Artículo de revisión

Estandarización en la caracterización analítica de vectores de virus adenoasociados (AAV)

DOI:

10.3791/71152

10 de julio de 2026

En este artículo

Resumen

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La terapia génica con virus adenoasociado (AAV) requiere Materiales Estándar de Referencia (RSMs) bien caracterizados para garantizar mediciones analíticas precisas y reproducibles dentro y entre laboratorios. Esta revisión examina la necesidad crítica de los RSM, evalúa los estándares comerciales y farmacopeicos disponibles, y proporciona estrategias prácticas para el desarrollo interno de RSM que avancen en terapias AAV seguras y eficaces.

Resumen

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El virus adeno-asociado (AAV) se ha convertido en un vector líder para la terapia génica in vivo, con ocho productos actualmente autorizados para su comercialización. A medida que el campo evoluciona rápidamente, la necesidad de métodos analíticos robustos para caracterizar atributos críticos de calidad (CQAs) —incluyendo el título de la cápside, el título del genoma, el contenido de la cápside (relación vacía/completa), la identidad y la pureza— sigue creciendo. Los Materiales Estándar de Referencia (RSM) desempeñan un papel fundamental al proporcionar lotes AAV bien caracterizados y estandarizados que sirven como referencias universales. Los RSM facilitan la validación de tecnologías analíticas emergentes, garantizan la precisión y reproducibilidad de los ensayos rutinarios y permiten la comparabilidad interlaboratorio. Sin embargo, el desarrollo de RSM AAV universales está fundamentalmente limitado por la compleja biología, la diversidad de serotipos, genomas vectoriales y variantes de cápsides diseñadas, lo que hace necesarias normas específicas de serotipo y aplicación. Los avances recientes, incluyendo la publicación de estándares farmacopédicos de referencia AAV8 caracterizados por múltiples métodos ortogonales, representan un avance significativo hacia la armonización de la medición. Esta revisión aborda la necesidad crítica de los RSM en la terapia génica AAV, evalúa los estándares farmacopeicos y comerciales actualmente disponibles, y describe estrategias prácticas para el desarrollo interno de RSM. Establecer RSMs AAV robustos y específicos para serotipo y protocolos operativos estándar (SOP) armonizados es esencial para avanzar en la terapia génica de AAV y garantizar la precisión, reproducibilidad y seguridad en la investigación, desarrollo y fabricación clínica.

Introducción

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La terapia génica ofrece una estrategia transformadora para tratar enfermedades genéticas y adquiridas mediante la entrega de material genético funcional a las células del paciente para corregir o regular la expresión génica. Entre ellos, los virus adenoasociados (AAVs) destacan por sus aplicaciones in vivo debido a su diversidad de tropismo tisular en diferentes serotipos y la expresión sostenida de transgenesepisómicos 1.

Los AAV son virus compactos (~25 nm de diámetro) de ADN del género Dependoparvovirus de la familia Parvoviridae . Estos virus no son patógenos y defectuosos en replicación, requiriendo virus auxiliares como adenovirus o virus del herpes simplex para sureplicación 2. El genoma AAV tiene dos genes, rep y cap, flanqueados por dos repeticiones palindrómicas de 145 pares de bases conocidas como repeticiones terminales invertidas (ITRs)3. Los vectores AAV recombinantes (rAAV) se generan reemplazando secuencias codificantes virales por casetes terapéuticos que contienen un promotor, transgén y elementos reguladores flanqueados por ITRs. Durante la producción, los genes rep y cap se administran en trans, facilitando la replicación y el empaquetado del casete terapéutico en cápsides virales y produciendo partículas no integradoras y deficientes en replicación que mantienen una capacidad de transducción robusta mientras previenen la replicación viralsalvaje 4. Ocho terapias génicas basadas en rAAV han recibido autorización de comercialización de la Agencia Europea de Medicamentos (EMA) o de la Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA), y los ensayos clínicos con AAV están en aumento. A enero de 2025, se habían registrado 343 ensayos clínicos de AAV a nivel mundial, lo que representa un aumento del 34% respecto a los 255 ensayos a mediados de 2022. Esta rápida expansión clínica intensifica la necesidad de un control de calidad riguroso para garantizar la seguridad delpaciente 6.

Garantizar que los productos rAAV sean seguros y eficaces para el uso humano requiere una caracterización exhaustiva de los atributos críticos de calidad (CQAs), incluyendo cantidad, potencia, pureza, identidad, seguridad y estabilidad. Sin embargo, la caracterización de AAV sigue siendo inherentemente desafiante debido a la complejidad estructural de estos vectores. Los AAVs son partículas icosaédricas compuestas por tres proteínas cápsides virales (VP1, VP2, VP3), ensambladas en una proporción aproximada de 1:1:10, y las variaciones en el ensamblaje proteico pueden afectar la eficiencia de latransducción 7. La carga útil terapéutica de ADN debe ser empaquetada en el cápside con alta fidelidad; las poblaciones de cápsides heterogéneas se generan inherentemente durante la producción de rAAV, consistiendo en cápsides que contienen un genoma completo (cápsides completas), un genoma parcial (cápsides parcialmente llenas) o sin material genético (cápsides vacías). A esta complejidad se suma que diferentes serotipos de VA presentan eficiencias de empaquetado, tropismos tisulares y perfiles inmunológicos distintos, lo que hace necesaria la elaboración de ensayos adaptados al serotipo. Más allá de estos desafíos biológicos, existe un problema crítico en cómo se realizan las mediciones. Diferentes laboratorios utilizan distintos ensayos, protocolos y enfoques de análisis de datos para medir la misma CQA. Como resultado, los valores reportados para muestras idénticas pueden variar en órdenes de magnitud entre los sitios8. Incluso dentro de un solo laboratorio, los cambios a lo largo del tiempo en los reactivos, instrumentos, operadores o entornos de análisis pueden provocar cambios en los resultados respecto al mismolote 9. Cuando las mediciones no son comparables, establecer asociaciones fiables entre las CQAs y los resultados preclínicos o clínicos se vuelve complicado, lo que complica la toma de decisionesregulatorias 10,11.

