizó una impresora 3D disponible comercialmente para producir las piezas (ver Tabla de Materiales). Cuando se utilizan diferentes impresoras o se externaliza la producción, es posible que sea necesario utilizar resinas diferentes y comparables para producir las piezas.
3. Post-procesamiento del cuerpo impreso en 3D
NOTA: La tapa y las lanzaderas no deberían necesitar procesamiento posterior. Dependiendo de la calidad de las impresiones 3D, es posible que deban lijarse ligeramente o eliminar los restos de soporte. Al lijar y taladrar, tenga cuidado de no romper las paredes del cuerpo de la transmisión. Si es necesario, limpie las piezas posprocesadas con isopropanol y, un paño suave y/o aire comprimido.

Figura 2: Representación de la TD Drive. (A,B) TD Drive (A) sin y (B) con una tapa protectora en un modelo de cráneo de rata. (C) Tubos guía de poliimida insertados correctamente en cada uno de los seis sitios de registro. (D) Un conjunto de lanzadera aislado y completo con el tornillo guía, la lanzadera impresa en 3D y el inserto de latón soldado. (E) Cuerpo TD Drive con dos lanzaderas insertadas. Marcados en rojo: (a) orificios avellanados para la lanzadera, (b) guía de la lanzadera, (c) pedestales centrales del cuerpo de la transmisión, (d) plantilla de guía. (F,G) Las ubicaciones importantes en la parte superior (F) e inferior (G) del cuerpo de la unidad que podrían requerir un procesamiento posterior después de la impresión 3D se indican con una flecha roja cada una. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
4. Conjuntos de lanzaderas
5. Montaje de la unidad
6. Preparación de la cubierta protectora
7. Preparación de los electrodos de alambre
8. Preparación del cable de tierra y los cables de EEG
9. Carga de los haces de cables en la unidad
10. Cirugía de implantes impulsivos
NOTA: Este paso describe brevemente los procedimientos quirúrgicos para implantar el TD Drive. Un protocolo de implantación más extenso, que incluye una descripción de las herramientas, así como las dosis y concentraciones de los fármacos, se puede encontrar en el Archivo Complementario 1.
11. Recuperación del BEI
Usando las instrucciones proporcionadas en el protocolo, el TD Drive podría ser construido fácilmente por múltiples experimentadores. Después del desarrollo de la unidad (n = 4), se ejecutó un piloto completo con ocho animales. Se implantó un lote adicional de ocho animales y se realizó la recolección de datos experimentales. Dado que no se ha completado el análisis de los datos de estos animales, se han incluido en el análisis de supervivencia, pero no en otros análisis (por ejemplo, de focalización o histología). La cirugía de implante se realizó 2 semanas después de la llegada (ver Figura 3A para ver las ubicaciones objetivo utilizadas en el piloto). El implante se realizó con los procedimientos quirúrgicos habituales y duró ~3 h. Un cirujano experimentado realizó los implantes iniciales y podría enseñar tanto a los experimentadores experimentados como a los novatos con 2-3 cirugías a la independencia.

