Name: Dos Métodos de Formación heterocarión para descubrir los factores de restricción del VHC (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2012-07-16T12:00:00.000+00:00
Duration: 16 min 49 s
Description: Aprende dos métodos de formación de heterocariones para identificar factores de restricción del VHC en líneas celulares. Estas técnicas permiten estudiar el ciclo de replicación viral mediante fusión celular con polietilenglicol o glicoproteína de virus espumoso.

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Estamos muy agradecidos a Takaji Wakita y Jens Bukh de JFH1 y aislados J6CF, respectivamente. Además agradecemos a Charles Rice de Huh-7.5 células y el anticuerpo 9E10, Steven Foung para el anticuerpo específico de CBH E2-23, y todos los miembros del Departamento de Virología Experimental, Twincore por sus útiles sugerencias y discusiones.

<ol><li>Zhu, Q., Guo, J. T., Seeger, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Replication+of+hepatitis+C+virus+subgenomes+in+nonhepatic+epithelial+and+mouse+hepatoma+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Replication of hepatitis C virus subgenomes in nonhepatic epithelial and mouse hepatoma cells.</a> J. Virol. 77, 9204-9210 (2003).</li>
<li>Kato, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonhepatic+cell+lines+HeLa+and+293+support+efficient+replication+of+the+hepatitis+C+virus+genotype+2a+subgenomic+replicon%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Nonhepatic cell lines HeLa and 293 support efficient replication of the hepatitis C virus genotype 2a subgenomic replicon.</a> J. Virol. 79, 592-596 (2005).</li>
<li>Ali, S., Pellerin, C., Lamarre, D., Kukolj, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hepatitis+C+virus+subgenomic+replicons+in+the+human+embryonic+kidney+293+cell+line%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Hepatitis C virus subgenomic replicons in the human embryonic kidney 293 cell line.</a> J. Virol. 78, 491-501 (2004).</li>
<li>Date, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genotype+2a+hepatitis+C+virus+subgenomic+replicon+can+replicate+in+HepG2+and+IMY-N9+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Genotype 2a hepatitis C virus subgenomic replicon can replicate in HepG2 and IMY-N9 cells.</a> J. Biol. Chem. 279, 22371-22376 (2004).</li>
<li>Chang, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Replication+of+hepatitis+C+virus+%28HCV%29+RNA+in+mouse+embryonic+fibroblasts%3A+protein+kinase+R+%28PKR%29-dependent+and+PKR-independent+mechanisms+for+controlling+HCV+RNA+replication+and+mediating+interferon+activities%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Replication of hepatitis C virus (HCV) RNA in mouse embryonic fibroblasts: protein kinase R (PKR)-dependent and PKR-independent mechanisms for controlling HCV RNA replication and mediating interferon activities.</a> J. Virol. 80, 7364-7374 (2006).</li>
<li>Zhong, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Robust+hepatitis+C+virus+infection+in+vitro%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Robust hepatitis C virus infection in vitro.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102, 9294-9299 (2005).</li>
<li>Lindenbach, B. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Complete+replication+of+hepatitis+C+virus+in+cell+culture%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Complete replication of hepatitis C virus in cell culture.</a> Science. 309, 623-626 (2005).</li>
<li>Wakita, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Production+of+infectious+hepatitis+C+virus+in+tissue+culture+from+a+cloned+viral+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Med%22%5BJournal%5D)">Production of infectious hepatitis C virus in tissue culture from a cloned viral genome.</a> Nat. Med. 11, 791-796 (2005).</li>
<li>Witteveldt, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CD81+is+dispensable+for+hepatitis+C+virus+cell-to-cell+transmission+in+hepatoma+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Gen.+Virol%22%5BJournal%5D)">CD81 is dispensable for hepatitis C virus cell-to-cell transmission in hepatoma cells.</a> J. Gen. Virol. 90, 48-58 (2009).</li>
<li>Bitzegeio, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Adaptation+of+hepatitis+C+virus+to+mouse+CD81+permits+infection+of+mouse+cells+in+the+absence+of+human+entry+factors%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">Adaptation of hepatitis C virus to mouse CD81 permits infection of mouse cells in the absence of human entry factors.</a> PLoS Pathog. 6, e1000978(2010).</li>
<li>Lindemann, D., Goepfert, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+foamy+virus+envelope+glycoproteins%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Top+Microbiol+Immunol%22%5BJournal%5D)">The foamy virus envelope glycoproteins.</a> Curr Top Microbiol Immunol. 277, 111-129 (2003).</li>
<li>Brohm, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+determinants+important+for+hepatitis+C+virus+p7+function+in+morphogenesis+by+using+trans-complementation%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Characterization of determinants important for hepatitis C virus p7 function in morphogenesis by using trans-complementation.</a> J. Virol. 83, 11682-11693 (2009).</li>
<li>Steinmann, E., Brohm, C., Kallis, S., Bartenschlager, R., Pietschmann, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+trans-encapsidation+of+hepatitis+C+virus+RNAs+into+infectious+virus-like+particles%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Efficient trans-encapsidation of hepatitis C virus RNAs into infectious virus-like particles.</a> J. Virol. 82, 7034-7046 (2008).</li>
<li>Koutsoudakis, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+the+early+steps+of+hepatitis+C+virus+infection+by+using+luciferase+reporter+viruses%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Characterization of the early steps of hepatitis C virus infection by using luciferase reporter viruses.</a> J. Virol. 80, 5308-5320 (2006).</li>
<li>Frentzen, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Completion+of+hepatitis+C+virus+replication+cycle+in+heterokaryons+excludes+dominant+restrictions+in+human+non-liver+and+mouse+liver+cell+lines%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">Completion of hepatitis C virus replication cycle in heterokaryons excludes dominant restrictions in human non-liver and mouse liver cell lines.</a> PLoS Pathog. 7, e1002029(2011).</li>
<li>Lindemann, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+particle-associated+glycoprotein+signal+peptide+essential+for+virus+maturation+and+infectivity%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">A particle-associated glycoprotein signal peptide essential for virus maturation and infectivity.</a> J. Virol. 75, 5762-5771 (2001).</li>
<li>Blight, K. J., McKeating, J. A., Rice, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Highly+permissive+cell+lines+for+subgenomic+and+genomic+hepatitis+C+virus+RNA+replication%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Highly permissive cell lines for subgenomic and genomic hepatitis C virus RNA replication.</a> J. Virol. 76, 13001-13014 (2002).</li>
</ol>

