Este protocolo proporciona instrucciones para la administración intranasal de IAV y el análisis posterior del daño pulmonar del ratón y los cambios transcripcionales asociados a los tipos de células pulmonares.
Artículo de método
Este protocolo proporciona instrucciones para la administración intranasal de IAV y el análisis posterior del daño pulmonar del ratón y los cambios transcripcionales asociados a los tipos de células pulmonares.
La infección viral causa daño agudo y a largo plazo al alvéolo pulmonar, la estructura tisular especializada responsable del intercambio de gases entre el sistema cardiovascular y el entorno externo. La infección por el virus de la influenza A (IAV) en ratones representa un modelo traslacional para la respuesta del pulmón humano a la infección viral e induce cambios de estado celular transitorios y persistentes en el alvéolo. En algunos casos, los estados celulares aberrantes inducidos por una lesión viral que no se resuelven con el tiempo pueden afectar permanentemente la función crítica de intercambio de gases del pulmón. Este artículo demuestra métodos para la infección intranasal de ratones con A/PR/8/34 IAV y la caracterización de alteraciones transitorias y duraderas en la composición celular y la estructura tisular de los pulmones dañados. Este modelo permite una investigación detallada de los mecanismos moleculares y celulares subyacentes a la reparación pulmonar y la disfunción crónica. Este enfoque también ofrece una plataforma para evaluar intervenciones terapéuticas destinadas a promover la regeneración pulmonar efectiva y restaurar la función respiratoria después de una lesión viral.
Los pulmones juegan un papel crucial en el suministro de oxígeno y nutrientes a los tejidos locales. Las células endoteliales (CE) que pueblan los pequeños vasos sanguíneos capilares de los pulmones son esenciales para el buen funcionamiento del tejido pulmonar, manteniendo la integridad vascular y el intercambio gaseoso eficiente1. Las CE forman el nicho vascular y se comunican recíprocamente con otras células, como las células epiteliales, las células inmunitarias y las células mesenquimales. Esto contribuye a la regulación del desarrollo pulmonar y de la reparación de tejidos en respuesta a una lesión o enfermedad2.
La infección por el virus de la influenza H1N1 A es un problema mundial3. Los pacientes con infección por H1N1 a menudo son diagnosticados con daño alveolar difuso exudativo (DAD)4. La infección por H1N1 puede provocar daños pulmonares graves y consecuencias graves, como neumonía, lesión pulmonar aguda grave (LPA) y síndrome de dificultad respiratoria aguda (SDRA)5. El daño surge principalmente del virus que infecta las células epiteliales pulmonares, lo que provoca una respuesta inmune excesiva que resulta en inflamación, daño tisular y acumulación de líquido en los pulmones. Las células epiteliales que recubren las vías respiratorias y los alvéolos, que son responsables del intercambio de gases, son dañadas directamente por el virus H1N1, lo que lleva a la alteración de la estructura normal del pulmón 6,7. Ha quedado claro que otros tipos de células, aunque no están directamente infectadas por IAV, pueden dañarse en respuesta a la infección 8,9. El daño tisular después de la infección por influenza, por lo tanto, afecta a todos los compartimentos celulares del pulmón, y recientemente se ha demostrado que la infección por IAV causa cambios transitorios y persistentes en el estado celular en múltiples compartimentos celulares9. Esta plasticidad celular en respuesta a la enfermedad puede ser útil o perjudicial para la reparación exitosa de los tejidos y justifica más estudios.