Figura 3: Cirugía de implantes, datos del sueño y actividad de banda ancha. (A) Vista general del esquema que muestra las ubicaciones objetivo de las craneotomías (círculos azules) y los tornillos del cráneo (verde: EEG, azul: GND, gris: tornillos de anclaje, tenga en cuenta que hay dos tornillos de anclaje en el lado del cráneo). (B) Fotografía de animales implantados con una cabeza atada durante el sueño y la vigilia. (C) Ejemplo de datos de sueño de animales atados PFC (Prelímbico) y HPC (Ca1), divididos en sueño REM con theta y sueño No REM con delta, husos y ondulaciones. Eje Y: microvoltios, eje x: segundos. Estos datos se pueden utilizar, por ejemplo, para la puntuación del sueño o la detección y el análisis de eventos de oscilación; (D) Ejemplo: actividad de banda ancha registrada de forma inalámbrica en un animal despierto (los canales ruidosos de la izquierda no estaban conectados). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Durabilidad del implante, detecciones delta e histología. (A) Diagrama de supervivencia del implante para dos rondas de experimentos de larga duración. Cabe destacar que en el día 85, n = 8 terminaron el experimento y se planeó la perfundida. (B) Ejemplo de datos para la estabilidad. Se muestra el recuento de detecciones delta en el canal del hipocampo durante los días de registro (~3 días a la semana). Cada animal mostró una variación normal en función de la cantidad de sueño, pero no hubo una deriva general en el tiempo en la señal y, por lo tanto, en las detecciones. (C) Histología representativa que muestra un objetivo bilateral para una rata. Columna izquierda: hemisferio izquierdo, columna derecha: hemisferio derecho. Las coordenadas AP indican las coordenadas anteroposteriores del corte representado, y las flechas apuntan a las lesiones en las áreas objetivo. Ampliación: 1,6x. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Todos los animales se recuperaron bien y toleraron el implante (Figura 3B). Los electrodos frontales y retroespleniales estaban fijos, pero los haces del hipocampo eran móviles. Los haces del hipocampo se implantaron a una profundidad dorsoventral de 2 mm y se ajustaron para maximizar la cobertura de HPC durante las 2 semanas de recuperación de la cirugía, donde se comprobó la señal en vivo durante los períodos de habituación al sueño. En 7 de los 8 animales, se alcanzaron todos los sitios objetivo en al menos un hemisferio (Tabla 2 para las tasas de aciertos, ver Figura 4C para histología representativa). Las grabaciones de vigilia y sueño se realizaron con éxito conectadas a una caja de grabación, así como las grabaciones inalámbricas en un laberinto más grande (datos de ejemplo Figura 3C, D). Los animales mantuvieron los implantes durante 2 meses, cuando los animales individuales comenzaban a perderlos; sin embargo, la mayoría de los animales conservaron los implantes hasta el final del experimento, 85-100 después del implante (Figura 4A). Durante este tiempo, el LFP se mantuvo estable, como se puede ver en un análisis de ejemplo donde se detectaron oscilaciones delta (Figura 4B). Hubo una variabilidad normal a lo largo del tiempo, pero no hubo una deriva sistemática de la señal en ninguna de las áreas cerebrales registradas (incluida la capa piramidal de CA1). Se recomienda que los experimentos finalicen dentro de las 10-15 semanas posteriores a la cirugía. Todos los BEI pudieron recuperarse.
Hemos aplicado este implante principalmente para medir las etapas del sueño y las oscilaciones del sueño en respuesta al aprendizaje y otras intervenciones. Por ejemplo, cómo la ingesta oral de CBD influye en la ocurrencia de oscilaciones y la coherencia entre las áreas cerebrales (ver Samanta et al.20).
| Parámetro | Valor mínimo (mm) | Valor máximo (mm) |
| medioLateralSite1 | 0.75 | 2 |
| medioLateralSite2 | 1.5 | 5 |
| medioLateralSite3 | 0.75 | 2 |
Tabla 1: Resumen de los límites impuestos manualmente a los parámetros que controlan las coordenadas mediolaterales de los sitios de registro.
| Hemisferio | PFC | RSC | CA1 pyr. |
| Derecha | 8 de 8 | 5 de 8 | 6 de 8 |
| Izquierda | 8 de 8 | 7 de 8 | 7 de 8 |
Tabla 2: Tasa de aciertos para piloto de 8 animales. En 4 de los 8 animales, todos los electrodos se colocaron correctamente. Sin embargo, en 7 de los 8 animales, todas las áreas del cerebro fueron correctamente dirigidas en al menos un hemisferio (con la excepción de 1 rata a la que le faltaba la capa piramidal CA1).
Figura complementaria 1: Arquitectura de TD Drive. (Arriba) Visión general del mapeo de canales para el TD Drive cuando se utiliza con una cabecera Intan RHD32. (Abajo) Una ilustración adicional de las configuraciones del haz de cables. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Figura complementaria 2: Imágenes adicionales del TD Drive en varias etapas del proceso de construcción. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo complementario 1: Un ejemplo de protocolo para la implantación del TD Drive. Los procedimientos y las ubicaciones objetivo se ajustan a las preguntas de investigación de los autores y a las políticas institucionales. Haga clic aquí para descargar este archivo.
TS y PvH son empleados de 3Dneuro, Nijmegen, Países Bajos. 3Dneuro co-desarrolló y produce el TD Drive.
