Name: Expresión, purificación y actividad antimicrobiana de S100A12 (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-05-13T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 10 s
Description: Aprende a expresar y purificar S100A12 para evaluar su actividad antimicrobiana contra H. pylori mediante ensayos microbiológicos cuantitativos. Este protocolo optimizado proporciona altos rendimientos de dímero estable puro.

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Esta investigación fue apoyada por el Departamento de Asuntos de Veteranos Premio de Desarrollo de Carrera 1IK2BX001701, CTSA premio UL1TR000445 del Centro Nacional para el Avance Translational Sciences, la Fundación Nacional de Ciencias Premio Números 1547757 y 1400969, y el NIH concesión GM05551. Su contenido es exclusivamente responsabilidad de los autores y no necesariamente representan puntos de vista oficiales del Centro Nacional para el Avance de las Ciencias Translacionales o los Institutos Nacionales de Salud.

1. Expresión de S100A12 <ol><li> Transformar células BL21 DE3 competentes con un plásmido pGEMEX-S100a12 usando un protocolo de choque térmico estándar 18 . Añadir 1 a 5 μL de plásmido a 50 μL de bacterias en un tubo de microcentrífuga sobre hielo. Incubar durante 20 min. </li><li> Caliente las células a 42 ° C durante 30 s. </li><li> Incubar las células en hielo durante 2 min. </li><li> Agregue 500 μl de medio SOC a las células. Incubar a 37 ° C con agitación a 250 rpm en un agitador orbital durante 1 h. </li><li> Placa 150 μL de la reacción de transformación en medio LB-agar (suplementado con 100 μg / ml de ampicilina). Incubar durante 12-16 h a 37 ° C. </li><li> Escoja una colonia. Inocular 2 mL de LB (suplementado con 100 μg / mL de ampicilina). </li><li> Incubar durante 4-6 h a 37 ° C en un agitador orbital (300 rpm). El OD 600 debe leer entre 1-3 unidades de absorbancia. </li><li> Añadir 500 μl de cultivo inicial a 50 ml de ZYM-5052 autoinduCtion 26 suplementado con 100 μg / ml de ampicilina. Para obtener la mejor aireación y máxima expresión, utilice un matraz erlenmeyer de 250 ml. Agitar (300 rpm) durante 24 h, a 37ºC. </li><li> Transferir la suspensión bacteriana a un tubo de centrífuga. Se peletean las células por centrifugación (4.000 xg, 10 min) a 4 ° C. </li><li> Decantar el medio, registrar la muestra y almacenar la pasta celular a -80 ° C. La muestra es estable durante años. </li></ol> 2. Purificación de S100A12 usando cromatografía de baja presión <ol><li> Resuspender las células en 30 ml de Tris 20 mM, pH 8,0. </li><li> Sonicar la suspensión en hielo para lisar las células. Utilice ~ 20 W de salida, 5 s on y 5 s off ciclo durante 5 min. </li><li> Transfiera la solución a tubos de centrifugación de alta velocidad. Aclarar el lisado celular por centrifugación, 20.000 xg durante 30 min a 4 ° C. </li><li> Decantar el sobrenadante y transferir a un vaso de precipitados de polipropileno limpio de 100 ml. Enfriar la solución colocando el vaso en hielo. Añade una agitaciónR y añadir lentamente 11,20 g de sulfato de amonio. Dejar que la solución se agite sobre hielo durante 1 h adicional. Esto creará una solución al 60% de sulfato de amonio y precipitará la mayoría de las proteínas endógenas de E. coli . S100A12 permanecerá soluble. </li><li> Centrifugar la solución a 4 ° C, 20.000 xg durante 20 minutos para sedimentar la proteína precipitada. </li><li> Decantar el sobrenadante y transferir al tubo de diálisis (MWCO 3.500 kDa). Dializar contra 1 l de Tris 20 mM, pH 8,0 a 4 ° C. Cambie el tampón de diálisis dos veces. Permita 4 h entre cambios. </li><li> La cromatografía de intercambio aniónico <ol><li> Realizar la cromatografía en un sistema de baja presión. El caudal típico es de 1 ml / min. </li><li> Equilibrar una columna de Sepharose