La estandarización pretende abordar este problema asegurando la comparabilidad de las medidas. En la analítica farmacéutica, la estandarización abarca dos aspectos clave: el uso de materiales estándar físicos de referencia (RSM) comunes y la adhesión a procedimientos operativos estándar detallados y armonizados (SOPs), asegurando que diferentes laboratorios midan de forma consistente el título, la identidad, la calidad, la potencia y la pureza12. Los RSM son muestras bien caracterizadas que actúan como referencias. Al validar ensayos contra el mismo RSM, los laboratorios anclan sus mediciones a un punto de referencia común. Esto reduce la variabilidad entre laboratorios y permite comparar de forma fiable los resultados de diferentes estudios, productos y centros de fabricación13. Además, también actúa como un control interno para monitorizar el rendimiento del ensayo y monitorizar la consistencia a lo largo deltiempo 14. Además, los procedimientos operativos estándar garantizan que los métodos analíticos se ejecuten de forma coherente entre laboratorios, minimizando la variabilidad derivada de diferencias en el pretratamiento de la muestra, instrumentación, estrategia de calibración, procesamiento de datos y prácticadel operador 8,9,12. Juntos, estos dos componentes forman la base de un sólido marco de estandarización analítica.

Esta revisión aborda sistemáticamente los aspectos clave de la estandarización en la analítica de AAV. Examinamos los tipos de RSMs y sus aplicaciones analíticas, evaluamos los RSM específicos de AAV actualmente disponibles para su idoneidad para su propósito, y proporcionamos orientación práctica consolidada para la producción, purificación, caracterización y almacenamiento interno de RSM. Además, identificamos los desafíos actuales en la fabricación y las limitaciones analíticas. Reconociendo que los RSM por sí solos no son suficientes, también discutimos los SOP armonizados como un componente complementario e igualmente importante de la estandarización. En conjunto, esta revisión está destinada a ser una referencia práctica para científicos analíticos, profesionales de la calidad y fabricantes que buscan avanzar en la armonización de la medición y apoyar la toma de decisiones regulatorias basadas en la ciencia en la terapia génica AAV.

Revisión y perspectiva

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1. RSM: definiciones y necesidad

Los RSM se organizan jerárquicamente, con dos tipos principales: RSM primarios y secundarios. Según la Guía ISO 30, un estándar primario se define como un "estándar designado o ampliamente reconocido como poseedor de las mayores cualidades metrológicas y cuyo valor es aceptado sin referencia a otros estándares de la misma magnitud, dentro de un contexto especificado". Por ejemplo, los RSM de la Farmacopea de los Estados Unidos (USP), Farmacopea Europea (Ph. Eur), Farmacópea Británica (BP), etc., que han sido ampliamente caracterizados mediante estudios multilaboratorio, califican como RSM primaria. Posteriormente, los fabricantes individuales utilizan estos RSM primarios para calibrar y calificar sus propios materiales de referencia de trabajo propietarios, que sirven como RSMs secundarios para pruebas rutinarias de controlde calidad 12,15. Por ello, la ISO define un RSM secundario como un "estándar cuyo valor se asigna mediante la comparación con un estándar primario de la misma cantidad". Este enfoque jerárquico garantiza la trazabilidad: las mediciones internas se remontan a estándares primarios, que a su vez se caracterizan mediante métodos analíticos de última generación16. El uso de RSMs proporciona referencias comunes que permiten a los fabricantes calibrar y validar sus métodos analíticos hasta el mismo punto de referencia, lo que conduce a mediciones más precisas. Por ello, las autoridades reguladoras fomentan el uso de RSMs primarios para calibrar los RSM internos y validar métodos de prueba, mejorando la consistencia en toda la fabricación deAAV 17,18. Esto permite la estandarización entre diversas técnicas analíticas, lo que conduce a una mejor comparación de los resultados de caracterización de rAAV entre laboratorios y diferentesproductos 17,19. La mejor comparabilidad mejora la comprensión de los riesgos de seguridad potencialmente asociados a dosis elevadas o impurezas relacionadas con el producto, como cápsides vacías y parcialmente llenas. En última instancia, estos conocimientos pueden informar la formulación de políticas regulatorias basadas en la ciencia, como un umbral mínimo de cápsides completas, análogo al criterio del ≥70% de células viables para terapias celulares somáticas, contribuyendo así a productos de terapia génica más seguros yfiables 13,20,21.

Para rAAV, varias CQAs ilustran claramente la necesidad de estandarización. El título del genoma del vector determina directamente la dosis del paciente; Títulos inexactos corren el riesgo de subdosis o sobredosis. La PCR cuantitativa (qPCR) y la PCR digital (dPCR) se utilizan ampliamente para medir el título, pero los resultados pueden diferir para la misma muestra si se utilizan diferentes calibrantes o protocolos de curva estándarinternos 11. El contenido de cápsides (la proporción de cápsides llenas, parcialmente llenas y vacías) es otra CAQ crítica, ya que las cápsides vacías y parcialmente llenas pueden contribuir a la inmunogenicidad o reducir la eficacia6. Se utilizan más de diez técnicas diferentes para medir el contenido de la cápside, incluyendo ultracentrifugación analítica (AUC), cromatografía de exclusión por tamaño acoplada a dispersión de luz multiángulo (SEC-MALS), fotometría de masas (MP), espectrometría de masas por detección de carga (CDMS), microscopía electrónica (EM), cromatografía de intercambio aniónico (AEX), enfoque isoeléctrico capilar (cIEF), espectroscopía ultravioleta-visible (UV/Vis), etc. Además, el contenido de cápsides suele estimarse indirectamente utilizando la proporción entre el título del genoma del vector y el título de la partícula viral, determinada por qPCR o dPCR y ELISA, respectivamente (PCR/ELISA)22. Cada técnica mide diferentes propiedades físicas y puede informar de distintos valores de contenido de la cápside para las mismas muestras. Un estudio interlaboratorio reciente del NIST que comparó UV/Vis, AUC, SEC-MALS y PCR/ELISA demostró una variabilidad significativa entre métodos e interlaboratorios, con PCR/ELISA mostrando una reproducibilidad particularmente baja y AUC mostrando una divergencia significativa entre laboratorios a pesar de ser ampliamente considerado un métodode referencia 8. Estos hallazgos indican que reducir la variabilidad en la analítica de la AAV requiere tanto RSMs compartidos como flujos de trabajo analíticos armonizados, como se discute en la Sección 5.

