Name: Extracción de ADN de los microbios del intestino de las termitas (Zootermopsis Angusticollis) y visualizar microbios intestinales (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-05-28T00:00:00.000+00:00
Duration: 15 min 27 s
Description: Aprende a extraer ADN de microbios intestinales de termitas Zootermopsis angusticollis y visualizar su comunidad microbiana. Este método revela la diversidad y complejidad de las interacciones en el intestino posterior.

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Resumen del procedimiento para la extracción de ADN de las termitas de todo el intestino: <ol><li> Las termitas se enfría en hielo, retire del intestino utilizando pinzas estériles y estabilizar muestras de intestino en el buffer. </li><li> Homogeneizar las muestras de PVPP / SDS / buffer de fenol. </li><li> Extraer y purificar el ADN de lisado crudo utilizando columnas Qiagen DNeasy. </li></ol> Protocolo: <ol><li> En el hielo, remover las entrañas de las termitas casta de obreras con una pinza estéril. </li><li> Inmediatamente la transferencia de las agallas y el contenido de una solución estéril, libre de nucleasa tubo que contiene 50 L helada 1x biología molecular grado buffer TE (1 mM Tris-HCl, 0,1 mM EDTA, pH 8,0). Congelar las muestras a -20 ° C, o proceder directamente a una homogeneización. </li><li> Transferencia de las muestras de intestino y de amortiguación de una solución estéril, libre de nucleasa 2 ml tubo de tornillo tope pre-cargado con 500 mg de estériles de zirconia / sílica perlas (0,1 mm) y 700 l de 1x tampón TE que contenía 1% w / v polivinilpolipirrolidona (PVPP ). </li><li> Añadir 50 l de sulfato de sodio al 20% dodecilsulfato (SDS) y 500 l de fenol para las muestras. </li><li> Homogeneizar (golpe del talón) sobre el valor más alto con tres ciclos de 30 segundos homogeneización y 30 segundos de enfriamiento en hielo. </li><li> Sedimentos material insoluble durante 1 minuto a 8000 x g. </li><li> Purificar 300 l alícuotas de la fase acuosa (superior) de la capa de columnas Qiagen DNeasy utilizando el método descrito para la purificación del lisado crudo. </li><li> Cuantificar el contenido de ácido nucleico y las muestras se congelan a -20 ° C para su uso posterior. </li></ol>