de 5 ml con 10 ml de Tris 20 mM, pH 8,0. </li><li> Cargue los ~ 40 ml de S100A12 solución utilizando la bomba de muestra (recoger el flujo a través). </li><li> Lavar la columna con 10 ml de Tris 20 mM, pH 8. </li><li> Desarrollar la columna con un gradiente 0-30% (BuFfer B es Tris 20 mM, pH 8,0, NaCl 1 M) sobre 19 volúmenes de columna (CV, 95 ml). Recoger fracciones de 5 ml. </li><li> Tomar una alícuota de 10 μL de cada fracción y analizar utilizando MES SDS PAGE con tinción Coomassie. Ejecutar el gel usando un voltaje constante (20 V / cm) durante 30 min. </li><li> Las fracciones de la piscina que contienen S100A12. S100A12 corre a ~ 10 kDa de proteína sobre un gel desnaturalizante. </li><li> Se concentran las fracciones a 5 ml usando un dispositivo de ultrafiltración (MWCO 10 kDa). Centrifugar a 3.000 xg durante ~ 8 min. Tome la fracción superior. </li></ol></li><li> La cromatografía de exclusión de tamaño <ol><li> Equilibrar la columna S75 con 1 CV (120 ml) de Tris 20 mM pH 8, NaCl 100 mM. </li><li> Inyectar &lt;5 ml de fracciones S100A12 concentradas (de la cromatografía de intercambio iónico). </li><li> Desarrollar la columna a un caudal de 1 mL / m sobre 120 mL. Recoger fracciones de 5 ml. </li><li> Tomar una alícuota de 10 μL de cada fracción y analizar utilizando SDS PAGE con tinción Coomassie. Validar la identidad de proteínas utilizandoWestern blot o espectrometría de masas (masa molecular calculada de la subunidad monomérica 10.575,0 Da, medida 10575,4 Da). </li></ol></li><li> Fracciones de piscina <ol><li> Medir la absorbancia de la proteína A 280 usando un espectrofotómetro. Utilice el búfer SEC como un espacio en blanco. El coeficiente de extinción calculado para el homodímero S100A12 es 5960 M -1 cm -1 . NOTA: Los rendimientos típicos son 35-45 mg de S100A12 por 50 mL de cultivo. </li><li> Alícuota S100A12 en tubos de microcentrífuga de 1,5 ml (1 mg / tubo), congelación rápida en nitrógeno líquido y almacenamiento a -80 ° C. </li></ol></li></ol> 3. Ensayos de actividad antimicrobiana <ol><li> Rallar la cepa G27 de H. pylori sobre placas de agar de soja trípticas suplementadas con sangre de oveja al 5% (placas de agar sangre). Crecer 2-3 días a 37 ° C en aire ambiente suplementado con 5% de dióxido de carbono. </li><li> Inocular H. pylori en caldo Brucella suplementado con 1x colesterol. Cultura sobreAgitación nocturna (250 rpm) a 37 ° C en aire ambiente suplementado con 5% de dióxido de carbono. </li><li> Diluir H. pylori 1:10 en 50% de caldo de Brucella, 50% de tampón de calprotectina más 1x colesterol y cultivar en medio solo o suplementado con 100 μM de cloruro de zinc más 0, 100 o 1.000 μg / ml de S100A12 purificado. Cultura agitando durante la noche (250 rpm) a 37 ° C en aire ambiente suplementado con 5% de dióxido de carbono. </li><li> Al día siguiente, realizar diluciones en serie y placa sobre placas de agar sangre. Dejar crecer las colonias bacterianas durante 2-3 días a 37 ° C en aire ambiente suplementado con dióxido de carbono al 5%. Enumerar las unidades formadoras de colonias para calcular el crecimiento bacteriano en presencia o ausencia de S100A12 y / o zinc exógeno. </li></ol>

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</ol>

Los autores declaran que no tienen intereses financieros en competencia.

Se presenta un protocolo eficaz tanto para la expresión como para la purificación de S100A12 humano. El sistema de expresión de E. coli es la herramienta más común usada para la producción de proteínas recombinantes, particularmente cuando se requieren cantidades de mg para estudios bioquímicos y biofísicos. Una mejora clave del procedimiento descrito aquí es el uso de medios de autoinducción 26 que aumenta el rendimiento de proteína purificada por un factor de casi treinta en comparació...