El modelo experimental más adoptado para estudiar la influenza y su patogénesis es la infección intranasal de ratones con el virus de la influenza A/PR/8/3410. Es una técnica importante que permite el estudio de la gravedad de la enfermedad, la mortalidad y la infectividad viral. La infección intranasal de ratones imita la ruta natural de infección en humanos y permite el estudio de las respuestas inmunitarias adaptativas e innatas contra el virus. En 1934, se aisló una cepa específica del virus de la influenza A "A/PR/8/34" de un paciente en Puerto Rico11. Esta cepa del virus de la influenza ahora se ha adaptado a los ratones y ya no infecta productivamente a los humanos. Debido a las similitudes en los sistemas inmunológicos de ratones y humanos, los ratones son el modelo animal más popular para la investigación de IAV12. En este método, la cepa A/PR/8/34 H1N1 se administra directamente a los ratones a través de las fosas nasales, imitando una infección natural13. Es un método fácil, rentable y conveniente para estudiar los efectos de la infección viral en el tejido pulmonar del huésped en condiciones de tipo salvaje (WT) y knockout (KO). Las técnicas alternativas tienen ventajas y desventajas en comparación con el modelo intranasal. La inoculación intratraqueal (IT) permite la administración precisa del virus a los pulmones, pero esta técnica no imita completamente la infección por inhalación y no proporciona información sobre la toxicidad en el tracto respiratorio superior. La inoculación IT también requiere una gran habilidad para reducir el riesgo de lesión traqueal13,14. La inoculación por inhalación de aerosol (AR) imita la ruta natural de la infección y crea una patología pulmonar más uniforme en comparación con la infección intranasal, pero puede ser difícil mantener una concentración uniforme del virus en el aerosol y lograr una administración precisa del aerosol viral. La seguridad también es una preocupación importante del método de inoculación AR10. Por lo tanto, la técnica de inoculación intranasal de la administración de IAV es un enfoque crucial para la investigación centrada en los pulmones sobre los efectos posteriores de la infección viral en la lesión y reparación de tejidos. A diferencia de los modelos químicos o mecánicos, proporciona una forma más realista y menos invasiva de estudiar el daño pulmonar inducido por la influenza y las interacciones huésped-patógeno.
Aquí, establecemos un método reproducible para la infección intranasal de ratones con el virus de la influenza A (A / PR / 8/34) y para caracterizar los cambios celulares y estructurales a corto y largo plazo en el alvéolo pulmonar que resultan de la lesión viral. Los estudios que utilizan este método pueden ayudar en el descubrimiento de mecanismos de daño y reparación del tejido pulmonar para identificar nuevos objetivos terapéuticos para enfermedades pulmonares.
Trabajar con el virus de la influenza A en un modelo animal se considera nivel de bioseguridad 2 (BSL2) y nivel de bioseguridad animal 2 (ABSL2). Todos los procedimientos en animales utilizados para generar estos datos fueron aprobados por el Comité de Cuidado y Uso de Animales del Centro de Investigación del Cáncer, Instituto Nacional del Cáncer, Institutos Nacionales de Salud (Protocolo # 24-452). Este protocolo también está aprobado por el Comité Institucional de Bioseguridad del Centro de Investigación del Cáncer, Instituto Nacional del Cáncer, Institutos Nacionales de Salud. Antes de comenzar este protocolo, se recomienda que los usuarios busquen la aprobación de su comité institucional de cuidado y uso de animales y del comité institucional de bioseguridad.
1. Preparación del material de trabajo
NOTA: Todo el trabajo con el virus de la influenza debe realizarse en hielo en un gabinete de bioseguridad. Expulse las puntas y cualquier otra cosa que entre en contacto con el virus en un recipiente con lejía al 10%. Los cubos de hielo, las pipetas y las cajas de puntas deben rociarse con una solución de lejía al 10% en lugar de sumergirse. Incubar a temperatura ambiente durante al menos 30 min. Deseche los desechos sólidos en un contenedor de desechos de riesgo biológico y deseche los desechos líquidos por el fregadero, enjuagando con agua.