<ol><li>Berthelet, M., Whyte, L. G., Greer, C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid%2C+Direct+Extraction+of+DNA+from+Soils+for+PCR+Analysis+using+Polyvinylpolypyrrolidone+Spin+Columns%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Microbiol.+Lett%22%5BJournal%5D)">Rapid, Direct Extraction of DNA from Soils for PCR Analysis using Polyvinylpolypyrrolidone Spin Columns.</a> FEMS Microbiol. Lett. 138, 17-22 (1996).</li>
<li>Kudo, T., Ohkuma, M., Moriya, S., Noda, S., Ohtoko, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+Phylogenetic+Identification+of+the+Intestinal+Anaerobic+Microbial+Community+in+the+Hindgut+of+the+Termite%2C+Reticulitermes+Speratus%2C+without+Cultivation%5BTitle%5D)+AND+%22Extremophiles%22%5BJournal%5D)">Molecular Phylogenetic Identification of the Intestinal Anaerobic Microbial Community in the Hindgut of the Termite, Reticulitermes Speratus, without Cultivation.</a> Extremophiles. 2, 155-161 (1998).</li>
<li>Moré, M. I., Herrick, J. B., Silva, M. C., Ghiorse, W. C., Madsen, E. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+Cell+Lysis+of+Indigenous+Microorganisms+and+Rapid+Extraction+of+Microbial+DNA+from+Sediment%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Quantitative Cell Lysis of Indigenous Microorganisms and Rapid Extraction of Microbial DNA from Sediment.</a> Appl. Environ. Microbiol. 60, 1572-1580 (1994).</li>
<li>Odelson, D. A., Breznak, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Volatile+Fatty+Acid+Production+by+the+Hindgut+Microbiota+of+Xylophagous+Termites%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Volatile Fatty Acid Production by the Hindgut Microbiota of Xylophagous Termites.</a> Appl. Environ. Microbiol. 45, 1602-1613 (1983).</li>
<li>Ottesen, E. A., Hong, J. W., Quake, S. R., Leadbetter, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microfluidic+Digital+PCR+Enables+Multigene+Analysis+of+individual+Environmental+Bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Microfluidic Digital PCR Enables Multigene Analysis of individual Environmental Bacteria.</a> Science. 314, 1464-1467 (2006).</li>
<li>Purdy, K. J., Embley, T. M., Takii, S., Newdell, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+Extraction+of+DNA+and+rRNA+from+Sediments+by+a+Novel+Hydroxyapatite+Spin-Column+Method%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid Extraction of DNA and rRNA from Sediments by a Novel Hydroxyapatite Spin-Column Method.</a> Appl. Environ. Microbiol. 62, 3905-3907 (1996).</li>
<li>Salmassi, T. M., Leadbetter, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+Genes+of+Tetrahydrofolate-Dependent+Metabolism+from+Cultivated+Spirochaetes+and+the+Gut+Community+of+the+Termite+Zootermopsis+Angusticollis%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Analysis of Genes of Tetrahydrofolate-Dependent Metabolism from Cultivated Spirochaetes and the Gut Community of the Termite Zootermopsis Angusticollis.</a> Microbiology. 149, 2529-2537 (2003).</li>
<li>Schmitt-Wagner, D., Friedrich, M. W., Wagner, B., Brune, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phylogenetic+Diversity%2C+Abundance%2C+and+Axial+Distribution+of+Bacteria+in+the+Intestinal+Tract+of+Two+Soil-Feeding+Termites+%28Cubitermes+spp%29%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Phylogenetic Diversity, Abundance, and Axial Distribution of Bacteria in the Intestinal Tract of Two Soil-Feeding Termites (Cubitermes spp).</a> Appl. Environ. Microbiol. 69, 6007-6017 (2003).</li>
<li>Tsai, Y. L., Olson, B. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+Method+for+Separation+of+Bacterial+DNA+from+Humic+Substances+in+Sediments+for+Polymerase+Chain+Reaction%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid Method for Separation of Bacterial DNA from Humic Substances in Sediments for Polymerase Chain Reaction.</a> Appl. Environ. Microbiol. 58, 2292-2295 (1992).</li>
</ol>

En nuestra experiencia, el ADN extraído de las comunidades microbianas de la alimentación de especies de termitas de madera como nevadensis Zootermopis es lo suficientemente puro para la plantilla de PCR después de una ronda de extracción y purificación. Sin embargo, algunas termitas tales como basura de alimentación y especies que se alimentan del suelo pueden tener una mayor concentración de ácidos húmicos en el contenido intestinal y puede requerir una purificación adicional de ADN microbiano intestinal. El rendimiento total de ADN de la...

<table><tbody><tr><td>PVPP/SDS/fenol</td><td>Tampón</td><td></td><td></td><td>tampón de homogeneización</td></tr><tr><td>Kit DNeasy Tissue</td><td>Kit</td><td>Qiagen</td><td>77607</td><td>Utilizado según el protocolo para el aislamiento de ADN genómico a partir de lisados crudos (Apéndice H, versión del manual del producto: julio de 2003)</td></tr><tr><td>TE</td><td>Tampón</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T9285</td><td>tampón 1x (1 mM Tris-HCl, 0,1 mM EDTA, pH 8,0) a partir de concentrado 100x</td></tr><tr><td>esferas de circonia/sílice</td><td>Suministros</td><td>Biospec Products</td><td>11079101z</td><td>0,1 mm</td></tr><tr><td>PVPP</td><td>Reactivo</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P6755</td><td>polivinilpolipirrolidona al 1 % p/v preparada a partir del reactivo seco como suspensión 1x en tampón TE</td></tr><tr><td>Zootermopsis nevadensis</td><td>Animal</td><td></td><td></td><td>Termitas</td></tr><tr><td>SDS</td><td>Reactivo</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>L4390</td><td>solución al 20 % de dodecilsulfato sódico en agua, a partir del reactivo seco</td></tr><tr><td>Fenol</td><td>Reactivo</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>77607</td><td>saturado con TE, ~73 %</td></tr><tr><td>MiniBeadbeater-8</td><td>Herramienta</td><td>Biospec Products</td><td>963</td><td></td></tr><tr><td>BSS</td><td>Solución salina tamponada, pH 7,2</td><td></td><td></td><td>Fórmula por litro: 2,5 g K&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;HPO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;, 1,0 g KH&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;PO&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;, 1,6 g KCl, 1,4 g NaCl, 0,075 g CaCl, 1 g MgCl y 10 mL de una solución 1 M de NaHCO&lt;sub&gt;3&lt;/sub&gt;</td></tr><tr><td>AxioPlan-2</td><td>Microscopio</td><td>Carl Zeiss, Inc.</td><td></td><td>Equipado con objetivo 40x, optivar 1,6x y lentes oculares 10x. Las muestras se observaron utilizando iluminación de contraste de fases</td></tr></tbody></table>

