La respiración mitocondrial en células enteras de levadura es un indicador valioso de la bioenergética celular. En este trabajo se presenta un protocolo para cuantificar este fenotipo aplicable a diferentes especies de levaduras.
Artículo de método
La respiración mitocondrial en células enteras de levadura es un indicador valioso de la bioenergética celular. En este trabajo se presenta un protocolo para cuantificar este fenotipo aplicable a diferentes especies de levaduras.
El metabolismo está coordinado principalmente por la disponibilidad de energía celular y las condiciones ambientales. Los ensayos para conocer cómo las células adaptan el metabolismo energético a diferentes condiciones nutricionales y ambientales proporcionan información valiosa para dilucidar los mecanismos moleculares. La fosforilación oxidativa es la fuente principal de ATP en la mayoría de las células, y la actividad de la respiración mitocondrial es un componente clave de la fosforilación oxidativa, manteniendo el potencial de la membrana mitocondrial para la síntesis de ATP. La respiración mitocondrial a menudo se estudia en mitocondrias aisladas que carecen del contexto celular. Aquí, presentamos un método para cuantificar la respiración mitocondrial en células intactas de levadura. Este método se aplica a cualquier especie de levadura, aunque generalmente se ha utilizado para las células de Saccharomyces cerevisiae. Primero, se prueba el crecimiento de la levadura en condiciones específicas. Luego, las células se lavan y se resuspenden en agua desionizada con una proporción de 1:1 (p/v). A continuación, las células se colocan en una cámara de oxímetro con agitación constante y se utiliza un electrodo Clark para cuantificar el consumo de oxígeno. Algunas moléculas se colocan secuencialmente en la cámara y se seleccionan de acuerdo con este efecto en la cadena de transporte de electrones o síntesis de ATP. El inhibidor de la ATPasa, la oligomicina, se añade primero para medir la respiración acoplada a la síntesis de ATP. Posteriormente, se utiliza un desacoplador para medir la capacidad respiratoria máxima. Finalmente, se añade una mezcla de inhibidores de la cadena de transporte de electrones para descartar el consumo de oxígeno no relacionado con la respiración mitocondrial. Los datos se analizan mediante una regresión lineal para obtener la pendiente, que representa la tasa de consumo de oxígeno. La ventaja de este método es que es específico para la respiración mitocondrial de la levadura, manteniendo el contexto celular. Es fundamental destacar que los inhibidores utilizados en la cuantificación de la respiración mitocondrial podrían variar entre especies de levaduras.
Las mitocondrias juegan un papel fundamental en la bioenergética celular ya que son la principal fuente de ATP para la mayoría de las células, y varias vías convergen y dependen de la actividad de las vías mitocondriales1. La fosforilación oxidativa es necesaria para la síntesis de ATP que combina el transporte de electrones a través de la cadena de transporte de electrones para reducir el oxígeno y la actividad de F1F 0-ATPasa, sintetizando ATP utilizando el potencial de membrana mitocondrial producido debido al flujo de electrones2. Así, la respiración mitocondrial forma parte de la fosforilación oxidativa3.
La cadena de respiración mitocondrial comprende cuatro complejos o, en algunos casos, deficiente en el complejo I de levadura (por ejemplo, Saccharomyces cerevisiae), tres complejos y tres proteínas deshidrogenasas4. Los complejos respiratorios se localizan en la membrana mitocondrial interna; algunas levaduras presentan la cadena de transporte de electrones canónica con complejo I (NADH deshidrogenasa) o tres NADH deshidrogenasa, ubiquinona (Co Q), complejo II (succinato ubiquinona oxidorreductasa), complejo III (ubiquinona citocromo oxidorreductasa), citocromo c (Cyt c) y complejo IV (citocromo c oxidasa)5,6. El transporte de electrones a través de los complejos permite el bombeo de protones desde la matriz mitocondrial hasta el espacio intermembrana, formando un potencial de membrana mitocondrial7. Los protones ubicados en el espacio intermembrana son bombeados a la inversa, hacia la matriz mitocondrial por F1F0 -ATPasa para sintetizar una molécula de ATP por cada cuatro protones bombeados8.
Las mediciones de la respiración mitocondrial proporcionan información valiosa sobre la integridad mitocondrial, la bioenergética celular y la capacidad respiratoria mitocondrial9. La función de la respiración mitocondrial puede ser analizada in vitro o in situ utilizando diversas técnicas. Sin embargo, el análisis de la respiración mitocondrial en células intactas podría presentar una serie de ventajas, ya que comprende todo el metabolismo celular, ya que se consideran las interacciones de las células con su entorno y el metabolismo intracelular cuando se emplean células enteras10. Además, el uso de células intactas permite una fácil evaluación de diversas condiciones experimentales y detecta cambios mínimos que no se pudieron observar en mitocondrias aisladas10,11. Otra ventaja de la cuantificación de la respiración mitocondrial en células intactas es que se conservan los efectos de la proliferación y localización mitocondrial12.