2. Dilución de alícuotas de virus para su uso en experimentos de infección intranasal
3. Transporte de alícuotas virales a instalaciones para animales
4. Administración de IAV a ratones
NOTA: Trabajar con el virus de la influenza en la instalación de animales requiere una instalación de nivel de seguridad ABSL2. El EPP estándar incluye uniformes médicos, una bata de laboratorio desechable, dos gorros para el cabello, guantes dobles de nitrilo, cubiertas dobles para zapatos, gafas protectoras (gafas de seguridad) y una máscara. El virus de la influenza diluido debe mantenerse en hielo durante todo el protocolo de administración para evitar la pérdida de infectividad.
5. Transporte de regreso al laboratorio
6. Seguimiento de ratones y procedimientos experimentales adicionales
7. Recolección de tejido pulmonar para enfoques posteriores
En comparación con los ratones no infectados tratados con PBS, los ratones infectados con IAV demostrarán daño tisular heterogéneo (Figura 1A). El daño tisular se puede cuantificar utilizando un algoritmo de agrupación de k-medias en MATLAB20 (Figura 1B). Los ratones infectados con IAV comenzarán a perder peso entre 3 y 4 días después de la infección. Con un título ideal, los ratones perderán entre el 20 y el 30% de su peso corporal inicial, y la pérdida de peso máxima se producirá entre 8 y 10 días después de la infección (dpi) (Figura 1C). A los 11-12 ppp, los ratones deberían haber comenzado a aumentar de peso y deberían volver a estar dentro del 10-15% de su peso corporal inicial a los 14 ppp. Para estudios de regeneración, es útil si la mayoría de los ratones en el experimento pierden peso y experimentan daño tisular pero no mueren. Sin embargo, debido a la heterogeneidad en el daño tisular (Figura 1A, B) y la posible variabilidad en la administración intranasal, es normal que varios ratones en un experimento no pierdan peso o experimenten daño tisular y que varios ratones pierdan >30% de peso corporal, lo que resulta en eutanasia (Figura 1D). Los experimentos que se esfuerzan por determinar una diferencia en la supervivencia y la pérdida de peso entre, por ejemplo, ratones con KO de un gen en particular y sus controles WT pueden necesitar ajustar el título y la dosis de IAV y deberán realizar un cálculo de potencia para determinar el tamaño de la muestra necesario para detectar tal diferencia en estos dos parámetros.
Además de los cambios en la estructura general del tejido y la salud del ratón, se producen cambios transcripcionales en todos los compartimentos celulares pulmonares en el transcurso de la respuesta del tejido al daño. Esto incluye tanto los estados celulares transitorios que finalmente se resuelven a medida que se repara el tejido, incluidos los estados celulares epiteliales transitorios o intermedios y los estados de células inmunitarias mieloides, como los estados celulares persistentes que no contribuyen a la reparación funcional, incluidas las células epiteliales Krt5+ y las células endoteliales TrkB+9. Por ejemplo, en el endotelio capilar del pulmón del ratón, surge un estado celular endotelial transitorio estimulado por interferón a 6 dpi, caracterizado por una alta expresión de genes estimulados por interferón (Figura 2A). Este estado se resuelve en 11-19 ppp (Figura 2A). A los 11 ppp surge un estado endotelial capilar inducido por lesión (iCAP), caracterizado por una alta expresión de Ntrk2 (TRKB), Sparcl1 y Bnip3 (Figura 2B). A diferencia del estado de las células endoteliales estimuladas por interferón, el estado de las células endoteliales iCAP persiste en regiones de tejido gravemente dañado y todavía está presente un año después de la infección (Figura 2C). Los estados celulares epiteliales alveolares transitorios, incluidas las células transicionales alveolares y los estados de células epiteliales alveolares inmaduras tipo I (AT1), también surgen después de la infección (Figura 2D). Finalmente, la infección da como resultado la pérdida de muchos macrófagos alveolares endógenos (aMAC_a) y su reconstitución tanto de monocitos inflamatorios (iMON) como de aMAC endógenos. Los macrófagos alveolares a 1 año de la infección tienen diferentes estados transcripcionales (aMAC_a y aMAC_b) dependiendo de su origen (Figura 2E)9. Los estados celulares transitorios y persistentes que surgen después de una lesión pulmonar aguda justifican un estudio adicional, ya que su comportamiento anormal dentro del nicho puede contribuir de manera productiva o negativa a la reparación exitosa del tejido y la función tisular posterior. Los datos de secuenciación de ARN unicelular se han publicado previamente9 y se depositan en el Gene Expression Omnibus como GEO: GSE262927.