Las proteínas S100 son una clase de la familia EF-mano de proteínas vinculantes de calcio con una amplia gama de funciones [ 1] . Se expresan de una manera específica de tejidos y células, y regulan un amplio espectro de funciones celulares 2 , 3 . Únicas a las proteínas de unión al calcio, las proteínas S100 exhiben funciones intracelulares y extracelulares 4 , 5 . Dentro de la célula, Ca 2 + vinculante induce un cambio conformacional que expone una superficie hidrófoba que se dirige específicamente a los socios de unión a proteínas [ 6] . Este mecanismo intracelular regula importantes procesos como la proliferación celular, la diferenciación y el metabolismo energético. En el medio extracelular, S100 proteínas presentan dos funciones [ 7] . En uno, actúan como patrón molecular asociado al daño (DAMP) e inician una inflamación pro-inflamatoriaRespuesta inmune a través de la interacción con el patrón de reconocimiento de los receptores [ 8 , 9] . Además, varios miembros de la clase de proteína S100 secuestran metales de transición, una función que sirve para matar de hambre a los patógenos microbianos en un proceso denominado inmunidad nutricional 10 , 11 . El S100A12 (también conocido como calgranulina C y EN-RAGE) está altamente expresado en macrófagos y neutrófilos y ha sido identificado como un biomarcador potencial para enfermedades inflamatorias 12 , 13 . Además de fijar calcio en sus sitios EF-Hand, S100A12 tiene dos sitios de unión de metal de transición de alta afinidad situados en extremos opuestos de la interfaz 14 , 15 de dímero. Cada sitio de unión está compuesto por tres residuos de histidina y un residuo de ácido aspártico y puede quelar zinc o cobre &lt;Sup class = &quot;xref&quot;&gt; 16 , 17 . Recientemente, se informó de que S100A12 dependientes de cinc hambre es importante en la regulación Helicobacter pylori crecimiento y la actividad de los factores de virulencia pro-inflamatoria [ 18] . H. pylori infecta el estómago de aproximadamente la mitad de la población humana del mundo; Por lo que sin duda uno de los más exitosos patógenos bacterianos [ 19] . La infección con H. pylori puede conducir a resultados significativos de la enfermedad gástrica incluyendo gastritis, úlcera péptica y duodenal, linfoma linfoide asociado con mucosa (MALT) y adenocarcinoma gástrico invasivo (cáncer de estómago). El cáncer de estómago es la principal causa de muerte asociada al cáncer no cardiaco en el mundo, y el factor de riesgo asociado más grande para el cáncer de estómago es la infección por H. pylori . H. pylori persiste en el nicho gástrico a pesar de un robuSt respuesta inmune al patógeno, lo que subraya la necesidad de una mejor comprensión de los mecanismos inmunes de control de esta infección bacteriana [ 20 , 21 , 22 , 23] . La inflamación asociada a H. pylori se caracteriza por una profunda infiltración de células polimorfonucleares, o neutrófilos, que depositan un repertorio de proteínas antimicrobianas, incluyendo S100A12, en el sitio de infección 18 , 24 , 25 . En un esfuerzo por entender el complejo diálogo entre el huésped y el patógeno, buscamos refinar la técnica para purificar S100A12 y usarla para estudiar el efecto antimicrobiano que ejerce sobre este patógeno relevante desde el punto de vista médico. El protocolo siguiente describe una técnica mejorada para la purificación de S100A12 en su estado biológicamente activo; Capaz de unir metales nutrientes con alto affiniY la quelación de los microorganismos invasores. Además, los métodos a continuación destacan la utilidad de esta proteína como un reactivo crítico para estudiar el mecanismo por el cual las moléculas antimicrobianas innatas restringen el crecimiento de patógenos bacterianos. Las proteínas de la familia S100A han ganado reconocimiento como un importante grupo de moléculas del sistema inmune innatas que participan en la señalización inmunológica así como en la defensa del huésped 27 . El más bien estudiado de estos es calprotectina (MRP-8/14, calgranulina A / B, S100A8 / A9) 28 , 29 , 30 . La calprotectina es una proteína asociada a los neutrófilos que forma un heterodímero de las subunidades S100A8 y S100A9 que se une a los metales de transición en la interfaz dímero [ 31] . Se ha demostrado que la calprotectina posee dos sitios de unión de metal: el sitio 1 puede unirse a Zn 2+ , Mn 2+ o Fe 2+ , y el sitio 2 puede<html> Se unen Zn ^ { 2+} 31 , 32 . Numerosos informes han demostrado que la calprotectina tiene actividades antimicrobianas contra diversos patógenos, incluyendo Staphylococcus aureus , Candida albicans , Acinetobacter baumannii , Klebsiella pneumoniae , Escherichia coli y H. pylori , y que los efectos inhibidores se deben a la actividad de quelación del metal de calprotectina 25 , 28 , 29 . Trabajos previos demostraron que la calprotectina ejerce numerosas actividades sobre H. pylori, incluyendo la alteración de la estructura de los lípidos A en la membrana externa, reprimiendo el sistema de secreción cag- Tipo IV (que es un factor de virulencia proinflamatorio mayor en H. pylori ), induciendo la formación de biofilm y reprimiendo Crecimiento y viabilidad de H. pylori de una manera dependiente de la dosisClass = &quot;xref&quot;&gt; 25 , 33 . Además, los ensayos genéticos y bioquímicos revelaron que la actividad antibacteriana de la calprotectina contra H. pylori se derivaba en gran medida de su capacidad para unirse al nutriente de zinc [ 25] . H. pylori requiere zinc, como se determinó mediante investigaciones previas que utilizaron un medio químicamente definido para determinar los requerimientos de micronutrientes para que este patógeno crezca y prolifere 34 . Además, la calprotectina era muy abundante dentro de los tejidos infectados por H. pylori , y asociada con infiltrados neutrófilos, lo que indica que el huésped puede emplear calprotectina como una estrategia antimicrobiana durante la infección y la posterior inflamación 25 , 35 . La evidencia reciente de las técnicas de detección de la proteómica imparcial sugiere que bajo condiciones donde las especies reactivas del oxígeno son abundantes, calprotecEl estaño experimenta modificaciones postraduccionales que alteran el sitio de unión de hexa-histidina, inhibiendo así la actividad de unión a metal de la proteína 36 . Como tal, la hipótesis de que otras proteínas de la familia S100A entre el amplio repertorio de estas moléculas podrían actuar potencialmente como metal-quelantes auxiliares. Se seleccionó S100A12 para su posterior estudio debido a que no se identificó en la pantalla antes mencionada para modificación post-traduccional, tiene la capacidad de unir zinc y es muy abundante en tejidos humanos derivados de H. pylori . Nuestro trabajo indica que S100A12 puede inhibir el crecimiento y la viabilidad de H. pylori de una manera dependiente de la dosis en la cepa G27 de H. pylori , y que la actividad antimicrobiana de esta proteína puede ser revertida por la adición de exceso de nutrientes de zinc. Este trabajo complementa nuestro trabajo anterior indicando S100A12 ejerció actividad antimicrobiana contra PMSS1 y 7.13 cepas de H. pylori , lo que demuestra su amplia actividad antibacteriana contra numerosos aislamientos clínicos y adaptado a laboratorio cepas de H. pylori [ 18] . En conjunto, estos resultados confirman la importancia de S100A12 como un mecanismo para controlar el crecimiento bacteriano y la proliferación a través de la inmunidad nutricional. Futuros estudios de esta importante interacción huésped-bacteriana podrían incluir explotar la actividad de S100A12 para reducir la carga bacteriana en los tejidos del huésped o determinar la contribución de esta proteína a la señalización inmune en el contexto de la infección por H. pylori .

