1. extracción de ADN de muestras de alimentos
2. Ajuste de reacciones de PCR
3 Preparación del Gel de agarosa al 3%
4. electroforesis de los productos PCR
| Número de tubo | Cartilla de | Muestra de ADN |
| 1 | Primer planta de 20 μl (verde) | Control de alimentos no-GMO 20 μl ADN |
| 2 | Cartilla GMO 20 μl (rojo) | Control de alimentos no-GMO 20 μl ADN |
| 3 | Primer planta de 20 μl (verde) | Comida de prueba 20 μl ADN |
| 4 | Cartilla GMO 20 μl (rojo) | Comida de prueba 20 μl ADN |
| 5 | Primer planta de 20 μl (verde) | Control positivo de GMO 20 μl ADN |
| 6 | Cartilla GMO 20 μl (rojo) | Control positivo de GMO 20 μl ADN |
Tabla 1. Lista de los números de tubo adecuado, imprimaciones y muestras de ADN.
| Pozo 1 | 1 control de alimentos no-GMO con planta primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 2 | 2 control de alimentos no-GMO con GMO primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 3 | 3 alimentos de prueba con planta primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 4 | 4 alimentos de prueba con GMO primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 5 | 5 ADN positivo GMO con planta primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 6 | 6 ADN positivo GMO con GMO primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 7 | Peso molecular PCR regla 20 μl. |
| Pozo 8 | Deje en blanco. |
Tabla 2. El orden adecuado para cargar 20 μl de la regla de peso molecular y 20 μl de cada muestra en el gel.
Fuente: Laboratorios de Margaret obrero y Kimberly Frye - Universidad de Depaul
Modificación genética de los alimentos ha sido una cuestión controvert…
1. extracción de ADN de muestras de alimentos
2. Ajuste de reacciones de PCR
3 Preparación del Gel de agarosa al 3%
4. electroforesis de los productos PCR
| Número de tubo | Cartilla de | Muestra de ADN |
| 1 | Primer planta de 20 μl (verde) | Control de alimentos no-GMO 20 μl ADN |
| 2 | Cartilla GMO 20 μl (rojo) | Control de alimentos no-GMO 20 μl ADN |
| 3 | Primer planta de 20 μl (verde) | Comida de prueba 20 μl ADN |
| 4 | Cartilla GMO 20 μl (rojo) | Comida de prueba 20 μl ADN |
| 5 | Primer planta de 20 μl (verde) | Control positivo de GMO 20 μl ADN |
| 6 | Cartilla GMO 20 μl (rojo) | Control positivo de GMO 20 μl ADN |
Tabla 1. Lista de los números de tubo adecuado, imprimaciones y muestras de ADN.
| Pozo 1 | 1 control de alimentos no-GMO con planta primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 2 | 2 control de alimentos no-GMO con GMO primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 3 | 3 alimentos de prueba con planta primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 4 | 4 alimentos de prueba con GMO primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 5 | 5 ADN positivo GMO con planta primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 6 | 6 ADN positivo GMO con GMO primers 20 μl de la muestra. |
| Pozo 7 | Peso molecular PCR regla 20 μl. |
| Pozo 8 | Deje en blanco. |
Tabla 2. El orden adecuado para cargar 20 μl de la regla de peso molecular y 20 μl de cada muestra en el gel.
Los alimentos genéticamente modificados son productos que contienen un ingrediente o ingredientes cuyo ADN ha sido específicamente alterado. La presencia de estas modificaciones se puede detectar mediante una técnica llamada reacción en cadena de la polimerasa.
La modificación genética de los alimentos ha sido un tema controvertido debido a las preocupaciones debatidas sobre la salud y la seguridad ambiental. La capacidad de detectar ADN genéticamente alterado en muestras de alimentos de interés permite la toma de decisiones informadas sobre la seguridad y los peligros potenciales del uso de organismos genéticamente modificados, o OGM, en los suministros de alimentos.
La reacción en cadena de la polimerasa, o PCR, se utiliza para amplificar el ADN de los alimentos para determinar la presencia o ausencia de secuencias modificadas genéticamente. A continuación, la electroforesis en gel extrae el ADN amplificado a través de una matriz de gel de agarosa y separa las bandas de ADN de diferentes tamaños que corresponden a marcadores modificados o no modificados. A continuación, se comparan con las bandas de control de los alimentos que se sabe que contienen OGM o que se sabe que no contienen modificaciones.