TP recibieron honorarios por consultoría de Biotest.

Se presentan dos métodos para inducir la formación heterocarión en células cultivadas para el análisis de las restricciones dominantes negativos que impiden la replicación del HCV. El uso de estos procedimientos se excluyó la presencia de un factor dominante expresa constitutivamente o inducida por virus, en diversas humano no-hígado y en murinos líneas de células hepáticas. El primer ensayo analiza principalmente si los factores de restricción impida la colocación del VHC y la liberación de la progenie infecciosa. Dado...

<table border="1"><tbody><tr><td> Nombre del reactivo </td><td> Empresa </td><td> Número de catálogo </td></tr><tr><td> DMEM </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> 41965-039 </td></tr><tr><td> L-glutamina </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> 25030-024 </td></tr><tr><td> No aminoácidos esenciales </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> 11140-035 </td></tr><tr><td> La penicilina / estreptomicina </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> 15140-122 </td></tr><tr><td> Suero de ternera fetal </td><td> PAA, Cölbe, Alemania </td><td> A15151 </td></tr><tr><td> α-E2 (CBH23) </td><td> amablemente proporcionados por Steven Foung 10 </td><td></td></tr><tr><td> ATP </td><td> Sigma, Steinheim, Alemania </td><td> A2833-106 </td></tr><tr><td> El glutatión </td><td> Sigma, Steinheim, Alemania </td><td&gt; G4251-1G </td></tr><tr><td> Blasticidin </td><td> Invivo Gen, San Diego, EE.UU. </td><td> Ant-V-1 </td></tr><tr><td> G418 (geneticina) </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> 11811-064 </td></tr><tr><td> Polietileno-glicol-1500 </td><td> Roche, Mannheim, Alemania </td><td> 10783641001 </td></tr><tr><td> Paraformaldehído </td><td> Roth, Karlsruhe, Alemania </td><td> 0335.3 </td></tr><tr><td> Triton X-100 </td><td> Roth, Karlsruhe, Alemania </td><td> 3051.2 </td></tr><tr><td> Suero de cabra </td><td> Sigma, Steinheim, Alemania </td><td> G9023-5 ml </td></tr><tr><td> α-NS5A (9E10) </td><td> Por cortesía de Charles Rice 7 </td><td></td></tr><tr><td> DAPI (4 &#39;, 6&#39;-diamino-2-fenilindol diclorhidrato) </td><td> Invitrogen </td><td> D1306 </td></tr><tr><td> Alexa-Fluor 546 - de cabra anti-IgG humana </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> A21089 </td&gt; </tr><tr><td> Alexa-Fluor 488 - de cabra anti-IgG de ratón </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> A10680 </td></tr><tr><td> Lipofectamine 2000 </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> 11668-019 </td></tr><tr><td> CellTracker CMTMR </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> C2927 </td></tr><tr><td> CellTracker CMFDA </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Alemania </td><td> C2925 </td></tr><tr><td> Fluoromount </td><td> Sigma, Steinheim, Alemania </td><td> F4680-25ML </td></tr><tr><td> Todos los otros productos químicos </td><td> Roth, Karlsruhe, Alemania </td><td></td></tr><tr><td> Materiales de cultivo celular </td><td> Sarstedt, Nümbrecht, Alemania </td><td></td></tr></tbody></table>

dos métodos de formación heterocarión para descubrir los factores de restricción del vhc

Two Methods of Heterokaryon Formation to Discover HCV Restriction Factors