<table><tbody><tr><td><fuerte>S100A12 Expresión</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td><fuerte>Células de expresión</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>BL 21 (DE3) células competentes</td><td>New England Biolabs</td><td>C25271</td><td></td></tr><tr>Componentes <td></td><td></td><td></td>del<td>medio de autoinducción</td></tr><tr><td>Extracto de levadura</td><td>Productos de investigación Internacional</td><td>Y20020-250.0</td><td></td></tr><tr><td>NaCl</td><td>Productos de Investigación Internacional</td><td>S23020-500.0</td><td></td></tr><tr>Productos de <td>Investigación</td> de<td>Triptona</td><td>Internacional T60060-250.0</td><td></td></tr><tr><td>FeCl3</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F2877</td><td></td></tr><tr><td>MgSO4Productos de</td> <td>Investigación Internacional</td><td>M65240-100.0</td><td></td></tr><tr><td>Na2HPO4</td><td>Research Products International</td><td>S23100-500.0</td><td></td></tr><tr><td>KH2PO4</td><td>Research Products International</td><td>P41200-500.0</td><td></td></tr><tr><td>NH4Cl</td><td>Research Products International</td><td>A20424-500.0</td><td></td></tr><tr><td>Na2SO4</td><td>Research Products International</td><td>S25150-500.0</td><td></td></tr><tr><td>Glycerol</td><td>Research Products International</td><td>G22020-1.0</td><td></td></tr><tr><td>D-glucose</td><td>Research Products International</td><td>G32040-500.0</td><td></td></tr><tr><td>lactosa</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>L2643</td><td></td></tr><tr><td><fuerte>agente de selección</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>ampicilina</td><td>Productos de investigación International</td><td>A40040-5.0</td><td></td></tr><tr><td><fuerte>S100A12 Purificación</fuerte></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>AKTA Sistema de cromatografía de inicio</td><td>GE</td><td>29-220-94</td><td></td></tr><tr><td>HiTrap Q Sepharaose Fast Flow</td><td>GE</td><td>17-5156-01</td><td></td></tr><tr><td>HiPrep 16/60 S-200 HR</td><td>GE</td><td>17-1166-01</td><td></td></tr><tr><td>Espectrofotómetro Nanodrop lite</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>ND-LITE</td><td></td></tr><tr><td>Tris Base</td><td>Research Products International</td><td>T60040-1000.0</td><td></td></tr><tr><td>H. pylori Culture</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Placas de agar</td> sangre <td>Lab Supply Company</td><td>BBL221261</td><td></td></tr><tr><td>Caldo de Brucella</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B3051</td><td></td></tr><tr><td>Colesterol (250x)</td><td>Thermo Fisher Scientific 12531018</td><td></td><td></td></tr><tr><td>NaCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>793566</td><td></td></tr><tr><td>CaCl2</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C4901</td><td></td></tr><tr><td>&beta;-mercaptoetanol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M6250</td><td></td></tr><tr><td>Tris Base</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T1503</td><td></td></tr><tr><td>Cloruro de zinc</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>229997</td><td></td></tr></tbody></table>