Este video ilustrará los principios detrás de la detección de ADN genéticamente modificado a partir de muestras de alimentos, cómo extraer ADN y amplificar los marcadores utilizados en el proceso de modificación genética, y cómo se puede establecer la presencia o ausencia de OGM en muestras de alimentos.
La reacción en cadena de la polimerasa identifica secuencias de ADN que se han insertado en el alimento modificado genéticamente. El ADN es una molécula relativamente estable, por lo que los fragmentos de ADN viables adecuados para la amplificación pueden aislarse incluso de productos altamente procesados, como chips de maíz o hamburguesas de verduras. Se utiliza un pequeño número de secuencias de ADN reguladoras para controlar la expresión de los genes insertados, por lo que estas secuencias están presentes en la mayoría de los cultivos transgénicos. Este procedimiento identifica dos de los más utilizados, el gen promotor 35S y el gen terminador de la nopalina sintasa. La secuencia 35S es un promotor fuerte, y cuando se une a un gen insertado impulsará niveles altos y constantes de expresión. Se incluye el terminador de nopalina sintasa para detener la transcripción del gen insertado en el punto final deseado.
La PCR implica ciclos repetitivos de calentamiento y enfriamiento en un termociclador, una máquina que controla estrictamente la temperatura de los tubos de reacción de PCR. Calentar la muestra a 94 ? C hace que las hebras de ADN se desnaturalicen y se separen. Enfriamiento rápido entre 45 y 65 ? C permite que los cebadores recocen las hebras de ADN separadas. Finalmente, recalentar a 72 ? C permite que la enzima polimerasa Taq extienda los cebadores y complete la duplicación de la región objetivo.
El cebador vegetal comprado se agrega a cada muestra y se amplificará en muestras que contengan ADN de planta. Las plantillas positivas de OGM para 35S y NOS se utilizan para proporcionar un control positivo de los OGM. Un certificado no transgénico se utiliza como control negativo. Si alguna de estas reacciones de control muestra bandas inesperadas, no se puede confiar en los resultados de las muestras de prueba.
El ADN amplificado se pasa a través de un gel de agarosa por electroforesis. Los productos de PCR se mezclan con un tinte y se cargan en pocillos. El ADN está cargado negativamente, y cuando se carga en el gel en el extremo del cátodo de la cámara, se moverá hacia el extremo del ánodo cuando se aplique corriente. Los fragmentos de ADN más grandes no pueden moverse tan fácilmente a través de la matriz de gel, por lo que permanecerán más cerca del cátodo, mientras que las secuencias más pequeñas se mueven hacia el extremo del ánodo, lo que resulta en la separación de ADN de diferentes tamaños en bandas distintas.
Después de la electroforesis, la tinción en gel ayuda a visualizar las bandas de ADN separadas.
Ahora que estamos familiarizados con los principios detrás de la detección de OGM y el uso de la PCR y la electroforesis para la identificación de OGM, echemos un vistazo a cómo se puede llevar a cabo esto en el laboratorio.
Una vez identificados los productos alimenticios de interés, se puede iniciar el análisis. Para extraer el ADN, tome dos tubos de rosca limpios y transfiera a cada uno de ellos 500 ? L de reactivo de aislamiento de ADN comprado, asegurándose de pipetear la mezcla hacia arriba y hacia abajo entre las alícuotas para mezclar uniformemente el reactivo. Etiquete uno de los tubos como "no transgénico" y el otro como "Prueba".
A continuación, pese 0,5 g de alimentos certificados como no transgénicos y colóquelos en un mortero limpio. Agregue 2,5 ml de agua destilada y muela con el mortero durante 2 minutos para formar una papilla. Agregue otros 2,5 ml de agua destilada y continúe moliendo la lechada hasta que esté lo suficientemente suave como para pipetear.
Pipeta 50 ? L de la suspensión conocida como no OGM al tubo con tapón de rosca marcado como "no OGM" que contiene el reactivo de aislamiento de ADN. Ahora agregue 50 ? L de la suspensión de la muestra de alimentos de prueba al tubo con tapón de rosca marcado como "Prueba". Agite los dos tubos que contienen las muestras de alimento y el reactivo de ADN durante 1 min. A continuación, coloque los tubos en un baño de agua a 95 ? C durante 5 min. Finalmente, coloque los tubos en una centrífuga durante 5 min. Tras el examen, se debe formar una bolita sólida en el fondo del tubo. Si no se forma un pellet después de 5 min, centrifugue nuevamente durante intervalos de 2 min hasta que se forme un pellet. Las muestras ahora se pueden usar inmediatamente para PCR o almacenarse en un refrigerador hasta por 1 semana.