Aquí, presentamos un implante único imprimible en 3D para ratas, llamado TD Drive, capaz de registros simétricos de electrodos de alambre bilaterales, actualmente en hasta diez áreas cerebrales distribuidas simultáneamente.
Los autores quieren agradecer a Angela Gómez Fonseca por la inspiración para desarrollar la unidad y a todos los estudiantes que realizaron experimentos piloto con los animales, Milan Bogers, Floor van Ravenswoud y Eva Severijnen. Este trabajo contó con el apoyo del Consejo Holandés de Investigación (NWO; Programa Crossover 17619 "INTENSE").
| broca de 0,5 mm | McMaster | 2951A38 | |
| Zócalo SIP/DIP interconectado de paso de 1,27 mm (Mill-Max) | Mouser Electronic | 575-003101 | Para el montaje y la conexión de EEG & Tornillos GND |
| epoxi de 5 minutos | Bisonte | Pegamento | de cianoacrilatoepoxi regular disponible en el mercado |
| Loctite | Super Glue-3 | ||
| Alambre de EEG | Science Products GmbH | 7SS-2T | |
| Alambre de electrodo | Science Products GmbH | NC7620F | |
| Etanol | LC | Para el procedimiento de esterilización preoperatoria estándar de la unidad | |
| Pinzas finas (5) | FST | 91150-20 | Para la preparación y manipulación de haces de alambre |
| Form 3B | Formlabs | Impresora 3D utilizada para imprimir en 3D las partes autoimpresas de la unidad TD Pines | |
| de oro (pequeños) | Neuralynx, Inc. | 9885 | Fijación de cables de electorde a la placa EIB |
| Cable de tierra | Science Products GmbH | SS-3T/A | |
| Conector de alta densidad | LabMaker GmbH/Omnetics | A79026-001 | |
| Lister Ratas enredadas | Charles River Laboratories | Crl:LIS | Utilizamos ratas macho, de 9 a 12 semanas de edad a la llegada |
| Inserto de latón M1 | AliExpress | Disponible comercialmente | https://aliexpress.com/item/33047616164.html |
| Grifo M1 | McMaster | 2504A33 | |
| Tornillo M1x16 | Bossard | 1096613 | |
| Tornillos de acero inoxidable M1x3 | Tornillos y más | 84213_14985 | |
| Tornillos de poliimida M2.5x5 | Tornillos y más | 7985PA25S_50 | |
| aceite mineral | McMaster | 1244K14 | |
| Esmalte de uñas | Etos | Disponible comercialmente | Para codificación de colores Alambres EEG y GND |
| de pintor | Gamma | Disponible comercialmente | Para la preparación del haz de alambre |
| Pin tornillo de banco | McMaster | 8455A16 | |
| papel de trazado | Canson | Disponible comercialmente | Para la preparación de haces de alambre |
| de poliamida | Amazon / Piezas pequeñas | TWPT-0159-30-50 | AWG, 0.0159" ID, 0.0219" OD, 0.0030" Pared, 30" Longitud |
| RHD Headstage de 32 canales con acelerómetro | Intan Technologies, LLC | C3324 | Para grabaciones conectadas en el sleepbox |
| RHD de 3 pies (0,9 m) cables SPI estándar | Intan Technologies, LLC | C3203 | Del conmutador a la cabecera |
| Cables SPI estándar RHD de 6 pies (1,8 m) | Intan Technologies, LLC | C3206 | De la caja OpenEphys al conmutador |
| Anillo colector con brida | Adafruit | 1196 | Conmutador: 22 mm de diámetro, 12 hilos |
| Fundente de soldadura | Griffon S-39 50 ml | Disponible en el mercado | Para soldar EEG & Tornillos GND |
| pasta de soldadura | Amazon | B08CBZ5HC5 | |
| tuerca M2 de acero inoxidable | McMaster | 93935A305 | |
| Configuración de grabación conectada | OpenEphys | Acquasition Board | |
| Registrador de grabación inalámbrico | SpikeGadgets | miniLogger 32 | Para grabaciones inalámbricas en la tarea |
| Configuración de grabación inalámbrica | Unidad de control principal (MCU)de SpikeGadgets | incl. placa de conexión y transceptor de RF | Para grabaciones inalámbricas en la tarea |