expresión, purificación y actividad antimicrobiana de s100a12

Expression, Purification, and Antimicrobial Activity of S100A12

Las proteínas de la calgranulina son mediadores importantes de la inmunidad innata y son miembros de la clase S100 de la familia EF de proteínas de unión al calcio. Algunas proteínas S100 tienen la capacidad de unirse a los metales de transición con alta afinidad y efectivamente secuestrarlos lejos de patógenos microbianos invasores en un proceso que se denomina &quot;inmunidad nutricional&quot;. S100A12 (EN-RAGE) se une tanto al zinc como al cobre y es muy abundante en las células inmunes innatas, como los macrófagos y los neutrófilos. Presentamos un método refinado para la expresión, enriquecimiento y purificación de S100A12 en su configuración activa de unión a metal. La utilización de esta proteína en el crecimiento bacteriano y análisis de viabilidad revela que S100A12 tiene actividad antimicrobiana contra el patógeno bacteriano , Helicobacter pylori . La actividad antimicrobiana se basa en la actividad de unión a zinc de S100A12, que quelates nutrientes de zinc, por lo tanto hambrientos H. pylori que requiere zinc para el crecimiento y pRoliferation.

S100A12 expresión y purificación Una purificación en tres etapas produjo ~ 40 mg de S100A12 recombinante a partir de 50 ml de cultivo bacteriano. El primer paso fue una precipitación con sulfato de amonio de proteínas endógenas de E. coli . Este paso fue seguido por cromatografía de intercambio aniónico ( Figura 1A ). La proteína es rastreada por una SDS-PAGE teñida con Coomassie Brillia...

