Ingredientes activos y objetivos de acción de las píldoras Xiaoyao
Al buscar en la base de datos de TCMSP y realizar el cribado según los criterios de biodisponibilidad oral (OB) ≥ 30% y propiedades similares a los medicamentos (DL) ≥ 0,18, se encontró que existían 125 ingredientes activos en las píldoras de Xiaoyao. Entre ellos, los ingredientes 6, 4, 9, 13, 2, 6, 83 y 2 eran de Paeonia lactiflora blanca, Atractylodes macrocephala, Menthae herba, Chaihu, Angelica sinensis, Poria cocos, regaliz y jengibre, respectivamente. Algunos de los ingredientes activos se muestran en la Tabla 1. Además, se obtuvieron un total de 879 dianas de ingredientes activos eficaces de la base de datos del TCMSP, y quedaron 232 dianas tras la conversión de ID y la eliminación de los valores duplicados.
Análisis de red de MTC - Ingrediente activo - Diana intersectante - Enfermedad
Se realizaron búsquedas en varias bases de datos utilizando la palabra clave osteoporosis para genes asociados con la enfermedad. En la base de datos GeneCards se obtuvieron 1692 genes después de filtrar de acuerdo con la puntuación de relevancia ≥1. Se obtuvieron un total de 35 genes en la base de datos OMIM. Había 3, 33 y 386 genes en las bases de datos PharmGkb, TTD y DrugBank, respectivamente. Posteriormente, se utilizó la intersección de los resultados de estas cinco bases de datos para su posterior análisis (Figura 1A). Uno de los genes que se representó en cuatro bases de datos fue el CALCR. Se obtuvieron un total de 102 genes que se cruzan después de combinar los genes relacionados con la enfermedad y tomar la intersección con el objetivo del fármaco (Figura 1B). Sobre la base de las interacciones entre las dianas de la enfermedad y los ingredientes activos del fármaco, se construyó una red de enfermedades diana que se cruzan con el principio activo de la MTC con el software Cytoscape. Como resultado, se obtuvieron relaciones entre los componentes del fármaco y la regulación polimórfica de las gammagrafías genéticas relacionadas con la enfermedad (Figura 2A).
En la base de datos String, se analizaron las interacciones de las proteínas en la intersección de los genes de la enfermedad y las dianas farmacológicas para obtener sus diagramas de red de interacción (Figura 2B), y luego se examinaron las proteínas más centrales (Figura 2C-D). Los resultados mostraron las interacciones más fuertes entre FOS, ESR1, MAPK3, TP53, MAPK1 y STAT3 entre los genes de la enfermedad y los objetivos farmacológicos (Figura 2E).
Función GO y análisis de enriquecimiento de la vía KEGG
El análisis de enriquecimiento de GO mostró un total de 2177 entradas, incluidas las entradas de 1990 de procesos biológicos (BP), 58 entradas de componentes celulares (CC) y 129 entradas de funciones moleculares (MF). En la BP, los genes se centraron principalmente en la respuesta a los niveles de nutrientes, la respuesta al estrés oxidativo y la respuesta celular al estrés oxidativo. MF se centró en la unión del factor de transcripción de unión al ADN, la unión del factor de transcripción de unión al ADN específico de la ARN polimerasa II, la actividad del receptor nuclear, la actividad del factor de transcripción activado por ligando y la actividad de las citocinas (Figura 3A-B).
En el análisis de enriquecimiento de la vía KEGG, se obtuvieron un total de 168 vías de señalización relacionadas, y las más significativas fueron la vía de señalización AGE-RAGE, la vía de señalización IL-17, la vía de señalización TNF, la vía de señalización HIF-1 y la diferenciación de células Th17 (Figura 3C-D). Se sugiere que las píldoras Xiaoyao pueden ejercer efectos terapéuticos sobre PMOM de múltiples maneras. La inflamación está fuertemente asociada con la osteoporosis y puede acelerarse con la menopausia, y la IL-17 es un factor inflamatorio importante7. Por lo tanto, el próximo plan es explorar si las píldoras Xiaoyao podrían tratar la osteoporosis desde una perspectiva inflamatoria con respecto a la IL-17.
