Name: Automatizado de dispensación acústica para la dilución en serie del péptido Los agonistas de la potencia Ensayos de Determinación (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-11-10T12:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 6 s
Description: Aprende a realizar diluciones en serie de péptidos mediante dispensación acústica automatizada para minimizar la adsorción a plástico y mejorar la determinación de potencia en descubrimiento de fármacos.

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1. Péptido dilución en serie <ol><li> Preparar tampón de ensayo: solución salina tamponada Hanks (HBSS) suplementado con HEPES 25 mM, 0,1% de BSA y 0,5 mM 3-isobutil-1-metilxantina (IBMX), pH 7,4. </li><li> Utilice un dispensador de reactivos a granel para añadir sistemáticamente 5 l de tampón de ensayo a cada pocillo de cinco placas de 384 pocillos de bajo volumen de ensayo. <ol><li> Utilice el software interno para crear un programa de dispensación para 5 l volumen de adición a cada pocillo de una placa de 384 pocillos según las instrucciones del fabricante. </li><li> Sumergir los tubos de distribución de cassette en tampón de ensayo y líquido primordial. </li><li> Coloque 384 pocillos placa de ensayo de bajo volumen en la placa portadora. </li><li> Presiona inicio. </li></ol></li><li> Diluir todas las muestras de péptidos, independientemente de vehículo de almacenamiento, en tampón de ensayo para producir un péptido de stock 100x. NOTA: Los péptidos que requieren la detección pueden proporcionarse en solución salina tamponada con fosfato (PBS) o sulfóxido de dimetilo (DMSO) como se considere apropiado (por ejemplo, DMSO wlos malos tienen un efecto perjudicial sobre los péptidos con modificaciones secundarias como PEGilación). </li><li> Prescindir de 25 l poblaciones de péptidos en columnas 1-5 100x de una microplaca acústicamente cualificado polipropileno de 384 pocillos. Esta placa se designa &quot;fuente placa A &#39;. Asegurar que las placas de origen, pero no placas de destino, son de fondo plano y cumplen con las tolerancias acústicas específicas definidas por el fabricante de los instrumentos acústicos. </li><li> Prescindir de control de referencia 100x 25 l en pocillos A23 y A24 de la placa de fuente de A. </li><li> Dispensar tampón de ensayo 10 l en columnas 11-15 y tampón de ensayo de 30 l en columnas 21-22 de la placa de fuente de A. </li><li> Dispensar tampón de ensayo 10 l en columnas 6-10 y 16-20 columnas de una segunda acústicamente cualificada de 384 pocillos de microplacas de polipropileno. Esta placa se designa &#39;placa de la fuente B&#39;. </li><li> Centrífuga de placas de fuente A y B a 300 xg durante 1 min. Incluir una placa equilibrio adecuado. </li><li> Utilice FLUI acústicad dispensadores integrados en un sistema robótico automatizado para preparar tres secuenciales 1: 100 diluciones intermedias (en tampón de ensayo) de las poblaciones de péptidos 100x de la columna 1 en la fuente de A. NOTA: La programación requiere el software de respuesta a la dosis (facilitada por el fabricante del dispensador de fluido acústico) cambio de formato de placa y permitir tres transferencias acústicas entre los orígenes A y B (véase la Figura 1 para los diseños de placa). Paso 1.9 detalles específicamente el uso de dispensadores de líquidos que se emplean en este laboratorio bajo control robótico automatizado (véase la Tabla de Materiales): <ol><li> placas de origen de carga y placas de ensayo en placa de sección del hotel de la robótica. </li><li> Abra el software automatizado robótica y la carga cambio de formato de placa y protocolos de expansión programa de respuesta a la dosis. Haga clic en &quot;Ejecutar&quot;. NOTA: Automatización instruye a un dispensador de fluido acústico para transferir 250 nl de las columnas 1-5 de la placa de la fuente A en columnas 6-10 de la placa de la fuente B, y un segundo acoustic dispensador de fluido capaz de manejar grandes volúmenes de fluido para rellenar con tampón de ensayo 15 l para mezclar. Automatización luego transfiere la placa de la fuente B de centrífuga y centrifugadoras a 300 xg durante 1 min integrado (una placa equilibrio apropiado en favor de todas las etapas de centrifugación). placa de la fuente B es devuelto a la distribución de productos fluidos acústico para la transferencia de 250 nl de columnas 6-10 de fuente de la placa B en columnas 11-15 de