Figura 1: Monitoreo de lesiones pulmonares y salud animal. (A) Tinción de hematoxilina y eosina (HE) de secciones de tejido pulmonar de un pulmón infectado (tratado con PBS) a la izquierda y un pulmón infectado con IAV a la derecha. En comparación con el pulmón no lesionado, el pulmón infectado por IAV muestra daño tisular heterogéneo. Barras de escala, 1 mm. (B) Utilizando un algoritmo de agrupación en clústeres de k-medias en MATLAB20, el daño tisular se puede caracterizar como grave (rojo), dañado (verde) o normal (azul). Es importante tener en cuenta que en el lóbulo pulmonar tratado con PBS a la izquierda, las estructuras de las vías respiratorias se clasifican como "graves" debido a la densidad y la intensidad de tinción de las células epiteliales de las vías respiratorias. Sin embargo, todavía es posible discernir fácilmente la diferencia entre los pulmones tratados con PBS e infectados por la influenza dada esta línea de base. Barras de escala, 1 mm. (C) Ejemplo de curva de pérdida de peso de un experimento representativo de infección por IAV en el que se recolectaron pulmones de ratón a los 13 días después de la infección (dpi). La curva contiene datos de seis ratones de tipo salvaje, y los puntos representan la media, mientras que las barras de error representan el error estándar de la media. (D) Ejemplo de curva de supervivencia de un experimento representativo de infección por IAV en el que se recolectaron pulmones de ratón a los 14 días después de la infección (dpi). La curva contiene datos de siete ratones de tipo salvaje. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.

Figura 2: Monitorización de los cambios en el estado de las células endoteliales capilares después de la infección por IAV. (A) Surge un estado de EC estimulado por interferón a 6 dpi que se resuelve entre 11-19 dpi. El nuevo análisis de los datos publicados de secuenciación de ARN unicelular de pulmones de ratón en varios momentos diferentes después de la infección por influenza muestra que la puntuación del módulo de interferón en todos los tipos de células endoteliales capilares es más alta a 6 dpi. Los datos se volvieron a analizar utilizando R, y la puntuación del módulo de interferón se basa en la expresión de 87 genes estimulados por interferón dentro de cada tipo de célula. CAP1, célula endotelial capilar tipo 1; iCAP, célula endotelial inducida por lesiones; CAP2, célula endotelial capilar tipo 2; EC, célula endotelial. (B) Por el contrario, un estado de CE inducido por lesiones caracterizado por la expresión de Ntrk2 (TRKB) surge a los 11 ppp y persiste hasta un año después de la infección. Barra de escala, 500 μm. (C) Los datos transcripcionales de la secuenciación de ARN unicelular de células endoteliales capilares pulmonares después de la infección por influenza demuestran la naturaleza dinámica del estado de las células endoteliales capilares durante la reparación de tejidos. (D) Las células epiteliales alveolares también experimentan plasticidad celular después de la infección por influenza. Un tipo de célula de transición alveolar surge entre 6-11 dpi y se resuelve en 19 dpi. Un estado de célula AT1 inmadura (AT1_c) surge a 11 ppp y persiste hasta 90 ppp. (E) Después de la infección, se pierden muchos macrófagos alveolares existentes (aMAC_a) y se observa una afluencia de monocitos inflamatorios (iMON) a 6 dpi. La población de macrófagos alveolares se reconstituye tanto por los aMAC existentes para regenerar la población aMAC_a como por los monocitos inflamatorios, que generan la población aMAC_b. Aunque ambos representan un estado de macrófagos alveolares, los aMAC resultantes se pueden distinguir transcripcionalmente. Los gráficos en (C-E) indican el porcentaje de células en cada población en cada punto de tiempo en el conjunto de datos longitudinal de infección por influenza y se generaron usando R. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Archivo complementario 1: Registro de lesiones de muestra, registro de peso y registro de puntuación de condición corporal (BCS) para monitorear animales después de la infección por influenza. Haga clic aquí para descargar este archivo.