En primer lugar, los seis tubos de PCR. Estos números corresponderán al contenido del tubo que se indica en la tabla. Coloque cada uno de los tubos de PCR etiquetados en un soporte de microtubos con las tapas abiertas.
Usando una punta nueva para cada adición, agregue 20 ? L cebador indicado en la Tabla a cada tubo de PCR. A continuación, agregue 20 ? L de las muestras de ADN indicadas en la Tabla a cada tubo de PCR. Pipetea hacia arriba y hacia abajo para mezclar. En el caso de las muestras granuladas, asegúrese de pipetear únicamente con el sobrenadante y evite la gránula sólida en la parte inferior de los tubos. Finalmente, coloque los tubos de PCR en un termociclador y prográmelo para que pase por los pasos de calentamiento y enfriamiento indicados en la tabla.
Coloque un gel de agarosa al 3% en la cámara de electroforesis con los pocillos más cercanos al extremo del cátodo. Agregue tampón TAE en la cámara para cubrir 2 mm por encima de la bandeja de gel. Recoja los tubos de PCR del termociclador y colóquelos en un soporte de microtubos. Usando una punta de pipeta nueva cada vez, agregue 10 ? L de ADN comprado cargando tinte a cada muestra y mezcle bien.
Usando una punta nueva cada vez, cargue los pocillos del gel de agarosa con 20 ? L de la regla de peso molecular en un pocillo, y 20 ? L de cada muestra en pocillos subsiguientes, como se indica en esta tabla. Configure la cámara de electroforesis para que funcione a 100 V durante 30 minutos.
Una vez que el gel haya terminado de correr, desenchufe con cuidado la cámara de gel, retire la bandeja y deslice el gel en una bandeja de tinción. Sumerja el gel en la mancha de gel 100x comprada durante 5 minutos, agitando suavemente la bandeja para distribuir la mancha. Una vez manchado, transfiera el gel a un recipiente de lavado y enjuague con agua del grifo durante aproximadamente 10 s. Elimine las manchas lavando tres veces con agua tibia del grifo durante 3 minutos cada una, cada una agitando suavemente para obtener mejores resultados. Si es necesario, continúe decolorando en agua tibia hasta alcanzar el contraste deseado.
La presencia o ausencia de una banda de 200 pb en el carril 4 indica si el alimento de prueba contiene OMG. Los cebadores de plantas determinan si el ADN de la planta se extrajo con éxito de la muestra. El control de alimentos no transgénicos es un indicador de resultados falsos positivos, en caso de que se produzcan. Si el control de alimentos no transgénicos sale positivo, significa que la PCR estuvo contaminada en algún momento. El control de plantilla positivo para OGM es un indicador de falsos negativos. Si el control de plantilla positivo para OGM no se amplifica, hay un problema con la reacción de PCR y no se puede confiar en un resultado negativo para OGM del alimento de prueba.
Los geles se pueden colocar sobre un papel blanco o amarillo para proporcionar un fondo contrastante para resaltar las bandas de ADN, o se puede lograr un mayor contraste utilizando una caja de luz ultravioleta.
La capacidad de analizar alimentos o productos para detectar ingredientes modificados genéticamente es pertinente para una serie de aplicaciones científicas o reglamentarias.
Existe cierta evidencia de que el ADN transgénico de los cultivos genéticamente modificados puede introducirse en los genomas de las poblaciones de cultivos silvestres. Por ejemplo, los polinizadores pueden facilitar esta transferencia fertilizando plantas de tipo silvestre con polen de una fuente modificada genéticamente. Esto es preocupante, ya que los impactos de la propagación de estos genes insertados en los ecosistemas en su conjunto no se comprenden bien. Las pruebas de PCR de poblaciones silvestres pueden proporcionar datos sobre la posible propagación, o la contención exitosa, de las inserciones genéticas.