la placa de la fuente A y el relleno con tampón de ensayo de 15 l para mezclar. Automation fuente transferencias placa de la A a la centrifugadora y centrifugadoras en 300 xg durante 1 min integrado. Una placa de fuente se devuelve a la distribución de productos fluidos acústico para la transferencia de 250 nl de columnas 11-15 de la placa de la fuente A en columnas 16-20 de fuente de la placa B y el relleno con tampón de ensayo de 15 l para mezclar. Automatización luego transfiere la placa de la fuente B de centrífuga y centrifugadoras integrado a 300 xg durante 1 min. NOTA: Por último, el protocolo de respuesta a la dosis de dispensación dirige acústico para transferirel volumen requerido de cada uno de los 4 pocillos de la placa fuente diluidas en serie (tanto en la placa de la fuente A y la placa de la fuente B) para construir una curva de 11 puntos completa por duplicado en placas de ensayo (pre-llenado con tampón de ensayo de 5 l en el paso 1.2 anterior ). las transferencias de automatización placa de ensayo a centrífuga integrada y centrífugas a 300 xg durante 1 min. </li></ol></li></ol> 2. Preparación de la célula <ol><li> Descongelar las células criopreservadas de ovario de hámster chino (CHO) que expresan el receptor de ratón objetivo GLP-1 rápidamente en un baño de 37 ºC agua y resuspender en tampón de ensayo de 20 ml. </li><li> suspensión de células Centrifugar durante 5 min a 200 xg a temperatura ambiente (RT). Incluir un equilibrio adecuado. </li><li> Desechar el sobrenadante y resuspender el sedimento celular en tampón de ensayo de 10 ml. </li><li> Diluir celular stock 1: 1 en Trypan azul y determinar la densidad de células viables utilizando un contador de células automatizado. Resuspender las células en tampón de ensayo a 1,6 x 10 6 células por ml (equivalentes a 8.000 células por well de placas de ensayo). </li><li> Utilice un dispensador de reactivos a granel a añadir 5 l de suspensión celular a cada pocillo de las placas de ensayo (que contienen péptidos diluidos en serie en tampón de ensayo 5 l) y se incuba a TA durante 30 min. </li></ol> 3. Ensayo HTRF detección de cAMP <ol><li> Llevar kit de ensayo de cAMP HTRF a TA durante 30 min antes de su uso. </li><li> Preparar cada reactivo HTRF (criptato y d2) por separado a una dilución 1:20 en tampón de lisis (formulación patentada, proporcionado por el fabricante del ensayo de detección de cAMP). NOTA: PRECAUCIÓN: Tampón de lisis contiene fluoruro de potasio (KF) que es tóxico y un teratógeno 13. Para su eliminación, las placas de ensayo que contienen KF deben ser selladas e incinerados, y los residuos líquidos que deben diluirse a &lt;1 mmol / l con agua antes de su eliminación por el desagüe. </li><li> Utilice un dispensador de reactivos a granel para agregar reactivo criptato de 5 l a todos los pocillos de las placas de ensayo. </li><li> Utilice un dispensador de reactivos a granel para agregar reactivo d2 5 l de Columns 1-22 de las placas de ensayo. </li><li> Inmediatamente pipetear manualmente tampón de lisis 5 l en pocillos A23-D24 de las placas de ensayo para dar la unión no específica pocillos de control (NSB), y 5 l de reactivo en los pocillos d2 E23-P24. </li><li> Centrifugar las placas de ensayo durante 1 min a 200 xg a temperatura ambiente para mezclar los pozos. </li><li> Cubrir las placas de ensayo para minimizar la evaporación y foto-blanqueo y se incuba a RT durante 1 hr. </li><li> Medir la señal de fluorescencia de transferencia de energía de resonancia (FRET) usando excitación a 320 nm y emisión a 620 nm y 665 nm usando un lector de placas. </li></ol> Análisis 4. Datos <ol><li> Utilice significar NSB para restar el fondo de todos los pocillos. </li><li> Calcular el% de Delta F de la relación nm 665 nm / 620 como sigue: Ratio = (A 665 nm / 620 nm A) x 10 4 Delta F = ((Relación de la muestra - Relación de NSB) / Relación de NSB)) x 100 donde Relación de NSB = pocillos sin reactivo d2. </li><li> Calcular el% de activatde iones entre las células no estimuladas y células estimuladas con la máxima GLP-1 ligando como sigue: la activación% = (% Delta Fsample - células DeltaFunstimulated%) / (% de células DeltaFGLP-1 estimulada -% de células no estimuladas DeltaF) x 100 </li><li> Analizar las curvas de concentración-respuesta mediante análisis logístico de 4 parámetros, y en el gráfico como la activación% como se define por control de referencia 1. </li></ol>