extracción de adn de los microbios del intestino de las termitas (zootermopsis angusticollis) y visualizar microbios intestinales

Extracting DNA from the Gut Microbes of the Termite (Zootermopsis Angusticollis) and Visualizing Gut Microbes

Las termitas se encuentran entre los pocos animales que sabe que tiene la capacidad de subsistir únicamente por el consumo de madera. El tracto intestinal termita contiene una población microbiana densa y rica en especies que contribuye a la degradación de la lignocelulosa predominantemente en acetato, el metabolismo de los nutrientes clave alimentando termitas (Odelson y Breznak, 1983). Dentro de estas poblaciones microbianas son bacterias, arqueas metanogénicas y, en algunos termitas (&quot;menor&quot;), eucariotas protozoos. Por lo tanto, las termitas son sujetos de investigación de excelencia para el estudio de las interacciones entre especies microbianas y las numerosas funciones bioquímicas que llevan a cabo en beneficio de su anfitrión. La composición de las especies de las poblaciones microbianas en el intestino de las termitas, así como los principales genes involucrados en diversos procesos bioquímicos se ha estudiado mediante técnicas moleculares (Kudo et al, 1998;. Schmit-Wagner et al, 2003;. Salmassi y Leadbetter, 2003). Estas técnicas dependen de la extracción y purificación de alta calidad, ácidos nucleicos del ambiente intestinal de termitas. La técnica de extracción se describe en este video es una compilación de modificación de los protocolos desarrollados para la extracción y purificación de ácidos nucleicos a partir de muestras ambientales (Mor et al, 1994;. Berthelet et al, 1996;. Purdy et al, 1996;. Salmassi y Leadbetter, 2003;. Ottesen et al 2006) y que produce material de ADN de las termitas del intestino grueso adecuado para su uso como plantilla para la reacción en cadena de polimerasa (PCR).

Este video muestra la técnica para extraer el ADN de las especies de microbios residentes en el intestino de termitas. La preparación de una diapositiva en fresco, que es útil para la visualización de la comunidad microbiana intestinal también se ilustra, y un recorrido por la riqueza de especies entorno intestinal es dado.

Extracción de ADN de los microbios del intestino de las termitas (Zootermopsis Angusticollis) y visualizar microbios intestinales

Las termitas se encuentran entre los pocos animales que se sabe que tienen la capacidad de subsistir consumiendo únicamente madera. El tracto intestinal de la termita contiene una densa y ...