La hepatitis C (VHC) es un virus hepatotropos con una gama de hospedadores limitada a los seres humanos y los chimpancés. Aunque la replicación del ARN VHC se ha observado en humanos líneas celulares no hepáticos y murino, la eficiencia fue muy baja y requeridas a largo plazo utilizando los procedimientos de selección VHC replicón construye expresar dominantes antibióticos seleccionables marcadores 1-5. VHC en la investigación in vitro se limita por tanto a humanos líneas celulares de hepatoma permisivas para la entrada del virus y la finalización del ciclo vital del virus. Debido a AVC tropismo especies de estrecho, no existe un modelo animal pequeño inmunocompetente disponible que sustenta el ciclo completo de replicación del VHC 6-8. La replicación ineficiente del VHC en células no humanas, por ejemplo de origen de ratón es probablemente debido a la falta de incompatibilidad genética de los factores esenciales de acogida de dependencia y / o expresión de los factores de restricción. Hemos investigado si la propagación del VHC es suprimida por fa restricción dominantectors en cualquiera de las líneas celulares humanas derivadas de tejidos no hepáticos o en líneas celulares de ratón hígado. Para este fin, hemos desarrollado dos independientes condicionales trans-complementación métodos que dependen de la fusión de células somáticas. En ambos casos, la terminación del ciclo de replicación viral sólo es posible en los heterocariones. En consecuencia, el éxito trans-complementación, que se determina midiendo la producción de novo de progenie viral infecciosa, indica la ausencia de restricciones dominantes. Específicamente, subgenómico replicones HCV que transportan un transgén luciferasa fueron transfectadas en células de hepatoma humano altamente permisivas (Huh-7.5 células). Posteriormente, estas células fueron co-cultivadas y fusionado a diversas células humanas y murinas que expresan las proteínas estructurales del núcleo del VHC, sobres 1 y 2 (E1, E2) y accesorio proteínas p7 y NS2. A condición de que la fusión celular fue iniciada por tratamiento con polietilenglicol (PEG), la cultura liberado infecciosa viral PArtículos que se infectan células de los animales de una manera dependiente del receptor. Para evaluar la influencia de las restricciones dominantes en el ciclo vital del virus completo incluyendo entrada a la célula, la replicación del ARN de traducción, y el ensamblaje del virus, que se aprovechó de una línea de células del hígado humano (Huh-7 células Lunet N 9), que carece de expresión endógena de CD81, un factor esencial de la entrada del VHC. En ausencia de ectópica expresó CD81, estas células son esencialmente refractario a la infección por HCV 10. Es importante destacar que, cuando se co-cultivaron y se fusionan con las células que expresan CD81 humano, pero la falta al menos otro factor crucial para la entrada de células (es decir, SR-BI, CLDN1, OCLN), sólo los que resulten heterocariones mostrar el conjunto completo de factores de entrada para la infección por VHC necesarias. Por lo tanto, para analizar si los factores dominantes de restricción suprimir la terminación del ciclo de replicación del HCV, que funden Lunet N celdas con varias células de origen humano y de ratón que cumplen la crit anteriormente mencionadoEria. Cuando se co-cultivos de células se transfectaron con un proteína de la envoltura vírica altamente fusogénica mutante del virus espumoso prototipo (PFV 11) y posteriormente desafiados con partículas infecciosas de HCV (HCVcc), de la producción de novo de virus infeccioso se observó. Esto indica que el VHC completó con éxito su ciclo de replicación en heterocariones descartando así la expresión de factores de restricción dominantes en estas líneas celulares. Estos nuevos condicionales trans-complementación métodos serán útiles para examinar un amplio panel de líneas celulares y células primarias para la expresión del VHC factores específicos de restricción dominantes.