<ol><li>Naylor, J., Rossi, A., Hornigold, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acoustic+Dispensing+Preserves+the+Potency+of+Therapeutic+Peptides+throughout+the+Entire+Drug+Discovery+Workflow%5BTitle%5D)+AND+%22J.Lab.Autom%22%5BJournal%5D)">Acoustic Dispensing Preserves the Potency of Therapeutic Peptides throughout the Entire Drug Discovery Workflow.</a> J.Lab.Autom. 21 (1), 90-96 (2016).</li>
<li>Campbell, J. E., Drucker, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pharmacology%2C+physiology%2C+and+mechanisms+of+incretin+hormone+action%5BTitle%5D)+AND+%22Cell.Metab%22%5BJournal%5D)">Pharmacology, physiology, and mechanisms of incretin hormone action.</a> Cell.Metab. 17 (6), 819-837 (2013).</li>
<li>Hui, H., Farilla, L., Merkel, P., Perfetti, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+short+half-life+of+glucagon-like+peptide-1+in+plasma+does+not+reflect+its+long-lasting+beneficial+effects%5BTitle%5D)+AND+%22Eur.J.Endocrinol%22%5BJournal%5D)">The short half-life of glucagon-like peptide-1 in plasma does not reflect its long-lasting beneficial effects.</a> Eur.J.Endocrinol. 146 (6), 863-869 (2002).</li>
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<li>Ekins, S., Olechno, J., Williams, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dispensing+Processes+Impact+Apparent+Biological+Activity+as+Determined+by+Computational+and+Statistical+Analyses%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Dispensing Processes Impact Apparent Biological Activity as Determined by Computational and Statistical Analyses.</a> PLoS ONE. 8 (5), 62325(2013).</li>
<li>Goebel-Stengel, M., Stengel, A., Tache, Y., Reeve, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+importance+of+using+the+optimal+plasticware+and+glassware+in+studies+involving+peptides%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.Biochem%22%5BJournal%5D)">The importance of using the optimal plasticware and glassware in studies involving peptides.</a> Anal.Biochem. 414 (1), 38-46 (2011).</li>
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<li>Grant, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Achieving+accurate+compound+concentration+in+cell-based+screening%3A+validation+of+acoustic+droplet+ejection+technology%5BTitle%5D)+AND+%22J.Biomol.Screen%22%5BJournal%5D)">Achieving accurate compound concentration in cell-based screening: validation of acoustic droplet ejection technology.</a> J.Biomol.Screen. 14 (5), 452-459 (2009).</li>
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<li>Butler, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+the+site-specific+retargeting+jump-in+platform+cell+line+to+support+biologic+drug+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22J.Biomol.Screen%22%5BJournal%5D)">Use of the site-specific retargeting jump-in platform cell line to support biologic drug discovery.</a> J.Biomol.Screen. 20 (4), 528-535 (2015).</li>
<li>Panchal, S., Verma, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+sodium+fluoride+in+maternal+and+offspring+rats+and+its+amelioration%5BTitle%5D)+AND+%22Asian+Pac.J.Reprod%22%5BJournal%5D)">Effect of sodium fluoride in maternal and offspring rats and its amelioration.</a> Asian Pac.J.Reprod. 3 (1), 71-76 (2014).</li>
<li>Hanson, S. M., Ekins, S., Chodera, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modeling+error+in+experimental+assays+using+the+bootstrap+principle%3A+understanding+discrepancies+between+assays+using+different+dispensing+technologies%5BTitle%5D)+AND+%22J.Comput.+Aided+Mol.Des%22%5BJournal%5D)">Modeling error in experimental assays using the bootstrap principle: understanding discrepancies between assays using different dispensing technologies.</a> J.Comput. Aided Mol.Des. 29 (12), 1073-1086 (2015).</li>
<li>Harris, D., Olechno, J., Datwani, S., Ellson, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gradient%2C+Contact-Free+Volume+Transfers+Minimize+Compound+Loss+in+Dose-Response+Experiments%5BTitle%5D)+AND+%22J.Biomol.+Screen%22%5BJournal%5D)">Gradient, Contact-Free Volume Transfers Minimize Compound Loss in Dose-Response Experiments.</a> J.Biomol. Screen. 15 (1), 86-94 (2010).</li>
<li>Chan, G. K. Y., Wilson, S., Schmidt, S., Moffat, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unlocking+the+potential+of+high-throughput+drug+combination+assays+using+acoustic+dispensing%5BTitle%5D)+AND+%22J.Lab.Autom%22%5BJournal%5D)">Unlocking the potential of high-throughput drug combination assays using acoustic dispensing.</a> J.Lab.Autom. 21 (1), 125-132 (2016).</li>
<li>Roberts, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Implementation+and+challenges+of+direct+acoustic+dosing+into+cell-based+assays%5BTitle%5D)+AND+%22J.Lab.Autom%22%5BJournal%5D)">Implementation and challenges of direct acoustic dosing into cell-based assays.</a> J.Lab.Autom. 21 (1), 76-89 (2016).</li>
</ol>