2. paisaje de RSM rAAV

Los esfuerzos para establecer RSMs para AAV han dado lugar a dos fuentes que proporcionan RSMs AAV primarios. Entre las fuentes farmacopéicas, la USP es actualmente el único proveedor de RSM primario de AAV. Más allá de los USP, los RSM AAV primarios también están disponibles en la American Type Culture Collection (ATCC). También está disponible una gama creciente de RSMs secundarios comerciales para múltiples serotipos, reflejando los esfuerzos continuos de la comunidad para abordar la falta de estandarización inherente a la caracterización de los AAV. La Tabla 1 resume los materiales actualmente disponibles para el RSM de AAV y sus características clave.

  1. Normas ATCC
    El primer esfuerzo internacional para establecer RSMs para rAAV comenzó en 2010, cuando el Grupo de Trabajo de Estándares de Referencia de AAV (AAVRSWG) produjo RSMs primarios para rAAV2, seguido por rAAV8 en 2014. Esta organización de voluntarios incluía miembros de cinco organizaciones industriales, 13 universidades, la Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA), el Instituto Nacional de Salud (NIH) y la Williamsburg Bioprocessing Foundation (WilBio), representando a cuatro países: Estados Unidos, Francia, Alemania y Japón. Los RSM primarios estaban destinados a servir como estándares comunitarios para facilitar la comparación interlaboratorio de dosis entre estudios no clínicos y clínicos. Se anima a los investigadores a informar de los títulos relacionados con este RSM primario al publicar o enviar datos a las autoridades sanitarias. La producción tenía como objetivo lograr un título final de 1 × 1012 genomas vectoriales por mililitro (vg·mL-1) y obtener aproximadamente entre 5.000 y 10.000 viales con 0,5 mL cadauno de 19. Los materiales se caracterizaron para el título del genoma del vector (qPCR), título de partículas (ELISA), título transductor (microscopía de fluorescencia), título de partículas infecciosas (TCID50), pureza (electroforesis en gel de dodecilo sulfato de sodio-poliacrilamida (SDS-PAGE)) e identidad del vector (electroforesis en gel) mediante un estudio multilaboratorio que involucró a 16 laboratorios en todo el mundo. Además, se evaluaron micoplasma, biocarga, esterilidad y endotoxinas para garantizar la seguridad delproducto 23,24,25. En la Sección 4 se presenta una visión general detallada de la caracterización analítica de la AAV, incluyendo los ensayos clave y la información que proporciona cada ensayo.
    Aunque los RSM del ATCC fueron materiales pioneros en el campo de los AAV, su utilidad está limitada por el hecho de que se produjeron hace más de una década, antes de que muchos enfoques analíticos actuales para la caracterización de los AAV fueran ampliamente adoptados. Por ejemplo, la caracterización original no incluía el perfilado de cápside vacío/completo, lo que limita su aplicabilidad directa para estandarizar el análisis de contenido de cásside, ahora considerado una CQA importante para rAAV. Además, se informó de una variabilidad interlaboratorio considerable para el título del genoma del vector, el título de la cápside y el título infeccioso a pesar del uso de protocolos y reactivos compartidos, lo que subraya que los materiales comunes por sí solos no garantizan mediciones armonizadas, y que los ensayos más maduros con SOPs detallados son igualmente importantes. Según la información actual de los proveedores, la disponibilidad de estos materiales también está restringida, lo que podría limitar aún más la implementaciónmás amplia 11. Según la información actual de productos de los proveedores, la disponibilidad de estos materiales está limitada a 3 viales por cliente al año para AAV2 (ATCC VR-1616), con el suministro registrado como reposición pendiente, y 12 viales por cliente al año para AAV8 (ATCC VR-1816). Estas restricciones limitan necesariamente el uso más amplio y rutinario de estos materiales como RSMs a nivel comunitario26,27.
  2. Estándares USP
    En cuanto a iniciativas farmacopéicas, la USP es actualmente la única organización que ha producido RSMs primarios para AAV. Los siguientes datos de caracterización se basan en las notas de aplicaciónde USP 28, 29, 30. En 2025, el USP lanzó AAV8 RSM para cápsides completas y vacías en un esfuerzo por estandarizar la analítica de contenido de cássidos. Para lograrlo, la USP estableció RSMs con altas concentraciones (> 3,0E+12 de título de partículas virales por mililitro (vp·mL-1)) y volúmenes sustanciales (300 μL), permitiendo su aplicación en diversos enfoques analíticos de contenido de cápsides. Se realizó un estudio colaborativo integral entre laboratorios para evaluar completamente el RSM del AAVA DE USP y garantizar la precisión y precisión de las mediciones. Este estudio implicó cinco laboratorios independientes y empleó varias técnicas analíticas de contenido de cápsides: AUC, SEC-MALS, CD-MS, MP y UV/Vis. Se aplicaron métodos adicionales de caracterización biofísica a las muestras de AAV, incluyendo mapeo de péptidos, secuenciación de nueva generación (NGS), dPCR y electroforesis en gel capilar (CGE), proporcionando datos adicionales de caracterizaciónde partículas 28.