Aquí, su reacción a este entorno no es, no es única. La mayoría de las personas, incluso los no científicos, se sorprenden bastante. Sí. Por la, la diversidad y la complejidad.Hola, mi nombre es Eric Matson y soy investigador posdoctoral en el Departamento de Ingeniería Ambiental y Científica en el Instituto de Tecnología de California. Mi trabajo bajo la dirección del profesor Jared Ledbetter se centra en las interacciones microbianas y la diversidad de especies que habitan en el intestino posterior de las termitas. En particular, estamos interesados en algunas de las vías bioquímicas que ocurren y especialmente en el proceso de acetogénesis, mediante el cual estos microorganismos consumen gases de hidrógeno y CO2 y los convierten en acetato, un nutriente clave en el metabolismo energético del hospedador termita.Yo y otros investigadores en el laboratorio hemos desarrollado conjuntos de cebadores específicos para poder analizar enzimas clave en esta vía. Sin embargo, para lograrlo, es necesario generar muestras de ADN limpias de la comunidad microbiana, ADN, que luego utilizaremos como dianas en este proceso. Por ello, hoy quiero demostrar cómo diseccionamos la especie de termita de la que hablamos, extraemos el ADN del intestino posterior, lo purificamos y lo preparamos para su uso posterior en investigaciones.Hoy nos centraremos en una especie de termita, en particular llamada Zo Opsis Nevadensis. Esta es una termita de madera húmeda de California recolectada localmente aquí, y es una especie bastante grande, lo que facilita bastante las disecciones y extracciones. Bien, hoy ya he preparado algunos de los materiales que necesitaremos para el procedimiento.Una de las primeras cosas que necesitamos es una cierta cantidad de hielo para enfriar los insectos que vamos a diseccionar. También he enfriado previamente un tampón TE, que contiene un compuesto que ayudará a estabilizar el ADN una vez que se libere de las células aquí dentro. Tengo viales estériles precargados con perlas de zirconia silicato.Estas son perlas de 0,1 milímetros y hay aproximadamente medio gramo o así aquí. Esto es lo que realmente haremos: cizallamiento mecánico. Y luego tengo algunos reactivos involucrados en el procedimiento de lisis y purificación.Aquí tengo un frasco que contiene 1 % de polivinilpolipirrolidona o PVPP en el tampón. La PVPP es importante para eliminar los ácidos húmicos de las preparaciones de ADN, los cuales pueden inhibir nuestro análisis mediante PCR de los resultados. Y luego tengo algo de sulfato de sodio ECO, que es un tensioactivo que utilizaremos para ayudar a extraer y romper las células.Luego, para realizar la disección de los termitas, todo lo que necesitamos son unas pinzas estériles. Estas tienen puntas bastante finas y son las que utilizaremos para extraer los tractos intestinales. Finalmente, para realizar la trituración mecánica, disponemos aquí de un dispositivo de batido que gira a un número muy elevado de RPM y que, junto con las perlas de silicato de circonia, provocará la ruptura mecánica de las células.Después de haber recolectado los térmites en el campo, los traemos aquí al laboratorio. La mayoría de los térmites californianos de madera húmeda con los que trabajamos son muy propensos a la desecación. Por ello, uno de los avances que hemos logrado en este laboratorio es incorporar el uso de cámaras controladas por humedad, como estas peceras de 10 galones.Aquí dentro, recolectamos las colonias individuales y las mantenemos separadas en estas, en estas cajas. Y en la base del tanque hay básicamente contenedores que tienen diferentes soluciones salinas. Esta en particular contiene una solución de fosfato de potasio, que mantiene la humedad relativa alrededor del 95 al 96 %, lo cual es perfecto.Y, con esas condiciones, hemos logrado que las termitas se reproduzcan en cautiverio, aunque cuando deseamos realizar un experimento, recolectamos ejemplares frescos del campo. Pero en esta caja puede observarse parte de la madera en la que se alimentan. Esta es simplemente pino Ponderosa o pino Jeffrey que recolectamos en el lugar donde se encuentra el nido de termitas.Y existen varios tipos diferentes de castas de termitas, incluidas las castas reproductoras macho y hembra. La mayor parte de la colonia está compuesta por termitas obreras, así como por un número de castas soldado. Curiosamente, los soldados tienen piezas bucales, mandíbulas, que están diseñadas para defender la colonia en lugar de para comer madera.Y por lo