Los autores no tienen nada que revelar.

Este protocolo describe la aplicación exitosa de dispensación acústico automatizado para diluir en serie muestras de péptidos en un rango de concentración de 3 x 10 6 que requiere menos de 1 l de muestra. La principal ventaja de este método es aumentar la calidad de los datos a través de minimizar la adsorción de péptido a recipientes de plástico a través de una menor exposición de las muestras a los contenedores experimentales y recipientes de plástico (por ejemplo, puntas de pipeta) que normalmente se requi...

El GLP-1R es una diana de fármaco establecido en el tratamiento de la diabetes tipo 2 2. El agonista de péptido nativo para este receptor, GLP-1, tiene una in vivo la vida media de 2 a 3 min 3. La unión de GLP-1 a sus acoplados a proteínas G resultados receptor diana en la producción corriente abajo de la segunda mensajero AMPc a través de acoplamiento nativo proteína G a la activación de la adenilato ciclasa. La medición de la cAMP acumulado proporciona un sólido ensayo para controlar la activación del receptor y para la detección de activos análogos de GLP-1 con propiedades físico-químicas preferidas. un ensayo de este tipo requiere la dilución en serie de muestras de ensayo para construir las curvas de concentración-respuesta, y esto es particularmente complicada cuando se entrega muestras de péptidos. Los errores potenciales de preparación de la dilución en serie basada en la punta se han descrito anteriormente 1,4,5. Los péptidos se adsorben a recipientes de plástico, lo que resulta en estimaciones de potencia poco fiables. pérdida de péptido puede ser minimizado a través de tque la inclusión de la albúmina de suero bovino (BSA) en tampones y el uso de recipientes de plástico siliconado, sin embargo, la proteína de unión sigue siendo impredecible. En particular, la variación en la unión de GLP-1 a recipientes experimentales se ha descrito 6. Existe una complicación adicional en la que los agentes de estabilización utilizados en recipientes de plástico de laboratorio pueden filtrarse desde las puntas y las placas de microtitulación en tampones de ensayo acuosas e interferir con la función de la proteína 7, 8. Por lo tanto, los métodos para reducir la exposición a los recipientes de plástico son necesarios para aumentar la precisión de las mediciones. Dispensadores de líquido acústicos centran una señal acústica de alta frecuencia sobre la superficie de una muestra de fluido, dando como resultado la expulsión de gotitas de nanolitros precisas en una placa de ensayo adyacente 9. El uso de eyección acústica es estándar en la industria farmacéutica para la preparación y selección de grandes bibliotecas de compuestos sintéticos, y la tecnología ha sido bien validado para pequeñas moleculES 10. Hasta donde sabemos, somos el primer grupo de distribución para describir acústica para la preparación de péptidos recombinantes y sintéticos y hemos informado anteriormente de la exactitud mejorada en comparación con los métodos convencionales basados en la punta 1. En este artículo se describe la integración de la preparación de diluciones en serie de péptidos y directos por transferencia acústica sin contacto sobre una placa de manipulación robótica sistema totalmente automatizado. Una