Aquí, hemos informado de un método conveniente para transferir el virus de la influenza a ratones para iniciar un daño rápido y efectivo a los pulmones de ratón y estudiar los mecanismos de regeneración exitosa y reparación displásica. Demostramos que la inoculación intranasal de A/PR/8/34 IAV puede ser una técnica libre de estrés. Se necesitan menos de 2 minutos por ratón para completar la inoculación después de la anestesia con isoflurano. Es una técnica sencilla y no invasiva de inoculación viral que sigue la vía natural de la infección y permite estudiar la respuesta tanto del tejido como del sistema inmune de una manera más fisiológicamente relevante. El virus inoculado a través de las fosas nasales del ratón puede inducir inmunidad tanto mucosa como sistémica21. Más importante aún, el daño causado por la infección viral es claramente visible en cortes de tejido pulmonar teñidos con tinción de hematoxilina y eosina (HE)22 (Figura 1). Se ha publicado previamente una línea de tiempo completa de los cambios transcripcionales esperados en los tipos de células pulmonares en cada compartimento del pulmón9. Aquí, hemos vuelto a analizar un subconjunto de estos datos para demostrar que en los compartimentos inmunitarios endotelial, epitelial alveolar y mieloide capilar de los pulmones de ratón, se producen cambios transcripcionales transitorios y persistentes en el transcurso de la respuesta a la infección por influenza de ratones no infectados hasta un año después de la infección (Figura 2).
Hay varios pasos críticos en este protocolo, y la solución adecuada de estos pasos producirá un experimento exitoso. El virus de la influenza A/PR/8/34 es una cepa de influenza adaptada al ratón que no infecta productivamente a los humanos23, pero siempre es importante seguir todos los procedimientos de seguridad indicados durante el experimento para evitar cualquier posibilidad de infección del personal de laboratorio. La administración de anestesia con isoflurano es un paso crítico para garantizar la administración exitosa del virus, ya que los ratones no inhalarán bien el virus cuando estén despiertos. Verifique la respiración y controle el movimiento de la cabeza del ratón durante el procedimiento para asegurarse de que el virus esté inoculado en ambas fosas nasales. Si los ratones no están completamente anestesiados, se pueden generar burbujas, que limitan la inhalación del virus y generan aerosoles. Ambos resultados deben evitarse, y los ratones deben volver a colocarse en el cono nasal de isoflurano si se observan estornudos o burbujas en las fosas nasales. El monitoreo posterior a la infección, como medir la pérdida de peso, la puntuación de la condición corporal y el estado de salud, así como proporcionar un suplemento alimenticio de recuperación, también es un componente importante de este experimento. Si se observa que los ratones no pierden el peso adecuado o no tienen la cantidad esperada de daño tisular (Figura 1), es posible que la dosis sea demasiado baja; Por otro lado, si muchos ratones alcanzan el punto final de pérdida de peso corporal del 30%, es posible que la dosis sea demasiado alta. En cualquier caso, es mejor determinar la dosis adecuada a través de un título empírico de la cantidad de virus utilizando una cohorte de ratones C57BL / 6 como describimos aquí.