La respiración de las mitocondrias de los mamíferos en células intactas ha sido descrita con gran detalle12, dejando de lado el estudio de otros organismos eucariotas, como las levaduras. En este trabajo se propone una técnica para cuantificar la respiración mitocondrial adaptada a levaduras a partir de protocolos de mamíferos. Por lo tanto, en esta técnica se han utilizado conceptos de la cuantificación de la respiración mitocondrial en mamíferos. Por ejemplo, esta técnica se divide en varias etapas según el protocolo de los mamíferos: 1) respiración basal (dependiente del sustrato), 2) respiración ligada al ATP (a través de la inhibición de la ATP sintasa), 3) capacidad respiratoria máxima (empleando un desacoplador que permite la permeabilidad de los protones a través de la membrana mitocondrial interna), 4) inhibición de la respiración mitocondrial (utilizando una mezcla de inhibidores de la cadena respiratoria para descartar el consumo de oxígeno por otras fuentes diferentes a respiración mitocondrial)11,13. Por lo tanto, este trabajo tiene como objetivo presentar un protocolo para cuantificar la respiración mitocondrial en levaduras.
1. Medios de cultivo y preparación de inóculo
2. Condiciones de crecimiento y diseño del experimento
3. Ensayo de consumo de oxígeno (polarografía)
4. Tratamiento de datos
Esta técnica de respiración mitocondrial se puede utilizar para otras especies de levaduras distintas a S. cerevisiae, como Scheffersomyces stipitis15 y K. marxianus16. Sin embargo, para fines representativos, solo presentamos resultados de S. cerevisiae. Es bien sabido que S. cerevisiae presenta un metabolismo respiratorio predominante en bajas concentraciones de glucosa (por debajo de 0,8 mM)17,18. Así, para corroborar el fenotipo respiratorio de S. cerevisiae, se cultivó en dos concentraciones de glucosa para estimular (0,5% de glucosa) y limitar (5% de glucosa) la respiración mitocondrial18,19. Como se esperaba, los resultados obtenidos en la respiración basal (sustrato oxidable), la respiración ligada a ATP (oligomicina) y la capacidad respiratoria máxima (CCCP) validan el metabolismo energético característico de S. cerevisiae (Figura 2). Observamos valores más altos de consumo de oxígeno (respiración basal, respiración ligada a ATP y capacidad respiratoria máxima) en las células cultivadas con 0,5% de glucosa en comparación con los valores obtenidos en las células cultivadas con 5% de glucosa (Figura 2).
Además, los ensayos utilizaron tres sustratos: glucosa, glicerol y L-lactato. El objetivo de emplear diversos sustratos es evaluar diferentes partes de la cadena respiratoria mitocondrial. En estas condiciones, la respiración mitocondrial no mostró cambios significativos dependientes del sustrato, ya que no se añadió ningún tratamiento para alterar la cadena respiratoria (Figura 2).
Utilizamos quercetina para evaluar la capacidad de la técnica, un compuesto que influye negativamente en la respiración mitocondrial20. Los datos obtenidos mostraron que la quercetina disminuyó significativamente la respiración mitocondrial en células cultivadas en medios suplementados con glucosa al 0,5% (Figura 3). Por otro lado, las células cultivadas en medios suplementados con glucosa al 5% no presentaron una influencia negativa significativa de la quercetina (Figura 4).