Se describen dos métodos para la condicional<em&gt; Trans</em&gt;-La complementación de la hepatitis C (VHC) el montaje y la realización del ciclo de vida viral, que se basan en la formación de heterocarión. Estas técnicas son adecuadas para la detección de líneas celulares que expresan los factores dominantes de restricción, lo que impide la producción de progenie infecciosa del VHC.

Dos Métodos de Formación heterocarión para descubrir los factores de restricción del VHC

El virus de la hepatitis C (VHC) es un virus hepatotrópico con un rango de hospedadores restringido a humanos y chimpancés. Aunque se ha observado la replicación del ARN del VHC en ...

El objetivo de este procedimiento es investigar el impacto de los factores de restricción en la finalización del ciclo de replicación del virus de la hepatitis C en una línea celular determinada, utilizando dos métodos que dependen de la formación de hécadas. Para el primer método, comience por cultivar células hepáticas humanas, así como células empaquetadoras HeLa y Hep56.1D. A continuación, transfecte el ARN del virus de la hepatitis C o VHC en las células hepáticas mediante electroforesis. Posteriormente, fusione la línea celular que replica el VHC con la línea celular empaquetadora respectiva mediante polietilenglicol en el segundo método de fusión. El primer paso consiste en la producción de un stock de VHC de alto título.A continuación, se realiza un cultivo conjunto de diferentes líneas celulares y se induce la fusión celular mediante la transfección del glicoproteína del virus espumoso prototípico. Luego, los heterocariones se infectan con VHC. Tras cualquiera de los métodos de formación de heterocariones, se lleva a cabo microscopía de fluorescencia para confirmar la fusión, y se cuantifica la producción de partículas infecciosas.La principal ventaja de esta técnica es qu

two-methods-heterokaryon-formation-to-discover-hcv-restriction

Research

Investigación

JoVE Journal

Immunology and Infection

Inmunología e Infección

Un método flexible y eficiente para la caracterización de la localización de la proteína tipo de células específicas y nucleocytoplasmic ir y venir se describe. Este enfoque heterocarión utiliza fluorescencia marcado con proteínas de fusión a la proteína localizaciones imagen después de la fusión celular. El protocolo es susceptible de estado estacionario localizaciones o más determinaciones dinámicas basadas en imágenes de células vivas.

Heterocarión Técnica para el Análisis de tipo de células específicas de localización

Source: Ren, S., et al. A Protocol for Analyzing Hepatitis C Virus Replication. J. Vis. Exp. (2014).This video demonstrates an immunofluorescence-based method to detect Hepatitis C virus replication in infected hepatoma cells. The protocol involves cell fixation, antibody staining for viral protein and double-stranded RNA, and visualization using fluorophore-tagged secondary antibodies. Dual signal detection under a fluorescence microscope confirms active viral replication within the host cells.