serie de métodos que comprenden la transferencia acústica de las muestras se han descrito anteriormente 11. Utilizamos un método de dos etapas para preparar las concentraciones de valores intermedios y para diluir en serie análogos de péptidos para la generación de la curva dosis-respuesta completa. Los péptidos preparados se incuban con las células que expresan el ratón diana GLP-1R, y que utilizan un ensayo disponible comercialmente homogénea de fluorescencia resuelta en el tiempo (HTRF) para medir la acumulación de cAMP dentro de estas células como una lectura de activ agonistas peptídicosdad. El ensayo es robusto y es susceptible de un alto rendimiento formato de 384 pocillos y se aplica de forma rutinaria tanto para el desarrollo y ensayo de detección de drogas proyecta 12.

<table><tbody><tr><td>Hanks' Solución salina equilibrada</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>H8264</td><td></td></tr><tr><td>HEPES</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>H3375</td><td></td></tr><tr><td>Albúmina sérica bovina</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9418</td><td></td></tr><tr><td>3-isobutil-1-metilxantina</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>I7018</td><td>Preparada como culata de 0,5 M en DMSO</td></tr><tr><td>GLP-1 (7-36) amida</td><td>Bachem</td><td>H-6795</td><td>Preparado como un stock de 1 mg/ml en PBS, denominado 'control de referencia 100x'</td></tr> <tr><td>Péptidos de prueba</td><td>Producido internamente en MedImmune</td><td></td><td>Suministrado a varias concentraciones en DMSO o PBS, según corresponda</td></tr><tr><td>Stock de péptidos 100x</td><td>Producido internamente en MedImmune</td><td></td><td>Péptido de prueba diluido en tampón de ensayo a 100 veces la concentración final requerida</td></tr><tr><td>Solución de azul de tripano, 0,4 %</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>15250-061</td><td></td></tr><tr><td>Analizador de células Cedex XS</td><td>Innovatis</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Corning Placas de 384 pocillos, bajo volumen</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>4514</td><td></td></tr><tr><td>Echo Qualified 384-Well Microplaca de polipropileno</td><td>Labcyte Inc.</td><td>P-05525</td><td></td></tr><tr><td>Echo Qualified Reservoir</td><td>Labcyte Inc.</td><td>ER-0055</td><td></td></tr><tr><td>Echo 550 Manipulador de líquidos</td><td>Labcyte Inc.</td><td></td><td>Volúmenes de transferencia de gotas en incrementos de 2,5 nl</td></tr><tr><td>Echo 525 Liquid Handler</td><td>Labcyte Inc.</td><td></td><td>Volúmenes de transferencia de gotas en incrementos de 25 nl</td></tr><tr><td>ACell Automatización de sobremesa&nbsp;</td><td>HighRes Biosolutions</td><td>MC522</td><td></td></tr><tr><td>Cellario Lab Automation Software de programación para robótica de ciencias</td><td>de la vida HighRes Biosolutions</td><td></td><td></td></tr><tr><td>MultidropCombi Dispensador de reactivos</td><td>ThermFisher Scientific</td><td>5840300</td><td>Denominado 'dispensador de reactivos a granel'HTRF</td></tr> <tr><td>cAMP Dynamic 2 kit</td><td>Cisbio Bioassays</td><td>62AM4PEJ</td><td></td></tr><tr><td>EnVision Multilabel Reader</td><td>PerkinElmer</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

