Artículo de método

Familia de las sirtuinas en la investigación con células madre mesenquimales de médula ósea: un análisis bibliométrico con Web of Science y R

DOI:

10.3791/68913

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30 de diciembre de 2025

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1Department of Prosthodontics, Tianjin Stomatological Hospital, School of Medicine, Nankai University, 2Tianjin Key Laboratory of Oral and Maxillofacial Function Reconstruction, 3Department of Periodontics, Tianjin Stomatological Hospital, School of Medicine, Nankai University

En este artículo

Resumen

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Este estudio proporciona un protocolo bibliométrico para identificar tendencias de investigación de la familia Sirtuin en estudios de células madre mesenquimales de médula ósea utilizando Web of Science y R.

Resumen

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Este estudio presenta un protocolo bibliométrico completo para mapear sistemáticamente las tendencias de investigación y las estructuras de conocimiento de la familia Sirtuinas (SIRTs) en la investigación con células madre mesenquimales de médula ósea. El protocolo implica la recuperación estructurada de la literatura de la Web of Science Core Collection utilizando términos de búsqueda predefinidos, la aplicación de criterios explícitos de inclusión y exclusión para filtrar artículos y revisiones en inglés, y un análisis bibliométrico en profundidad a través del paquete bibliometrix en R. Los principales pasos metodológicos incluyen la recuperación y limpieza de datos, análisis estadístico descriptivo, evaluación de co-ocurrencia de palabras clave, mapeo de redes colaborativas y generación de temas temáticos Mapas de evolución y estructura conceptual. Nuestro análisis de 496 artículos elegibles (2009-2024) reveló un notable aumento en las publicaciones anuales, destacando China como el principal contribuyente. La Universidad de Soochow y el autor LI Y fueron identificados como la institución y el autor más productivos, respectivamente. Las palabras clave de alta frecuencia incluían 'células madre mesenquimales', 'estrés oxidativo' y 'SIRT1', con mapeo temático que destacaba temas motores como la senescencia y el estrés oxidativo. Este marco metodológico reproducible y transparente no solo delimita los puntos críticos actuales de investigación, sino que también proporciona un enfoque riguroso y escalable para la síntesis literaria a gran escala, apoyando futuras evaluaciones científicas y evaluaciones de tendencias en el campo con mayor claridad y reproducibilidad.

Introducción

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Las células madre son células indiferenciadas capaces de autorrenovarse y diferenciarse, ofreciendo un potencial terapéutico considerable. Las células madre adultas, como las células madre mesenquimales de la médula ósea (BMSC), se utilizan ampliamente en la regeneración tisular debido a su accesibilidad y falta de cuestiones éticas en comparación con las células madreembrionarias 1. Son células no hematopoyéticas de la médula ósea capaces de diferenciarse en varios tipos celulares y están implicadas en la reparación tisular y el tratamiento de enfermedades 2,3.

Las células madre adultas están presentes en diversos tejidos, incluyendo médula ósea, grasa y piel, y evitan las preocupaciones éticas asociadas a las células madreembrionarias. Estas células mantienen el conjunto de células madre y apoyan la regeneración tisular mediante ladiferenciación 5,6. La médula ósea en particular contiene células madre mesenquimales que migran a tejidos dañados y contribuyen a la regeneración 7,8. Las aplicaciones incluyen el tratamiento del cáncer, la degeneración del disco intervertebral y los trastornosinmunitarios 9,10.