Immunofluorescence Assay to Detect Hepatitis C Virus Replication Complexes in Infected Cells

El virus de la hepatitis C (VHC) es un importante patógeno humano que causa trastornos hepáticos, como cirrosis y cáncer. Un sistema de cultivo de células infecciosas del VHC es esencial para comprender el mecanismo molecular de la replicación del VHC y desarrollar nuevos enfoques terapéuticos. Aquí describimos un protocolo para investigar varias etapas del ciclo de replicación del VHC.

Un protocolo para el análisis de la hepatitis C de replicación del virus

La patogénesis del VIH-1 se define tanto por las características virales como por los factores genéticos del huésped. Aquí describimos un método robusto que permite mediciones reproducibles para evaluar el impacto de la variación de la secuencia del gen gag en la capacidad de replicación in vitro del virus.

Una enzima de restricción método basado clonación para evaluar la<em&gt; In vitro</em&gt; Capacidad de replicación del VIH-1 subtipo C Gag-MJ4 quiméricos virus

Aquí se describe un virus de la hepatitis B de nuevo desarrollo sistema indicador (HBV) para supervisar las primeras etapas del ciclo de vida de HBV. Esta simplificado sistema in vitro ayudará en la selección de agentes anti-HBV utilizando una estrategia de alto rendimiento.

Desarrollo de un sistema reportero virus de la hepatitis B para supervisar las primeras etapas del ciclo de replicación

gotitas de lípidos son orgánulos importantes para la replicación de varios patógenos, incluyendo el virus de la hepatitis C (VHC). Se describe un método para aislar las gotas de lípidos para la espectrometría de masas cuantitativa de proteínas asociadas; se puede utilizar bajo una variedad de condiciones, tales como infección por el virus, el estrés ambiental, o tratamiento con fármacos.

Aislamiento gotas de lípidos para el análisis cuantitativo de Espectrometría de Masas

Aquí describimos la generación en vitro de ADN del VHB a través de un sistema de infección de virus de Hepatitis B y la detección altamente sensible de su integración de (1 – 2 copias) con inversa nested PCR.

Detección de copia baja número DNA Viral integradora formada por In Vitro la infección Hepatitis B

Aquí, presentamos un método para el cribado de agentes virales antihepatitis B que inhiben la interacción HBx-DDB1 utilizando un sistema de ensayo de luciferasa dividida. Este sistema permite una fácil detección de interacciones proteína-proteína y es adecuado para identificar inhibidores de dichas interacciones.

Identificación de inhibidores de la interacción HBx-DDB1 mediante un sistema de ensayo de Luciferase dividido

Este manuscrito describe un protocolo detallado para la infección por el virus de la hepatitis B (VHB) en células 293T de ingeniería novedosa (293T-NE-3NR, expresando NTCP humano, HNF4, RXR y PPAR) y células hepáticas tradicionales (HepG2-NE, expresando NTCP humano).

Modelado de la infección por el virus de la hepatitis B en células no hepáticas 293T-NE-3R

El protocolo describe un método para introducir una diversidad genética controlable en el genoma del virus de la hepatitis C mediante la combinación de la síntesis de ARN mutante de longitud completa mediante PCR propensa a errores y genética inversa. El método proporciona un modelo para la selección del fenotipo y se puede utilizar para genomas de virus de ARN de sentido positivo de 10 kb de largo.

Genética inversa para diseñar variantes de virus de ARN de sentido positivo

Presentamos un protocolo para detectar compuestos contra el virus de la hepatitis B (VHB) dirigidos a las etapas del ciclo de vida de entrada pre y post-viral, utilizando calorimetría de titulación isotérmica para medir la afinidad de unión (KD) con el polipéptido cotransportador de taurocolato de sodio del huésped. La eficacia antiviral se determinó a través de la supresión de los marcadores del ciclo de vida viral (formación de ADNcc, transcripción y ensamblaje viral).

Un modelo competente de hepatocitos que examina la entrada del virus de la hepatitis B a través del polipéptido cotransportador de taurocolato de sodio como objetivo terapéutico

Aprende dos métodos de formación de heterocariones para identificar factores de restricción del VHC en líneas celulares. Estas técnicas permiten estudiar el ciclo de replicación viral mediante fusión celular con polietilenglicol o glicoproteína de virus espumoso.

Dos Métodos de Formación heterocarión para descubrir los factores de restricción del VHC

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