Aquí, se presenta un método para expresar y purificar S100A12 (calgranulina C). Se describe un protocolo para medir su actividad antimicrobiana contra el patógeno humano H. pylori .

Expresión, purificación y actividad antimicrobiana de S100A12

Calgranulin proteins are important mediators of innate immunity and are members of the S100 class of the EF-hand family of calcium binding proteins. Some ...

El objetivo general de este protocolo es facilitar el aislamiento y la purificación de S100A12 en su forma activa para que pueda utilizarse en ensayos antimicrobianos. Este método puede ayudar a responder preguntas clave en el campo de la microbiología, como cuál es el papel de S100A12, un péptido antimicrobiano, que se produce en respuesta a la infección por bacterias patógenas. La principal ventaja de esta técnica es que nuestro protocolo optimizado proporciona altos rendimientos de dímero de S100A12 puro y estable, que tiene la capacidad de unirse y secuestrar metales nutrientes.Por lo general, las personas nuevas en este método tendrán dificultades porque S100A12 forma oligómeros de tamaños variables bajo ciertas condiciones, y estos oligómeros presentan una actividad antimicrobiana reducida in vitro. Tuvimos la idea inicial de este método cuando comenzamos a purificar y estudiar la actividad antimicrobiana de una proteína relacionada de la familia S100A denominada calprotectina. La demostración visual de este método es fundamental para el tamaño y los pasos finales de purificación en columna.Y los ensayos antimicrobianos son importantes para el éxito de este proceso. Para iniciar este procedimiento, transforme células competentes BL21 DE3 según se describe en el protocolo escrito. A continuación, agregue de uno a cinco microlitros de plásmido a 50 microlitros de bacterias en un tubo de microcentrífuga sobre hielo.Incubar durante 20 minutos. Después de esto, aplicar un choque térmico a las células a 42 grados Celsius durante 30 segundos. Incubar en hielo durante dos minutos.Luego, agregue 500 microlitros de medio SOC. Incube a 37 grados Celsius en un agitador orbital a 250 rpm durante una hora. A continuación, siembre 150 microlitros de la reacción de transformación en medio LB arga, suplementado con 100 microgramos por mililitro de ampicilina.Incubar durante 12 a 16 horas a 37 grados Celsius. Después de la incubación, seleccionar una colonia individual e inocular dos mililitros de medio LB suplementado con ampicilina. Incubar a 37 grados Celsius en un agitador orbital, a 300 rpm, durante cuatro a seis horas.A continuación, agregue 500 microlitros de cultivo inicial a 50 mililitros de medio de autoinducción ZYM 5052 suplementado con ampicilina. Agite a 300 rpm durante 24 horas a 37 grados Celsius. Luego, transfiera la suspensión bacteriana a un tubo de centrífuga.Centrifugar a 4.000 × g y cuatro grados Celsius durante 10 minutos. Después de la centrifugación, desechar el medio, registrar la muestra y almacenar la pasta celular a menos 80 grados Celsius. Para comenzar, resuspender la pasta celular en 30 mililitros de tris 20 milimolar, a pH 8,0. A continuación, sonicar la suspensión en hielo a 20 vatios utilizando un ciclo de cinco segundos encendido y cinco segundos apagado durante cinco minutos para lisar las células.Transfiera la solución sonicada a tubos de centrifugación de alta velocidad. Centrifugue a 20.000 ×g a cuatro grados Celsius durante 30 minutos para clarificar el lisado celular. Después de esto, vierta cuidadosamente el sobrenadante en un vaso de polipropileno limpio de 100 mililitros.Coloque el vaso de precipitados en hielo para enfriar la solución. Añada una barra de agitación y agregue lentamente 11,20 gramos de sulfato de amonio. Agite la solución en hielo durante una hora.Luego, transfiera la solución a tubos de centrífuga y centrifugue a 20.000 × g a cuatro grados Celsius durante 20 minutos para obtener el sedimento de la proteína precipitada. Vierta cuidadosamente el sobrenadante en tubos de diálisis. Realice la diálisis frente a un litro de tris 20 milimolar a cuatro grados Celsius y pH 8,0. Cambie el tampón de diálisis dos veces, con un intervalo de cuatro horas entre cada cambio.A continuación, equilibre una columna de sepharosa de cinco mililitros con 10 mililitros de tris 20 milimolar. Utilizando la bomba de muestra, cargue aproximadamente 40 mililitros de la solución de S100A12. Recoja el flujo que atraviesa.A continuación, lave la columna con tris 20 milimolar. Desarrolle la columna utilizando un gradiente del 0 al 30 % durante 19 volúmenes de columna. Recoja fracciones de cinco mililitros.Utilice una electroforesis SDS-PAGE con tinción de