La familia Sirtuin (SIRTs) consta de siete enzimas dependientes de NAD+ (SIRT1-SIRT7) que regulan diversas funciones celulares, incluyendo la expresión génica y la reparación y metabolismodel ADN 11. Es importante destacar que su actividad está modulada por varios activadores específicos (por ejemplo, resveratrol para SIRT1, precursores de NAD⁺) e inhibidores (por ejemplo, nicotinamida, EX-527 para SIRT1), que son herramientas cruciales de investigación y potenciales agentesterapéuticos 12. Estas proteínas están localizadas en diferentes compartimentos subcelulares y han sido implicadas en procesos biológicos críticos. Varios estudios han destacado la importancia de los SIRTs en la regulación de la respuesta al estrés oxidativo, el envejecimiento y la diferenciación osteogénica en losBMSC 12,13. Las células madre mesenquimales de la médula ósea son células no hematopoyéticas derivadas de la médula ósea capaces de diferenciarse en varios tipos celulares como osteoblastos, condrocitos y adipocitos, desempeñando papeles vitales en la reparación tisular y el tratamiento de diversas enfermedades, incluyendo la degeneración del disco intervertebral, el cáncer y los trastornosinmunitarios 2,9,10.

A pesar del creciente cuerpo de literatura sobre SIRTs y BMSC, falta una síntesis integral de las tendencias de investigación y las estructuras de conocimiento. Aunque las revisiones narrativas y sistemáticas tradicionales ofrecen una discusión profunda y una evaluación crítica, pueden ser subjetivas y consumir mucho tiempo, especialmente en campos grandes y en rápida evolución. En cambio, el análisis bibliométrico proporciona un enfoque cuantitativo objetivo para analizar grandes volúmenes de datos de publicación, permitiendo la identificación de tendencias de investigación, contribuyentes clave y puntos calientes emergentes mediante análisis estadístico y de redes14. El mapeo del conocimiento mejora aún más esto al representar visualmente la estructura intelectual y los desarrollos dinámicos dentro de un campo de investigación, ofreciendo una ventaja única para mapear el paisaje conceptual y revelar patrones ocultos que podrían pasar desapercibidos en revisionescualitativas 15,16,17.

Este estudio emplea un enfoque bibliométrico para mapear la estructura de conocimiento de los SIRTs en la investigación del BMSC. Es importante señalar que el análisis se basa únicamente en artículos y revisiones en inglés extraídos de la Web of Science (WOS) Core Collection, que, aunque garantiza la calidad y coherencia de los datos, puede excluir estudios relevantes publicados en otros idiomas o indexados en otras bases de datos. No obstante, al utilizar el paquete bibliometrix en R, este estudio pretende analizar objetivamente el desarrollo, las redes de colaboración y los enfoques temáticos en este campo, proporcionando así valiosas perspectivas y orientando futuras líneas de investigación.

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Protocolo

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Este estudio solo utilizó datos bibliográficos públicos y no involucró a humanos ni animales. Por lo tanto, no se requería la aprobación del comité de ética.

1. Diseño del estudio

  1. Realizar un análisis bibliométrico retrospectivo de la literatura publicada sobre la familia SIRTs en la investigación con células madre mesenquimales de médula ósea.
  2. Recopilar literatura del Núcleo WOS y realizar recuperación estructurada, cribado, análisis cuantitativo y visualización de datos bibliográficos.

2. Recuperación de literatura

  1. Abre el Núcleo WOS y selecciona la base de datos SCI-Expandida (todos los códigos de operación y puntos de inspección se muestran en (Archivo Suplementario 1).
  2. Utiliza la siguiente estrategia de búsqueda: TS=('Célula madre mesenquimal*' O 'Célula estromal mesenquimal*' O 'Célula estromal de médula ósea*' O 'Célula estromal mesenquimal' Multipotente O 'Célula madre mesenquimal' de médula ósea*) Y TS=('SIRT*' O 'Sirtuin' O 'Sirtuins' O 'SIRT1' O 'SIRT2' O 'SIRT3' O 'SIRT6')
  3. Filtra los resultados para incluir solo artículos de revistas en inglés y artículos de revisión.
  4. Limita la fecha de publicación al 1 de noviembre de 2024.
  5. Exporta las referencias seleccionadas como un archivo de texto plano con registros completos y referencias citadas.