    Además, USP desarrolló un control cuantitativo basado en AAV5 por PCR que contiene potenciador de citomegalovirus (CMV), promotor de β-actina (CBA) de pollo, proteína fluorescente verde (GFP) y señal de poliadenilación del virus simio 40 (SV40), destinado a usarse como calibrante estándar de curvas o control de ensayos en mediciones de títulos genómicos. El contenido de la cápside fue determinado por SEC-MALS, mientras que el título del genoma viral se cuantificó mediante dPCR dirigido a múltiples secuencias. Un estudio multilaboratorio de dPCR, que incluyó 4 laboratorios, reveló que dirigir SV40 produjo una menor variabilidad interlaboratorio (CV 11,2%) en comparación con la segmentación ITR (CV 36,1%), probablemente debido a la interferencia de la estructura secundaria ITR. En consecuencia, el valor de referencia asignado se basa en el título objetivo SV40 y es igual a 7 x 1010 vg·mL-1,32. En cuanto a materiales de referencia para ensayos de títulos de capsida, USP proporciona materiales de referencia de títulos de capsid para AAV1, AAV5, AAV8 y AAV9. Estos materiales, caracterizados por SEC-MALS para cuantificación absoluta de partículas de la cápside y que van desde 1x1011 hasta 1x1012 vg·mL-1, pueden servir como calibrantes de curva estándar o controles positivos en ensayos de títulosde cápside 30.
  3. Normas comerciales
    Varias empresas comerciales ofrecen RSMs AAV completos y vacíos para múltiples serotipos, por ejemplo, PROGEN, AAVnergene y Revvity; Los siguientes datos de caracterización y especificaciones del producto se basan en la información proporcionada por el proveedor, incluyendo hojas de producto y notasde aplicación 31,32,33,34,35. Como RSM secundarios, estos materiales se comparan frecuentemente con los RSM del ATCC. En comparación con los RSM farmacopéicos, estos RSM cubren una gama más amplia de serotipos, con ciertos proveedores suministrando AAV1–13 y variantes diseñadas. Los RSM comerciales se caracterizan típicamente por atributos básicos de calidad como el título de la cápside (por ELISA o SEC-MALS), el título del genoma del vector (por qPCR o dPCR) y el contenido de la cápside (a menudo mediante un solo método analítico).
    Sin embargo, algunos de estos materiales comerciales solo están disponibles en pequeñas cantidades, lo que limita su uso para el desarrollo extensivo de métodos de diferentes ensayos o estudios multisitio. Además, falta una caracterización extensa mediante un estudio colaborativo multilaboratorio que involucre múltiples técnicas ortogonales, incluida la evaluación de estabilidad, lo que limita la confianza en los valores asignados y la aplicabilidad interlaboratorio. A pesar de estas limitaciones, los RSM comerciales desempeñan un papel importante en el desarrollo, validación y optimización de procesos de ensayos, y pueden actuar como RSMs provisionales cuando los RSM primarios no están disponibles para serotipos específicos.
    Algunos proveedores están trabajando hacia protocolos de caracterización más rigurosos y una mayor transparencia para mejorar la utilidad de sus ofertasRSM 36,37.
  4. Estándares internos
    Los laboratorios individuales también pueden desarrollar RSMs internos, una estrategia que se emplea a menudo para productos AAV únicos, como serotipos modificados por cápsides o constructos genómicos virales específicos. También pueden preferirse los RSM internos para reducir costes, ya que los materiales de referencia secundarios primarios y comerciales pueden ser costosos. Cuando sea posible, estos RSMs internos deben compararse con los RSM primarios para ser utilizados posteriormente en el desarrollo del ensayo, validación, pruebas rutinarias durante la fabricación o control de calidad. Se aplican varias consideraciones importantes al utilizar RSMs internos: estos materiales deben estar completamente caracterizados, reservar cantidades suficientes y establecer protocolos para monitorizar la estabilidad a lo largo del tiempo. Además, la planificación para la producción de nuevos lotes de RSM es fundamental, incluyendo la retención de suficiente material del lote anterior para cubrir mediciones y garantizar la continuidad durante todo el desarrollodel producto 20. En la sección 3, se ofrece una visión detallada de las estrategias para la producción interna de RSM, cubriendo procesos aguas arriba y aguas abajo, así como la caracterización analítica. En conjunto, estos enfoques ofrecen un marco práctico para generar RSMs internos.

3. Estrategias de fabricación de RSM:

Producir RSM AAV de alta pureza presenta desafíos inherentes. Lograr preparaciones de cápside 100% vacías se complica por el hecho de que las cápsides "vacías" pueden contener material genético residual. De manera similar, obtener preparaciones puras de cápsides completas resulta difícil porque las cápsidas vacías y parcialmente llenas comparten características físicas similares y se co-purifican con las cápsidas completas durante los procesosde separación 10. A pesar de estos desafíos, los avances significativos en la tecnología de producción permiten ahora el enriquecimiento de poblaciones de cápsides predominantemente llenas o mayormente vacías. La siguiente sección ofrece una visión completa de las tecnologías actuales de producción y separación, así como de los métodos de caracterización y condiciones de formulación que pueden emplearse para producir, caracterizar y almacenar los RSM AAV.