comassie para analizar una alícuota de 10 microlitros de cada fracción. Luego, recupere las fracciones que contienen S100A12. Mediante un dispositivo de ultrafiltración, concentre las fracciones hasta cinco mililitros.A continuación, equilibre una columna S75 con una solución de 120 mililitros de tris 20 milimolar y cloruro de sodio 100 milimolar. Inyecte la muestra de cinco mililitros de las fracciones concentradas. A continuación, eluya la columna a un flujo de un mililitro por minuto durante 120 mililitros.Recolecte fracciones de cinco mililitros. Mediante SDS-PAGE con tinción de coomassie, analice una alícuota de 20 microlitros de cada muestra. Luego, valide la identidad de la proteína y reúna las fracciones según se indica en el protocolo del texto.Para comenzar, realice un aislamiento de H.pylori en caldo de brucella suplementado con 1X colesterol. Incube durante la noche a 37 grados Celsius con agitación a 250 rpm y aire enriquecido con 5% de dióxido de carbono. Diluya el H.pylori uno a diez en una mezcla de 50% de caldo de brucella y 50% de tampón de calprotectina más 1X colesterol.Agregue la proteína S100A12 y/o metales exógenos según sea necesario. Los ensayos antimicrobianos son un punto crítico. Es importante utilizar tampón de calprotectina para garantizar la estabilidad de los dímeros de S100A12, y proporcionar un medio mineral deficiente en metales para los ensayos de crecimiento bacteriológico, de modo que la proteína no se vea abrumada por exceso de micronutrientes, que comúnmente están presentes en medios bacteriológicos complejos y ricos.Al día siguiente, realice diluciones seriadas de las muestras. Luego, siembre en placas de agar sangre. Deje crecer las colonias bacterianas durante dos o tres días a 37 grados Celsius en aire suplementado con 5% de dióxido de carbono.Después de esto, calcule el crecimiento bacteriano según se describe en el protocolo del texto. En este estudio, se presenta un método refinado para expresar y purificar S100A12 en su configuración activa de unión a metales. El proceso de purificación en tres pasos comienza con una precipitación con sulfato de amonio de proteínas endógenas de E.coli, seguida de cromatografía de intercambio aniónico.Después de rastrear la proteína mediante una electroforesis SDS-PAGE con azul brillante de coomassie. Las fracciones que contienen S100A12 se recogen para cromatografía de exclusión por tamaño. S100A12 es un homodímero con 92 aminoácidos por subunidad y tiene un peso molecular total de aproximadamente 21 kilodaltons.La actividad antimicrobiana de la S100A12 se investiga luego mediante técnicas cuantitativas de cultivo microbiológico. El recuento de células bacterianas revela que la exposición a 100 microgramos por mililitro de S100A12 en presencia o ausencia de una fuente exógena de zinc nutriente no inhibió significativamente la viabilidad bacteriana. Sin embargo, la exposición a 1.000 microgramos por mililitro de S100A12 en medio solo provoca una disminución de 69 veces en la viabilidad bacteriana.La adición de una fuente exógena de zinc como nutriente revierte este resultado, lo que demuestra que la actividad antimicrobiana de S100A12 depende de su actividad de secuestro de zinc. Una vez dominada, la expresión y purificación de proteínas puede realizarse en tres o cuatro días, si se lleva a cabo correctamente. Tras seguir este procedimiento, se pueden utilizar otros métodos, como la espectrometría de masas con acoplamiento inductivo, para responder preguntas adicionales.¿De qué manera la quelación de metales restringe el crecimiento microbiano? Tras su desarrollo, esta técnica allanó el camino para que investigadores en el campo de la microbiología exploraran la inmunidad nutricional de H. pylori. Después de ver este video, deberías tener una buena comprensión de cómo expresar, purificar y cuantificar la actividad de la proteína antimicrobiana S100A12.No olvide que trabajar con H.pylori puede ser extremadamente peligroso. Siempre se deben tomar precauciones, como trabajar en un espacio certificado de nivel BS2, al realizar este procedimiento. Las implicaciones de esta técnica se extienden hacia enfermedades gástricas, incluyendo úlcera, gastritis y carcinoma anexial invasivo.Al comprender estos procesos, estaremos mejor preparados para desarrollar nuevas moléculas antimicrobianas que actúen sobre estos procesos. Aunque este método puede proporcionar información sobre la bioquímica de las proteínas de la familia S100A, también puede aplicarse al estudio de su papel en la señalización inmunitaria y en numerosos procesos de enfermedades como el cáncer, la artritis y las enfermedades infecciosas.