3. Selección de literatura

  1. Utiliza los siguientes criterios de inclusión:
    1. Tipo de estudio: artículos de investigación originales y artículos de revisión
    2. Idioma: artículos publicados en inglés
  2. Utiliza los siguientes criterios de exclusión:
    1. Elimina publicaciones duplicadas.
    2. Excluir los estudios no relacionados principalmente con SIRTs y BMSC (por ejemplo, estudios centrados en otros objetivos de SIRT, otros tipos celulares o enfermedades no relacionadas).
    3. Excluye los tipos de artículos como resúmenes de reuniones, actas de congresos, editoriales, cartas, errátas, capítulos de libros y patentes.
    4. Excluye los estudios cuyo texto completo no está disponible.

4. Limpieza de datos

  1. Abre el archivo de texto exportado en R usando el paquete bibliometrix.
  2. Convierte el archivo de texto en un marco de datos usando la función convert2df().
  3. Excluir artículos duplicados.
  4. Revisa los títulos y resúmenes para eliminar literatura irrelevante.

5. Análisis de datos

  1. Instala los paquetes R, bibliometrix, ggplot2, igraph, factoextra y wordcloud, desde la Red Completa de Archivos R usando la función install.packages().
  2. Analizar el número de publicaciones anuales, la productividad de los autores, las contribuciones a los países, los resultados institucionales y las métricas de citas.
  3. Identifica la frecuencia de palabras clave y las tendencias de crecimiento utilizando la palabra clave Growth().
  4. Construir redes de colaboración entre países e instituciones utilizando networkPlot().
  5. Evalúa la distribución e impacto de las revistas utilizando funciones de análisis de fuentes.

6. Visualización

  1. Utiliza las funciones thematicMap() y conceptualStructure() para generar mapas de evolución temática y estructura conceptual.
  2. Exportar gráficos en formatos de alta resolución (Portable Document Format [PDF] o Tagged Image File Format [TIFF]) para la presentación de figuras.

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Resultados

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Datos generales de publicación

Se recuperaron un total de 580 artículos de la Colección Núcleo de WOS utilizando la estrategia de búsqueda detallada. Tras aplicar los criterios predefinidos de inclusión y exclusión para eliminar 84 registros no relacionados (por ejemplo, estudios que no se centraban principalmente en SIRTs en BMSC o tipos de publicación irrelevantes como resúmenes de reuniones) o duplicados, se incluyeron 496 artículos elegibl...

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Discusión

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Actualmente, existen numerosos estudios sobre la familia SIRTs y los BMSC, pero falta una síntesis exhaustiva de las tendencias de investigación. La sirtuina 6 es un miembro único de la conocida familia SIRTs y tiene diversas funciones en diferentes vías moleculares relacionadas con la reparación del ADN, glucólisis, gluconeogénesis, tumorigénesis, neurodegeneración e hipertrofia cardíaca18,19. Sus amplios roles regulatorios pone...

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Divulgaciones

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Los autores no tienen conflictos de interés que revelar.

Agradecimientos

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Agradecemos a todos los miembros de nuestro grupo de investigación sus contribuciones y comentarios durante la preparación del manuscrito.

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Materiales

Lista de materiales utilizados en este artículo
NombreEmpresaNúmero de catálogoComentarios
ordenador con el sistema operativo Windows 11Microsoft Corporation, Redmond, WA, EE. UU.)
Rversión 4.4.1, Fundación R para la Computación Estadística, Viena, AustriaPaquetes Bibliometrix (versión 4.3.1), ggplot2, igraph, factoextra y wordcloud

Referencias

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  1. Henden, C., et al. NK cell cytotoxicity towards pluripotent stem cells and their neural progeny: impacts of activating and inhibitory receptors and KIR/HLA mismatch. Stem Cells. 42 (3), sxae083(2024).
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  11. Gao, J., et al. The dynamic in vivo distribution of bone marrow-derived mesenchymal stem cells after infusion. Cells Tissues Organs. 169 (1), 12-20 (2001).
  12. Sacconnay, L., Carrupt, P. A., Nurisso, A. Human sirtuins: structures and flexibility. J Struct Biol. 196 (3), 534-542 (2016).
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