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Artículo de método

Aislamiento de mitocondrias para el análisis de supercomplejos mitocondriales a partir de muestras de pequeños tejidos y cultivos celulares

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DOI:

10.3791/66771

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3 de mayo de 2024

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En este artículo

Resumen

Este protocolo describe una técnica para el análisis de supercomplejos respiratorios cuando solo se dispone de pequeñas cantidades de muestras.

Resumen

A lo largo de las últimas décadas, la evidencia acumulada sobre la existencia de supercomplejos respiratorios (SCs) ha cambiado nuestra comprensión de la organización de la cadena de transporte de electrones mitocondrial, dando lugar a la propuesta del "modelo de plasticidad". Este modelo postula la coexistencia de diferentes proporciones de SCs y complejos en función del tejido o del estado metabólico celular. La naturaleza dinámica del ensamblaje en las SC permitiría a las células optimizar el uso de los combustibles disponibles y la eficiencia de la transferencia de electrones, minimizando la generación de especies reactivas de oxígeno y favoreciendo la capacidad de las células para adaptarse a los cambios ambientales.

Más recientemente, se han descrito anomalías en el ensamblaje de SC en diferentes enfermedades como trastornos neurodegenerativos (enfermedad de Alzheimer y Parkinson), síndrome de Barth, síndrome de Leigh o cáncer. El papel de las alteraciones del ensamblaje de las SC en la progresión de la enfermedad aún debe confirmarse. Sin embargo, la disponibilidad de cantidades suficientes de muestras para determinar el estado del ensamblaje SC es a menudo un desafío. Esto sucede con biopsias o muestras de tejido que son pequeñas o que deben dividirse para múltiples análisis, con cultivos celulares que tienen un crecimiento lento o provienen de dispositivos microfluídicos, con algunos cultivos primarios o células raras, o cuando se debe analizar el efecto de tratamientos costosos particulares (con nanopartículas, compuestos muy caros, etc.). En estos casos, se requiere un método eficiente y fácil de aplicar. En este trabajo se presenta un método adaptado para obtener fracciones mitocondriales enriquecidas a partir de pequeñas cantidades de células o tejidos para analizar la estructura y función de las SC mitocondriales mediante electroforesis nativa seguida de ensayos de actividad in-gel o western blot.

Introducción

Los supercomplejos (SC) son asociaciones supramoleculares entre complejos de cadenas respiratorias individuales 1,2. A partir de la identificación inicial de las SC y la descripción de su composición por el grupo de Schägger 2,3, posteriormente confirmada por otros grupos, se estableció que contienen complejos respiratorios I, III y IV (CI, CIII y CIV, respectivamente) en diferentes estequiometrías. Se pueden definir dos poblaciones principales de SC, las que contienen CI (y CIII solo o CIII y CIV) y con un peso molecular muy alto (MW, comenzando ~1,5 ....

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Protocolo

NOTA: La composición de todos los medios de cultivo y tampones se especifica en la Tabla 1 y los detalles relacionados con todos los materiales y reactivos utilizados en este protocolo se enumeran en la Tabla de Materiales.

1. Aislamiento de mitocondrias a partir de cultivos celulares

NOTA: El volumen mínimo de células analizadas ha sido de ~30-50 μL de células empaquetadas (paso 1.4). Esto puede corresponder aproximadamente a al menos dos o tres placas de cultivo celular de 100 mm o a una placa de 150 mm al 80-90% de confluencia, dependiendo del tipo de célula (en....

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Resultados

Los rendimientos de mitocondrias obtenidos siguiendo los protocolos descritos anteriormente varían en función de varios factores, como la línea celular o el tipo de tejido, la naturaleza de las muestras (es decir, si se utilizan tejidos frescos o congelados) o la eficiencia del proceso de homogeneización. Los rendimientos esperados de mitocondrias de diferentes líneas celulares y tejidos se recogen en la Tabla 2. Una vez obtenidas las fracciones mitocondriales, el siguiente paso es el análisis del patrón.......

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Discusión

Las adaptaciones metodológicas introducidas en los protocolos aquí descritos están destinadas a evitar pérdidas y aumentar el rendimiento, manteniendo al mismo tiempo las actividades del complejo mitocondrial (lo cual es crucial cuando la disponibilidad de cantidades suficientes de muestras se ve comprometida) y reproducir el patrón esperado de SC del tejido o de la línea celular (ver Figura 2C). Con este propósito y dado que no se requiere una alta pureza mitocondrial para detectar correcta.......

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Divulgaciones

Los autores declaran no tener conflictos de intereses.

Agradecimientos

Este trabajo ha contado con el apoyo de la subvención número "PGC2018-095795-B-I00" del Ministerio de Ciencia e Innovación (https://ciencia.sede.gob.es/) y de las subvenciones "Grupo de Referencia: E35_17R" y subvención número "LMP220_21" de la Diputación General de Aragón (DGA) (https://www.aragon.es/) a PF-S y RM-L.

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
Ácido acéticoPanReac131008
Ácido aminocaproicoFluka Analytical7260
ATPSigma-AldrichA2383
Bis TrisAcrons Ensayo de327721000
BradfordBiorad 5000002
Coomassie Blue G-250Serva17524
Coomassie Blue R-250Merck1125530025
Citocromo cSigma-AldrichC2506
Diamino  bencidina (DAB)Sigma-AldrichD5637
DigitoninSigma-AldrichD5628
EDTAPanReac131669
EGTASigma-AldrichE3889
Libre de ácidos grasos BSARoche10775835001
GlycinePanReacA1067
Homogeneizador Mortero de teflónDeltalab 196102
ImidazolSigma-AldrichI2399
K2HPO4PanReac121512
KH2PO4PanReac121509
manitolSigma-AldrichM4125
MetanolLabkemMTOL-P0P
MgSO4PanReac131404
Mini Trans-Blot CellBioRad1703930
MOPSSigma-AldrichM1254
MTCO1 Anticuerpo monoclonalInvitrogen459600
NaClSigma-AldrichS9888
NADHRoche10107735001
NativePAGE 3 a 12% Mini Geles de ProteínasInvitrogenBN1001BOX
NativePAGE Aditivo tampón catódico (20x)InvitrogenBN2002
NativePAGE Running Buffer (20x) InvitrogenBN2001
NDUFA9 Anticuerpo monoclonalInvitrogen459100
Nitroblue sal de tetrazolio (NBT)Sigma-AldrichN6876
Pb(NO3)2Sigma-Aldrich228621
Membrana PDVFAmersham10600023
Metasulfato de fenazina (PMS)Sigma-AldrichP9625
Pierce ECL SustratoThermo Scientific32106
PMSFMerckPMSF-RO
SDHA Anticuerpo monoclonalInvitrogen459200
Succinato de sodioSigma-AldrichS2378
Estreptomicina/penicilinaPAN biotechP06-07100
SacarosaSigma-AldrichS3089
TrisPanReacA2264
UQCRC1 Anticuerpo MonoclonalInvitrogen459140
XCell  SureLock Mini-CellInvitrogen  EI0001

Referencias

  1. Acin-Perez, R., Fernandez-Silva, P., Peleato, M. L., Perez-Martos, A., Enriquez, J. A. Respiratory active mitochondrial supercomplexes. Mol Cell. 32 (4), 529-539 (2008).
  2. Schagger, H., Pfeiffer, K. Supercomplexes in the respiratory chains of yeast and mammalian mitochondria. EMBO J. ....

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