  1. Procesamiento ascendente
    El rAAV, como otras bioterapias, debe producirse en células vivas, utilizando habitualmente transfección transitoria o plataformas basadas en infecciones virales. El enfoque dominante para material de grado clínico es la transfección transitoria por triple plásmido en células de suspensión HEK293, utilizando tres plásmidos separados para el transgen flanqueado por ITR, los genes rep/cap y funciones auxiliares; Este sistema flexible y libre de virus ayudantes soporta la rápida intercambiabilidad de serotipos y transgenes y se utiliza en la mayoría de los programas clínicos y productosaprobados 38. Sin embargo, los costes del ADN plasmidico aumentan considerablemente a medida que la producción crece, lo que representa una desventaja significativa. Para reducir los costes de materia prima, los sistemas de producción se han simplificado de tres plásmidos a dos (genes rep/cap/helper en un plásmido, transgenes en otro) o uno (con todos los genes en un solo plásmido)39,40. Las células HEK293 pueden cultivarse en formatos adherentes o de suspensión con productividad comparable, aunque se prefiere el cultivo en suspensión por suescalabilidad 41.
    Las plataformas alternativas de producción incluyen el Sistema de Vectores de Expresión de Baculovirus (BEVS) en células de Sf9 u otras células de insectos, líneas celulares productoras estables, sistemas basados en virus del herpes simplex y sistemas de expresión inducible. Cabe destacar que diferentes plataformas de producción pueden producir proporciones significativamente distintas de vacío/lleno incluso para el mismo serotipo, con un porcentaje reportado que oscila entre el 8% y más del 39% dependiendo de la plataforma y del serotipo AAV específicoempleado en 42.
    Seleccionar la plataforma de producción adecuada y optimizar las condiciones aguas arriba para la generación de RSM requiere una cuidadosa consideración de la población objetivo de la cápside. Con respecto a la transfección transitoria HEK293, el sistema de producción más utilizado para material clínico y los RSMs actualmente disponibles (Tabla 1), se pueden optimizar varios parámetros de proceso para mejorar tanto el rendimiento como la relación vacío/capsid completo. Para los RSM de cápsides completas, la optimización de procesos aguas arriba busca maximizar la eficiencia del rendimiento y del empaquetado del genoma para minimizar la formación parcial o vacía de la cápside, ya que la relación inicial vacía/lleno en el lisato de crudo impacta directamente en la relación vacía/llena aguas abajo. Los parámetros clave incluyen la densidad celular en la transfección, las proporciones molares de plásmidos, la proporción entre el reactivo de transfección y el ADN, el momento de la cosecha, los aditivos de pequeñas moléculas (por ejemplo, agentes de detención del ciclo celular) y el diseño de casetestransgénicos 40,43,44,45,46.
    Los RSM vacíos de la cápside suelen producirse omitiendo el plásmido del transgénico durante la transfección, evitando el empaquetado del ADN tras el ensamblaje de la cápside. Sin embargo, en la práctica, estas preparaciones "vacías" a menudo aún contienen ADN contaminante, lo que las hace compositivamente heterogéneas y pone de manifiesto la necesidad de una caracterización analíticaexhaustiva 47,48.
  2. Procesamiento aguas abajo
    El proceso aguas abajo (DSP) incluye la cosecha, clarificación y purificación del vector para obtener un producto AAV altamente puro, asegurando al mismo tiempo un alto rendimiento vectorial y una relación óptima vacía/lleno. El procesamiento aguas abajo comienza 72 horas después de la transfección, con lisis celular para recuperar los rAAVs intracelulares49. Aunque la salida viral varía según el serotipo, la lisis celular garantiza una recuperación intracelular completa50. La lisis se logra mecánicamente mediante ciclos de congelación-descongelación o químicamente utilizando tampones a base de detergente (por ejemplo, Triton X-100, Tween-20/80, CHAPS), preferiéndose métodos químicos para mejorar la escalabilidad49,51. El tratamiento con nucleasas (por ejemplo, la Benzonasa) durante la lisis degrada los genomas vectoriales no capsidados y el ADN plásmico contaminante, evitando el sesgo en la titulación genómica y reduciendo la viscosidad del ADN para los siguientes pasos de la DSP. Un tampón de lisis común para rAAV derivado de HEK293 es 50 mM Tris-HCl (pH 8,0), 150 mM NaCl, 0,1% Triton X-100 y Benzonasa 25–50 U.mL-1,51. El lisado se clarifica entonces mediante filtración en profundidad o centrifugación para eliminar los restos celulares. La filtración tangencial de flujo (TFF) concentra entonces la cosecha y cambia el tampón por la purificación aguas abajo, aunque este paso puede omitirse si el paso de purificación aguas abajo puede manejar grandes volúmenes. La purificación posterior se realiza mediante métodos de ultracentrifugación (UC) o cromatografía52.

    La UC de densidad de gradiente, más comúnmente a través del gradiente de cloruro de cesio (CsCl) o yodixanol, se ha empleado tradicionalmente para la purificación de rAAV, proporcionando alto rendimiento y una separación efectiva de los cápsides completos de impurezas relacionadas con el proceso y el producto53. Aunque la UC ofrece independencia serotípica y alta pureza, presenta carencias significativas, como el manejo manual, escalabilidad limitada para grandes volúmenes y procesamiento intensivo en mano de obra. La cromatografía en columna ha surgido como una alternativa preferida, ofreciendo escalabilidad, tiempos de procesamiento más rápidos y capacidad de automatización, y se ha aplicado con éxito para la producción de rAAV y RSM de grado clínico. La cromatografía en columna para rAAV se realiza típicamente en dos pasos secuenciales: captura y pulido52,54.

