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La matriz extracelular (MEC) es un andamiaje estructural y bioquímico fundamental que define las propiedades mecánicas de los tejidos y apoya sus funciones biológicas. Por ejemplo, los tejidos elásticos como los pulmones y las arterias están enriquecidos con ECM a base de colágeno y elastina, que proporcionan la resistencia mecánica necesaria para ciclos repetidos de estiramiento-retroceso durante la respiración. En cambio, el sistema nervioso central contiene ECM rica en glicosaminoglicanos que crea un entorno altamente complaciente optimizado para la diferenciación neuronal y laseñalización 1. En diversos tejidos del cuerpo, la rigidez tisular abarca varios órdenes de magnitud, que van desde cientos de pascales en tejidos blandos como el cerebro y los pulmones hasta niveles de rigidez en megapascal y gigapascal en tendones y huesos,respectivamente 2,3. Estas diferencias mecánicas no son solo estructurales, sino que también desempeñan un papel fundamental en la regulación del comportamiento celular 4,5. Por ejemplo, las células madre mesenquimales sufren una especificación de linaje dependiente de la rigidez, adoptando destinos neuronales en sustratos blandos, destinos miogénicos en sustratos intermedios y destinos osteogénicos en sustratosrígidos 6. Las alteraciones patológicas en la rigidez de la MCE también pueden impulsar respuestas celulares aberrantes y contribuir al inicio y progresión de la enfermedad 7,8,9. De manera similar, los cambios en las propiedades de la ECM alrededor de las células también alteran la función de los orgánulos y varios comportamientoscelulares 10,11. A pesar de la reconocida importancia de la ECM para guiar la señalización, la función de los orgánulos y la patogénesis de la enfermedad, los mecanismos por los que las células detectan y transducen las señales de ECM en señales bioquímicas siguen siendo incompletamente comprendidos.
El progreso en la comprensión de la diafonía célula-ECM se ha visto obstaculizado en parte por la limitada disponibilidad de plataformas experimentales que ofrecen un control preciso sobre las propiedades de la ECM y que permanecen totalmente compatibles con los ensayos bioquímicos estándar y los flujos de trabajo de imagen. Además, estudiar las interacciones célula-ECM suele percibirse como técnicamente complicado, ya que requiere experiencia interdisciplinar que abarca ciencia de materiales, biología celular y bioingeniería. Este método pretende abordar estos desafíos proporcionando protocolos paso a paso para generar sustratos ECM basados en PA y silicona con propiedades mecánicas definidas, que pueden prepararse fácilmente en la mayoría de entornos de laboratorio húmedo.
Los hidrogeles PA con rigidez ajustable son elementos básicos de la mecanobiología; sin embargo, su utilidad suele verse obstaculizada por el alto coste de los reactivos para la conjugación de ECM, la funcionalización superficial inconsistente y la escasa compatibilidad con flujos de trabajo bioquímicos a gran escala. Además, no están bien establecidos enfoques prácticos y estandarizados para la obtención de muestras e imágenes en sustratos de rigidez variable. Estos cuellos de botella pueden abordarse utilizando nuestra plataforma de gel PA descrita, caracterizada por cuatro innovaciones clave: (i) reducción sustancial de costes, (ii) química de funcionalización reproducible, (iii) producción escalable mediante hardware reutilizable y (iv) integración perfecta con muchos ensayos convencionales de biología celular y bioquímica. Este enfoque utiliza diferentes proporciones de acrilamida y bisacrilamida para generar hidrogeles con propiedades mecánicas distintas (Tabla 1). Los geles de PA son inertes y no se conjugan directamente con las proteínas ECM. Por ello, se utiliza una reacción de polimerización de radicales libres iniciada por los rayos UV para conjugar una fina red entrecruzada de tetraacrilato de di(trimetilopropano), éster de ácido acrílico N-hidroxisuccinimida (NHS-acrilato) y bisacrilamida sobre la superficie de los geles de PA (Figura 1). Esta red crea una superficie adhesiva de doble acción para las proteínas ECM: el NHS-acrilato proporciona un anclaje covalente estable para las proteínas ECM, mientras que el tetraacrilato facilita la adsorción uniforme de proteínasECM 12. Además, proporcionamos métodos que demuestran cómo extraer proteínas y ácidos nucleicos como el ARN de estos sustratos de manera compatible con análisis de biología celular posteriores como western blotting y reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa por transcripción inversa (RT-qPCR). Además, los sustratos PA cumplidores resultantes también apoyan la formación y posición de esferoides dentro de un plano focal consistente, lo que permite un análisis sistemático de comportamientos celulares 3D13.
En contraste, las limitaciones ópticas de los hidrogeles PA limitan su uso en modalidades avanzadas de imagen, especialmente en la microscopía de fluorescencia de reflexión interna total (TIRF) 14. Para abordar esta limitación, desarrollamos sustratos ECM a base de silicona mecánicamente sintonizables optimizados para la imagen TIRF. Estos materiales presentan un índice de refracción estrechamente similar al del vidrio, manteniendo la rigidez sintonizable en un amplio rango (Figura 2A). Una capa fina de gel de silicona, con diferentes proporciones de piezas, se aplica por centrifugación sobre un vaso de cubierta antes de la conjugación de ECM (Figura 2B y Tabla 2). Sin embargo, la hidrofobia intrínseca y la inercia química de la silicona impiden la conjugación directa de la ECM. Por ello, implementamos una estrategia de modificación superficial para permitir la unión covalente de ligandos ECM. El tratamiento con plasma de oxígeno introduce grupos hidroxilo en la superficie de la silicona (Figura 2C). Posteriormente, el (3-aminopropil)trietoxisilano (APTES) convierte estos grupos hidroxilo en amina reactiva. El 1-etil-3-(3-dimetilaminopropilo) carbodiimido cloruro (EDC), un entrecruzador de carbodiimida de longitud cero, facilita la formación de enlaces amida covalentes entre los grupos aminas en la superficie del gel y los grupos carboxilo en las proteínas ECM.
En conjunto, estas plataformas ECM proporcionan sistemas rentables, reproducibles y escalables para sondear mecanismos de señalización dependientes de la rigidez del ECM. Su flexibilidad permite una integración fluida con ensayos bioquímicos, imágenes de alta resolución y flujos de trabajo de alto rendimiento, lo que permite investigar cómo la rigidez de la ECM influye en el comportamiento celular y favorece la progresión de la enfermedad.