La falta de etiquetado o el etiquetado incorrecto de los ingredientes genéticamente modificados puede ser una preocupación para el consumidor. Esto puede deberse a la preferencia de consumo del consumidor, o a la posible introducción de alérgenos durante el proceso de transgénicos, aunque esto último es controvertido. En algunos países, se exige que los ingredientes modificados genéticamente figuren en los envases de los alimentos. Las juntas reguladoras de dichos países pueden utilizar las pruebas de PCR para comprobar la exactitud del etiquetado de los alimentos.
En los casos en que la modificación genética introducida en un cultivo confiere resistencia a los plaguicidas, algunos estudios han suscitado preocupación por la producción de "supermalezas". Esencialmente, puede tratarse de cualquier planta que no haya sido inicialmente objeto de modificación y que obtenga la resistencia a los plaguicidas a través de mecanismos como la introgresión o la hibridación. Estas plantas pueden ser capaces de propagarse con más éxito y ser más difíciles de controlar que las que no tienen el inserto. Las pruebas de PCR para la modificación genética pueden ayudar a resaltar y rastrear dichas poblaciones potenciales para determinar si esta propagación podría resultar problemática.
Acabas de ver la introducción de JoVE a las pruebas de alimentos transgénicos. Ahora debe comprender los principios detrás de la identificación de alimentos modificados genéticamente mediante PCR, cómo extraer y amplificar el ADN de los alimentos y cómo determinar si su muestra de alimentos ha sido modificada genéticamente. ¡Gracias por mirar!
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Q1: What is polymerase chain reaction and how does it detect genetically modified foods?
Polymerase chain reaction (PCR) amplifies specific DNA sequences from food samples to identify genetically modified markers. The process uses repetitive heating and cooling cycles in a thermal cycler to denature DNA strands, allow primers to anneal, and enable Taq polymerase to extend and duplicate target regions. This amplification makes modified DNA sequences detectable even in highly processed foods like corn chips or vegetable burgers.
Q2: How does gel electrophoresis separate and identify genetically modified DNA?
Gel electrophoresis pulls amplified DNA through a 3% agarose gel matrix using electrical current. DNA is negatively charged and migrates toward the anode, with larger fragments moving slowly and remaining near the cathode, while smaller sequences travel farther. This separation creates distinct bands corresponding to modified or non-modified markers that are compared to known control bands.
Q3: What are the 35S promoter and nopaline synthase terminator genes?
The 35S promoter and nopaline synthase (NOS) terminator are regulatory DNA sequences commonly used in genetically modified crops. The 35S sequence is a strong promoter that drives constant, high-level expression of inserted genes. The NOS terminator stops transcription of the inserted gene at the desired endpoint. PCR testing identifies these two sequences as indicators of genetic modification.
Q4: Why are control samples essential in GMO detection testing?
Control samples validate PCR and electrophoresis results. Plant primers confirm successful DNA extraction from test samples. A certified non-GMO control detects false positives, indicating PCR contamination if it shows unexpected bands. A GMO-positive template control identifies false negatives; if it fails to amplify, the PCR reaction is compromised and test results cannot be trusted.
Q5: How can genetically modified DNA spread to wild plant populations?
Transgenic DNA from genetically modified crops can become introgressed into wild crop genomes through mechanisms like pollination. Pollinators may transfer pollen from genetically modified sources to wild-type plants, introducing inserted genes into natural populations. PCR testing of wild populations provides data on the potential spread or successful containment of genetic inserts in ecosystems, similar to how carbon and nitrogen analysis of environmental samples helps assess ecosystem health.
Q6: What are super-weeds and how does GMO testing help track them?
Super-weeds are plants that acquire pesticide resistance through introgression or hybridization with genetically modified crops. These plants may spread more successfully and become harder to control than non-resistant varieties. PCR testing for genetic modification helps identify and track potential super-weed populations to determine if resistance spread could become problematic for agriculture.
Q7: Why is GMO testing important for food labeling and consumer safety?
Some countries require genetically modified ingredients to be listed on food packaging. Lack of accurate labeling raises consumer concerns about health, environmental safety, and potential allergens introduced during genetic modification. Regulatory boards use PCR testing to verify the accuracy of food labels and ensure consumers receive truthful information about GMO content in their food products.
Chapters in this video
0:00
Overview
1:41
Principles of Identifying Genetically Modified Foods using PCR
4:44
Extraction of DNA from Food Samples
6:35
Setting up PCR
7:30
Electrophoresis of PCR Products
9:07
Results
10:10
Applications
12:15
Summary