Cambios estructurales en el tejido óseo antes y después de la extracción del tejido ovárico
La tinción HE mostró que en los fémures de los ratones Sham, las trabéculas estaban bien dispuestas, con buena continuidad, pequeños espacios entre las trabéculas, fracturas raras y tamaño normal de la cavidad de la médula ósea. En comparación con el grupo Sham, los fémures del grupo OVX estaban escasamente dispuestos, con fracturas graves de las trabéculas, continuidad interrumpida y una cavidad de la médula ósea marcadamente agrandada, mostrando cambios osteoporóticos típicos (Figura 4A).
Comparación de micro-TC entre los grupos
Los fémures de los ratones del grupo OVX mostraron una malla trabecular incompleta, una cavidad medular parcialmente vacía y un adelgazamiento de la corteza ósea en comparación con los de los ratones del grupo Sham. El grupo de ratones Sham mostró una abundancia de trabéculas, buena continuidad y un estrechamiento de la cavidad medular en sus fémures (Figura 4B).
Efectos conductuales de las píldoras Xiaoyao en ratones
Durante el período de estudio, a excepción del grupo OVX, todos los ratones de los otros grupos tenían mejores hábitos de vida, un color de pelo normal, mucha movilidad y buena salud. La orina y las heces de cada ratón volvieron a la normalidad dentro de 1 semana después del tratamiento con píldoras Xiaoyao. No hubo mordeduras, infecciones de heridas, obstrucción gastrointestinal, desprendimiento de suturas, necrosis cutánea de la incisión ni muerte de ninguno de los ratones. Los ratones del grupo OVX eran propensos a la pérdida de cabello, al oscurecimiento del color del cabello, a la reducción de la movilidad, a los reflejos más largos, al aumento de la excreción y a la disminución de la comida y la bebida.
Tinción de HE de secciones patológicas de ratones después de la intervención farmacológica
En el grupo Sham, el tejido femoral era denso, reticular y regular dispuesto. El tamaño y la continuidad de la cavidad medular eran normales y el espaciamiento entre las trabéculas óseas adyacentes era relativamente pequeño. En comparación con el grupo Sham, la corteza femoral y el hueso esponjoso en el grupo OVX mostraron defectos evidentes, disminución de las trabéculas, aumento de los espacios, continuidad interrumpida, adelgazamiento de la estructura, ensanchamiento de la cavidad medular y adelgazamiento de la corteza ósea. En comparación con el grupo OVX, las trabéculas femorales de los ratones en los grupos tratados con fármacos (dosis bajas y altas) parecían estructuralmente intactas, con un espaciamiento reducido, una mayor conectividad, cavidades de médula ósea más estrechas y estructuras más densas (Figura 5A).
Detección de índices de imagen en ratones tras la intervención farmacológica
En comparación con el grupo Sham, los fémures de los ratones del grupo OVX tenían trabéculas óseas escasas y rotas y corteza ósea adelgazada. En comparación con el grupo OVX, los ratones en el grupo de píldoras Xiaoyao de dosis alta tenían menos trabéculas óseas fracturadas, reticulación restaurada y un grado significativo de reducción parcial de la cavidad de la médula ósea. Sin embargo, los ratones tratados con píldoras Xiaoyao de dosis bajas todavía tenían trabéculas óseas fracturadas, aunque hubo un aumento de las trabéculas óseas y una reducción de la cavidad de la médula ósea. La estructura trabecular de las trabéculas óseas del grupo operado simuladamente mostró más continuidad y completitud (Figura 5B).