Figura 1: Curva representativa de consumo de oxígeno. Curva de consumo de oxígeno obtenida en células de S. cerevisiae cultivadas en medio SC (0,5% de glucosa). Los colores representan las diferentes pendientes obtenidas en el sustrato, los desacopladores y la suplementación con inhibidores. Verde: El sustrato utilizó glucosa y respiración basal correspondiente a la pendiente. Azul: oligomicina, inhibidor de la ATP sintasa, pendiente empleada para la determinación de la respiración ligada al ATP. Amarillo: CCCP, desacoplador, pendiente utilizada para evaluar la respiración máxima. Gris y rojo: complejo inhibidor II y III, respectivamente; Pendiente empleada para determinar el consumo de oxígeno no dependiente de las mitocondrias. Abreviaturas: CCCP = cianuro de carbonilo de 3-clorofenilhidrazona; TTFA = 2-tenoiltrifluoroacetona; AA = antimicina A. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Ensayos de consumo de oxígeno en células de S. cerevisiae cultivadas al 0,5% y al 5% de glucosa. La respiración mitocondrial se evalúa a través del consumo de oxígeno medido en la respiración basal, la capacidad respiratoria máxima y la respiración ligada a ATP en células de S. cerevisiae cultivadas en SC suplementadas con 0,5% y 5% de glucosa. Se utilizaron tres sustratos para evaluar su influencia específica en la cadena de transporte de electrones: glucosa (NADH deshidrogenasas), glicerol (pool de ubiquinona) y L-lactato (citocromo c). (A) Respiración basal al 5% y 0,5% de glucosa con glucosa, glicerol y L-lactato como sustratos; (B) respiración máxima al 5% y 0,5% de glucosa con glucosa, glicerol y L-lactato como sustratos; (C) Respiración ligada a ATP al 5% y 0,5% de glucosa con glucosa, glicerol y L-lactato como sustrato. Los resultados se presentan como media ± S.D. de tres experimentos independientes, cada uno de los cuales tiene dos repeticiones técnicas. ANOVA de un factor seguido de la prueba de Tukey (p ≤ 0,05; diferentes letras: diferencia significativa, mismas letras: sin diferencia significativa) para el análisis estadístico. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 3: Quercetina limitó la respiración mitocondrial en baja concentración de glucosa en células de S. cerevisiae cultivadas. La medición del consumo de oxígeno se realizó a la respiración basal, la capacidad respiratoria máxima y la respiración ligada a ATP en células de S. cerevisiae cultivadas en medio SC (0,5% de glucosa) con quercetina suplementada (100 μM). Se utilizó etanol para disolver la solución de quercetina. Los resultados se presentan como media ± S.D. de tres experimentos independientes, cada uno de los cuales tiene dos repeticiones técnicas. El análisis estadístico se realizó mediante una prueba t de student pareada (*, ** p ≤ 0,05). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 4: La quercetina no afecta la respiración mitocondrial en alta concentración de glucosa en S. cerevisiae. El consumo de oxígeno se midió a la respiración basal, la capacidad respiratoria máxima y la respiración ligada al ATP en células de S. cerevisiae cultivadas en medio SC (5% de glucosa) con quercetina suplementada (100 μM). El etanol se utiliza para disolver la solución de quercetina. Los resultados muestran la media ± S.D. de tres experimentos independientes, cada uno con dos repeticiones técnicas. El análisis estadístico se realizó mediante la prueba t de Student pareada (p ≤ 0,05; ns: no significativa). Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
La fosforilación de la respiración mitocondrial juega un papel fundamental en varias vías que dependen del potencial de la membrana mitocondrial y mantienen los niveles de ATP a través de la fosforilación oxidativa. Comprender cómo las condiciones ambientales y nutricionales afectan la respiración mitocondrial de las levaduras sirve como herramienta para dilucidar los mecanismos moleculares.
Es esencial tener en cuenta los siguientes pasos críticos para obtener resultados fiables de este método. La agitación >200 rpm es fundamental para obtener suficiente biomasa en condiciones de crecimiento respiratorio para probar la respiración mitocondrial; Las condiciones de agitación inferiores a 200 rpm provocan un crecimiento y una formación de biomasa deficientes, tardando más en alcanzar la fase de crecimiento logarítmico medio y podrían afectar a las tasas de consumo de oxígeno, ya que las células sobreviven en un entorno menos oxigenado. La concentración de glucosa en el medio se establece de acuerdo con el fenotipo de la levadura (Crabtree-positivo o negativo); esto es crítico en el caso de las levaduras Crabtree positivas, ya que las concentraciones altas de glucosa inhiben la respiración mitocondrial y podrían ejercer un sesgo en la interpretación de los datos. Por ejemplo, en S. cerevisiae, la glucosa provoca represión catabólica, inhibiendo la respiración mitocondrial a altas concentraciones de glucosa21,22. Con base en esta evidencia, se obtienen valores más bajos en la respiración basal, la respiración ligada a ATP y la respiración máxima de las células cultivadas a alta concentración de glucosa (5%) en comparación con las células de levadura cultivadas a baja concentración de glucosa (0,5%). Los inhibidores de la cadena respiratoria deben seleccionarse cuidadosamente de acuerdo con la susceptibilidad de la levadura; Esto es fundamental para descartar otras fuentes de consumo de oxígeno celular que no sean la respiración mitocondrial.