    La cromatografía de afinidad es el paso principal de captura, utilizando ligandos inmovilizados en resinas para unirse a los cápsidos AAV mientras se eliminan la mayoría de las impurezas relacionadas con el proceso. Fragmentos de anticuerpos de dominio único (VHH) se han convertido recientemente en la opción preferida de ligando debido a su versatilidad entre serotipos y su alta especificidad. Las columnas basadas en anticuerpos más utilizadas incluyen POROS CaptureSelect AAVX, AVB Sepharose High Performance y Capto AVB51. POROS CaptureSelect AAVX ofrece la mayor especificidad, uniéndose a AAV1–9, rAAV-10 y variantes diseñadas, lo que lo hace adecuado para una purificación serotípica55​. Se emplea comúnmente para la mayoría de las purificaciones comerciales de RSM rAAV (Tabla 1). Dado que las columnas de afinidad no pueden diferenciar entre cápsidos llenos y vacíos, dado que los epítopos están presentes en ambas variantes, se emplea un paso adicional de pulido. El paso de pulido suele emplear cromatografía de intercambio aniónico (AEX) para separar capsids llenos y vacíos. Este método aprovecha la ligera diferencia en punto isoeléctrico (pI) entre poblaciones de cápsidos completas (~5,9) y vacías (~6,3)52. Existen tres formatos de fase estacionaria disponibles comercialmente: resinas empaquetadas, monolitos y columnas de membrana53. Los datos comparativos de rendimiento en los tres formatos para AAV son limitados. Sin embargo, los monolitos y columnas de membrana soportan caudales basados en convección más altos, lo que los hace preferidos a escalas mayores donde es crítico reducir el tiempo de procesamiento. Las resinas empaquetadas se basan en transferencias de masa limitadas por difusión y una mayor contrapresión, lo que limita los caudales56,57. Una lista de columnas de AEX disponibles comercialmente puede encontrarse en una reseña de Jungbauer et al.51. Para la elución, los gradientes de sal escalonados son cada vez más preferidos frente a gradientes de sal continuos superficiales porque los escalones fijos de sal son menos sensibles a las variaciones instrumentales (mezcla de bombeo, caudal) que los gradientes que cambian continuamente, mejorando la reproducibilidad y reduciendo el consumo de tampón52. Los protocolos AEX optimizados pueden alcanzar un > 90% de pureza completa de la cápside en múltiples serotipos58. Sin embargo, a diferencia de la UC, AEX aún no ha demostrado una separación fiable de cápsidas parcialmente llenas, y cada serotipo requiere optimización ya que el perfil de carga varía según el serotipo51. Cabe destacar que la mayoría de los procesos comerciales de purificación de RSM combinan cromatografía por captura de afinidad con UC (iodixanol o CsCl) como paso de pulido, aprovechando las ventajas de alta pureza de la UC tras la eliminación inicial de impurezas por afinidad (Tabla 1).
  3. Formulación
    La optimización de la formulación de AAV es importante para garantizar la estabilidad del RSM y su vida útil. El diseño de la formulación implica selección de excipientes, regulación de osmolaridad, selección de tampón, surfactante y control de la fuerza iónica para minimizar la agregación. Los sistemas tampón más comunes incluyen fosfatos, tris, acetato, citrato y lactato, que normalmente operan dentro de un rango de pH de 7,4 ± 0,3 en diferentes serotipos. Los excipientes son agentes estabilizadores comúnmente presentes en formulaciones de AAV, incluyendo NaCl, KCl, poloxámero 188 (Px188), MgCl₂, CaCl₂, sacarosa, PS20, sorbitol, manitol, glicerol y albúmina sérica humana. Px188 a ~0,001% se utiliza comúnmente para reducir el estrés interfacial y mecánico, limitando así la ruptura de la cápside y la pérdida de títulos durante la manipulación y elcongelamiento-descongelación 59. La osmolaridad es una consideración importante para la administración en humanos, pero es menos relevante para los RSM60 de grado de investigación. La mayoría de los RSM comerciales utilizan amortiguadores basados en PBS, ocasionalmente complementados con sales adicionales. Los proveedores recomiendan almacenar a -80 °C y evitar múltiples ciclos de congelación y deshielo, ya que esto puede favorecer la ruptura de la cápside en las interfaces entre agua y hielo, lo que podría provocar una pérdida de título34,61.

4. Caracterización analítica: Definición del estándar

Una vez producido, purificado y formulado el RSM, se realiza una caracterización analítica exhaustiva. Este paso garantiza la calidad del RSM y su aplicabilidad como referencia en diferentes métodos analíticos. Emplear técnicas analíticas ortogonales para evaluar los mismos atributos de calidad es especialmente importante para garantizar la robustez y, por tanto, se recomienda encarecidamente. Los atributos clave de calidad específicamente para AAV RSM pueden dividirse en tres categorías: título, identidad y pureza, según se enumera en la Tabla 2.