Resultados inmunohistoquímicos de los tejidos de los grupos tras la intervención farmacológica
Act1 e IL-6 son proteínas clave en la vía de señalización de IL-17, y ALP y COL-1 son genes osteogénicos. La expresión de las proteínas ALP, COL-1, IL-6, IL-17 y Act1 conduce a la formación de gránulos de color canela o amarillo en el tejido óseo. Los resultados de inmunohistoquímica mostraron que los valores medios de densidad óptica de ALP y COL-1 en el grupo de fármaco fueron superiores a los del grupo OVX después del tratamiento con pastillas de Xiaoyao, y la diferencia fue estadísticamente significativa (p < 0,05). Los valores medios de densidad óptica de IL-17, Act1 e IL-6 en el grupo de fármaco fueron inferiores a los del grupo OVX, y la diferencia fue estadísticamente significativa (p < 0,05; Figura 6). Las píldoras de Xiaoyao revirtieron la disminución de ALP y COL-1 causada por la ovariectomía, al tiempo que disminuyeron la expresión de varias proteínas clave IL-17, IL-6 y Act1 en la vía de señalización de IL-17, lo que sugiere que el fármaco puede ejercer sus efectos terapéuticos a través de esta vía.

Figura 1: Análisis de red de la intersección de los ingredientes activos de la medicina herbal china y los genes relacionados con la enfermedad. (A) La intersección de genes relacionados con enfermedades, obtenidos de las bases de datos GeneCards, OMIM, PharmGkb, TTD y DrugBank. Estos están representados por colores azul, rojo, verde, amarillo y marrón con 1692, 35, 3, 33 y 386 genes, respectivamente. La intersección son los genes asociados a la enfermedad en las cinco bases de datos, y la parte superpuesta indica el número de genes que se cruzan en cada base de datos. (B) Se muestran las dianas de los fármacos (con el color azul que indica este conjunto de datos, es decir, el conjunto de genes diana que actúan contra los fármacos recogidos en la base de datos de TCMSP después de la transformación de la identificación y la eliminación de duplicados) y los genes relacionados con la enfermedad (con el color rojo que indica este conjunto de datos, que contiene todos los genes de las cinco bases de datos mencionadas anteriormente). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Interacción de los ingredientes activos de la MTC con las redes reguladoras de genes relacionadas con enfermedades y las proteínas centrales. (A) La red reguladora de ingredientes activos y genes relacionados con enfermedades en la medicina tradicional china muestra las relaciones reguladoras de genes correspondientes a cada ingrediente activo en las píldoras Xiaoyao, con cada ingrediente vinculado al gen que regula. (B) Los resultados del análisis de interacción proteína-proteína de genes que se cruzan en STRING (los nodos de la red representan proteínas, los bordes representan asociaciones proteína-proteína y los enlaces múltiples indican interacciones múltiples entre dos proteínas). (C-E) Las interacciones proteicas obtenidas por String se examinaron varias veces. (C) La red de interacción de proteínas se obtuvo después del primer cribado, y la parte resaltada es su parte central. (D) El resultado del segundo cribado y la parte resaltada es la parte central. (E) La red de interacción proteína-proteína más central en la red de interacción proteína. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Análisis de enriquecimiento de GO y KEGG. (A-B) Los resultados del análisis de enriquecimiento de GO de genes que se cruzan se dividen en 3 entradas, Proceso Biológico (BP), Componente Celular (CC) y Función Molecular (MF), y cada entrada muestra solo los 10 genes más significativamente enriquecidos. (C-D) Los resultados del análisis de enriquecimiento KEGG de los genes que se cruzan (mostrando los 30 más enriquecidos más significativamente). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: Establecimiento y evaluación del modelo de ratones ovariectomizados. (A) Comparación de la morfología ósea metafisaria entre los grupos operados simuladamente y los ovariectomizados (10x). En el grupo OVX, las fracturas trabeculares fueron graves, la continuidad se interrumpió y la cavidad de la médula ósea se agrandó significativamente, mientras que en el grupo simulado, las fracturas trabeculares fueron raras y la cavidad de la médula ósea fue de tamaño normal. (B) Micro-TC del fémur en los grupos operados simuladamente y ovariectomizados. En el grupo OVX, la malla trabecular estaba incompleta y la cavidad de la médula ósea estaba parcialmente vacía. En el grupo Sham, las trabéculas eran abundantes y continuas, y la cavidad de la médula ósea era estrecha. