Un bayesiano novela Cambio de punto Algoritmo para el Genoma en todo el análisis de diversos tipos de datos ChIPseq

10.8K visualizaciones

Citado por 6

12:39 min.

10 de diciembre de 2012

10.3791/4273-v

10 de diciembre de 2012

10.8K visualizaciones

Nuestro punto de cambio bayesiano (BCP) algoritmo se basa en los avances del estado de la técnica de modelado en los puntos de cambio a través de modelos ocultos de Markov y los aplica a la cromatina immunoprecipitation secuenciación (ChIPseq) el análisis de datos. BCP funciona bien en ambos tipos de datos amplios y punteada, pero sobresale en la identificación precisa de las islas robustas, reproducibles de enriquecimiento histona difusa.

Explorar más videos

Análisis de datos de ChIP-seq

Chapters in this video

0:05

Título

2:43

Preprocesamiento: Preparación de archivos de entrada para el análisis de puntos de cambio bayesianos (BCP) y densidades de lecturas de ChIP para la detección de islas enriquecidas en datos difusos

4:48

Estimación de la media posterior de la densidad de lecturas de cada bloque mediante la aproximación BCMIX

6:24

Postprocesamiento de las medias posteriores de perfiles de lecturas difusos

7:06

Resultados: Comparación de BCP y SICER en el análisis de datos de modificaciones de histonas

11:47

Conclusión

Related Videos