  1. Título
    La caracterización de RSM abarca la medición del título, cuantificado como título del genoma del vector y título de partículas de la cápside, proporcionando información sobre el número de genomas y cápsides del vector presentes. El título genómico se mide típicamente mediante qPCR o dPCR dirigido al transgeno, los ITR u otros elementos del casete transgénico, siendo el diseño del ensayo y la colocación del cebador/sonda que influyen significativamente en los resultados. Los ensayos basados en ITR son independientes del serotipo y de aplicación general, pero la estructura en horquilla de los ITR puede dificultar la unión de los cebadores, y tales ensayos pueden sobreestimar los títulos cuando hay cápsides parcialmente llenas que retienen secuencias ITR; Se ha demostrado que la qPCR dirigida a ITR sobreestima los títulos genómicos para los RSM AAV2 y AAV8 en comparación con los ensayos de expresión dirigidos acasete 11. Otra fuente de sesgo en la qPCR es el uso de calibrantes de ADN plasmidal de doble cadena, que presentan una cinética de amplificación diferente a la de los genomas rAAVde cadena simple 29.
    La dPCR aborda ambas limitaciones mediante cuantificación absoluta mediante estadística de Poisson, eliminando la dependencia de curvas estándar, y se ha demostrado que es menos susceptible a la interferencia de estructurasecundaria ITR 62. Cabe destacar que la qPCR puede alcanzar una precisión equivalente cuando se calibra frente a un calibrante basado en rAAV en lugar de en plásmidos, ofreciendo una alternativamás rentable de 63. El pretratamiento adecuado de la muestra es igualmente importante. El tratamiento con DNasa elimina el ADN externo para asegurar que solo se cuantifiquen los genomas encapsulados, y debe ser seguido de una inactivación antes de la ruptura de la cápside, utilizando la proteinasa K o el tratamientotérmico 64,65,66. Nuestro grupode investigación 67 ha publicado un protocolo optimizado y validado para la cuantificación genómica basada en ddPCR en muestras de vectores purificadas.
    El título de partículas de la cápside se determina comúnmente mediante un ELISA o SEC-MALS. ELISA ofrece alta especificidad y robustez frente a efectos matriciales, pero es específico del serotipo, dependiente de la curva estándar y requiere mucho trabajo. SEC-MALS es independiente del serotipo y es más rápido, pero requiere instrumentaciónespecializada 22.
  2. Identidad
    La evaluación de la identidad tiene como objetivo confirmar que el AAV producido se ajusta al serotipo y la secuencia genómica previstos, excluyendo alteraciones no deseadas tanto en el nivel de proteína como en el de ADN. La identidad de la proteína de la cápside se refiere a la identificación de serotipos. Los métodos más comunes incluyen ELISA y western blot (WB) utilizando anticuerpos específicos del serotipo. Más recientemente, la espectrometría de masas acoplada a cromatografía líquida de alto rendimiento (LC-MS) ha surgido como un enfoque complementario de orden superior para la identificación de serotipos y el análisis de composición de cápsides debido a su alta reproducibilidad, precisión y robustez, aunque generalmente no se utiliza para caracterizaciones rutinarias internas deRSM 6,22. La identidad genómica del vector puede evaluarse mediante métodos de secuenciación, como la secuenciación por nanoporos. Este enfoque proporciona una cobertura de lectura larga de genomas completos de AAV, permitiendo determinar con precisión la identidad de secuencia22.
  3. Pureza
    Un tercer parámetro de calidad importante para los RSM de AAV es la pureza, que abarca la pureza de proteínas, la integridad de la cápside y del genoma, el contenido de la cápside y la agregación. La integridad de la cápside se evalúa verificando la estequiometría VP (VP1:VP2:VP3 ≈ 1:1:10) mediante electroforesis en gel de dodecil sulfato de sodio y poliacrilamida (SDS-PAGE), electroforesis capilar de dodecilo sulfato de sodio (CE-SDS) o WB, con WB proporcionando además la confirmación de identidad de la proteínacápsida 22.
    La integridad del genoma, ya sea que el transgen sea de longitud completa o truncado, puede evaluarse mediante electroforesis en gel de agarosa (AGE), multiplexación ddPCR o enfoques basados en secuenciación como la secuenciación por nanoporos. Aunque AGE es sencillo, ofrece una resolución y especificidad limitadas. Multiplex ddPCR proporciona datos cuantitativos y específicos de región que los métodos basados en gel no pueden, aunque a costa de un desarrollo de ensayos másextenso 22,68.
    El contenido de la cápside suele estimarse dividiendo el título del genoma por el título de la cápside; sin embargo, esto depende de dos ensayos independientes, que pueden introducir variabilidad adicional y, por tanto, no se recomienda para la caracterización de RSMs. Técnicas más adecuadas para este atributo con menor variabilidad incluyen AUC, SEC-MALS, MP, CD-MS y UV/Vis 8,69,70,71,72,73. Los desarrollos recientes han incrementado aún más el valor de AUC y SEC-MALS como métodos multiatributo. En particular, la AUC MULTI-LONGITUD DE ONDA (MWL-AUC) permite no solo discriminar cápsides vacías, parcialmente llenas y completas, sino también la evaluación del título genómico, título de la cápside yagregación 71,74. De manera similar, SEC-MALS puede proporcionar, dentro de un solo ensayo, información sobre el título de la cápside, el título del genoma, la pureza, la agregación y las proporciones de cápsidetotal-vacía 73,75. La agregación también puede monitorizarse mediante dispersión dinámica de la luz (DLS). Cabe destacar que solo AUC, MP y CDMS han ofrecido tradicionalmente una resolución suficiente para cuantificar los cápsidos parcialmente rellenados. Sin embargo, recientemente se ha desarrollado un método TEM mejorado, que también puede cuantificar con precisión los cápsidos parcialmente rellenos en comparación con SV-AUC y MP76. Como ningún método único ha surgido como estándar de oro para el contenido de la cápside, y estas técnicas se basan en diferentes principios analíticos, se recomienda utilizar múltiples enfoques complementarios para obtener una evaluación exhaustiva de la purezaglobal 10.
  4. Estabilidad
    La estabilidad a largo plazo es fundamental para los RSM, ya que los valores de referencia deben permanecer constantes para garantizar una calibración fiable a lo largo del tiempo. Los RSM AAV suelen almacenarse a ≤ -70 °C para mantener la integridad del cápside y del genoma. Un estudio de estabilidad multilaboratorio de AAV8 RSM (ATCC VR-1816) demostró un título genómico vectorial estable, un título infeccioso y un título de cápside estables durante al menos dos años a < -70 °C 77. Los procedimientos para pruebas de estabilidad pueden seguir las directrices de la Q1A del ICH, evaluando atributos clave en intervalos definidos: cada 3 meses (año 1), cada 6 meses (año 2) y anualmente a partir de entonces 78. La estabilidad a corto plazo en condiciones de almacenamiento acelerado (2–8 °C) suele evalúarse a 1, 2 y 4 semanas79. Los atributos críticos que indican la estabilidad incluyen el título del genoma, el título de la cápside, el contenido de la cápside, la integridad de la proteína de la cápside y la agregación. Los RSM también deben evaluarse para una sensibilidad alcongelamiento-deshielo de 80.