tanto, dependen de las termitas obreras para alimentarlos también. Así, puede observarse en esta caja tanto termitas obreras como soldado, así como algunos jóvenes que han eclosionado recientemente de huevos, aquí en cautiverio.Entonces, he seleccionado cinco termitas obreras del grupo que acabo de mostrarles. Y he comenzado por enfriarlas sobre hielo aquí. Para prepararme para la disección, voy a usar estas pinzas y trabajaré con la ayuda de un microscopio estereoscópico, y espero que puedan ver el gran volumen del intestino que podremos extraer de cada uno de estos individuos.Simplemente dé la vuelta al término y, con una pinza, sostenga el extremo de la cabeza y, con la otra, simplemente apriete. Justo en la punta del abdomen aquí. Y con una sola tracción, debería ver el tracto intestinal siendo extraído del organismo. Bien.Y puede observarse el gran volumen, aproximadamente del 30% al 40% del peso del insecto, que en realidad está contenido dentro de ese ambiente. Y puede verse que está dividido en varias secciones. Tenemos el intestino anterior, luego el intestino medio y luego esta cámara del intestino posterior, que es la cavidad muy grande que contiene la mayor parte de la comunidad microbiana que lleva a cabo las fermentaciones.Aquí he extraído las entrañas de cinco termitas obreras. Y ahora el siguiente paso es estabilizar los ácidos nucleicos contenidos en esta comunidad en una solución de tampón TE frío con hielo. En este punto, pueden congelarse a menos 20 grados Celsius si se está trabajando en campo.O bien podemos continuar directamente con el procedimiento de extracción. Pero todas las células y el material de ADN aún están contenidos dentro del intestino. Y simplemente voy a colocarlos en 100 microlitros de tampón TE.Vale, antes de comenzar realmente la extracción de las muestras de intestino, necesito preparar el tampón que voy a utilizar para romper las células y los tejidos. Así que a este tubo, en el que ya tengo aproximadamente medio gramo de perlas de circonio, voy a añadir 700 microlitros de PVPP. Este es el tampón TE al 1 % y 50 microlitros de una solución al 20 % de SDS.Es importante resuspender el PVPP antes de añadirlo, ya que es insoluble en tampones acuosos. En este momento, estamos listos para añadir el fenol a la muestra, así que voy a usar una pipeta para agregar aproximadamente 500 microlitros o así. Bien. Y con esto, estamos listos para comenzar la extracción. Sí.Con el fenol añadido, estamos listos para agregar la muestra de intestino que diseccionamos previamente de la termita, lo que facilita macerar ligeramente los tejidos. Esto suele hacer que la transferencia sea algo más sencilla. Ahora, con el fenol añadido, estamos listos para comenzar la ruptura mecánica con el dispositivo de bolas de vidrio.La técnica que vamos a utilizar consiste en tres ciclos a máxima velocidad, durante 30 segundos, seguidos de 30 segundos en hielo. Es importante incluir el paso en hielo para enfriar la muestra, ya que tiende a calentarse debido a la fricción. Así que insertaré la muestra en el dispositivo de perlas aquí, y procederé durante 30 segundos. De acuerdo.Al final del procedimiento, debería observar que la mayor parte del tejido ha sido homogeneizado. Debería quedar muy pocos grumos, y verá que tiene, tiene una apariencia algo espumosa, probablemente debido al SDS presente. En este punto, estamos listos para centrifugar y luego comenzar la purificación y extracción real del ADN a partir de esta muestra.Ahora que hemos roto mecánicamente las células, vamos a centrifugar el material insoluble. Lo haremos colocándolo en la centrífuga y aplicando 8.000 veces la gravedad durante un minuto. Y ahora lo que esperamos ver es que la mayor parte del material soluble se recolecte cerca del fondo del tubo.Y lo que nos interesa es la solución acuosa de la parte superior. Esta es la que realmente agregaremos al kit de extracción de ADN KaiGen siguiendo el procedimiento para lisado crudo. Ahora que tenemos nuestra muestra centrifugada, tomaremos 200 microlitros por preparación del sobrenadante, y extraeremos el ADN utilizando únicamente el kit KaiGen A-D-N-E-Z siguiendo el protocolo indicado para lisado crudo.Ahora tenemos los 200 microlitros de muestra de intestino, y voy a proceder utilizando el kit kyogen d easy siguiendo el protocolo indicado para lisado crudo. Cada vez que realizamos una extracción intestinal, siempre es recomendable verificar el estado del contenido intestinal. Para ello, diseccionamos un