Los sustratos, desacopladores mitocondriales e inhibidores se utilizan para determinar diferentes parámetros de la respiración mitocondrial en células intactas. Sin embargo, su uso tiene algunas limitaciones. Por ejemplo, se deben considerar los objetivos inespecíficos fuera de las mitocondrias de los inhibidores y desacopladores mitocondriales en células intactas para evitar sesgos en la interpretación del consumo de oxígeno. Además, el uso de fuentes alternativas de carbono para detectar el sitio de acción en la cadena respiratoria debe probarse con más detalle, ya que los subproductos del metabolismo del glicerol o del L-lactato podrían oxidarse para reducir el NAD+ o el FAD+, que cede electrones y activa la cadena respiratoria desde el NADH deshidrogenasas y el Complejo II, respectivamente. Finalmente, S. cerevisiae y otras levaduras albergan transportadores de PDR como Yor1p (proteína de resistencia a la oligomicina de la levadura), lo que sugiere la salida de oligomicina de las células23. Además, se necesitan ensayos con células deficientes en PDR, por ejemplo, la cepa AD1-8, que tiene los principales transportadores de PDR y los factores de transcripción PDR1/PDR3 eliminados, para validar el uso de oligomicina en S. cerevisiae para la cuantificación de la respiración mitocondrial.
El uso de células intactas para la cuantificación de la respiración mitocondrial mantiene el contexto celular, proporcionando una técnica más robusta para conocer los efectos nutrimentales o ambientales sobre la bioenergética de la levadura. Además, el uso de células intactas de levadura para la cuantificación de la respiración mitocondrial es más económico y, a nivel técnico, más fácil que las mitocondrias aisladas. Además, al igual que en los ensayos de mitocondrias aisladas, diversas fuentes de carbono indican el sitio de acción en la cadena respiratoria de algunas moléculas. Como prueba de concepto, esta técnica corrobora que la suplementación con resveratrol afecta la cadena respiratoria a nivel de NADH deshidrogenasa, ya que la inhibición del resveratrol en la respiración basal solo se observa con glucosa y no con glicerol o L-lactato24. Los estudios in vitro con el complejo I solubilizado demostraron que el resveratrol compite con el NAD+, afectando la actividad del complejoI 25. Esto corrobora el fenotipo observado en células intactas con la técnica aquí presentada. Además, esta técnica también es fiable para explorar los efectos negativos de los productos químicos en la respiración mitocondrial de la levadura. Por ejemplo, la quercetina es un polifenol ampliamente estudiado en las últimas décadas. Entre las evidencias primarias encontradas, se ha demostrado que limita la respiración mitocondrial en células intactas, lo que ha sido validado por la actividad de la cadena respiratoria compleja26,27. Es importante destacar que diversas investigaciones han reportado efectos inhibidores de la quercetina en la respiración mitocondrial en diferentes estudios de modelos28.
Es importante tener una descripción detallada del metabolismo de la levadura, incluyendo la bioenergética, ya que estos microorganismos podrían ser patógenos animales, incluyendo humanos, y también se utilizan como fábricas de células o en aplicaciones biotecnológicas.
Los autores no tienen nada que revelar.
Este trabajo contó con el apoyo del Tecnológico Nacional de México (Subvención 20026.24-PD) otorgado a LAMP.
| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| 2-tenoiltrifluoroacetona (TTFA) | Merck | T27006 | Inhibidor del complejo II |
| 3-clorofenilhidrazona, cianuro de carbonilo (CCCP) | Merck | C2759 | Desacoplador de la respiración mitocondrial |
| Etanol Absolut | Merck 107017 | Para disolver quercetina | |
| Agar | Merck | A1296 | YPD preparación de agar |
| Sulfato de amonio granular (NH4)2SO4 | J.T. Baker | 0792-05 | SC preparación de caldo |
| Antimicina A (AA) | Merck | A8674 | Inhibidor complejo III |
| aYSI5300A | ---- | ---- | Monitor |
| Centrífuga | Hermle | Z 206 A | Para centrifugación |
| de células de oxígeno | ---- | ---- | Electrodo tipo Clark |
| Computadora | ---- | ---- | Para la adquisición de datos |
| Fosfato dipotásico K2HPO4 | J.T. Baker | 3252-05 | SC preparación de caldo |
| Glucosa | Merck | G7021 | YPD preparación de caldo |
| Glicerol | Merck | G5516 | Suplementación con sustrato y medio |
| Lactato | Merck | L1250 | Suplementación con sustrato medio |
| Oligomicina de Streptomyces diastatochromogenes | Merck | O4876 | Inhibición de la ATP sintasa mitocondrial |
| Agitador orbital | Thermo Fisher | SHKE6000 | Incubación de inóculo tubos de vidrio y matraz |
| Peptona de caseína, digesto enzimático | Merck | 82303 | YPD preparación de caldo |
| Quercetina | Merck | 337951 | Para disminuir la respiración mitocondrial |
| Uracil | Preparación de caldo | Merck | U0750 |
| Extracto de levadura Preparación | Merck | Y1625 | YPD |
| Base de nitrógeno de levadura sin aminoácidos ni sulfato de amonio | Preparación de caldo | Merck | Y1251 |
| Levadura sintética Suplementos de medio de abandono sin uracilo | Preparación de caldo | Merck | Y1501 |
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