5. Procedimientos estándar estándar armonizados como segundo pilar de la estandarización analítica de la AAV

Más allá de la disponibilidad de RSMs bien caracterizados, una estandarización significativa en la analítica de AAV también requiere procedimientos estándar estándar armonizados y suficientemente detallados. Incluso cuando se aplica el mismo método analítico, los resultados pueden diferir sustancialmente entre laboratorios debido a diferencias en el pretratamiento de la muestra, ajustes instrumentales, estrategia de calibración, procesamiento de datos e interpretación, factores que han demostrado contribuir a la variabilidad interlaboratorio independientemente de la plataforma analíticaen sí 8,9.

Esto se ilustra en un estudio colaborativo entre el NIST, el Instituto Nacional para la Innovación en la Fabricación de Biofármacos (NIIMBL) y USP, en el que seis laboratorios evaluaron las mismas muestras de AAV5 y AAV8 para el contenido de cápsides utilizando cuatro métodos. Los métodos ópticos, incluyendo SEC-MALS y UV/Vis, mostraron la mayor concordancia interlaboratorio, mientras que PCR-ELISA mostró baja reproducibilidad y se consideró inadecuado para uso cuantitativo sin mayor armonización. A pesar de ser ampliamente considerado un método de referencia de referencia, el SV-AUC mostró una mayor variabilidad interlaboratorial que el SEC-MALS, y los esfuerzos de seguimiento para desarrollar procedimientos estandarizados del SV-AUC han sido identificados como un siguiente pasoimportante 8,81.

Una conclusión similar ha surgido para la determinación del título genómico mediante dPCR, donde el pretratamiento de la muestra, la estrategia de extracción, la plataforma del instrumento, las condiciones de dilución, el momento de la lisis de la cápside y la historia de congelación-deshielo pueden afectar los valores reportados. Es importante destacar que se demostró que un control procedimental más estricto reduce sustancialmente la variabilidad, subrayando aún más el valor de las SOParmonizadas 9.

Por tanto, los RSM y los SOP deben considerarse pilares complementarios de la estandarización analítica de la AAV. Los RSM proporcionan el ancla de medición necesaria para la trazabilidad y calibración, mientras que los SOP reducen la variabilidad de procedimientos y ayudan a garantizar que los valores asignados se reproduzcan de forma consistente entre analistas, instrumentos y laboratorios.

Conclusiones

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La terapia génica rAAV avanza más rápido que la capacidad del campo para caracterizar de forma consistente atributos de calidad. Esta revisión demuestra que la principal barrera para la caracterización comparable de AAV no es la falta de herramientas analíticas, sino la ausencia de anclajes de medición compartidos y flujos de trabajo armonizados. Los RSM abordan este desafío transformando mediciones dependientes del método en valores rastreables y comparables. Los RSM permiten la validación de métodos, mejoran la reproducibilidad entre laboratorios y proporcionan controles continuos para detectar la deriva del ensayo. Sin embargo, la producción de RSM AAV de alta calidad sigue siendo técnicamente exigente debido a la dificultad de obtener poblaciones puras de cápsidas vacías y completas, la necesidad de una caracterización ortogonal completa y la necesidad de estabilidad a largo plazo bajo condiciones de almacenamiento definidas. Los avances recientes en tecnologías de fabricación y purificación han permitido la producción de preparaciones predominantemente vacías y completas de la cápside, que pueden utilizarse para generar RSMs internos, y las ofertas actuales de organismos farmacopeiales (USP), consorcios colaborativos (ATCC) y proveedores comerciales representan un avance significativo. Sin embargo, el desarrollo de RSM AAV universales está fundamentalmente limitado por la diversidad de serotipos, genomas vectoriales y, cada vez más, variantes de cápsides diseñadas. A diferencia de los anticuerpos monoclonales, la heterogeneidad del AAV exige RSM específicos de serotipo y aplicación. Esta complejidad se amplifica aún más por las cápsides híbridas y/o diseñadas, que requieren que los desarrolladores mantengan RSMs primarios internos propietarios, fragmentando así el panorama de medición. Además, otros atributos de calidad como modificaciones posttraduccionales (PTM) han sido destacados como posibles CQA y carecen de RSMs bien caracterizados para los PTM, creando una brecha crítica en la comprensión de este atributo vectorial. Más allá de la disponibilidad de RSM, los procedimientos estándar de operaciones estándar (SOP) armonizados son igualmente críticos. El campo se beneficiaría de métodos compendiales—protocolos estandarizados y detallados publicados por organismos farmacopéicos—que garanticen que todos los laboratorios ejecuten pruebas consistentes y controladas para las CQAs de AAV. Los documentos de orientación escritos que detallen las mejores prácticas para métodos de uso común reducirían aún más la variación entre laboratorios y armonizarían los flujos de trabajo analíticos. Al establecer RSMs de medición de AAV rastreables e implementar prácticas de caracterización consistentes y precisas, la comunidad puede fortalecer la base científica que vincula las CQAs con la seguridad y eficacia, apoyar la toma de decisiones regulatorias con confianza y, en última instancia, ofrecer terapias génicas más seguras y fiables a los pacientes.

Tabla 1: RSMs rAAV actualmente disponibles y sus características

Esta tabla resume los materiales de referencia estándar rAAV disponibles y sus características clave. Por favor, haz clic aquí para descargar esta tabla.

Tabla 2: Conjunto recomendado de métodos analíticos para la caracterización interna de RSM

Esta tabla resume los métodos analíticos recomendados para la caracterización interna de RSM. Por favor, haz clic aquí para descargar esta tabla.

Divulgaciones

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Los autores declaran que no hay conflictos de interés

Agradecimientos

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Este proyecto ha recibido financiación del Programa Marco de la Unión Europea para la Investigación e Innovación, Horizon Europe, bajo el Acuerdo de Subvención Nº 101119880. Este proyecto fue financiado por la subvención "Flandes Resiliencia" del Gobierno flamenco, procedente del "Mecanismo Europeo de Recuperación y Resiliencia" (RRF) (VV021/13).

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