término y nos aseguramos de que sea representativo de lo observado previamente.En realidad, haremos esto visualmente observando las células en esta comunidad microbiana. Justo en la punta del abdomen aquí. Y con un polo, deberían ver el tracto intestinal.Entonces, esta es simplemente una solución salina tamponada que se asemeja mucho a la composición del fluido intestinal real de la termita. Voy a macerar esto un poco y luego lo añadiré a la preparación microscópica y echaremos un vistazo. Bien, ahora estamos listos para observarlo al microscopio.Sí, eso se ve muy bien. Intestino de termita. Hay representantes de los tres dominios reconocidos de la vida.Existen protozoos eucariotas, existen organismos metanógenos y también existen bacterias. Y nuestro laboratorio se ocupa predominantemente de la población bacteriana en este ambiente. Concretamente, los SPI kes en este tipo particular de termite spire keets son, entre los más dominantes de los miembros bacterianos de la comunidad.Y nuestra investigación actual muestra que, de hecho, participan en gran medida en la reductasa de CO2 hacia una cetogénesis. Por lo tanto, estos son varios tipos diferentes de protozoos, y se cree que participan, principalmente, en la degradación primaria de la madera. Por ello, se piensa que contienen xinasas y celulasas que permiten a sus enzimas acceder a estos polímeros de madera.Y luego, fermentan esos compuestos en monómeros de azúcares simples y en polímeros que son descompuestos más adelante por otros miembros de la comunidad. Estos protozoos también producen acetato por sí mismos, pero uno de sus subproductos es hidrógeno y CO2, y este hidrógeno y CO2 nuevamente son utilizados o consumidos por las poblaciones de acetógenos en este entorno. Y aquí se puede ver simplemente una concentración de organismos protozoarios, probablemente justo al lado de una especie muy grande de trico e infa allí.Es uno de los organismos más grandes en el intestino de las termitas. A medida que se avanza y se observan áreas que no contienen estas grandes células de protozoos, se puede ver que el fondo, este tipo de líquido intersticial, también está cargado de espiquetas y otras células bacterianas. Por lo tanto, ya sabe, la complejidad no disminuye ni siquiera en esos espacios.Una de las cosas que debo señalar es que el volumen típico del extracto del intestino posterior, como el que hemos observado aquí, oscila entre dos y cinco microlitros, dependiendo del tamaño de la termita. Por lo tanto, la preparación en fresco que he realizado aquí representa realmente una dilución de al menos uno a veinte de ese entorno. Así pues, estas especies están empaquetadas de forma mucho más densa en el intestino intacto real de lo que se representa aquí.Esto les da una idea de la densidad, así como de la diversidad de la vida en este entorno. Hoy les he mostrado cómo aislamos el ADN del intestino de las termitas utilizando estas muestras purificadas. Ahora vamos a poder aplicar conjuntos específicos de cebadores dirigidos.Es decir, vamos a analizar genes para una deshidrogenasa, la deshidrogenasa de monóxido de carbono y la síntesis de tetrahidrofolato formal, que son tres de los conjuntos de cebadores que nuestro laboratorio ha desarrollado. Estamos interesados en estudiar la diversidad y las características específicas de la secuencia de varios de estos genes diferentes en este ambiente. Esto implicará la amplificación por PCR de los distintos genes, su clonación, secuenciación y la elaboración de inventarios genéticos.En función de los resultados, podemos obtener información sobre la naturaleza de algunas de estas interacciones y, específicamente, sobre cómo se construyen estas vías en estos diferentes microorganismos mediante este proceso.

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Investigación

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Biology

Biología

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Aprende a extraer ADN de microbios intestinales de termitas Zootermopsis angusticollis y visualizar su comunidad microbiana. Este método revela la diversidad y complejidad de las interacciones en el intestino posterior.

Extracción de ADN de los microbios del intestino de las termitas (Zootermopsis Angusticollis) y visualizar microbios intestinales (Video) | JoVE Journal

Extracción de ADN de los microbios del intestino de las termitas (Zootermopsis Angusticollis) y visualizar microbios intestinales

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