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 5: Ensayo de HE y micro-CT después del tratamiento con las píldoras Xiaoyao. (A) Tinción de HE (10x) de secciones de fémur de ratones en cada grupo después del tratamiento con píldoras Xiaoyao. En el grupo OVX, las trabéculas óseas estaban reducidas, la continuidad se interrumpía, la estructura era escasa y la cavidad medular estaba agrandada. En el grupo de Sham, las trabéculas óseas tenían buena continuidad, el tejido femoral era estructuralmente denso y la cavidad medular era normal. En comparación con el grupo OVX, las trabéculas óseas en el grupo del fármaco parecían estructuralmente intactas, con una mayor conectividad, una cavidad medular reducida y una estructura más densa que en el grupo modelo. (B) Comparación de micro-CT de fémures de ratones en cada grupo después del tratamiento con píldoras Xiaoyao. Las trabéculas óseas en los fémures de los ratones del grupo ovariectomizado eran escasas y rotas, mientras que el grupo Sham tenía trabéculas más continuas e intactas. En comparación con el grupo ovariectomizado, los ratones en el grupo tratado con dosis altas de fármaco tenían menos trabéculas óseas rotas, estructura reticular restaurada y cavidad de la médula ósea parcialmente reducida, mientras que los animales en el grupo de dosis bajas de fármacos tenían más trabéculas óseas y menos cavidad de la médula ósea, pero las trabéculas óseas rotas permanecieron. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 6: Inmunohistoquímica para detectar el efecto de las píldoras de Xiaoyao en la vía de señalización de IL-17 y la expresión de proteínas génicas marcadoras osteogénicas en ratones osteoporóticos (40x). Las reacciones positivas para la presencia de ALP, COL-1, IL-6, así como de las proteínas IL-17 y Act1 se manifestaron por la aparición de gránulos de color canela o amarillo en el tejido óseo. La expresión de ALP y COL-1 en el grupo de fármaco fue mayor que en el grupo de OVX (p < 0,05). La expresión de IL-17, Act1 e IL-6 en el grupo de fármacos fue menor que en el grupo de OVX (p < 0,05). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
| Nombre de la medicina tradicional china | Identificación molecular | Nombre de la molécula |
| Paeonia lactiflora blanca | MOL001918 | paeoniflorgenone |
| Paeonia lactiflora blanca | MOL000211 | Mairín |
| Atractylodes macrocephala | MOL000022 | 14-acetil-12-senecoil-2E,8Z,10E-atractilentriol |
| Atractylodes macrocephala | MOL000049 | 3β-acetoxiatractilona |
| Menthae Herba | MOL000471 | Aloe-Emodin |
| Menthae Herba | MOL005190 | Eriodictyol |
| Chai Hu | MOL000354 | isorhamnetin |
| Chai Hu | MOL013187 | Cubebin |
| Angélica sinensis | MOL000449 | Estigmasterol |
| Angélica sinensis | MOL000358 | beta-sitosterol |
| Poria cocos | MOL000282 | ergosta-7,22E-dien-3beta-ol |
| Poria cocos | MOL000283 | Peróxido de ergosterol |
| Regaliz | MOL002311 | Glicirol |
| Regaliz | MOL004990 | 7,2',4'-trihidroxi - 5-metoxi-3 - arilcoumarina |
| Jengibre fresco | MOL006129 | 6-metilgingediacetato2 |
| Jengibre fresco | MOL001771 | poriferast-5-en-3beta-ol |
Tabla 1: Ingredientes activos en medicamentos chinos seleccionados. La primera columna enumera los nombres de las medicinas tradicionales chinas, la segunda columna es la identificación del ingrediente activo de la medicina china y la tercera columna es el nombre del ingrediente activo de la medicina china.
Archivo de codificación suplementario 1: Nombre de la hierba, ingrediente y código de combinación de ID de destino. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Fichero de codificación suplementario 2: Conversión de ID de diana de fármaco. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Fichero de codificación suplementario 3: Ficheros para el análisis de redes. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo de codificación suplementario 4: Conversión de símbolo a identificación de genes. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Fichero de codificación suplementario 5: Análisis de enriquecimiento de GO. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Archivo de codificación suplementario 6: Análisis de enriquecimiento de KEGG. Haga clic aquí para descargar este archivo.