expression-purification-and-antimicrobial-activity-of-s100a12

Research

Investigación

JoVE Journal

Biochemistry

Bioquímica

En este video, demostramos una técnica de cromatografía de intercambio aniónico para purificar la S100A12 de proteínas de unión al calcio humano basada en la carga superficial neta de la proteína de un cultivo de Escherichia coli.

Purificación de proteínas basada en cromatografía de intercambio aniónico: una técnica de separación para aislar una proteína de interés del lisado bacteriano dializado basada en la carga neta

Este video muestra un ensayo para investigar la citotoxicidad de las proteínas producidas por Staphylococcus aureus, una bacteria patógena, en leucocitos polimorfonucleares humanos (PMN) aislados. Las proteínas citotóxicas secretadas forman poros en la membrana celular PMN, iniciando la muerte celular. Al teñir las células muertas con yoduro de propidio, se realiza una citometría de flujo para cuantificar las células muertas y evaluar la citotoxicidad de las bacterias.

Un ensayo para la citotoxicidad mediada por proteínas extracelulares bacterianas en PMN

La preparación de extractos de células de levadura de alta calidad es un primer paso necesario en el análisis de las proteínas individuales o proteomas completos. Aquí se describe un protocolo de homogeneización rápida, eficiente y fiable para las células de levadura en ciernes que ha sido optimizada para conservar funciones de las proteínas, las interacciones y las modificaciones posteriores a la traducción.

Florecimiento extracción de proteínas de levadura y purificación para el Estudio de la función, las interacciones y modificaciones post-traduccionales

Aquí, se describe un método que utiliza un sistema de infección basados ​​en la inserción de la membrana permeable a estudiar los efectos de estreptolisina S, una toxina secretada producida por estreptococos del grupo A, en los queratinocitos. Este sistema se puede aplicar fácilmente al estudio de otras proteínas bacterianas secretadas en diversos tipos de células huésped durante la infección.

Implementación de un Sistema de infección basada en la inserción de membrana permeable para estudiar los efectos de toxinas secretadas bacterianas en células huésped de mamífero

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MALT1 regula la inmunidad innata pero cómo esto ocurre sigue siendo mal definida. Utilizamos el inhibidor selectivo de la paracaspase del MALT1 MLT-827 a desentrañar la contribución de MALT1 al innato señalización corriente abajo de los receptores de lectina-como Toll-like o tipo C, demostrando que MALT1 regula la producción de citocinas mieloide y aguas abajo de los receptores de lectina-como de tipo C, selectivamente.

Reglamento de vía señalización innata mieloide por MALT1 Paracaspase actividad

Este protocolo describe un método de purificación para la proteína de unión al calcio sin etiquetas recombinante S100A12 y sus oligómeros inducidos por iones para ensayos de estimulación de monocitos humanos.

Purificación del S100A12 humano y sus oligomeros inducidos por iones para la estimulación celular inmune

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Aprende a expresar y purificar S100A12 para evaluar su actividad antimicrobiana contra H. pylori mediante ensayos microbiológicos cuantitativos. Este protocolo optimizado proporciona altos rendimientos de dímero estable puro.

Expresión, purificación y actividad antimicrobiana de S100A12

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