Dado que la infección por influenza sigue prevaleciendo en todo el mundo, causa enfermedades respiratorias graves y puede ser fatal, es de suma importancia comprender el proceso de infectividad viral y la respuesta celular a la infección y la lesión tisular en el pulmón. Por lo tanto, el método de infección intranasal descrito en este estudio puede ayudar en la identificación de importantes mecanismos reguladores y el desarrollo de nuevos enfoques terapéuticos para las enfermedades pulmonares. Además, las aplicaciones futuras de la técnica podrían utilizar una cepa diferente del virus de la influenza adaptado al ratón, como X31, para determinar los efectos sobre la estructura y función del tejido pulmonar en el caso de infecciones respiratorias repetitivas. Dado que muchas personas están sujetas a múltiples infecciones respiratorias a lo largo de su vida, tal extensión de este modelo podría tener implicaciones importantes para el estudio de la regeneración del tejido pulmonar y, por lo tanto, para la salud pública.
Los autores no tienen nada que revelar.
Esta investigación fue apoyada por el Programa de Investigación Intramuros de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) de EE. UU., Instituto Nacional del Cáncer, Centro de Investigación del Cáncer.
| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| 1,5 mL de tubo y nbsp; | Fisher Scientific | 02-682-557 | |
| 100 & micro; Colador de células M | Halcón | 352360 | |
| Tubo cónico de 15 mL | Halcón | 352196 | |
| 1x PBS | Gibc0 | 10010-023 | |
| 40 y micro; Colador de células M | Halcón | 352340 | |
| Tubo de 5 mL | Globo | 6101C | |
| Tubo cónico de 50 mL | Halcón | 352098 | |
| Material del virus de la gripe A/PR/8/34 | ATCC | VR-95PQ | Cada lote tiene distintos títulos virales |
| Búfer de lisis ACK | Calidad Biológico | 118-156-101 | |
| Anticuerpo anti-TRKB | R& Sistemas D | AF1494 | |
| Lejía | Clorox | Lejía al 10% | |
| Albúmina sérica bovina | Sigma Aldrich | A8022 | |
| Cámara de inducción de anestesia por CO2 | Cualquiera | N/A | |
| Colagenasa Tipo I | Gibco | 17100017 | |
| DAPI | Milipore Sigma | 28718-90-3 | |
| Dispasa | Corning | CB-40235 | |
| Herramientas de disección: tijeras, pinzas curvas, pinzas rectas | Cualquiera | N/A | |
| Dnase | Sigma Aldrich | 4716728001 | |
| D-PBS | Corning | 21-031-CM | |
| Etanol | Pharmco | 111000200 | |
| Frascos de vidrio | DWK Ciencias de la Vida | 986562 | |
| Cubo de hielo | Cualquiera | N/A | |
| Isoflurano | Covetrus | 29404 | |
| Agujas, 21 y guion; 23 G | Cualquiera | N/A | |
| pipeta P20/P200 & nbsp; | Pipetman | F144056M/F144058M, | |
| Puntas de pipeta P20/P200 | Thomas Scientific | 1159M43/1159M40 | |
| Paraformaldehído (PFA) y nbsp; | Termo Científica | J19943-k2 | 2%PFA |
| Pipetman | Cualquiera | N/A | |
| Cajas de congelador de plástico o cartón | Cualquiera | N/A | |
| Cuchilla de afeitar | Cualquiera | N/A | |
| Ring Stand | Cualquiera | N/A | |
| Pipetas serológicas, 5 mL | Halcón | 357543 | |
| Cámara de isoflurano para ratones de inducción con tapa deslizante | Somni Scientific | ||
| Sutura | Fisher Scientific | NC9422522 | |
| Tubos de jeringuilla y luer-locks | Cualquiera | N/A | |
| Jeringuilla, 10 mL | Cualquiera | N/A | |
| Máquina de anestesia de mesa Isoflurano | Ohmeda | Ohmeda Isotec- 4 | El caudal debería ser 2,5 y guiño; 3% |
| Agarosa de fusión ultrabaja | Sigma Aldrich | A5030-1G | |
| Balanza | OHAUS | CS200 |