automatizado de dispensación acústica para la dilución en serie del péptido los agonistas de la potencia ensayos de determinación

Automated Acoustic Dispensing for the Serial Dilution of Peptide Agonists in Potency Determination Assays

Al igual que con el descubrimiento de fármacos pequeña molécula, el cribado de agonistas de péptidos requiere la dilución en serie de péptidos para producir curvas de concentración-respuesta. Screening péptidos proporciona una capa adicional de complejidad como los métodos de manipulación de muestra basada en la punta convencionales exponen péptidos a una gran superficie de material de plástico, proporcionando una mayor oportunidad para la pérdida de péptido a través de la adsorción. La prevención de la exposición excesiva a recipientes de plástico reduce la pérdida de péptido a través de la adhesión a los plásticos y por lo tanto minimiza las imprecisiones en la predicción de la potencia, y se han descrito anteriormente los beneficios de la acústica de no contacto de dispensación para cribado de alto rendimiento in vitro de agonistas de péptido 1. Aquí hablamos de una solución de automatización totalmente integrado para la preparación de no contacto acústico de diluciones en serie de péptidos en placas de microtitulación utilizando el ejemplo de la detección de agonistas peptídicos en el péptido similar al glucagón-1 receptor de ratón (GLP-1R). Nuestros métodos permiten altaLos ensayos para la detección de agonistas -throughput basados en células y son fácilmente escalable para soportar el aumento de rendimiento de la muestra, o para permitir el aumento del número de copias placa de ensayo (por ejemplo, para un panel de más líneas de células diana).

<html> Como rutina usamos un método de dos pasos para diluir los péptidos a través de transferencia acústica. Para el primer paso, un distribuidor acústico alineado con la automatización se utiliza para crear cuatro diluciones intermedias de stock de péptidos a través de dos placas de origen (Figura 1a, b). Para la segunda etapa, se utiliza un distribuidor acústico para diluir aún más diluciones del stock de placas de fuente A y B para crear un intervalo ...

La adsorción de péptidos a los materiales de plástico durante las diluciones en serie tradicionales basadas en puntas puede afectar significativamente la determinación de la potencia y confundir la comprensión de las relaciones estructura-actividad utilizadas para las fases de identificación y optimización de pistas del descubrimiento de fármacos. Aquí se describen los métodos para la dilución en serie acústica automatizada sin contacto de muestras de péptidos.

Automatizado de dispensación acústica para la dilución en serie del péptido Los agonistas de la potencia Ensayos de Determinación

As with small molecule drug discovery, screening for peptide agonists requires the serial dilution of peptides to produce concentration-response curves. ...

El objetivo general de este protocolo automatizado para la dilución seriada de muestras de péptidos es minimizar la absorción del péptido al material plástico, lo que permite una determinación precisa de la potencia en el descubrimiento de fármacos. Este método puede aumentar la calidad y la reproducibilidad de los datos, y la eliminación de la pipetación basada en puntas también evita la transferencia cruzada de muestras, de modo que los errores no se propaguen a lo largo de toda la dilución seriada. La principal ventaja de esta técnica es que mejora la calidad de los datos al minimizar la absorción del péptido al material plástico.Esto es particularmente importante para impulsar una campaña de identificación de relaciones estructura-actividad o de compuestos iniciales en el descubrimiento de fármacos. Después de preparar el tampón de ensayo y crear un programa de dispensación para un dispensador masivo según el protocolo descrito, sumerja los tubos del casete de dispensación en el tampón de ensayo y purgue con líquido. Coloque una placa de ensayo de bajo volumen de 384 pocillos sobre un portaplacas.Luego, presione inicio. Dispense 25 microlitros de stocks de péptido 100 veces en

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Investigación

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Biochemistry

Bioquímica

Normas de isótopos estables y de captura de anticuerpos anti-péptido (SISCAPA) enriquecimiento de las parejas de afinidad de los péptidos con una dilución de isótopos estables de espectrometría de masas (MRM-MS) para proporcionar una medición cuantitativa de los péptidos como sustitutos de sus respectivas proteínas. A continuación se describe el protocolo de uso de partículas magnéticas en un formato parcialmente automatizado.

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Este protocolo demuestra el registro en tiempo real de las relaciones de dosis-respuesta completa para la activación gpCR inducida por agonistas a partir de una sola capa de células cultivada en un solo microelectrodo mediante mediciones de impedancia sin etiquetas. El nuevo esquema de dosificación aumenta significativamente el rendimiento sin pérdida en la resolución de tiempo.

Protocolo de dosificación escalonada para aumentar el rendimiento en ensayos GPCR basados en impedancia sin etiquetas

Este flujo de trabajo describe el rendimiento del enriquecimiento eficiente en tiempo y costo de múltiples modificaciones post-traduccionales de proteínas (PTF) simultáneamente para el análisis proteómico global cuantitativo. El protocolo utiliza el enriquecimiento de PTM a nivel de péptido con múltiples anticuerpos conjugados, seguido de un análisis de espectrometría de masas de adquisición independiente de datos para obtener información biológica sobre la conversación cruzada PTM.

Enriquecimiento de afinidad simultánea de dos modificaciones post-traduccionales para la cuantificación y la localización del sitio

En este trabajo, se describe un ensayo de fluorescencia de calcio intracelular de alto rendimiento para placas de 384 pocillos para examinar bibliotecas de moléculas pequeñas en receptores acoplados a proteínas G recombinantes (GPCR). El objetivo, el receptor de cinina de la garrapata de la fiebre del ganado, Rhipicephalus microplus, se expresa en las células CHO-K1. Este ensayo identifica agonistas y antagonistas utilizando las mismas células en un ensayo de "doble adición".

Un ensayo de fluorescencia de calcio de "doble adición" para el cribado de alto rendimiento de receptores acoplados a proteínas G recombinantes

Aquí, describimos un flujo de trabajo de proteómica para la caracterización del proteoma de la superficie celular de varios tipos de células. Este flujo de trabajo incluye el enriquecimiento de proteínas en la superficie celular, la posterior preparación de muestras, el análisis mediante una plataforma LC-MS/MS y el procesamiento de datos con software especializado.

Flujo de trabajo "Cell Surface Capture" para la cuantificación sin etiquetas del proteoma de la superficie celular

Aprende a realizar diluciones en serie de péptidos mediante dispensación acústica automatizada para minimizar la adsorción a plástico y mejorar la determinación de potencia en descubrimiento de fármacos.

Automatizado de dispensación acústica para la dilución en serie del péptido Los agonistas de la potencia Ensayos de Determinación (Video) | JoVE Journal

Automatizado de dispensación acústica para la dilución en serie del péptido Los agonistas de la potencia Ensayos de Determinación

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